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1/1肠道病毒71型基因组分析和sars冠状病毒结构蛋白的鉴定与分析中文摘要本文对肠道病毒71型(SHZH03毒株)进行了全基因组序列测定,利用巴斯德毕赤酵母系统表达了肠道病毒71型外壳蛋白vP2,对SAILS冠状病毒的核蛋白(N)和突起子糖蛋白(s)进行了鉴定与分析,研究结果如下:

1.肠道病毒71型(SHZH03毒株)全基因组序列测定对肠道病毒71型(eaterovirus71,EV71)国(深圳)分离株SHZH03基因组建立了覆盖全基因组的8个首尾重叠的克隆,并在此基础上对全基因组昧包括多聚腺苷酸尾)的7406个碱基进行了核苷酸序列的测定和分析。

结果表明,SHZH03株基因组具有典型的肠道病毒71型的基因组结构,在编码区没有核苷酸的缺失和插入;在5’UTR和3’UTR区,SHZH03在核苷酸序列和长度上和其它EV71有差异,存在缺失和插入。

核苷酸同源性比较结果表明,在P1区,SHZH03株与台湾流行株(TW2086、TW2272)的同源性较高,为87.9~92.5%;与新加坡流行株SIN5666、SIN5865以及标准株MS和BtCr的同源性则为80.4~82.3%,而与CoxsaldevirusAl6的同源性最低,为63+6%。

氨基酸同源性比较结果表明,在P1区SHZH03株与CoxsakievirusA16的同源性最低(79.8%),但在p2和P3区,SHZH03株与CoxsakievirusAl6的同源性最高(98.3%和96.8%)。

P1区的遗传进化分析表明,SHZH03株和台湾98年流行的EV71毒株的亲缘关系较近,而与标准株BrCr和MS的亲缘关系较远。

外壳蛋白基因vPl的遗传进化分析表明,SHZH03和SHZH98以及台湾1998年Ev71流行时的8个毒株属于同一组(dusted。

这些结果提示了我国深圳地区流行的肠道病毒71型有可能来源于台湾1998年的Ev71大规模流行时的毒株,对于我国EV71的基因分型、分子流行病学研究、EV71流行规律和疾病的治疗与预防都有借鉴意义。

2.肠道病毒7l型外壳蛋白VP2在巴斯德毕赤酵母中的表达从细胞培养物中提取EV71病毒基因组RNA,再利用RTPCR技术,扩增出EV71外壳蛋白基因VP2,连接于T载体,经测序证实目的基因VP2的序列正确:

构建酵母分泌型表达质粒peIC9KfVP2,经序列测定证实afactor信号肽和VP2的序列和阅读框正确后,经SacI酶切使之线性化,用电转化法将目的基因转化并整合到宿主菌GSl15基因组中;经G418加压筛选多拷贝整合菌株、转化子表型筛选和PCR分析鉴定后以及甲醇诱导,在Pichiapastoris酵母中实现了VP2的高效分泌性表达。

经饱和硫酸胺分级沉淀法初步纯化后,重组蛋白VP2的纯度可达90%以上。

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