专科专病临床研究数据库共性技术平台需求

专科专病临床研究数据库共性技术平台需求一、技术要求1.1技术要求系统建议采用B/S架构，纯WEB版产品界面，无需安装插件，无需下载客户端；支持与医院信息系统数据的批量定时同步；支持物理服务器和虚拟服务器部署方案；系统支持结构化统计，如标准术语数量、标准术语类别；1.2性能要求产品稳定性要求：系统24小时不宕机；服务器的平均无故障运行时间不少于一年(该故障定义为：导致客户无法进行正常操作、存在一个或多个功能无法实现)；数据检索时间：病历查询，平均响应时间小于3秒；多维度查询，病历记录总数据达200万以上，查询平均响应时间小于3秒；系统性能应满足用户的要求，稳定、可靠、实用。人机界面友好，输出、输入方便，图表生成美观，检索、查询简单快捷。二、功能要求2.1科研数据采集2.1.1采集方式支持批量数据采集完成对数据的采集工作。支持参照已定义的数据采集规范标准，完成批量数据采集工作；支持批量数据接收服务：通过批量数据接收服务在中心端完成数据缓存；支持数据预处理：将数据按批存储在采集工具里并逐行进行数据清洗。支持数据分发服务：将预处理完成的增量数据导入科研数据中心。2.1.2采集范围支持以患者为单位，整合患者特征中医数据、病种中医数据、治疗方案与费用中医数据等形成中医数据中心；支持存储患者就诊全过程中医数据；支持存储基于中医数据标准治理后的结构化中医数据；支持存储基于中医数据标准构建的符合临床研究维度的中医数据表；2.1.3数据内容支持以患者为单位，整合患者特征数据、病种数据、治疗方案与费用数据等形成数据中心；支持存储患者就诊全过程数据；支持存储基于数据标准治理后的结构化数据；支持存储基于数据标准构建的符合临床研究维度的数据表；支持存储通过eCRF科研表单、随访管理系统采集的数据；支持外部数据的整合；支持对多种临床数据的采集，包括但不限于患者基本信息、临床诊疗病史信息、临床诊疗病史信息、首次病程记录、日常病程记录、检验记录表、检验明细表、入院登记信息、出院登记信息、住院费用发生明细表等；2.2科研数据中心RDR构建中医科研数据中心，采集和存储全院各个业务系统科研相关中医数据，为临床研究者最大化提供临床中医数据资源。为了保证科研项目的信息完整，除了患者诊疗信息，系统应支持对患者的随访信息、科研样本信息和科研项目信息进行收集。2.2.1数据存储支持结构及非结构等多样化的数据存储方式，支持结构化数据、文本类数据存储；支持快速构建不同主题的数据库；2.2.2科研指标管理支持对数据集进行分类和管理；支持对数据集随时进行补充和调整、修改、删除等设置；支持从全量指标和专科指标两个层次提供多病种专科指标集分类管理，包括但不限于技术指标和业务指标；支持提供指标目录，可以快速实现对所有应于临床数据中心的指标字段的维护；支持对多种数据项的多样化设置及管理，丰富科研指标体系和指标维度；支持将业务指标按照研究标准转化为研究指标；支持根据不同需求和研究方向不同选取不同的指标集；支持科研数据值域和临床数据值域的代码映射和转化功能；2.2.3数据建模支持以临床科研通用数据模型（commondatamodel,CDM）管理、存储科研样本数据；支持使用CDM模型的指标目录维护所有对应于临床数据中心的医疗事件模型的字段；支持对CDM模型进行扩充；支持以CDM模型为基础对临床科研模型进行全局、专科、队列模型分层；支持支持对通用中医数据模型等多种中医数据模型的管理；支持中医基于专病库权限控制、数据去隐私化等设置，保证数据安全；能够对不同权限用户进行权限配置，不同科室的用户可以查看特定专病库的数据；2.2.4第三方数据接入管理支持开放接口以便未来为不同的研究课题、项目和其他数据分析提供数据；2.2.5权限安全管理支持角色管理，包括角色的创建，角色权限设置等功能；支持设置角色权限的增加、删除和修改管理，可以对不同用户、不同角色配置不同的功能权限和专病库开放权限。2.3数据治理系统2.3.1后结构化处理支持自定义待结构化的实体以及实体所属业务分类；支持提供可视化的实体管理功能，允许对接来自于病历非结构化文本，并提供默认主动式的实体提取工具从文本中匹配指标数据；支持识别文本中的症状、影像所见、患者结局等术语、日期、数字等实体，并通过识别实体关系来判别文本中实体的关联；在对相关实体和实体关系识别和处理之后，支持通过映射将相同、相似的实体和实体关系映射到所有文本中，以便对同类型的文本进行自动处理；支持在线自定义否定语义、排除语义；支持后结构化处理模型的在线调试，支持通过输入调试样本文本实时反馈后结构化结果；支持提供后结构化结果的验证功能，可以针对验证结果逐步完善语义处理模型准确率；支持基于专病库样本为验证范围的过滤功能，能够针对性的进行校验；支持在校验功能中对语义处理的溯源，并以明显标识并指示实体在源文本中的上下文位置；支持人工验证功能对后结构化处理结果，支持对结果进行正误判定；支持模型的二次验证功能，对模型调整后的后结构化处理结果进行多次评判；2.3.2术语库支持参照国内、国际临床术语标准，构建基于标准的术语体系；支持以目录树的形式展示术语库体系，并按术语所属业务领域进行划分；支持基于关键字配置、以分词匹配算法对数据进行术语归一化处理；支持术语的的在线校验功能；支持对术语归一化后结果校验，支持通过筛选具体术语查看匹配情况2.3.3数据脱敏支持后台隐藏患者的个人信息，包括患者姓名、身份证号、住址、手机号等敏感数据；支持在需要定位到具体患者时，可以在申请通过后，用患者就诊号或者EMPI号来定位具体患者；2.4专病库管理系统在科研数据中心的基础上构建面向不同研究方向的专病数据库支持集成不同病种的患者样本，并以专病库的形式收集、预览、共享专病样本数据；支持专病库指标按业务域分组查看功能；支持用户在权限许可情况下对系统内用户的专病库构建情况进行概览，支持以可视化的方式展示专病库数据的分布、来源、临床特征等数据；支持对专病库名称、所属专科、项目标签进行说明及设置；支持专病库使用权限控制，管理专病库所属用户；对各用户角色的权限在系统功能进行统一配置管理；支持设置专病数据库的纳排条件，实现符合条件的患者定期收录进专病库；支持全文及精确入组规则设置功能，将符合条件的患者加入专病数据库；支持按照病人信息、临床信息等维度在设置纳排规则时同步规则预览，并实时统计样本数量；支持以二维表形式预览符合入组条件的患者明细数据；支持专病视图预览，支持通过饼状图、柱状图、散点图、箱图、词云、折线图等形式对数据进行图形化展示；2.5科研队列管理支持根据专病库定义科研队列，各队列按专病进行分组，并提供通过切换专病库查看不同专病研究队列；提供对队列的管理功能，包括增加修改和删除；支持队列定义功能：能添加队列，通过动态调整数据集中指标项目的方式，进行队列人群的定义，可以通过与或非逻辑任意添加入组规则；支持快捷入组条件设定和复杂入组条件相结合的方式收集入组患者；支持对入组规则历史追溯的功能，支持通过点击历史入组条件进行样本查询；支持以可视化方式查看队列数据质量，对队列中的指标缺失度比率以柱状图的形态进行展示，按缺失度由低向高排序，并将完全为空或非缺失的指标以明细方式分组显示；支持使用直方图、饼图、环形图、折线图等形式查看队列指标集中的值域分布；支持动态定义、添加、删除值域分布视图中的指标项目，可对待显示的可视化指标进行组合展示；支持动态切换可视化值域视图中的直方图和环形图表现形式；支持按队列定义此队列下的指标集，可以对指标集进行增删改查等操作；支持自定义队列指标集中的指标名称；支持在已建指标集列表上显示当前数据量、指标提取状态等；支持按实际研究需要将队列指标集进行分组，并支持自定义分组名称；支持以拖拽的方式增添队列指标集，支持拖拽方式对指标集分组进行排序；支持从队列中重复拾取不同名称的指标项目，支持重复设置指标集分组；支持细粒度定义队列中的指标对应样本数据提取方式，提取规则包括但不仅限于设置最大值、最小值、平均值等；支持细粒度定义队列中指标集的事件来源，并可手工修改原队列指标的对应事件项目；支持将调整规则后的队列指标集特征数据多次生成，支持选择不同特征指标进行数据导出；支持指标集导出前对数据集进行全量预览；支持克隆已有的队列指标集，并自动对复制的指标集重命名；支持队列指标集中指标的统计类型设置，包括但可不仅限于连续变量、二分类变量、离散变量、有序多分类变量等；支持对队列指标集样本数据的假设检验，包括但可不仅限于正态性检验、离群点检验、总体参数比较、比例检验等；支持对队列指标集样本数据的统计描述，包括但可不仅限于频率分布、疑似异常值分布、一般性统计等描述；支持对队列指标集样本数据的缺失值填补，包括但可不仅限于补零、均值、中位数、众数、临近值、固定值等；支持通过可视化图表展示各指标集在空缺值填补后的表现；支持队列组内及队列组件样本特征数据对比功能，并在线生成基线特征提取报告；2.6大数据检索平台系统提供一套灵活强大的数据查询筛选工具，提供多维度、多病种符合专病模型的检索功能，可以对所有维度数据进行灵活地组合需要查询筛选的数据项及条件，能够从病历、诊断、用药医嘱、检验、检查报告、体征等结构化及非结构化文本中提取检索点位，个性化定制专病检索模型。支持通过入选和排除等集合运算实现研究人群的精确筛选，实现自动发现满足条件的新病人并自动入组，实时精准从海量病历中定位研究人群。支持通过输入任意诊疗关键字进行全文检索；支持检索时即时提示联想词条供快捷选择输入；支持指定检索词条所属具体诊疗业务过程；支持通过输入逻辑符组织各结构化指标的关系；支持通过目录树的方式选择诊疗过程中产生的各数据指标；支持通过and/or/分组的方式进行检索指标的逻辑组合；支持对日期、数值等不同数据类型的指标进行包含、不等于等关系设置；支持对日期、数值等不同数据类型的指标值进行差异化录入；支持对性别、诊断、检验等指标进行语义化输入；支持以病历模式、病人模式、表格模式进行检索检索展示；支持默认使用“并且”的方式理解指标关系；支持将全文检索输入的条件理解并转化为高级检索逻辑关系的过程；支持全文检索过程中对输入指标进行递进式联想；支持检索结果表格根据检索指标进行动态拓展；支持高级检索过程的值域控件跟随指标类型动态变化；支持对检索条件的分组后逻辑进行排除，进行反向条件检索；支持对需纳入人群的检索条件进行记录、调出、管理；支持对检索结果一键导出为excel格式；支持动态监测检索结果指标项目，并自行转化为表格结果列以及导出项目；支持对导出项目进行手工调整；支持默认通过基础信息、检验、用药及诊断几个大的维度观察数据分布；支持通过饼状图、柱状图、散点图、箱图、词云、折线图等形式对数据进行图形化展示；支持基于术语库归一化治理之后的同义词检索；支持检索平台全局检索词条的实时统计；支持对检索平台访问量的在线实时统计；支持对结构化数据和非结构化数据的检索；支持根据操作者权限对检索结果的结果项目进行控制；支持对检索历史进行实时记录，并通过检索历史进行回溯；支持对检索条件模板进行收藏，并可以对收藏进行增删管理；项目实施要求（1）实施时间：自合同签订之日起3个月内完成开发、安装、调试并交付使用；（2）实施地点：招标人指定地点。（3）投标方需提供项目详尽的实施方案和实施进度表。（4）投标人应在系统实施方案