新冠病毒变异株监测工作方案

新冠病毒变异株监测工作方案四川省疾病预防控制中心新冠病毒全球流行情况

BA.5及其亚分支仍为全球优势流行毒株，占比约60%。

BA.2及其亚分支的流行比例升高，占比约18%。

占比前三的进化分支：

―BA.2.75：15.26%

―BQ.1.1：10.33%―BQ.1.1.20：8.22%(丹麦)https://gisaid.org/Omicron变异株进化速度四川本土疫情本土疫情基因分型本土疫情基因分型2020年12月郫都疫情B.1.362022年8月

西藏相关BA.2.762021年7月

南京相关疫情Delta2022年8月

海南相关BA.5.1.32021年11月

西北相关疫情Delta2022年8月

新疆相关BA.5.22022年2月

泸州BA.1.12022年11月

内蒙相关BF.72022年2月

成都BA.22022年4月

上海相关疫情BA.1.1/BA.2.22022年5月

广安BA.2.22022年7月

成都BG.22022年7月

成都BA.2.386-12月全省本土序列变化情况8-12月市州数据报送情况月份报送序列市州数总计序列总计8月10839月1132610月1318311月1540012月83421334入境病例病毒亚型月份亚型数9月12种10月17种11月28种12月26种新冠病毒变异株监测工作方案监测目的、对象、时间监测目的为实时动态监测新冠病毒变异情况，评估不同变异株的临床分型差异，及时监测和捕获传播力、致病力和免疫逃逸能力发生重要改变的本土和输入奥密克戎变异株，为检测试剂、疫苗和药物的研发和评价提供科学基础。监测对象（⼀）本⼟病例监测。（⼆）输⼊病例监测。监测时间全年持续开展监测。监测内容和方法（⼀）监测内容抽取代表性城市哨点医院门急诊、重症和死亡病例、代表性口岸（陆路、航空、海港）入境人员的新冠病毒核酸阳性样本，开展新冠病毒全基因组测序，动态监测病毒变异情况，及时发现输入和本土流行的新变异株和潜在重要变异株，评估不同变异株的临床分型差异，研判新变异株和重要变异株的致病力和免疫逃逸能力，及其对现有核酸检测试剂及疫苗效力的影响。（⼆）监测地点选取监测内容和方法本土病例监测。每个省选择不少于3个城市（含1个省会城市和2个地级市），每个城市选择1-2个具有新冠重症病房的三甲综合医院或新冠定点医院作为哨点监测医院。鼓励其他市州开展哨点监测。输入病例监测陆路口岸（5个）：广东深圳、云南瑞丽、内蒙古满洲里、黑龙江绥芬河/黑河、新疆霍尔果斯、广西防城港/崇左；航空口岸（7个）：广东广州、四川成都、重庆、陕西西安、北京、福建厦门、上海；海港口岸（5个）：海南三亚、辽宁大连、山东青岛、浙江宁波、天津。（三）样本采集原则监测内容和方法本土病例监测每个哨点医院每周采集15例门急诊新冠病例、10例重症和所有因新冠死亡病例核酸阳性样本，原则上每个哨点医院每周采集重症病例新冠病毒核酸阳性样本不少于5份。输入病例监测上述入境口岸采用方便抽样的方法每周抽样采集10例新冠病毒核酸阳性样本，原则上10份样本尽可能代表不同来源国家、且相对均匀分散于一周的不同日期。上述监测需在新冠病毒核酸阳性样本采集后的一周内完成病毒全基因组测序工作，病例采样时间和序列上报时间不应超过1周，在完成测序后的48小时内将测序数据通过报送国家疾控中心病毒病所。监测信息报告信息表各市州疾控统一将序列及信息表发给省疾控中心，省疾控汇总初