临床微生物学检验：4-微生物的分类与命名

微生物的分类与命名

M的分类与命名对M的分类鉴定,特别是新种属的分类鉴定有着十分重要的意义.

一、微生物在生物分类学中的地位

微生物包括细菌、支原体、螺旋体、立克次体、衣原体、放线菌、真菌和病毒共8类。其中前6类为原核生物界（单细胞)，真菌为真核界(单细胞或多细胞)，病毒属病毒界(非细胞形态微生物)。

（一）原核生物界分类等级依次为：界（kingdom)、门（divisions)、纲（classes)、目（orders)、科（families）属（genera）、种（species）。

（二）真菌界原核生物与真核生物细胞结构比较

原核生物真核生物核无核膜、核仁、只有拟核有核膜、核仁和染色体细胞器无线粒体、细胞器不完善有完整细胞器，有线粒体细胞壁肽聚糖为基本成分无肽聚糖细胞分裂二分裂有丝分裂、芽生（三）病毒界病毒界的分类等级不同，病毒的最高分类等级为科，依次为属、种。科、属均用首写字母大写的斜体字表示，而种名则用首写字母小写的正体字表示。如PicornaviridaeEnteroviruspolioIvirus,HerpesviridaeSimplexvirusherpessimplex2virus。

二、细菌的分类单位、系统和命名

（一）细菌的分类单位和命名常用的分类单位是科、属、种。种是细菌分类的基本单位。在同一菌种内还可分组。差异较明显的称亚种(subspecies)和变种(variety）,现不主张使用变种;差异微小的为型（type)，不同来源的同一种细菌称为该菌的不同菌株。具有该种细菌典型特征的菌株称为该菌的标准菌株(standardstrain）或模式菌株(typestrain)，在细菌的分类、鉴定和命名时都以标准菌株为依据，也可作为质量控制的标准。

命名：常采用拉丁文双命名法（林奈双命法），即两个拉丁字组成，前一字为属名，用名词，首字母大写；后一字为种名，用形容词,首字母小写用斜体字，中文译名则种名在前,属名在后。

Staphylococcusepidermidis；

Mycobacteriumtuberculosis；

Salmonellatyphi。亚种的名称是由三名组成；如S.aureussubsp.anaerobius,译名金黄色葡萄球菌厌氧亚种.

有时泛指某一属细菌，而不特指其中某个菌种，则可在属名之后加上sp.复数用spp.sp代表菌种（species)，如Staphylococcussp、Mycobacteriumsp、Salmonellasp。细菌的命名由国际细菌命名法规所决定。凡有关细菌研究的学术论文必须使用细菌命名批准目录中正式的细菌学名。凡亚种以上的分类需按命名法规的规定，亚种以下的分类则用细菌的血清群，血清型、毒素抗原性、噬菌体型与药敏鉴定等，其命名不受法规的约束。

（二）、细菌的分类系统国际上普遍采用伯杰（Bergey)分类系统。临床上也有采用ＣＤＣ系统分类。

该系统由美国疾病控制和预防中心(centerfordiseasecontrolandprevention)使用核酸杂交和核酸序列分析结果编排，对许多菌属的分类均有所修改，并增加了许多新的菌种。

三、细菌的分类方法（一）生理学与生物化学分类法

目前，以生理生化作细菌分类广泛采用方法有两种：１、传统分类法——生物的基本性质（主要的、次要的）。２、数值分类法——与传统主次原则不同，而是根据“等重要原则”进行分类。

（二）遗传学分类法

遗传学分类是根据细菌的核酸、蛋白质等在组成上的同源程度而分类。该分类具有下述优点：①、对细菌的“种”有一个较为一致的概念；②、使分类不会出现经常性和根本性的变化；③、根据分类法，可制定可靠的细菌鉴定方案；④、有利于了解细菌的进化和原始亲缘关系。１、ＤＮＡＧ＋Cmol%测定

２、核酸同源值（ＤＮＡ杂交）测定３、核蛋白体ＲＮＡ碱基序列的测定

四、病毒的分类病毒的分类是将自然界存在的病毒按其生理生化特性相似性和亲缘关系加以归纳分类，国际病毒分类委员会（ＩＣＴＶ）对脊椎动物病毒提出的分类原则是：

１、核酸类型、结构与分子量；

2、病毒的形状大小；３、病毒的形态结构；４、对乙醚或氯仿的敏感性；５、Ａg性；６、在细胞培养物上的生长特性；７、对理化因素的敏感性；８、宿主种类、传播方式和媒介种类，流行病学特点及临床病理学特征。

与人类感染有关的病毒：ＤＮＡ－Ｖ：微小V科、乳多空V科、腺v科、嗜肝Ｖ科、疱疹Ｖ科、虹彩Ｖ科、痘Ｖ科。ＲＮＡ－Ｖ：小核糖核酸Ｖ科、嵌杯样Ｖ科呼肠Ｖ科、披盖Ｖ科、黄Ｖ科。正粘Ｖ科、副粘Ｖ科。沙粒样Ｖ科、弹状Ｖ科、冠状Ｖ科、本扬V科和逆转录Ｖ科。

传统分类：常根据virus的传播途径和临床特点而将病毒分成。１、呼吸道Ｖ：流感Ｖ、副流感ｖ、风疹Ｖ、腺Ｖ科、腮腺炎Ｖ、呼吸道合胞Ｖ、冠状Ｖ、呼肠孤Ｖ；２、肝炎病毒：甲、乙、丙、丁、戌型肝炎Ｖ；３、肠道病毒:小核糖核酸V科:poloiv、coxsackiev、ECHOv；

４、痘类Ｖ：天花Ｖ、类天花Ｖ、牛痘Ｖ、传染性软疣Ｖ。主要由呼吸道飞沫传播与皮肤接触传播，引起皮肤和粘膜的病变；５、疮疹Ｖ：水痘一带状痘疹Ｖ、巨细胞Ｖ、ＥＢ病毒和猴B病毒。主要引起皮肤病变，大多有潜伏感染形式和肿瘤有关；

６、虫媒Ｖ：乙型脑炎Ｖ、森林脑炎Ｖ、登革热Ｖ、黄