水环境中的微生物化学过程

关于水环境中的微生物化学过程物质在生物作用下经受的化学变化，称为生物转化或代谢。三大转化类型：微生物作用：生物转化化学转化光化学转化自然界自净废水处理污染场址修复生物转化、化学转化和光化学转化构成了污染物质在环境中的三大主要转化类型。第2页,共77页，2024年2月25日，星期天6.1有机污染物质的微生物降解6.2有毒有机污染物质生物转化类型6.3水体中金属的微生物转化6.4污染物质的生物转化速率第3页,共77页，2024年2月25日，星期天6.1有机污染物质的微生物降解（P158)第4页,共77页，2024年2月25日，星期天微生物是一切肉眼看不见或看不清、个体微小、构造简单的低等生物的统称微生物分类：原核生物（细菌、古细菌、放线菌、立克次氏体、支原体、衣原体）真核生物（原生动物、真菌、藻类）非细胞生物（噬菌体、病毒）第5页,共77页，2024年2月25日，星期天微生物的微观性研究手段的限制分离培养的局限种类多生理代谢类型多代谢产物种类多微生物种数多地球上的微生物：估计有100万种以上已发现的微生物：约有10万种已开发利用的微生物：约1000种第6页,共77页，2024年2月25日，星期天

水里的微生物“夜光藻”活性污泥中的丝状菌第7页,共77页，2024年2月25日，星期天

水蚤第8页,共77页，2024年2月25日，星期天

第9页,共77页，2024年2月25日，星期天有机化合物的生物降解水环境中有机物的生物降解依赖于微生物通过

催化反应分解有机物，其本质是

促反应。第10页,共77页，2024年2月25日，星期天一、生物转化中的酶Enzyme

（大多数生物转化是在酶的参与和控制下进行的）1、几个概念酶(enzyme)：一种由细胞制造和分泌的、以蛋白质为主要成分的、具有催化活性的生物催化剂。底物（或基质）(substrate)：在酶催化下发生转化的物质。酶促反应(enzymaticreaction)：底物在酶催化下发生的转化反应。

第11页,共77页，2024年2月25日，星期天2、酶催化作用的特点催化专一性高。一种酶只能对一种底物或一类底物起催化作用，生成一定的代谢产物。酶催化效率高。一般酶催化反应的速率比化学催化剂高107～1013倍。酶催化需要温和的外界条件，如常温、常压、接近中性的酸碱度。第12页,共77页，2024年2月25日，星期天3、酶的分类 2,000多种a、根据作用场所胞内酶胞外酶b、根据催化反应类型氧化还原酶转移酶水解酶裂解酶异构酶合成酶c、根据成分单成分酶(只含有蛋白质)双成分酶(酶蛋白和辅酶或辅基)第13页,共77页，2024年2月25日，星期天二、若干重要辅酶的功能1、FMN和FAD一些氧化还原酶的辅酶，在酶促反应中具有传递氢原子的功能。F：黄素flavinM：单monoN：核苷酸nucleotideA：腺嘌呤adenineD：二核苷酸dinucleotideFMNFAD第14页,共77页，2024年2月25日，星期天+2H-2H（氧化型FMN/FAD）（还原型FMN/FAD）FMN/FADFMNH2/FADH2R——FMN/FAD的其余部分第15页,共77页，2024年2月25日，星期天2、NAD＋和NADP＋(分别称为辅酶Ⅰ辅酶Ⅱ)某些氧化还原酶的辅酶，在酶促反应中具有传递氢的作用。NAD+（烟酰胺腺嘌呤二核苷酸）NADP+（烟酰胺膘嘌呤二核苷酸）磷酸腺嘌呤第16页,共77页，2024年2月25日，星期天NAD+/NADP＋（氧化型NAD+/NADP＋）+2H+H+NADH/NADPH（还原型NAD+/NADP＋）R——NAD+/NADP+的其余部分第17页,共77页，2024年2月25日，星期天3、辅酶Q（又称泛醌）是某些氧化还原酶的辅酶，在酶促反应中具有传递氢的作用。CoQ（氧化型CoQ）+2H-2HCoQH2（还原型CoQ）（n=6~10）第18页,共77页，2024年2月25日，星期天4、细胞色素酶系的辅酶细胞色素酶系是催化底物氧化的一类酶系，主要有细胞色素b1、c1、c、a、a3等几种。它们的酶蛋白部分不同，但辅酶都是铁卟啉。cytnFe3+cytnFe2++e-ecyt—细胞色素酶系n—b1、c1、c、a、a3第19页,共77页，2024年2月25日，星期天5、辅酶A（简写为CoASH）转移酶的辅酶，所含的巯基与酰基形成硫酯，而在酶促反应中起着传递酰基的功能。反应式如下：CoASH+CH3CO+CH3CO-SCoA+H+第20页,共77页，2024年2月25日，星期天三、生物氧化中的氢传递过程（hydrogentransfer）生物氧化指有机质在机体细胞内的氧化，并伴随能量的释放。一般多为去氢氧化。所脱落的氢（H++e）以原子或电子的形式，由相应的氧化还原酶按一定顺序传递至受氢体。这一氢原子或电子的传递过程称为氢传递或电子传递过程，其受体称为受氢体或电子受体。受氢体如果为细胞内的分子氧就是有氧氧化；若为非分子氧的化合物则是无氧氧化。第21页,共77页，2024年2月25日，星期天1、有氧氧化中以分子氧为直接受氢体的递氢过程分子氧作为直接受氢体的氢传递过程第22页,共77页，2024年2月25日，星期天2、有氧氧化中分子氧为间接受体的递氢过程分子氧作为间接受氢体的氢传递过程第23页,共77页，2024年2月25日，星期天生物去氢氧化中各反应的电极电位电对E/V电对E/VNAD+/(NADH+H+)-0.322cytc1(2Fe3+/2Fe2+)+0.22FMN/FMNH2-0.122cytc(2Fe3+/2Fe2+)+0.26CoQ/CoQH2+0.102cytaa3(2Fe3+/2Fe2+)+0.282cytb(2Fe3+/2Fe2+)+0.05O2/H2O+0.82第24页,共77页，2024年2月25日，星期天3、无氧氧化中有机底物转化中间产物受氢体的递氢过程一系列酶促反应中间代谢产物作为受氢体葡萄糖CH3CHO（乙醛）CH3CH2OH（乙醇）NADH+H+NAD+乙醇脱氢酶2H葡萄糖CH3COCOOH（丙酮酸）CH3CH(OH)COOH（乳酸）NADH+H+NAD+乳酸脱氢酶2H第25页,共77页，2024年2月25日，星期天4.无氧氧化中某些无机含氧化合物做受氢体的递氢过程最常见的受氢体：硝酸根、硫酸根和二氧化碳10[H]+2NO3-+2H+N2+6H2O兼性厌氧反硝化菌24[H]+3H2SO43H2S+12H2O兼性厌氧硫酸还原菌8[H]+CO2CH4+2H2O厌氧甲烷菌第26页,共77页，2024年2月25日，星期天四、耗氧有机污染物质的微生物降解是生物残体、排放废水和废弃物中的糖类、脂肪和蛋白质等较易生物降解的有机物质有机物质通过生物氧化以及其他的生物转化，可以变成更小、更简单的分子。如果有机物质降解成二氧化碳、水等简单无机化合物，则为彻底降解，矿化（mineralization）；否则为不彻底降解。第27页,共77页，2024年2月25日，星期天1、糖类的微生物降解糖类Cx(H2O)yA、多糖水解成单糖B、单糖酵解成丙酮酸C、丙酮酸的转化有氧条件无氧条件多糖细胞外水解酶二糖单糖细胞内水解酶第28页,共77页，2024年2月25日，星期天C、丙酮酸的转化：有氧条件TAC三羧酸循环第29页,共77页，2024年2月25日，星期天C、丙酮酸的转化：无氧条件CH3COCOOH+2[H]CH3COCOOH+2[H]CH3CH(OH)COOH(乳酸)

乳酸菌

厌氧CH3COCOOHCO2+CH3CHOCH3CHO+2[H]CH3CH2OHCO2+CH3CH2OH

酵母菌

兼性厌氧第30页,共77页，2024年2月25日，星期天2、脂肪的生物降解

A、脂肪水解成脂肪酸和甘油B、甘油的转化第31页,共77页，2024年2月25日，星期天C、脂肪酸的转化有氧时，饱和脂肪酸经过酶促β-氧化途径变成酯酰辅酶A和乙酰辅酶A。乙酰辅酶A进入TCA循环，而酯酰辅酶A又经β－氧化途径进行转化。RCH3CH2COOHRCH2CH2COSCoARCH=CHCOSCoARCH(OH)CH2COSCoARC(O)CH2COSCoARCOSCoA+CH2COSCoACOASHH2OFADFADH2H2ONAD+NADH+H+CoASH饱和脂肪酸β-氧化途径简要图示脂酰辅酶Aα,β-烯脂酰辅酶Aβ-羟脂酰辅酶Aβ-酮脂酰辅酶A乙酰辅酶A少2C的脂酰辅酶A第32页,共77页，2024年2月25日，星期天3、蛋白质的微生物降解A、蛋白质水解成氨基酸B、氨基酸脱氨脱羧成脂肪酸第33页,共77页，2024年2月25日，星期天4、甲烷发酵在无氧氧化条件下，糖类、脂肪和蛋白质降解成简单的有机酸、醇等。这些有机化合物在产氢菌和产乙酸菌作用下，可转化为乙酸、甲酸、氢气和二氧化碳，进而经产甲烷菌作用产生甲烷。这一总过程称为甲烷发酵。在甲烷发酵中糖类的降解率和降解速率最高，脂肪次之，蛋白质最低。产生甲烷的主要途径：CH3COOH→CH4+CO2CO2+4H2→CH4+2H2O第34页,共77页，2024年2月25日，星期天甲烷发酵需要满足产酸菌、产氢菌、产乙酸菌和产甲烷菌等各种菌种所需的生活条件，它只能在适宜环境条件下进行。产甲烷菌是专一厌氧菌，因此甲烷发酵必须处于无氧条件下。甲烷菌生长要求：弱碱性环境；一般pH为7－8；适宜碳氮比为30左右。第35页,共77页，2024年2月25日，星期天6.2有毒有机污染物质生物转化第36页,共77页，2024年2月25日，星期天有毒有机污染物质生物转化类型生物转化的结果，一方面往往使有机毒物水溶性和极性增加易于排出体外；另一方面也会改变有机毒物的毒性，多数是毒性减小，少数毒性反而增大氧化、还原、水解—第一阶段反应

结合—第二阶段反应

第37页,共77页，2024年2月25日，星期天1.氧化反应类型混合功能氧化酶加氧氧化C=C环氧化C羟基化氧脱烃硫脱烃、硫-氧化及脱硫N脱烃、氮-氧化及脱氮脱氢酶脱氢氧化醇氧化成醛醇氧化成酮醛氧化成羧酸氧化酶氧化第38页,共77页，2024年2月25日，星期天A.混合功能氧化酶加氧氧化混合功能氧化酶又称单加氧酶，功能是利用细胞内的分子氧，将其中的一个氧原子与有机底物结合，使之氧化，而使另一个氧原子与氢原子结合成水。两个电子是由NADPH＋H＋传递来的第39页,共77页，2024年2月25日，星期天NADPH+H+第40页,共77页，2024年2月25日，星期天混合功能氧化酶的专一性较差，能催化很多底物碳双键环氧化第41页,共77页，2024年2月25日，星期天碳羟基化第42页,共77页，2024年2月25日，星期天硫脱烃、硫－氧化及脱硫硫脱烃脱硫硫氧化亚砜砜第43页,共77页，2024年2月25日，星期天氮脱烃、氮－氧化及脱氮氧脱烃第44页,共77页，2024年2月25日，星期天脱氮氮氧化羟胺第45页,共77页，2024年2月25日，星期天B.脱氢酶脱氢氧化脱氢酶是伴随有氢原子或电子转移，以非分子氧化合物为受体的酶类。脱氢酶能使相应的底物脱氢氧化。醇氧化成醛RCH2OH→RCHO+2H醇氧化成酮R1CH(OH)R2→R1COR2+2H醛氧化成羧酸RCHO＋H2O→RCOOH＋2H第46页,共77页，2024年2月25日，星期天C.氧化酶氧化氧化酶是伴随有氢原子或电子转移，以分子氧为直接受氢体的酶类。氧化酶能使相应的底物氧化。

RCH2NH2＋H2O→RCHO＋NH3＋2H第47页,共77页，2024年2月25日，星期天2.还原反应类型A.可逆脱氢酶加氢还原：可逆脱氢酶是指起逆相作用的脱氢酶类，能使相应的底物加氢还原。B.硝基还原酶还原：硝基还原酶能使硝基化合物还原，生成相应的胺。C=O+2H→CHOHR1R2R1R2NO22H-H2ONO2HNHOH2H-H2ONH2第48页,共77页，2024年2月25日，星期天C.偶氮还原酶还原：偶氮还原酶能使偶氮化合物还原，生成相应的胺。（增毒反应）D.还原脱氯酶还原：还原脱氯酶能使含氯化合物脱氯（用氢置换氯）或脱氯化氢而被还原。N=N2HNH2NH-NH2H2第49页,共77页，2024年2月25日，星期天3.水解反应类型A.羧酸酯酶使酯水解RCOOR+H2O→RCOOH+R'OHB.磷脂酯酶使磷脂水解C.酰胺酶使酰胺水解第50页,共77页，2024年2月25日，星期天4.结合反应A.葡萄糖醛酸结合：在葡萄糖醛酸基转移酶的作用下，在生物体内尿嘧啶核苷二磷酸葡萄糖醛酸中，葡萄糖醛酸基可转移至含羟基的化合物上，形成O-葡萄糖苷酸结合物。所涉及的羟基化合物有醇、酚、烯醇、羟酰胺、胺等。芳香及脂肪酸中羧基上的羟基，也可与葡萄糖醛酸结合成O－葡萄糖苷酸。此外，伯胺、酰胺、磺胺等中的氮原子和大部分含巯基化合物中硫原子，也都能与葡萄糖醛酸分别形成N－和S－葡萄糖苷酸结合物第51页,共77页，2024年2月25日，星期天对氯苯酚葡萄糖苷酸UDP－尿嘧啶核苷二磷酸UDPGA－尿嘧啶核苷二磷酸葡萄糖醛酸第52页,共77页，2024年2月25日，星期天苯胺葡萄糖苷酸葡萄糖醛酸具有1个羧基及3个羟基，（pKa=3.2）第53页,共77页，2024年2月25日，星期天B.硫酸结合在硫酸基转移酶的催化下，可将3’－磷酸－5’－磷硫酸腺苷中硫酸基转移到酚或醇的羟基上，形成硫酸酯结合物。可结合到氮、硫上。第54页,共77页，2024年2月25日，星期天++PAPS－3'－磷酸－5'－磷硫酸腺苷对硝基苯基硫酸脂PAP－3‘－磷酸－5'－磷酸腺苷第55页,共77页，2024年2月25日，星期天C.谷胱甘肽结合在相应转移酶催化下谷胱甘肽中的半胱氨酸及乙酰辅酶A的乙酰基，将以N-乙酰半胱氨酸基形式加到有机卤化物（氟除外）、环氧化合物、强酸酯、芳香烃、烯等亲电化合物的碳原子上，形成巯基尿酸结合物。亲电子化合物如果与细胞蛋白或核酸上亲核基团结合，常可引起细胞坏死、肿瘤、血液功能紊乱和过敏现象。谷胱甘肽的结合，有力地解除了对机体有害亲电化合物的毒性。。第56页,共77页，2024年2月25日，星期天C4H9Br+HOOC-CH-CH2-CH2-C-NH-CH-C-NH-CH2-COOH∣NH2=O

∣HS-CH2=O谷胱甘肽S-转移酶HBr酶H2OHOOC-(CH2)2-CHCOOH∣NH2GSH-谷胱甘肽H2ONH2-CH2-COOH谷氨酸甘氨酸CH3COSCoACoASHS－(丁基)巯基脲酸谷胱甘肽结合反应第57页,共77页，2024年2月25日，星期天有毒有机污染物质的微生物降解碳原子数>1的正烷烃烷烃末端氧化次末端氧化双端氧化生成醇、醛及脂肪酸，最终降解成二氧化碳和水不饱和末端双键环氧化环氧化合物二醇饱和脂肪烃饱和末端氧化最常见的开环烃类第58页,共77页，2024年2月25日，星期天上节课内容有机污染物质的微生物降解糖类、脂肪、蛋白质6.2有毒有机污染物质生物转化类型氧化、还原、水解、结合6.3水体中金属的微生物转化6.4污染物质的生物转化速率第59页,共77页，2024年2月25日，星期天6.3水体中金属的微生物转化（汞的氧化、还原和甲基化P182）第60页,共77页，2024年2月25日，星期天汞汞存在形态汞在环境中的存在形态有三种金属汞无机汞化合物有机汞化合物汞的毒性大小有机汞〉金属汞〉无机汞化合物第61页,共77页，2024年2月25日，星期天汞汞的环境化学行为汞及其化合物有较大挥发性有机汞〉无机汞汞的氧化还原电位较高胶体对汞有强烈的吸附作用汞的甲基化第62页,共77页，2024年2月25日，星期天

环境中的汞与甲基汞和二甲基汞的生化循环P185图第63页,共77页，2024年2月25日，星期天汞甲基化甲基化过程：在好氧或厌氧条件下，水体底质中某些微生物能使二价无机汞转变为甲基汞和二甲基汞的过程，称为汞的甲基化。甲基钴氨蛋氨酸转移酶，辅酶为甲基钴氨素：含钴的一种咕啉衍生物。第64页,共77页，2024年2月25日，星期天

甲基汞和二甲基汞之间可以相互转化。它主要决定于反应的条件。好氧条件下，产物主要是甲基汞厌氧条件下，尤其是H2S存在时，则更多地转化为二甲基汞，是重金属完全甲基化的一个重要途径第65页,共77页，2024年2月25日，星期天汞的甲基化产物与pH的关系pH较低时，甲基化产物以CH3Hg+为主；pH升高到8以上时，则以(CH3)2Hg占优势；水中甲基汞和二甲基汞是两种主要形态

(CH3)2Hg+H+===CH3Hg++CH4第66页,共77页，2024年2月25日，星期天甲基汞在水中的实际存在形态取决于Cl-难度和pH，一般有CH3HgCl、CH3HgOH、CH3Hg+三种形式。正常水体中，主要以CH3HgCl、CH3HgOH形态存在。二甲基汞是挥发性的，可由水体挥发至大气中。在大气中由于紫外线的照射，二甲基汞可光解为Hg0及－CH3，并可进一步放出氢和偶合成甲烷和乙烷。第67页,共77页，2024年2月25日，星期天甲基钴氨素简式六个配体四个咕啉环上四个氮咕啉D环支链上二甲基苯并咪唑的一个氮原子一个甲基负离子第68页,共77页，2024年2月25日，星期天汞的生物甲基化途径第69页,共77页，2024年2月25日，星期天汞的生物去甲基化汞的生物去甲基化（还原作用）：在水体底质中还存在一类抗汞微生物，能使甲基汞或无机汞化合物变成金属汞，这是微生物以还原作用转化汞的途径。CH3HgCl+2H→Hg+2CH4+HCl(CH3)2Hg+2H→Hg+2CH4HgCl2+2H→Hg+2HCl第70页,共77页，2024年2月25日，星期天6.4污染物质的生物转化速率第71页,共77页，2024年2月25日，星期天酶促反应的速率米氏方程式中：S——底物；E——酶；ES——复合物；P——产物；

k1、k2、k3——相应单元反应速率常数。k2则ES形成与分解的速率微分方程为：如果酶促反应体系处于动态平衡，则：令Km=(k2+