浙江大学生物化学与分子生物学笔记8-蛋白质结构与功能-PPT幻灯片

蛋白质结构与功能研究方法X-Ray衍射NMR(核磁共振)MolecularModelingMutation/Function(分子生物学)结晶困难分子量不能太大理论不太完善费时费力蛋白质结构与功能研究方法1、免疫体系中分子间的识别机制2、DNA与蛋白质的相互作用3、蛋白水解酶与疾病4、膜蛋白、受体与信号转导5、酶抑制剂与药物开发本章主要内容1.免疫体系分子的相互识别1免疫体系分子的相互识别两种T细胞上的MHC分子是特异性识别的关键两种不同的MHC分子TCR识别抗原TCR如何识别抗原MHC1分子的结构容纳抗原的口袋MHCI分子结构2.蛋白质与DNA的相互作用Helix-Turn-HelixHelix-Loop-HelixZinc-fingerLeucinezipper非特异性:特异性:Histones2蛋白质与DNA的相互作用核小体上DNA与组蛋白的接触点核小体的组蛋白与DNA核小体上的DNA碱基组成分布核小体的DNA碱基组成分布蛋白质与DNA的相互作用Helix-turn-helix，HTHHelix-turn-helixHTH的分子识别机制HTH的分子识别机制HLH结构特征HLH的结构特征Leucine-zipper的结构特征Lwucine-zipper结构特征Alphahelix截面图上Ca的位置LeucineZipper蛋白的剪刀型结合模式LeucineZipper蛋白与DNA的结合模式Zinc-finger蛋白结构特征Zinc-finger蛋白结构特征研究蛋白在DNA上的结合位点的FootPrintingFoot-Printing3.蛋白水解酶与人体疾病Cardiovasculardieseases心血管疾病HemophiliaA/B血友病Programmedcelldeath/appotosis细胞凋亡Alzheimerdisease痴呆Cancermetastasis癌细胞转移Pulmonaryemphysema/pancreatitis/arthritisParasitedisease:malaria/Tcruzain疟疾InfluenzaA&AIDS甲型流感与爱滋病3蛋白水解酶与人体疾病血栓形成与消除血栓形成与消失LifeCycleofInfluenzaAvirus甲型流感病毒生活史A型流感病毒的H抗原蛋白的结构域受蛋白水解酶活化后才有感染细胞的能力H抗原蛋白的结构域AIDS病毒生活史有个必须的ProteaseAIDS病毒生活史癌细胞的转移需要蛋白水解酶的帮助癌细胞的转移4.膜蛋白、受体与信号转导4膜蛋白_受体与信号转导白介素-6的信号转导IL-6的信号转导FGF的信号转导几条信号转导途径5.酶抑制剂与药物开发5酶抑制剂与药物开发真正意义上的抗流感病毒药物ZanamivirSialicacidGS4104真正意义上的抗流感病毒药物金刚烷(Amantadine)的结构作用于MatrixProtein2(M2)蛋白Amantadine结构作用于DNA聚合酶的抗病毒药物病毒DNA聚合酶的抑制剂，真核生物的DNA聚合酶不敏感抗病毒药物抗AIDS病毒

的药物（I）抗AIDS药物I核苷类抗AIDS药物作用原理核苷类药物作用原理HIVprotease

HIVprotease作用于AIDS病毒专有的蛋白水解酶抗AIDS病毒的药物（II）Viracept(Nelfinavir,Agouron,1998)Crivivian(Indinavir,Merck,1997)Invirase(Sequinavir,Roche,1995)Norvir(Ritonavir,Abbot,1997)抗AIDS药物II抗病毒感染药物的开发抗病毒感染抗癌药物的研究动态MMPinhibitorcdk2/cdk4inhibitorPoly(ADP-ribose)polymerase(PARP)inhibitorGlycinamideRibonucleotideformyltransferase(GRFT)inhibitorVDGFreceptorblocker等等，等等抗癌药物研究动态6.新方向与新技术1、Proteomics2、Proteinchips3、Display/molecularevolutionengineering4、Two-hybridsystem5、Geneknockoutmice

新研究方法与技术WhatisProteomics?Proteomics什么是生物芯片技术？以微点阵排列技术（MicroarrayTechnology）将生物大分子固定到适当的固体载体上，方便各种生化和分子生物学的操作。生物芯片技术蛋白质芯片筛选新药的原理受体、酶的微点阵与中草药抽提物反应后再与受荧光标记的配体或底物结合以激光进行检测不出现荧光的点表明中草药样品中含有与这些点上的蛋白质相互作用的物质，因此是作用于这些位点的新药候补荧