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文档简介

《生化大实验》《生化大实验》1实验课程简介生化大实验是一门综合性的实验课程,教学的目的在于通过对生命物质的分离制备,纯化,分析等综合性实验,在已掌握的基础生物化学理论知识和生化实验常用方法的基本原理、基本操作技术(如滴定、比色、层析、电泳等)的基础上,训练学生的综合实践动手能力,掌握蛋白质、酶、核酸等重要物质的分离、纯化等的测定技术。实验课程简介生化大实验是一门综合性的实验2目录实验一蛋白质含量的测定实验二离子交换法血清纯化实验三离子交换层析法分离血清白蛋白实验四聚丙烯酰胺凝胶电泳测定分子量实验五等电聚焦法测定样品的等电点实验六质粒的分离与纯化实验七扩增目的基因片段实验八酶联免疫吸附实验目录实验一蛋白质含量的测定3实验一蛋白质含量的测定(一)考马斯亮蓝法【实验目的】学习考马斯亮蓝法测定蛋白质浓度的原理和方法。【实验原理】考马斯亮蓝测定蛋白质含量是利用蛋白质染料结合法的原理,定量测定微量蛋白质浓度快速、灵敏的方法。实验一蛋白质含量的测定(一)考马斯亮蓝法【实验目的】4考马斯亮蓝存在着两种不同样色形式,红色棕黑色和蓝色。染料与蛋白质结合后有红色棕黑色和蓝色形式,最大光吸收由变成,测定吸光的增加量,可以测定与其结合的蛋白质的量。

蛋白质与染料结合速度很快,就可以反应完全,并可以稳定,蛋白质染料复合物有很大的消光系数,使得测定蛋白质浓度是灵敏度很高。测定范围为μ蛋白质,微量测定时达到μ蛋白质。此反应反复性好精度高,线性关系好。考马斯亮蓝存在着两种不同样色形式,红色棕黑色5【实验仪器及用品】.标准蛋白液()结晶牛血清白蛋白用稀释到。..考马斯亮蓝试剂:考马斯亮蓝溶于乙醇中,加磷酸,蒸馏水稀释,滤纸过滤。.待测蛋白:人血清,用前用稀释倍。.漩涡混合器【实验仪器及用品】.标准蛋白液()结6.移液管(×),(×),(×)

.分光光度计

.试管×(×)

.量筒(×)

.电子分析天平

.试管架(×).移液管(×),(×),(×)

.分光光度7【实验内容及步骤】一、标准曲线线的绘制取支干净试管,按下表进行编号并加入试剂。以为纵坐标,标准蛋白质年浓度为横坐标,绘制标准曲线。

试剂号试剂标准蛋白液

考马斯亮蓝染液摇匀,小时内以号管为空白对照,在处比色

【实验内容及步骤】一、标准曲线线的绘制8.未知样液的测定

另取一干净试管,加入样品及考马斯亮蓝染液,混匀,室温静置,于波长处比色,读取吸光度。在标准曲线上查找蛋白质浓度。

【注意事项】

、如果测定的要求很严格,可以在试剂加入内测定吸光度,在这段时间内样色很稳定。

、测定中,蛋白质染料复合物会吸附在比色皿上,实验证明可以忽视。测定完后可以用乙醇洗干净。.未知样液的测定

另取一干净试管,加入9【思考题】、根据一下要求选择一种或者几种蛋白质定量测定蛋白质浓度。()样品不容易溶解,但要求结果很准确。()要求在半天内测定个样品。()要求很迅速的测定一系列试管(只)中溶液的蛋白质浓度。、试着比较该法与其他几种方法的优缺点。【思考题】、根据一下要求选择一种或者几种10二、紫外分光光度法测定蛋白质含量【实验目的】.学习紫外分光光度法测定蛋白质含量的原理。.掌握紫外分光光度法测定蛋白质含量的实验技术和使用方法。【实验原理】蛋白质中酪氨酸和色氨酸残基的苯环含有共轭双键,所以蛋白质溶液在具有一个吸收紫外吸收高峰。在一定浓度范围内,蛋白质溶液在最大吸收波长处的吸光度与其浓度成正比,因此可作蛋白质定量分析。二、紫外分光光度法测定蛋白质含量【实验目的】11利用紫外分光光度法测定蛋白质浓度的优点是迅速,简便,不消耗样品,低浓度盐类不干扰测定,因此广泛应用与蛋白质和酶的生化制备。此法的缺点是:对酪氨酸和苯丙氨酸含量差异大的蛋白质测定有一定误差。若样品种含有嘌呤嘧啶等会出现比较大的干扰,此时必须同时测定和吸光度,通过公式校正测定,以消除核酸的影响,而推算处蛋白质浓度。

不同蛋白质和核酸吸收是不同的,即使校正也存在误差,但是可以做为初步测定。该法测定蛋白质的浓度范围为—。利用紫外分光光度法测定蛋白质浓度的优点是迅速12【仪器与试剂】

.紫外分光光度计,比色管(的个),吸量管。

.标准蛋白质溶液:

溶液溶解结晶牛血清白蛋白,稀释到。

.待测蛋白溶液:用酪蛋白配制,浓度在

.

溶液

.试管×(×)

.移液管(×),(×),(×)。【仪器与试剂】

.紫外分光光度计,比色管13【实验步骤】

、标准曲线法

()标准曲线的制作:取只试管按表加入试剂,摇匀。选择光程石英比色皿,在波长测定,以值为纵坐标,蛋白质浓度为横坐标,绘制标准曲线。项目标准蛋白液蒸馏水蛋白质浓度表紫外分光光度法测定蛋白质浓度标准曲线的绘制【实验步骤】

、标准曲线法

(14()样品测定:

配制待测蛋白质溶液,加入蒸馏水,摇匀,测定,从标准曲线中查出蛋白质浓度。

.直接测定法

在紫外分光光度计上,将待测蛋白质溶液加入比色皿,以生理盐水为对照,测定和波长吸光度。按一下公式计算蛋白质浓度:

蛋白质浓度()

(为蛋白质浓度,和分别为蛋白质溶液在和处测得的吸光度值)。()样品测定:

配制待测蛋白质溶液15本法适用于微量蛋白质浓度测定,对盐类混杂的情况比较合适,为简便起见,对混合蛋白质溶液,可用×来表示蛋白质大概浓度。

【注意事项】

由于各种蛋白质的酪氨酸和苯丙氨酸含量不同,显色深浅随不同蛋白质改变,因而本法只适用于蛋白质相对浓度的测定,核酸对结果也有影响,尽管进行了公式校正,但是不同样品干扰成分差异较大,致使紫外吸收法检测的准确性较差。

【思考题】

.

紫外分光光度法测定蛋白质浓度的原理是什么?

.影响紫外分光光度法测定准确性的因素有那些?本法适用于微量蛋白质浓度测定,对盐类混杂的情况16三、酚法测定蛋白质浓度【实验目的】熟悉酚法测定蛋白质浓度的方法。【实验原理】酚法又称法。首先在碱性溶液中形成铜蛋白质复合物,后与磷钼酸磷钨酸作用,产生深蓝色的钼蓝和钨蓝复合物,这中复合物在和处有最大吸收峰,颜色与蛋白质浓度成正比,进而可以计算蛋白质浓度。三、酚法测定蛋白质浓度【实验目的】17【材料、试剂、与器具】.酚(碱性铜试剂):碳酸氢钠和氢氧化钠双蒸水定容为储备液;五水硫酸铜,定容,为储备液。将储备液和储备液混合为溶液,混合后一日有效。.酚:钨酸钠、钼酸钠、蒸馏水、磷酸、浓硫酸在磨口圆底小瓶中混匀后接上磨口冷凝管,回流再加入硫酸锂、蒸馏水及液溴数滴,开口煮沸,冷却,稀释至过滤,至微绿,储存于棕色瓶。临用前氢氧化钠滴定,用酚酞做指示剂,据滴定结果,将试剂稀释至的酸,冰箱保存。【材料、试剂、与器具】.酚(碱性18、标准浓度牛血清蛋白溶液μ

、分光光度计

、刻度吸管(×),(×),(×)

、试管只

、恒温水浴

【操作步骤】

、标准曲线的绘制、标准浓度牛血清蛋白溶液μ

、分光光度计

、刻度吸管(×)19取只试管,按下表加入试剂:试剂牛血清蛋白溶液蒸馏水酚酚第一次第二次总体积取只试管,按下表加入试剂:试剂牛血清蛋白溶20加入试剂后,混匀,室温,在加酚,混匀后,再第二次加,混匀放置。于比色,做标准曲线。

、样品测定

取样品按上表加试剂,处比色,对照标准曲线求出蛋白质浓度。

【思考题】

、酚法测定蛋白质浓度的原理是什么?

、影响酚法测定蛋白质浓度的准确性的因素有那些?加入试剂后,混匀,室温,在加酚,混匀后,再第21四、双缩脲法【实验目的】了解双缩脲法测定蛋白质浓度的原理和方法。【原理】蛋白质含有两个以上的肽键,因此有双缩脲反应。在碱性溶液中蛋白质与+形成紫红色络合物,在波长处有最大吸收。在一定浓度范围内,其颜色的深浅与蛋白质的浓度成正比,可以用比色法定量测定双缩脲法通常用于需要快速但不十分精确的测定。四、双缩脲法【实验目的】22【试剂和器材】

.牛血清白蛋白溶液

.容量瓶(×)

.试管×(×)

.双缩脲试剂:溶解硫酸铜()溶于水中,在容量瓶中加入浓氨水、冷蒸馏水和饱和氢氧化钠,摇匀,室温定容,摇匀备用。在搅拌下加入氢氧化钠溶液,用水稀释到,贮存在内壁涂以石腊的瓶中。此试剂可长期保存。若贮存瓶中有黑色沉淀出现,则需要重新配制。【试剂和器材】

.牛血清白蛋白溶液23.吸量管(,,)

.型分光光度计

【操作步骤】

.绘制标准曲线

取只试管编号,按下表加入试剂,即得种不同浓度的蛋白质溶液。

另取试管只,按、、、、、、编号,号分别加上述蛋白质溶液号为对照,加蒸馏水分别加入,各试管中加双缩脲试剂混匀,紫色出现后,与测定吸光度,闭塞测定法务必在内完成,绘制蛋白质浓度—吸光度曲线。.吸量管(,,)

.24容量瓶编号牛血清蛋白溶液蒸馏水蛋白质浓度稀释至刻度稀释至刻度稀释至刻度稀释至刻度稀释至刻度稀释至刻度容量瓶编号牛血清蛋白溶液蒸馏水蛋白质浓度稀释至刻度稀释至刻度25.未知样品蛋白质浓度的测定

取样品于试管中,加双缩脲试剂混匀,于处测定其吸光度,对照标准曲线,求出蛋白质浓度。

【思考题】

.本法与其他测定蛋白质浓度的方法比较,有那些优点?

.若样品中有干扰测定的杂质,应该如何校正实验结果?.未知样品蛋白质浓度的测定

26实验二离子交换法血清纯化【实验原理】(二乙氨基乙基葡萄糖凝胶)为弱碱性阴离子交换剂。用将型转变为型后,可吸附酸性蛋白。血清中的γ球蛋白属于中性蛋白(等电点为~),其余均属酸性蛋白。~的环境中。酸性蛋白均被吸附,只有γ球蛋白便可在洗脱液中先流出,而其他蛋白则被吸附在柱上,从而便可分离获得纯化的。实验二离子交换法血清纯化【实验原理】27【试剂与器材】..和..().%..无水乙醇.紫外分光光度计.×玻璃层析柱.自动部分收集器【试剂与器材】.28【操作步骤】.预处理称(下称),悬于蒸馏水内,后倾去上层细粒。按每克加的比例,将浸泡于液中,搅匀,静置,装入布氏漏斗(垫有层滤纸)中抽滤,并反复用蒸馏水抽洗至呈中性;再以同上操作过程处理,最后以再处理一次,处理完后,将浸泡于中过夜。【操作步骤】.预处理称29.装柱

()将层析柱垂直固定于滴定架上,柱底垫一圆形尼龙纱,出水口接一乳胶或塑料管并关闭开关。()将()沿玻璃棒倒入柱中至高度,再倒入经预处理并以同上缓冲液调成稀糊状的。待凝胶沉降~高时,开启出水口螺旋夹,控制流速,同时连续倒入糊状凝胶至所需高度。()关闭出水口,待凝胶完全沉降后,柱面放一圆形滤纸片,以橡皮塞塞紧柱上口,通过插入橡皮塞之针头及所连接的乳胶或塑料管与洗脱液瓶相连接。.装柱

()将层析柱垂直30.平衡启开出水口螺旋夹,控制流速滴,使约倍床体积的洗脱液流出。并以计与电导仪分别测定洗脱液及流出液之值与离子强度,两者达到一致时关闭出水口,停止平衡。.加样及洗脱启开上口橡皮塞及下口螺旋夹,使柱中液体缓慢滴出,当柱面液体与柱面相切时,立即关闭出水口,以毛细滴管沿柱壁加入样品(血清,体积应小于床体积的,蛋白浓度以<为宜)。松开出水口螺旋夹使面样品缓慢进入柱内,至与柱面相切时,立即关闭下口,以少量洗脱液洗柱壁~次;再放开出水口,使洗液进入床柱,随后立即于柱面上加入数毫升洗脱液,紧塞柱上口,使整个洗脱过程成一密闭系统。并控制流速,滴..平衡启开出水口螺旋夹,控制流速31.收集开始洗脱的同时就以试管进行收集;每管收集.共收集~管。

.测蛋白以型紫外分光光度计分别测定每管,按公式计算各管蛋白含量。并以为纵坐标,绘制洗脱曲线。

.合并、浓缩将洗脱峰的上坡段与下坡段各管收集液分别进行合并,以()浓缩至所需体积,加入%防腐,于℃保存备用。长期保存时应贮于℃冰箱。

.凝胶的再生在柱上先以洗脱杂蛋白至流出液的<,再以蒸馏水洗去柱中盐。然后按预处理过程将再处理一遍即达再生。近期用时泡于洗脱缓冲液中℃保存;近期不用时,以无水酒精洗次,再置℃温箱烘干,装瓶内保存。.收集开始洗脱的同时就以试管进行收集;每32实验三离子交换层析法分离

血清白蛋白【实验目的】通过对白蛋白纯化的实验,培养学生综合运用离子交换层析手段分离蛋白质纯品的技能。实验三离子交换层析法分离

血清白蛋白【实验目的33【基本原理】离子交换是指液相中的离子与固定相上可解离基团的可逆交换反应。利用这个反应先将要分离的混合物在一定的溶液中解离,而后流经固定相,使之与固定相上的可解离基团进行离子交换,吸附于固定相上,凡不能进行交换吸附的成分,则流出层析柱外。【基本原理】34再根据交换吸附于固定相的各组分解离力度的差别,运用不同的值或不同盐浓度的溶液作流动相,流过层析柱将各组分分别再交换洗脱下来,这样混合物的各组分即被分开,达到分离的目的,此即为离子交换层析。再根据交换吸附于固定相的各组分解离力度的35【试剂与器材】

.磺酰水杨酸.-.():取、混合,用酸度计检查值应为。取该混合液用蒸馏水稀释至。..和.试剂.×层析柱.黑、白比色板【试剂与器材】

.磺酰水杨酸36【操作步骤】

.-纤维素的活化处理:

()取-纤维素(-纤维素的量(干重),一般按样品的蛋白质量计算,大约是蛋白质量的倍)悬于溶液中,浸泡过夜,用锥形瓶盛装;

()次日,在布氏漏斗上轻吸过滤,用蒸馏水洗,直至左右,抽干;

()用浸泡,用蒸馏水洗净,直至左右,抽干;【操作步骤】

.-纤维素37()()浸泡;

()倾去微细颗粒(浮悬),加入()使容积为沉淀体积的倍;

.关闭柱的出口,向柱内加入体积的(),将-悬浮液用玻棒引流连续倒入柱内,当交换剂沉积到底部时,打开流出口,让缓冲液缓慢流出,再倒入更多的悬液,直至整个用量加完为止;

.将柱与储液瓶(内盛同样)连接,流洗几个柱体积的缓冲液,使柱床稳定,并使得流出液为;()()浸泡;

38.纯化γ球蛋白:取实验所保存溶液(γ球蛋白),再对()透析,更换数次,使蛋白质溶液中为;

.将透析后的粗提样品缓缓加在柱床顶部,打开出水口,待样品全部进入柱床后,缓慢流入(),调整流速至,开始用管收集洗脱液,每管,先用磺酰水杨酸检测有无蛋白质流出(蛋白质遇磺酰水杨酸显白色,故用黑色比色板),待蛋白质流出后,迅速收集蛋白液(视收集量和蛋白质的浓度可选择用浓缩)。此不被吸附的即为纯化的γ球蛋白;.纯化γ球蛋白:取实验所保存溶液(γ球蛋39.将收集到的蛋白液合并,紫外分光光度计法(见实验)测定蛋白质的含量,取部分溶液进行纯度鉴定、分子量和等电点的测定实验;

.用完的凝胶柱用流洗干净,再用缓冲液()流洗平衡后可重复使用,但应将顶部吸去并新添,暂不用时可将其倒出,浸于正丁醇的缓冲液中,以防霉变。.将收集到的蛋白液合并,紫外分光光度40.纯化白蛋白取上一实验所保存溶液(白蛋白),再对()透析,更换数次,使蛋白质溶液中为;透析后白蛋白样品上柱后,改用缓冲液()洗涤,流出约(其中含α–及β–球蛋白)后,将柱上的缓冲液面降至与纤维素床表面平齐。然后改用缓冲液()洗脱,并用磺基水杨酸检查流出液是否含有蛋白质。由于纯化的白蛋白仍然结合有少量胆色素等物质,故肉眼可.纯化白蛋白取上一实验所保存溶液(41见一层浅黄色的成分被缓冲液洗脱下来,大约改用洗脱约时,即可试出有蛋白质白色混浊,立即连续收集管,每管滴,此即为纯化的白蛋白液,取其中蛋白质浓度高的两管留作含量测定和纯度鉴定用(视收集量和蛋白质的浓度可选择用浓缩)。用过的–层析柱,应重新再生平衡,方法如下,先用–流洗,再用()流洗平衡即可。暂不用时可将其倒出,浸于正丁醇的缓冲液中,以防霉变。见一层浅黄色的成分被缓冲液洗脱下来,大约改用洗42【注意事项】

.装柱时柱子一定要垂直;

.装柱时应注意,柱床内不得产生界面、气泡,表面要平整;

.柱子用完后一定要用高浓度的盐溶液洗净。【注意事项】

.装柱时柱子一定要垂直;

43实验四聚丙烯酰胺()凝胶电泳测定蛋白质分子量【实验目的】.学习测定蛋白质分子量的原理。.掌握垂直板电泳的操作方法。.运用测定蛋白质分子量及染色鉴定。实验四聚丙烯酰胺()凝胶电泳测定蛋白质分子量【实验目的44【基本原理】聚丙烯酰胺凝胶电泳具有较高的分辨率,用它分离、检测蛋白质混合样品,主要是根据各蛋白组分的分子大小和形状以及所带电荷多少等因素所造成的电泳迁移率的差别。将已知相对分子质量的标准蛋白的迁移率对分子量的对数作图,可得到一条标准曲线。将未知相对分子量的蛋白质样品,在相同的条件下进行电泳,根据它的电泳迁移率可在标准曲线上查得它的相对分子量。也可以用相关分析软件得出回归方程并计算出结果。【基本原理】聚丙烯酰胺凝胶电泳具有较高的45【仪器、材料与试剂】

(一)仪器

.电泳仪

.垂直平板电泳槽

.微量进样器

(二)材料

.:

.血清【仪器、材料与试剂】

(一)仪器

.电泳仪

.46(三)试剂

.凝胶贮液:丙稀酰胺()、双丙稀酰胺(),溶解,定容至。

.缓冲液:加入使之溶解,再加入溶液,混匀后在计上调至,最后加定容至。

.分离胶缓冲液:加入溶液,再加到,。(三)试剂

.凝胶贮液:丙稀酰胺()、双47.电极缓冲液:、甘氨酸、,定容至。

.样品缓冲液:甘油、巯基乙醇、、溴酚蓝、()缓冲液,定容至。

.过硫酸铵()溶液:溶于中(要求现用现配)。

.四甲基乙二铵()。.电极缓冲液:、甘氨酸、,定容至48.染色液:考马斯亮兰,溶于固定液中,混匀。

.脱染液:冰醋酸、甲醇、水,混匀。

.标准蛋白(次高分子量)。

.浓缩胶缓冲液:加溶液,加到,。

.固定液:取甲醇,冰醋酸混匀。.染色液:考马斯亮兰,溶于固定液中49【实验步骤】

.将电泳槽玻璃板洗净,吹干,安装好;用的琼脂糖电泳缓冲液(琼脂糖溶于 电泳缓冲液)封严玻璃板的边和底(保证不漏胶新式电泳槽此步免);

.配分离胶(()+凝胶溶液+蒸馏水,μ溶解,混匀后再加入µ和µ,混匀);

.将配好的分离胶立即倒入凝胶槽内,至凝胶槽高三分之二处,加高的蒸馏水密封。待胶凝固后(约需)倒掉水,用吸水纸吸干;【实验步骤】

.将电泳槽玻璃板洗净,吹干50配浓缩胶(()+凝胶溶液+蒸馏水,μ溶解,混匀后再加入μ和µ,混匀),将配好的浓缩胶

立即倒入凝胶槽(插入梳子不溢出为宜),插入梳子;配浓缩胶(()+凝胶溶液+蒸馏水,μ溶解,51对于不同分子量样品建议使用的凝胶浓度分子量胶浓度()<×××××>×对于不同分子量样品建议使用的凝胶浓度分子量胶浓52.待胶凝固后,拔出梳子,加入电泳缓冲液(淹没胶,但不高于电泳槽);

.样品处理:取标准蛋白或样品µ,加入μ样品缓冲液,混匀,℃水浴加热。

.进样:将处理好的样品µ加入到凝胶孔中,连接电泳仪;

.电泳:打开电源,调整电压至,开始电泳,待样品全部进入凝胶后,将电压调至,待指示剂(溴酚兰)到达凝胶的底部.待胶凝固后,拔出梳子,加入电泳缓冲液(53距离下缘时停止电泳,取下玻璃板,小心地把其中一块玻璃板从凝胶上取下来,测量分离胶的长度及分离胶上沿至溴酚蓝带中心的距离,记录于表中,或者在溴酚蓝带的中心插入一段细铜丝以标出染料的位置,取出分离胶(注意保持胶的完整性);

.固定:将胶置于固定液中浸泡;

.染色:将分离胶浸入染色液中染色;距离下缘时停止电泳,取下玻璃板,小心地把其54.脱染:取出分离胶,先用蒸馏水漂洗一次,浸入脱染液中脱染,室温浸泡凝胶或℃加热使其脱色,更换几次脱色液,直至出现清晰的电泳带为止;

.将胶片小心放置于一块玻璃板上,分别测量分离胶的长度、样品和标准蛋白的泳动距离(分离胶上沿至各蛋白区带中线的距离);

.凝胶照相;.脱染:取出分离胶,先用蒸馏水漂洗一次,浸入脱染液55、电泳迁移率的计算

()不插铜丝的计算方法:

迁移率(蛋白质移动距离染料移动距离)×(染色前胶长脱色后胶长)

()插铜丝的计算方法:

迁移率蛋白质移动距离染料移动距离、电泳迁移率的计算

()不插铜丝56、标准曲线的制作:以各标准蛋白质样品迁移率做横坐标,蛋白质分子量作纵坐标,在半对数坐标纸上作图,即可得一条标准曲线(也可取蛋白质分子量的对数值用一般坐标纸作图)。测得待测蛋白质的迁移率后,由曲线上即可查出其分子量。、标准曲线的制作:以各标准蛋白质样品迁移率做横57【注意事项】

.丙烯酰胺具有中等毒性.常人每天允许的最大暴露量不超过μ,皮肤接触可致中毒,症状为红斑,脱皮,眩晕,动作机能失调,四肢无力等.

.没有聚合的丙烯酰胺不要倾倒到水源附近,一定要催化充分,使之完全聚合,集中处理,实验中全部的胶由专门受过训练的人收集到一起,在一个特殊标明的容器中保存,并进一步催化使之反应完全,最后送交学校危险品仓库,统一处理.

.待测样品如果蛋白含量低于,处理之前应先浓缩至;若高于,处理之前应先稀释至。【注意事项】

.丙烯酰胺具有中等毒性.常人每天58【思考题】

.在不连续体系中,当分离胶加完后,需在其上加一层水,为什么?

.电极缓冲液中甘氨酸的作用?

.在不连续体系中,分离胶与浓缩胶中均含有和,试述其作用?

.样品液为何在加样前需在沸水中加热几分钟?【思考题】

.在不连续体系中,当分离胶加完59实验五等点聚焦测定蛋白质

的等电点【实验目的】.掌握凝胶等电聚焦的基本原理。.学习用等电聚焦电泳测定蛋白质等电点的操作和方法。实验五等点聚焦测定蛋白质

的等电点【实验目的】60【实验原理】蛋白质(酶)、多肽等两性电解质,其所带电荷的数量与性质,随所处环境的而变化。环境低于其等电点时,带正电荷,在电场中向阴极移动;环境高于其等电点时,带负电荷,在电场中向阳极移动;环境等于其等电点时,不带电荷,在电场中不移动。据此,在电泳系统中创造一个由阳极向阴极,由低到高的连续而稳定梯度环境,那么处在这种系统中具有不同等电点的各种蛋白质,将根据所处环境的与其自身等电点的差异,分别带上正电荷或负电荷,并向与它们各自的等电点相当的环境位置处移动,当到达该位置时即停止移动,从而各自焦聚(聚焦),分别形成一条集中的蛋白质区带。这种根据蛋白质等电点的不同而将它们分开的电泳方法称为等电聚焦电泳。电泳后测定其各种蛋白质“聚焦”部位的,即可得知它们的等电点。【实验原理】61(一)仪器

.电泳仪

.垂直平板电泳槽(园盘电泳)

(二)材料

.:

.血清

(三)试剂

.两性电解质,,浓度。

.丙烯酰胺()溶液:,甲叉双丙烯酰胺(),蒸馏水溶解后定容至,过滤,℃保存。(一)仪器

.电泳仪

62.

.溶液:临用时配制。

.正极缓冲液:()硫酸或磷酸。(磷酸配成)

.负极缓冲液:()乙二胺水溶液。(配成)

.固定液:()三氯乙酸。

.染色液:考马斯亮蓝以甲醇溶解。使用时取,加入冰醋酸,摇匀即可使用。

.脱色液:按份甲醇、份水和份冰醋酸混合即可。.

.溶液:临用时配制。

.正极缓冲液:()硫酸或磷酸63【实验步骤】凝胶制备:按下表配制凝胶。水:凝胶储液::蛋白质样品:()::【实验步骤】凝胶制备:按下表配制凝胶。64吸取丙烯酰胺凝胶储液,和水于的小烧杯中混匀,在真空干燥器中抽气(本实验将次步省略,并不影响实验结果)。然后加入、待测样品和溶液,混匀后立即制胶(方法同电泳),胶液加至距离顶部处,在胶面上覆盖厚的水,应注意不要让水破坏胶的表面,室温下放置即可聚合。为观察聚焦状况,可在样品中加入聚焦指示剂,如带红颜色的肌红蛋白()、细胞色素()或甲基红染料(),以示聚焦的进展情况。吸取丙烯酰胺凝胶储液,和水于的小烧杯中混匀,65.电泳:吸去凝胶表面上的水层,于电泳槽正极缓冲液加入的硫酸(或磷酸),负极加入的乙二胺(或乙醇胺或)。打开电源,将电压恒定为,因为聚焦过程是电阻不断加大的过程,故聚焦电泳过程中,电流不断下降,降至稳定时,即表明聚焦已完成,继续电泳约后,停止电泳。

.剥胶:电泳结束后,取下胶块,分别于正负两极做上标记,切不可弄混,并测量出凝胶的长度。.电泳:吸去凝胶表面上的水层,于电泳槽正66.固定、染色和脱色:固定液中浸泡,然后转移至脱色液中浸泡,换次溶液,每次浸泡过程中不断摇动,以除去。量取并记录漂洗后的胶长。再把胶放置于染色液中,室温染色,取出用蒸馏水洗后,放在脱色液中脱色,不断摇动,并更换次脱色液,待本底颜色脱去,蛋白质区带清晰时,量取并记录凝胶长度以及蛋白质区带中心至正极端的距离。.固定、染色和脱色:固定液中浸泡,然67.梯度的测量:在未固定前将凝胶纵切为两部分,一部分用于进行第四步,另一部分(三条泳道即可)按从正极端向负极端的顺序切成的区段,按次序放入有标号的、装有蒸馏水的试管中,浸泡过夜,然后用精密试纸测出每管浸泡液的并记录。有条件的实验室最好用精密计测定。.梯度的测量:在未固定前将凝胶纵切为两部68、结果测定:

()梯度曲线的制作:以胶长()为横坐标,各区段对应的的平均值为纵坐标,在坐标纸上作图,可得到一条近似直线的梯度曲线。由于测得的每一管的是长一段凝胶各点的平均值,因此作图时可把此视为小段中心区的,于是第一小段的所对应的凝胶长度为;第二小段的所对应的凝胶长度为(×-);由此类推,第小段的所对应的凝胶长度为(-)。、结果测定:

()梯度曲线的制作69()待测蛋白样品等电点的计算:

①按下列公式计算蛋白质聚焦部位距凝胶正极端的实际长度(表示):

×

式中——染色后蛋白质区带中心至凝胶正极端的长度

——凝胶固定前的长度

——凝胶染色后的长度

②根据上式计算待测蛋白的,在标准曲线上查出所对应的,即为该蛋白的等电点。()待测蛋白样品等电点的计算:

70【注意事项】

.盐离子可干扰梯度形成并使区带扭曲。为防止上述影响,进行时,样品应透析或用脱盐,也可将样品溶解在水或低盐缓冲液中使其充分溶解,以免不溶小颗粒引起拖尾。

.加样量则取决于样品中蛋白质的种类、数目以及检测方法的灵敏度。如用考马斯亮蓝染色,加样量可为;如用银染色,加样量可减少到。一般样品浓度以为宜,最适当加样体积为。【注意事项】

.盐离子可干扰梯度形成并使71.通常,窄范围的梯度可以提高分辨率,但是需要时间也比较常,梯度范围为是较好的选择。

.由于电源和凝胶冷却系统的限制,最长的凝胶长度为-,实际上,分别电泳几块不同的梯度的凝胶比只电泳一块较长凝胶效果更好。

.在变性液中加入%-以保证蛋白质(尤其是膜蛋白)的充分溶解,有些作者推荐使用如和-等两性离子去垢剂。.通常,窄范围的梯度可以提高分辨率,但是72【思考题】.凝胶等电聚焦电泳法测定蛋白质等电点的原理?.凝胶等电聚焦电泳法操作时应注意的问题?【思考题】73实验六质粒的分离与纯化【实验目的】

通过本实验学习和掌握碱裂解法分离提取质粒。实验六质粒的分离与纯化【实验目的】

通过本实74【实验原理】碱裂解法去、提取质粒是根据共价闭合环状质粒与线性染色体在拓扑学上的差异来分离它们。在值介于这个狭窄的范围内,线性的双螺旋结构解开而被变形,尽管在这样的条件下,共价闭环质粒的氢键会被断裂,但两条互补链彼此相互盘旋,仍会紧密地结合在一起。当加入的乙酸钾高盐缓冲液恢复至中性时,共价闭合环状的质粒的两条互补链仍保持在一起,因此复性迅速而准确,它们缠绕形成网状结构,通过离心,染色体与不稳定的大分子,蛋白质复合物等一起沉淀下来而被除去。【实验原理】碱裂解法去、提取质粒是根据75【仪器、材料与试剂】(一)仪器恒温培养箱;恒温摇床;台式离心机;高压灭菌锅(二)材料.葡萄糖.三羟甲基氨基甲烷.已二胺四乙酸.氢氧化钠【仪器、材料与试剂】(一)仪器76.十二烷基硫酸钠

.乙酸钾

.冰乙酸

.氯仿

.乙醇

.胰酶

.氨苄青霉素

.蔗糖.十二烷基硫酸钠

.乙酸钾

.冰乙酸

.氯仿77.溴酚蓝

.酚

.羟基喹啉

.巯基乙醇

.盐酸

.质粒的大肠杆菌

.吸头、小指管.溴酚蓝

.酚

.羟基喹啉

.巯基乙醇

.盐78(三)试剂

.溶液Ⅰ

葡萄糖

三羟甲基氨基甲烷

乙二胺四乙酸

.溶液Ⅱ

氢氧化钠,用前等体积混合

.溶液Ⅲ(三)试剂

.溶液Ⅰ

79乙酸钾

冰乙酸

.缓冲液

()

()

.乙醇

.胰酶

将酶溶于、氯化钠中,配成的浓度,于摄氏度加热分钟,缓慢冷却至室温,保存于摄氏度。

.凝胶加样缓冲液():蔗糖、溴酚蓝

.酚乙酸钾

80【实验步骤】(一)提取质粒.将毫升含相应抗生素的液体培养基加入到试管中,接入上述的含质粒的大肠杆菌,摄氏度振荡培养过夜。.取毫升培养物倒入微量离心管中,离心分钟。.吸去培养液,使细胞沉淀尽可能干燥。.将细菌沉淀悬浮于溶液中,充分混匀,室温放置分钟。【实验步骤】(一)提取质粒81.加溶液,盖紧管皿,混匀内容物,将离心管放在冰上分钟。

.加入溶液,盖紧管口,颠倒数次使混匀,冰上放置分钟。

.。离心分钟,将上清转至另一离心管中。

.向上清中加入等体积酚:氯仿(:),反复混匀,,离心分钟,将上清转移到另一离心管中。

.向上清加入倍体积无水乙醇,混匀后,室温放置分钟,离心分钟。倒去上清液,把离心管倒扣在吸水纸上,吸干液体。.加溶液,盖紧管皿,混匀内容物,将离心管放在82.用乙醇洗涤质粒沉淀,振荡并离心,倒去上清液,真空抽干或空气中干燥。

.加缓冲液,其中含有的胰酶,使完全溶解,摄氏度保存。

(二)对提取的质粒进行纯化:

琼脂糖凝胶电泳检测质粒,采用胶回收试剂盒纯化质粒。

【实验安排】

本实验一天内可做完。实验结果可结合下一个实验一起观察。

.用乙醇洗涤质粒沉淀,振荡并离心,倒去上清液83实验七扩增目的基因片段【实验目的】.通过本实验学习反应的基本原理。.了解扩增过程中各因素对扩增结果的影响。.掌握的基本操作。实验七扩增目的基因片段【实验目的】84【实验原理】多聚酶链式反应(,)的原理类似于的天然复制过程。在待扩增的片段两侧和与其两侧互补的两个寡核苷酸引物,经变性、退火和延伸若干个循环后,扩增倍。.变性:加热使模板在高温下(℃)变性,双链间的氢键断裂而形成两条单链,即变性阶段。.退火:使溶液降温至~℃,模板与引物按碱基配对原则互补结合,即退火阶段。【实验原理】多聚酶链式反应(,)85.延伸:溶液温度升至℃,耐热聚合酶以单链为模板,在引物的引导下,利用反应混合物中的种脱氧核苷三磷酸(),按照’→’方向复制出互补,即引物的延伸阶段。

上述步为一个循环,即高温变性、低温退火、中温延伸个阶段。从理论上讲,每经过一个循环,样本中的量应该增加一倍,新形成的链又可成为新一轮循环的模板,经过~个循环后可扩增~倍。

典型的反应体系由如下组分组成:模板、反应缓冲液、、、两个合成的引物、耐热聚合酶。.延伸:溶液温度升至℃,耐热聚合酶以单链为86【仪器、材料与试剂】

(一)仪器

.热循环仪

.琼脂糖凝胶电泳系统

.台式离心机

.微量移液器

.微波炉【仪器、材料与试剂】

(一)仪器

.热循环仪

.琼脂87(二)材料

.模板

.上游和下游

(三)试剂

.反应物:聚合酶,种混

合液()。

.×溴酚蓝上样缓冲液。

.×电泳缓冲液:,乙酸,(),加水到,高压灭菌后备用。(二)材料

.模板

.上游和下游

(三)试剂

.88【实验步骤】

.分别在两个灭菌的离心管中,按加样表的顺序加样(整个加样过程聚合酶放于冰中保持低温),建立µ反应体系。成分体积终浓度×µ×(种混合物)µ每种µ(上游)µµµ(下游)µ模板µ~µ~µ聚合酶µ至µ【实验步骤】

.分别在两个灭菌的离心管中,按加样表的顺序加89.在仪上设置如下程序进行扩增

①℃预变性;

②℃变性;

③℃退火;

④℃延伸;

⑤重复步骤②~④,约次;

⑥℃延伸;

⑦℃保温。.在仪上设置如下程序进行扩增

①℃预变性;

②90.琼脂糖凝胶电泳分析结果取~µ反应液及µ上样缓冲液混合,进行电泳,选择适当大小的分子量标准,检查扩增产物。电泳结束后,染色,紫外灯下观察实验结果,必要时拍照。.琼脂糖凝胶电泳分析结果取~µ反应液91【注意事项】

.是建立在一定量的模板和与之专一性互补配对的一对引物之上的,因此,在进行之前,模板的纯化和引物设计尤为重要。

.对聚合酶的活性影响很大,有时按照试剂商提供的说明扩增不出目的基因时,不妨适当增加的浓度。

.模板和引物的浓度要适量,并不是越多越好,否则,会出现非特异条带。【注意事项】

.是建立在一定量的模板和与之92【思考题】

中怎么预防假阳性结果?

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