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文档简介
真核生物RNA转录和后加工
1/39转录:以DNA为模板合成RNA过程。2/39参加转录物质原料:NTP(ATP,UTP,GTP,CTP)模板:DNA酶:RNA聚合酶(RNApolymerase,RNA-pol)其它蛋白质因子3/39真核生物RNA聚合酶
——三种RNA-pol
I、II、III4/39真核生物RNA聚合酶特征类别IIIIII细胞内位置核仁核质核质转录产物除5S-rRNA外其余rRNAhnRNAtRNAsnRNA5S-RNA占RNA转录总量50-70%20-40%10%对α-鹅膏蕈(xun)碱敏感性耐受高度敏感中等敏感(物种特异性)注:鹅膏覃碱是真核生物RNA-pol特异性抑制剂5/39真核生物转录过程(一)转录起始真核生物转录起始上游区段比原核生物多样化,转录起始时,RNA-pol不直接结合模板DNA,而是借助众多转录因子,其起始过程比原核生物复杂。6/39真核生物转录起始是在转录因子(TF)帮助下,RNA聚合酶识别结合转录起始点上游DNA序列(开启子),生成起始前复合物。7/391.转录起始前上游区段顺式作用元件(cis-actingelement)顺式作用元件是指与结构基因串联特定DNA序列,是转录因子结合位点,它们经过与转录因子结合而调控基因转录准确起始和转录效率。转录起始点TATA盒CAAT盒GC盒AATAAA转录终止点外显子翻译起始点内含子OCT-1OCT-1:ATTTGCAT八聚体8/392.转录因子能直接或间接识别和结合转录上游区段DNA蛋白质,统称为反式作用因子(trans-actingfactors)。反式作用因子中,直接或间接结合RNA聚合酶,则称为转录因子(trans-criptionalfactors,TF)。9/39参加RNA聚合酶Ⅱ转录转录因子(TF)Ⅱ转录因子亚基和(或)分子量(kDa)功效TFⅡDTBP,38结合TATA盒TAF辅助TBP-DNA结合TFⅡA12,19,35稳定ⅡD-DNA复合物TFⅡB33促进RNA-polⅡ结合TFⅡF30,74解螺旋酶TFⅡE57(
),34(β)ATPaseTFⅡH蛋白激酶,使CTD磷酸化10/393.转录起始前复合物
(pre-initiationcomplex,PIC)
真核生物RNA-pol不与DNA分子直接结合,而需依靠众多转录因子。11/39TBPTAF
TFIIH12/394.拼板理论(piecingtheory)
一个真核生物基因转录需要3至5个转录因子。转录因子之间相互结合,生成有活性和专一性复合物,再与RNA聚合酶搭配而有针对性地结合、转录对应基因。13/39(二)转录延长
真核生物转录延长过程与原核生物大致相同,但因有核膜相隔,没有转录与翻译同时现象。RNA-pol前移处处都遇上核小体。转录延长过程中能够观察到核小体移位和解聚现象。14/39转录延长中核小体移位RNA-PolRNA-PolRNA-Pol核小体转录方向15/39(三)转录终止
终止过程:酶停顿添加底物→→释放RNA链→→酶解离终止反应…杂合双链氢键断裂,…重新形成双螺旋,酶解离。终止子(terminator):在转录过程中,提供转录终止信号RNA序列真正起终止作用是RNA序列,与开启子不一样16/3917/39真核生物转录后修饰Post-transcriptionalModification18/39在细胞内,原初转录产物经过一系列改变转变为成熟RNA分子过程,称为转录后加工(post-transcriptionalprocessing)19/39RNA加工反应分类加工反应举例剪切使rRNA和tRNA从多顺反子转录本中释放,终止真核生物mRNA转录内切降解加工rRNA和tRNA产生成熟末端核酸转移转移CCA到一些tRNA3’末端碱基化学修饰mRNA和rRNA甲基化,tRNA和snRNA普遍碱基修饰核酸切除和替换tRNA鸟嘌呤过分修饰产生二氢尿嘧啶(Q)和假尿嘧啶(W)加帽在真核生物mRNA5’末端加上7-甲基鸟嘌呤多腺苷酸化在大多数真核生物和少数细菌mRNA3’末端加上多腺苷酸尾巴剪接(转接)去除大多数内含子(经常是顺式,偶然反式)剪接(连接)去除tRNA内含子编辑经过碱基修饰改变mRNA所携带信息,在编码区中插入或缺失碱基引自《AdvancedMolecularBiologiy:AConciseReference》tabl27.1,RichardM.Twyman,BIOSScintificpublisherslimited,199820/39一、mRNA转录后加工(一)首尾修饰1.5´-端加帽:m7GpppG——2.3´-端加尾:多聚腺苷酸(polyA)
3.剪接:外显子和内含子、断裂基因(interruptedgene)4.编辑
21/395`pppN5`pNppipppGpi5`GpppN5`m7GpppN(S-腺苷甲硫氨酸)CH3磷酸酶甲基化酶mRNAmRNAmRNAmRNA5`-末端帽子生成
——先于剪接加工注:帽子结构中G未甲基化,翻译效果差,但稳定性不变mRNA鸟苷酰转移酶22/39帽子结构23/393`-末端多聚腺苷酸合成先于剪接加工polyApolymerase催化,转录后修饰点序列(AAUAAA)提供信号普通长度为100~200个腺苷酸
24/39(二)mRNA剪接1.hnRNA和snRNAhnRNA——
成熟mRNA前身(含非编码内含子)
snRNP(smallnuclearribonucleoprotein,小核核糖核蛋白体)——
由snRNA和核内蛋白质组成,作为RNA剪接场所。25/39断裂基因(splitegene)
真核生物结构基因,由若干个编码区和非编码区相互间隔开但又连续镶嵌而成,去除非编码区再连接后,可翻译出由连续氨基酸组成完整蛋白质,这些基因称为断裂基因。非编码区A~G编码区1~726/392.外显子(exon)和内含子(intron)
外显子在断裂基因及其初级转录产物上出现,并表示为成熟RNA核酸序列。内含子隔断基因线性表示而在剪接过程中被除去核酸序列。27/39鸡卵清蛋白基因hnRNA首、尾修饰hnRNA剪接成熟mRNA鸡卵清蛋白基因及其转录、转录后修饰
28/393.内含子分类I:主要存在于线粒体、叶绿体及一些低等真核生物rRNA基因;II:也发觉于线粒体、叶绿体,转录产物是mRNA;III:是常见形成套索结构后剪接,大多数mRNA基因有这类内含子;IV:是tRNA基因及其初级转录产物中内含子,剪接过程需酶及ATP。29/394.mRNA剪接
——除去hnRNA中内含子,将外显子连接。snRNP与hnRNA结合成为并接体。(1)剪接接口(边界序列)——内含子5`-末端GU和3`-末端AG,也即5`GUAG-OH3`。(2)剪接体(splicesome)——由snRNP与hnRNA结合复合体。其功效:致内含子形成套索,并使上、下游外显子靠近。30/39•RNA编辑作用说明,基因编码序列经过转录后加工,是可有多用途分化,所以也称为分化加工(differentialRNAprocessing)。5.mRNA编辑(mRNAediting)——指在转录水平上发生改变RNA编码序列,致一个基因产生不止一个蛋白质加工方式。31/39tRNA加工分成3个阶段
(1)“斩头”,形成5′末端。RNaseP识别二级结构——发夹所组成tRNA(外部引导区)。(2)去尾,形成3′-OH末端。由内切酶和外切酶共同参加。前者识别发夹结构,后者识别CCA序列。
(3)修饰:在前体tRNA一些专一部位碱基需要经过甲基化酶,硫醇酶,假尿嘧啶核苷化酶等作用进行修饰成为特殊碱基,如氨基酸臂上5′4-硫尿苷(4tu),D臂上2甲基鸟苷(2mG),TψC臂上假尿苷(ψ)以及反密码子环上2异戊腺苷(2ipA)
32/39二、tRNA转录后加工tRNA前体TGGCNNAGTGCGGTTCGANNCCDNA33/39RNAaseP、内切酶连接酶34/39tRNA核苷酸转移酶35/39碱基修饰(2)还原反应如:UDHU(3)核苷内转位反应如:Uψ(4)脱氨反应如:A
I如:AAm(1)甲基化(1)(1)(3)(2)(4)36/39三、rRNA转录后加工1.甲基化——先于切割拼接,主要位置在核糖-2`-OH上,约占2%(真核)左右。
真核rRNA甲基化程度比原核高
2.rRNA前体剪切成一定链长rRNA分子;3.rRNA在修饰酶催化下进行碱基修
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