第四章 病毒基因组

第四章病毒基因组临床生化教研室病毒（virus）的概念是一类比较原始的、有生命特征的、能够自我复制的、严格细胞内寄生的非细胞生物，是结构最简单、最微小的生命形式。病毒的四种基本结构成份：①核酸(DNA或RNA)②衣壳。③被膜④病毒颗粒中的其它内容物。第一节病毒基因组的一般特征一、病毒基因组的组成和分类病毒基因组有4种核酸类型：双链DNA、单链DNA、双链RNA及单链RNA。一个或多个核酸分子（即分段基因组）。还有线状和环状分子之分。国际病毒分类委员会（ICTV）根据病毒的基因组组成及复制方式，病毒分为如下几类：

DNA病毒（DNAViruses）第一组：双链DNA病毒（dsDNAViruses）第二组：单链DNA病毒（ssDNAViruses）RNA病毒（RNAvirus）

第三组：双链RNA病毒（dsRNAViruses）第四组：正链RNA病毒（(+)ssRNAViruses）第五组：负链RNA病毒（(-)ssRNAViruses）DNA与RNA逆转录病毒（DNAandRNAReverseTranscribingViruses）

第六组：RNA逆转录病毒（RNAReverseTranscribingViruses）第七组：DNA逆转录病毒（DNAReverseTranscribingViruses）亚病毒因子（SubviralAgents）

卫星（Satellitesviruses）类病毒（Viroids）朊病毒（Prions）二、病毒基因组的大小及碱基组成病毒基因组大小范围在1.5×103bp（nt）～3.6×106bp（nt）之间；可编码5~数百个基因。痘苗病毒科最大：3.6×106bp，编码数百个蛋白质；乙型肝炎病毒最小：仅3.2Kb，仅编码6个蛋白质。三、病毒基因组的结构特点

5′端的帽子结构（m7GpppGmp）—多数单链RNA病毒有此结构。3′端poly(A)尾结构—RNA病毒末端结构，对RNA具有保护作用。（一）帽子和poly（A）尾结构（二）粘性末端

是指病毒基因组双链DNA分子两端具有能够互补的单链DNA部分。带粘性末端的病毒双链DNA基因组形成环状结构或二聚体环化聚合末端正向重复序列

是指双链DNA分子两端有一段相同的核苷酸序列。

末端反向重复序列

是指病毒基因组两端的反向互补重复序列。

长末端重复序列（longterminalrepeat，LTR）

逆转录病毒基因组RNA在逆转录后生成的双链DNA中，两端有LTR结构。逆转录病毒基因组利用LTR中的重复序列形成环状结构。病毒基因组重叠基因ORF1ORF2ORF3ORF4重叠基因病毒基因组的重叠基因重叠基因（overlappinggene）

很多病毒基因组的一段DNA序列有两个或两个以上的开放读码框架，可以编码两种或两种以上的多肽链，称为重叠基因。分段基因组（segmentedgenome）

是指病毒基因组由数条不同的核酸分子组成，分段基因组多见于RNA病毒，由于分段基因组易发生重组，故病毒容易变异。第二节DNA病毒基因组

DNA病毒基因组又分为单链DNA和双链DNA两种，它们以线状或环状分子存在。1.双链线状DNA病毒

2.双链环状DNA病毒：乙型肝炎病毒（hepatitisBvirus，HBV）二、单链DNA病毒基因组一、双链DNA病毒基因组（二）HBV基因组结构HBV基因组长约3.2Kb，是不完全双链环状DNA分子，有部分单链区。长链（L）与病毒mRNA互补，为负链，大小为3.2Kb，短链（S）为正链，5′端固定，3′端不确定，链长度为L链的50%～100%。HBV基因组上有4个已知的开放读码框架（ORF），都在L（－）链上，S、C、P和X；分别编码外膜蛋白、核壳蛋白、聚合酶及X蛋白。6个ORF相互重叠，HBV基因组序列的利用率高达150%～200%。正负DNA链的5‘端互补区域各有TTCACCTCTGC构成的正向重复序列（DR），分别称DR1和DR2，DR在病毒基因组复制及维持基因组环状结构中起重要作用。第三节RNA病毒基因组RNA病毒基因组为线状单链或双链，有一个RNA分子或多个RNA分子（即分段基因组）。正链RNA（+RNA）病毒：正链RNA病毒基因组均为线状RNA分子。基因组序列与mRNA相同负链RNA（-RNA）病毒：几乎负链RNA病毒基因组均为线状。基因组序列与mRNA互补双链RNA病毒：流行性感冒病毒的基因组

流行性感冒病毒（influenzavirus），简称流感病毒，属正粘病毒科。根据病毒核衣壳蛋白（NP）及基质蛋白（M）的特征，分甲（A）、乙（B）和丙（C）型。根据病毒颗粒表面的血凝素（Hemagglutinin,HA）和神经氨酸酶（Ne