PubMed数据库检索介绍

PubMed数据库检索介绍

河北医科大学图书馆

于伟概况基本检索高级检索主题词途径检索临床查询检索单引文匹配检索检索结果处理概况基本检索高级检索主题词途径检索临床查询检索单引文匹配检索检索结果处理

PubMed（)

是由美国国立医学图书馆（National

Library

of

Medicine，NLM)的国家生物技术信息中心（National

Center

for

Biotech-nology

Information，NCBI)开发的一个以网络为基础的医学文献检索系统,是NCBI庞大的检索体系Entrez的一部分。

概况

收录从1948年至今80多个国家和地区37种文字的5000多种生物医学期刊上的文献2400多万条。每日更新（周二到周六），每天增加2000－4000条完整记录。PUBMED引文90%为英文文献，79%有英文摘要。

概况概况基本检索高级检索主题词途径检索临床查询检索单引文匹配检索检索结果处理

基本检索自动词语匹配检索著者检索期刊检索词组检索截词检索布尔逻辑检索自动词语匹配检索著者检索期刊检索词组检索截词检索布尔逻辑检索

基本检索对于输入检索框中未加标识的检索词，PubMed依次在下列词表中查找匹配的内容：MeSHtranslationtableJournalstranslationtableFullAuthortranslationtableAuthorindex

基本检索Keyword(s)Mesh转换表期刊名转换表作者索引表经过转换后的检索式Pubmed系统进行检索Details分析11作者姓名转换表

基本检索1、Mesh转换表由Mesh词、款目词、Mesh副主题词、

文献类型词、药理作用词、一体化医学语言系统词及

化学物质名称等组成。2、期刊转换表由Pubmed收录期刊的刊名全称、

MEDLINE格式刊名缩写和ISSN三种形式组成。3、作者全名转换表由2002年以来发表文章作者的姓名

全称组成。检索时，按自然顺序或姓前名后的形式输

入均可。4、作者索引Pubmed将姓全称，后边带名首字母缩写

的短语自动识别为作者姓名。

如果在上述转换表中找不到相同匹配的词，Pubmed会将短语拆开，按单个词重复以上顺序分别查找，直到找到相匹配的词。

基本检索Heartattack

自动匹配检索"myocardialinfarction"[MeSHTerms]OR("myocardial"[AllFields]AND"infarction"[AllFields])OR"myocardialinfarction"[AllFields]OR("heart"[AllFields]AND"attack"[AllFields])OR"heartattack"[AllFields]"myocardialinfarction"[MeSHTerms]OR("myocardial"[AllFields]AND"infarction"[AllFields])OR"myocardialinfarction"[AllFields]OR("heart"[AllFields]AND"attack"[AllFields])OR"heartattack"[AllFields]自动词语匹配检索著者检索期刊检索截词检索词组检索布尔逻辑检索

基本检索以作者姓全称加名首字缩写的格式输入姓名，PubMed通过自动匹配自动在作者字段进行检索。可通过在姓名前后加双引号并加作者字段标识[au]关闭该功能，如：“SmithJ”[au]

基本检索

基本检索以作者姓全称加名首字缩写的格式输入姓名，PubMed通过自动匹配自动在作者字段进行检索。可通过在姓名前后加双引号并加作者字段标识[au]关闭该功能，如：“SmithJ”[au]。如果只输入作者的姓，则PubMed会在所有字段中对其进行检索，如只想将其作为作者检索，需加作者字段标识[au]。

2002年以后的论文，如果提供作者全名，可使用作者全名进行检索。作者姓名可正序或倒序。如：juilaswong或wongjulias。为了区分姓名全称与首字缩写，需加标全名字段标识[fau]，如：petersondo[fau]

基本检索

检索字段及标识符AD(Address):第一作者所属单位和地址ALL(AllFields):全部字段AU(Author):作者姓名DP(PublicationDate):出版时间EDAT(EntrezDate):录入时间1AU(FirstAuthorName):第一作者姓名FAU(FullAuthorName):作者姓名全称(02年以后）LASTAU(LastAuthor)最后一个作者（通讯作者）IP(Issue):期号、部分号、增刊号IS(ISSN):国际标准刊号LA(Language):原文语种

检索字段及标识符MH(MeshTerms):主题词MAJR(MeshMajorTopic):主要主题词PG(Pagination):页码（起页）PT(PublicationType):出版类型SB(Subset):文献子集SH(MeshSubheadings):副主题词TA(JournalTitleAbbreviation):刊名缩写TI(Title):文章题名TIAB(Title/Abstract):题名摘要TW(TextWords):文本词VI(Volume):卷号自动词语匹配检索著者检索期刊检索截词检索词组检索布尔逻辑检索

基本检索

直接在检索框中输入刊名全称、Medline缩写及ISSN，PubMed通过自动匹配自动在刊名字段进行检索。使用PubMed资源的“JournalsDatabase”查询特定期刊上的文章。

基本检索

直接在检索框中输入刊名全称、Medline缩写及ISSN，PubMed通过自动匹配自动在刊名字段进行检索。使用PubMed资源的“JournalsDatabase”查询特定期刊上的文章。

基本检索

如果刊名是Mesh词（如：GeneTherapy、Science、Cell)，或刊名是单个单词（Scanning)，如只想将其作为刊名检索，需加刊名字段标识[ta]。推荐使用刊名全称或缩写查找，因为有些过早的文献没有ISSN。

基本检索scienceScience[ta]

直接在检索框中输入刊名全称、Medline缩写及ISSN，PubMed通过自动匹配自动在刊名字段进行检索。使用PubMed资源的“JournalsDatabase”查询特定期刊上的文章。

基本检索自动词语匹配检索著者检索期刊检索截词检索词组检索布尔逻辑检索

基本检索截词检索：可通过在词干后加“*”检索以该词干开头的所有词的文献。需要注意的是：截词检索将关闭PubMed的自动单词匹配功能以及Mesh主题词的扩展检索功能。如：输入heartattack*，不会启动自动匹配功能检索与之匹配的Mesh主题词“MyocardialInfarction”及其下位更专指的主题词的相关文献。

基本检索

基本检索截词功能最多可使用600个词形变化。超过600个会显示如下图的提示信息。

基本检索PubMed在检索时忽略一些常用的英语词汇，下表为禁用词列表

基本检索自动词语匹配检索著者检索期刊检索截词检索词组检索布尔逻辑检索

基本检索

对于输入PubMed的多词词组，PubMed会查询词组索引，如果查到相应词组则将其作为一个检索词来检索。如果未查到相应词组，则将其拆分成单个词，分别进行检索并以逻辑和（AND）进行组配，如：singlecell相当于检索singleANDcell。可通过如下方式强制将其作为一个词组进行检索：

1.加双引号，如：“singlecell”2.加标段标识[tw]:singlecell[tw]3.使用短横线“-”将两词连接起来：single-cell4.使用截词符*：singlecell*

基本检索

基本检索自动词语匹配检索著者检索期刊检索截词检索词组检索布尔逻辑检索

基本检索概况基本检索高级检索主题词途径检索临床查询检索单引文匹配检索检索结果处理

PUBMED的AdvancedSearch页面整合了多种对检索有用的辅助功能，可实现如下操作：

•Searchingbyaspecificfield•

Browsingtheindexofterms•Combiningsearchesusinghistory•Displayingthesearchdetails

高级检索

PUBMED的AdvancedSearch页面整合了多种对检索有用的辅助功能，可实现如下操作：

•Searchingbyaspecificfield•

Browsingtheindexofterms•Combiningsearchesusinghistory•Displayingthesearchdetails

高级检索作者检索：通过AdvancedSearch页面中的“SearchBuilder”下拉列表选择“Author”字段，在字段后的检索框中输入作者姓名，姓名的输入具有自动完成属性。

高级检索

期刊检索：通过AdvancedSearch页面中的“SearchBuilder”下拉列表选择“Journal”字段，在字段后的检索框中输入刊名全称、Medline缩写及ISSN

高级检索通过高级检索页面的“SearchBuilder”可以进行特定字段的限定检索。

首先在下拉列表中选择要检索的字段，然后在检索框中输入检索词。再选择“AND”、“OR”、“NOT”三种逻辑关系之一，即可将输入的检索词在所选字段中检索的策略以相应的逻辑关系加入到检索框中。

高级检索nature

高级检索Searchingbyaspecificfield

PUBMED的AdvancedSearch页面整合了多种对检索有用的辅助功能，可实现如下操作：

•Searchingbyaspecificfield

•

Browsingtheindexofterms•Combiningsearchesusinghistory•Displayingthesearchdetails

高级检索

通过“SearchBuilder”检索框下面的“ShowIndex”选项可查询在所有字段或某一特定字段中的索引，可以从索引中选择一个或几个词来完善检索策略。

高级检索chronicproctitis

PUBMED的AdvancedSearch页面整合了多种对检索有用的辅助功能，可实现如下操作：

•Searchingbyaspecificfield•

Browsingtheindexofterms

•Combiningsearchesusinghistory•Displayingthesearchdetails

高级检索

检索史按检索式运行的顺序列出各检索式，包括检索式序号、检索策略、检索时间、检索到的文献条数。检索史最多保存100条检索式，检索史将在离开PubMed或其他Entrez数据库8小时后消失。单击检索式后的文献数链接可显示该检索式的检索结果。可通过检索策式的序号对检索策略进行组配，如：#2AND#6，#3AND(drugtherapyORdiettherapy)单击检索史窗口下方的ClearHistory按钮可将所有检索式删除。

高级检索Deletefromhistory:从检索史中删除该条检索式Showsearchresults:查看该条检索策略的检索结果Showsearchdetails:显示该条检索策略的具体执行情况SaveinMyNCBI：在MyNCBI中保存该条检索策略。

PUBMED的AdvancedSearch页面整合了多种对检索有用的辅助功能，可实现如下操作：

•Searchingbyaspecificfield•

Browsingtheindexofterms•Combiningsearchesusinghistory

•Displayingthesearchdetails

高级检索

“Details”(细节）可实现如下功能：1、查看检索策略被PubMed的自动单词匹

配功能、检索规则和句法转换后的形式。2、存储和编辑检索策略并重新发送出该项策略。3、提示出错信息和说明。

高级检索

限定检索可限定只检索那些提供全文或免费全文的文献，也可将检索策略限定于特定的年龄组、性别、人类与动物研究、语种、文献类型、PubMed的特定文献子集等。

由于inprocesscitations和publishersuppliedcitaions没有进行标引，因此选择某些限定功能，PubMed将仅在Medline中进行检索。选择了某种限定条件并进行检索后当前的限定条件显示于检索结果页面上方，进行新的检索时需单击限定条件后的“Remove”选项清除当前的限定条件，否则将使用相同的限定条件进行检索。

限定检索限定检索概况基本检索高级检索主题词途径检索临床查询检索单引文匹配检索检索结果处理通过主题词数据库可以查询Mesh词、副主题词、出版类型、物质名和药物作用等，并生成检索策略。可以使用Mesh词、Mesh款目词、副主题词、出版类型、物质名或Mesh范畴注释中的词检索Mesh数据库中的数据。主题词途径检索

MeshDatabasehighbloodpressure√√√概况基本检索高级检索主题词途径检索临床查询检索单引文匹配检索检索结果处理

PubMed在其临床查询页面为临床医生提供如下特殊的PubMed检索服务:•SearchbyClinicalStudyCategory•FindingSystematicReviews•MedicalGeneticsSearches

临床查询检索

1.按临床研究类别检索文献使用内建过滤器专门查询有关临床研究类别的文献，提供5种研究类别（etiology、diagnosis、therapy、prognosis、clinicalpredictionguides）和2种强调类型（narrowspecificsearch、broadsensitivesearch）临床查询检索ResearchMethodologyFilters临床查询检索2.查询系统综述

系统综述包括如下文献类型：

systematicreviewsmeta-analysisreviewsofclinicaltrialsevidence-basedmedicineconsensusdevelopmentconferencesguidelines

临床查询检索3.医学遗传学研究用来查找医学遗传学相关的各主题的文献，包括：DiagnosisDifferentialDiagnosisClinicalDescriptionManagementGeneticCounselingMolecularGeneticsGeneticTesting临床查询检索

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UsingClinicalQueries

UsingClinicalQueries概况基本检索高级检索主题词途径检索临床查询检索单引文匹配检索检索结果处理以填空的方式填入已知的期刊信息，查询一篇已知论文或指定期刊某一卷或期上的一批论文。期刊名和作者名有自动完成属性，输入部分信息