生物信息学智慧树知到期末考试答案章节答案2024年华东理工大学

生物信息学智慧树知到期末考试答案+章节答案2024年华东理工大学LINUX不支持多个程序同时并独立的运行。

答案:错两个蛋白质序列相似性超过30%就是同源蛋白。

答案:错在代谢组学分析中，PLS-DA（偏最小二乘判别分析分析）是一种有监督方法，需要事先确定样品所属的类别。

答案:对同源性是指一种很直接的数量关系，需实验验证。

答案:错流平衡分析生成的代谢矩阵S中，反应物的系数表示为正值，产物的系数表示为负值。

答案:错代谢网络模型分为（）模型、（）模型和（）模型等三个层次。

答案:动力学模型###计量模型###调控模型在全基因组代谢网络构建时，一个代谢反应只能由一种酶催化。

答案:错下面各种相互作用中，哪些属于大分子间相互作用？

答案:蛋白-蛋白相互作用###基因-蛋白相互作用利用实验手段获得蛋白质等生物大分子三维结构的方法有哪些？

答案:X射线衍射###核磁共振###冷冻电镜美国政府于1990年10月启动被称为生命科学“登月计划”的人类基因组计划,预期到2005年完成人类基因组大约（）亿个碱基的全序列测定。

答案:30下面哪些代谢物组分析方法不需要有样品的类别信息？

答案:主成分分析###层次聚类法13C代谢通量分析中，如果测量谷氨酸同位素丰度，最多能测量出几种同位素异构体的信息？

答案:32人类基因组计划中，中国参与了（）%的测序工作？

答案:1生物信息学产生的背景源于美国政府于1990年10月启动的（）计划。

答案:人类基因组计划在蛋白质功能预测中，通过比对数据库相似性序列确定功能的原则是：超过（）个氨基酸的区段至少有25%相同为显著匹配。

答案:80除了人工审核注释的蛋白质序列数据库，以下哪个数据库中收录了由计算机翻译或模拟获得的蛋白质序列数据？

答案:TrEMBL分子动力学模拟通过求解（）来模拟分子体系的运动，获得体系内原子的运动轨迹。

答案:牛顿力学方程综合考虑准确性和计算速度，目前常用于对未知序列进行数据库相似性搜索的算法属于以下哪种？

答案:Fasta或Blast利用X射线衍射、核磁共振、冷冻电镜等技术获得的生物大分子结构，存储于下列哪个生物大分子结构数据库？

答案:PDBDavidBaker是研究蛋白质晶体结构解析的领军人物。

答案:错生物信息学就是“干”的实验科学，所有的研究结论从计算和预测中来，于“湿”实验中得到验证。

答案:对在全基因组代谢网络构建时，一种酶只能催化一个代谢反应。

答案:错在代谢组学分析中，PCA（主成分分析）是一种有监督方法，需要事先明确样品所属类别。

答案:错生物信息学研究任务之一包括SNP的发现和鉴定，对于疾病机理和药物开发靶点发现具有重要意义。

答案:对同源序列（Homolog）根据在同种属和不同种属可再分为直向同源序列（Ortholog）和旁系同源序列（Paralog）。

答案:对局部比对用于比较相似性程度较高的两个序列的比对，找出两个序列全长的最优比对结果。

答案:错利用分子对接方法可以预测获得蛋白质和小分子的复合物结构。

答案:对代谢组学能够更准确地反映生物体系的状态，基因组学和蛋白质组学告诉你什么可能会发生，而代谢组学则告诉你什么确实发生了。

答案:对网络可以分为有向网络和无向网络，生物网络都是无向网络。

答案:错分子动力学模拟是解析蛋白质结构功能关系的重要手段之一，其主要理论基础是求解牛顿力学方程。

答案:对国际核酸数据库由EMBL，DDBJ和GenBank组成，它们在1988年形成国际核酸数据库联合中心，对数据进行

答案:数据同步更新###数据格式相同###三方共享下面哪类生物分子属于小分子物质？

答案:氨基酸###抗生素全基因组代谢网络模型可用于哪些方面研究？

答案:预测基因操作靶点###估算代谢通量分布###分析基因对生长的重要性分子动力学模拟通过求解牛顿力学方程模拟分子体系的运动，获得体系内原子的运动轨迹。

答案:对代谢物组学数据具有什么特点？

答案:相互作用关系复杂###高噪声###高变异性###高维、小样本随着生物信息学的诞生及应用，今后生物学研究项目的起点将是理论的，一位科学家将从理论推测开始，然后才转向实验去追踪或检验该假设。

答案:对全基因组代谢网络模型可整合基因组、蛋白组、代谢物组和代谢通量组等多组学数据，为全面了解细胞功能提供了便利条件。

答案:对分子对接的两个理论基础模型是（）模型和（）模型。

答案:诱导契合模型###锁钥模型分子钟是用高度保守的核酸或蛋白质分子变异程度来度量时间的一个尺度。

答案:对IluminaSolexa测序技术的技术缺点是不能测定很长的序列，其根本原因在于

答案:难以做到所有反应随着时间和测序长度的平齐性：###DNA聚合酶随着反应时间效率的衰减对生物体系代谢产物的分析可分为哪几个层次。

答案:代谢指纹分析###代谢靶标分析###代谢轮廓分析###代谢组分析序列比对根据比对的计算方法可以分为（）比对和（）比对。

答案:全局序列比对###局部序列比对生物学工作者向Genbank数据库提交大量序列或较复杂序列的独立程序是（）。

答案:Sequin在蛋白质功能预测中，通过比对数据库相似性序列确定功能的原则是：超过80个氨基酸的区段至少有（）相同为显著匹配。

答案:25%二代测序技术平台因为采用大规模平行测序思路，可以用于统计学分析，因此有很多应用领域

答案:ChIP-seq###sRNA-seq###RNA-seq###Tnseq哪种组学数据不能通过仪器直接测量出来，只可通过计算得到？

答案:代谢通量组如果要构建进化树，首先需要对序列进行。

答案:多序列比对IluminaSolexa测序技术的核心步骤是边测序边合成(SBS)，其中每一步加入一种荧光标记以及修饰过的碱基，其目的在于（）：

答案:阻断扩增反应二代测序技术技术总体特征不包括的是：

答案:荧光拍照生物信息学的研究目标：以（）和（）等生物大分子数据为主要对象。

答案:核酸###蛋白（）是NCBI提供的集成检索工具，通过一次检索可查询NCBI多个子数据库中的相关信息。

答案:Entrez在核酸数据库中比对核酸序列，需要选择一下那种blast模式？

答案:blastn当目标蛋白质和模板蛋白的序列比对完成后，同源建模方法如何对目标蛋白的主链结构进行建模？

答案:根据结构保守区将模板结构的坐标直接拷贝到目标蛋白中生物信息学方法识别基因主要的两个途径：基因组外显子识别和EST策略，其中人类基因组（）序列均可用前者预测，但基因的完整预测准确性仅20%。

答案:90%生物序列数据库包括核酸序列数据库和蛋白序列数据库，以下哪个不属于蛋白质序列数据库？

答案:OMIM截止到2019年5月，我国运算速度最快的超算是以下哪个？

答案:神威太湖之光能统筹兼顾准确性和计算量的分子对接算法是一下哪种？

答案:半柔性对接一般情况下，序列一致性需高于多少，同源建模预测得到的三维结构被认为是可靠的？

答案:30%在各种代谢物组学分析方法中，哪种方法不需要识别出化合物？

答案:代谢指纹分析生物序列常使用的序列文件格式为（），是最简单的格式，第一行以“>”表示一个序列的开始。

答案:FASTA合成生物学的研究内容包括：合成代谢网络、遗传/基因线路的设计与构建、细胞群体系统及多细胞系统研究、数学模拟和功能预测。

答案:对R语言中，需要安装软件包时需要调用的命令是（）？

答案:install.packages()在代谢网络中，每一个节点代表一个（）？

答案:代谢物Linux是一款免费的操作系统，用户可以通过网络或其他途径免费获得，并可以任意修改其源代码。

答案:对Linux系统非常独立，不能在Windows下运行Linux环境。

答案:错利用R可以绘制并分析基因芯片数据的火山图来显示差异基因及p-value。

答案:对R是生物信息分析中非常重要的工具，可以实现以下哪些功能？

答案:测序数据分析###生态学数据分析###进化树分析###聚类分析在生物信息学研究中使用Linux系统的优势在于？

答案:Linux系统支持集群计算机的使用###Linux系统支持多种平台，并且不断更新###Linux系统是科学研究的通用平台###Linux系统是免费的以下哪些属于生物网络？

答案:蛋白质互作网络###基因调控网络###代谢网络###信号转导网络系统生物学是在系统层面上研究生命现象的一门学科，最基本的模型是网络模型。

答案:对全基因组代谢网络模型是基于基因-蛋白-代谢反应三者之间的对应关系建立起来的？

答案:对代谢物组分析可在代谢靶标分析、代谢物谱分析和代谢指纹分析三个层次上开展。

答案:对在主成分分析中，两个样品在得分图上的距离越近，它们属于同一类别的可能性就越大。

答案:对流平衡分析不但考虑了代谢反应的化学计量信息，也包含了代谢反应的调控信息。

答案:错下面哪些方法可用在代谢物组学分析中应用？

答案:质谱法###核磁共振法###光谱法下面哪些测量值可作为流平衡分析的约束条件？

答案:产物生成速率###同位素丰度代谢网络研究所建立的模型可分为计量模型、调控模型和动力学模型三种。

答案:对常用的代谢物分离方法包括哪些？

答案:液相色谱法###气相色谱法###毛细管电泳法代谢物组研究的对象是什么？

答案:内源性化合物13C代谢通量分析中，测量丙氨酸同位素丰度时，最多能测量出几种同位素异构体的信息？

答案:8PDB数据库中同时包含了利用实验解析和计算模拟的生物大分子的三维结构信息。

答案:错分子对接可以分为哪几种类型？

答案:半柔性对接###刚性对接###柔性对接以下哪项参数无法通过一级序列的理化性质计算获得？

答案:进化关系分子动力学模拟可以获得蛋白质在溶液中一段时间内的运动情况，但是消耗计算资源。

答案:对以下分子力场中，不属于非键作用的是（）？

答案:键的伸缩蛋白质三维结构预测的方法包括哪些？

答案:同源建模###折叠识别###从头预测以下关于同源建模的说法中，表述错误的是（）？

答案:同源建模时只能选择一个结构作为模板来建模疏水作用力是蛋白质折叠的主要驱动力，氨基酸亲疏水性等分析为高级结构预测提供参。

答案:对UniProt数据库整合了哪三大数据库资源？

答案:PIR-PSD###Swiss-Prot###TrEMBL利用计算手段预测的蛋白质三维结构能达到很高的准确性，不需要再进行优化了。

答案:错IluminaSolexa测序技术的技术缺点是不能测定很长的序列，其根本原因在于PCR扩增掺入碱基时，难以做到所有反应随着时间和测序长度的平齐性。

答案:对二代测序技术技术总体思路是统计学（大量重复）、分子生物学（如PCR和连接反应）和微液滴/微流控化学反应

答案:对二代测序技术平台包括

答案:IlluminaSolexa###454平台IluminaSolexa对测序对象进行测序时需要采用P5和P7引物进行扩增，其目的是与芯片中植入的寡核苷酸进行配对，从而固定到芯片上，为后续边测序边合成打下良好基础。

答案:对与IlluminaSolexa相比，454测序技术平台的缺点是荧光试剂成本高，而且会产生相同碱基的连续掺入。

答案:对基因结构的预测是基因组测序后的最重要一个步骤，真核生物和原核生物因为密码子表的不同，方法会有所不同。各种预测方法得到的结果也有所不同

答案:对随着链特异性转录组测序技术等的大量应用，为基因的鉴定提供了一个更为直接的工具和数据库

答案:对CodonW是密码子偏好性分析软件，以下哪些功能可以用该软件分析

答案:密码子适应指数###最优密码子使用频率###有效密码子数###密码子偏性指数基因的预测软件主要有

答案:CpGPlot###GENOMESCAN###GENSCANCpG岛指的是一段（）bp长度的DNA序列，G+C含量达到（）以上，与基因的存在相关性达到60-80%以上

答案:200，50全局序列比对用于整体相似性程度较低、在较小区域内有局部相似性的两个序列比对。

答案:错在蛋白质数据库中比对蛋白质序列，需要选择一下那种blast模式？

答案:blastp传统的基于动态规划的局部性比对性算法采用的是精确的序列比对，虽然有着较好的比较结果，但是算法的时间复杂度较高。

答案:对多序列比对就是两条以上的序列进行比对，可以用于进化树分析、寻找保守区域等。

答案:对以下哪些属于蛋白质打分矩阵？

答案:遗传密码矩阵###PAM矩阵###BLOSUM矩阵###疏水矩阵BLAST是基于局部比对算法，采用渐进式比对方法，对数据分成字段等思路进行的成对比对方法

答案:对生物信息学的研究对象中包括各种数据库，比如

答案:PDB###GenBank###Uniprot###KEGGGenBank对于核酸数据的显示方式有以下几种

答案:Graph###ASN.1###FASTA###GBKUniprotKB对于生物数据在不同数据