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文档简介
向GenBank批量上传序列的方法Qin1.利用DNAstar的editSeq制作待序列的FASTA文档:待上传序列删减至合适长度后,将待上传序列全部打开随后点击File-exportasone,保存文件格式为:*.fas,将待上传序列全部归至一个FASTA文档。注意序列命名:2.在GenBank的SubmissionTools里,下载序列信息编辑软件Sequin。网址:/Sequin/(下图中点击Instructions下载软件)注意打开安装文件后,程序会自动安装在安装包所在的文件夹。3.打开Sequin,点击StartNewSubmission。导入之后,输入序列ID(序号ID相当于编号,可以自由命名,只要各个序列的ID不一致即可。在这里以病人编号作为序列ID):导入序列成功后,显示各个序列信息如下:点击SequencingMethod,将测序方法输入:选择上传序列的用途:病毒类型:编辑每条序列的信息:点击ImportSourceTable可以导入模板,点击ExportThisTable可以输出模板备用。选择核酸类型,序列内容后,点击OpenRecordViewer。添加每条序列的信息,包括编码区重复区RNA结构等等。双击相关信息可进行修改,点击Annotate添加相关信息。检查信息是否有误(也可以点击Search里的Validate检测是否有明显错误):有些错误是可以忽略的,如上传的序列为CDS序列,那么软件报错”序列无终止子”时可忽略。随后,点击Done保存待上传序列:注意此时保存的文件包含所有序列信息,因此只需保存一次即可。12.将保存好的文件作为邮件附件,发送
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