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文档简介
1高通量动植物基因型分型平台技术规范GB/T33681.1—2017高通量高通量测序high-throughpu2通过生物来源的、人工合成的或克隆技术等所得到的一个重建分子群,如基因组文库、互补构成核酸的基本单位,由三部分组成:五碳糖、磷酸和环状的含);基于文本的、保存生物序列(通常是核酸序列)和其测序质量信息的、每四行表示一条序列的标单核苷酸多态性singlenucleotide设定的要求,进行自动处理、自动检测、信息处理、分析判断和操纵控制,实现预期目子系统之间的集成测试,主要验证各子系统之间接口及系统整体功能3核酸提取模块文库构建模块样品信息管理系统测序芯片加载仪分布式计算集群高通量样品研磨站、分液器集群管理及调度软件系统站储板、冰箱基因测序模块核酸提取模块文库构建模块样品信息管理系统测序芯片加载仪分布式计算集群高通量样品研磨站、分液器集群管理及调度软件系统站储板、冰箱基因测序模块码系统高通量测序仪测序服务器&测序伴侣琼脂糖凝胶电泳机械臂琼脂糖凝胶电泳机械臂浓度测定膜机、封膜机、浓度测定膜机、封膜机、片段检测仪4.1用于核酸提取的模块提取,气压泵或液压泵,移液通量≥96,板位数≥28,移液精度5μlCV≤±5%,10μlCV≤±1%,20μl4.2用于文库构建的模块4.3用于基因测序的模块选择测序仪伴侣设备,协助测序仪快速完成碱基识别、数据临时存储及中转传输等。4.4用于数据分析的模块45.1设备仪器连接根据自动化设备的电源要求,通过电源线将其与电源之间进行5.2设备仪器联调联动通过校准板对移液工作站和机械手的位置进5.3软件开发5.4硬件调度与管理12534567PCR仪温度均一性≤±0.3℃,温度精准度≤±0.1℃89可根据微孔板封膜形式自动调整以达到最好撕6机最大平衡许可误差≤10克洗板速度:≤96孔板(96道分液头)13秒择激发/检测范围:≥455-650nm/510-检测样品量≥96个样品,样品反应体系范围≥15-100µl仪7不同组织样本类型采用不同的提取设备和方法进行提取。血液类样品(如拭子、血卡、血液等核酸提取完成后,进行核酸浓度和核酸片段大小检8),9数据分析9.1数据质量控制9.1.1数据质量分析满足要求则判定为符合质量要求,否则判定为不符合质量9.1.2测序数据过滤9.2基因型分型9.2.1序列比对9.2.2变异检测在群体研究中,利用生信分析工具整合突变群体的变异信息,主要是SNPs信息,输出VCF文9.2.3基因型鉴定9数据传输前应进行文件压缩,常用的压缩方式为gz数据存储应进行文件压缩,常用压缩方式为gzip,为方便数据管理和查阅同一个项目的数据还应根据新增需求,对程序细节、移液参数等做11.3.4检查多功能移液工作站的四通阀[3]GB/T6682-2008[10]GB/T37864—2019生[11]GB/T37874—2019[
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