杨荣武生物化学蛋白质的结构课件

第二章蛋白质的结构ProTens提纲、肽的结构1.肽的定义、分类和命名2.寡肽的理化性质蛋白质的结构1.蛋白质的一级结构2.蛋白质的二级结构3.蛋白质的三级结构4.蛋白质的四级结构三、蛋白质的折叠历程与结构预测蛋白质折叠的基本规律2.蛋白质折叠的历程3.与蛋白质错误折叠相关的疾病4.蛋白质结构的预测四、蛋白质组及蛋白质组学肽的定义★肽就是氨基酸之间通过α-氨基和α-羧基缩合以酰胺键或肽键相连的聚合物,它包括寡肽、多肽和蛋白质。★构成肽的每一个氨基酸单位被称为氨基酸残基。各氨基酸残基以肽键相连形成的链状结构被称为肽链。肽的分类和命名★肽的命名和分类的主要依据是氨基酸残基的数目和组成。★肽的分类可根据氨基酸残基的数目而直呼其为几肽。例如,2个氨基酸形成的肽称为二肽,3个氨基酸构成的肽称为三肽,以此类推。一般将2~10个氨基酸残基组成的肽称为寡肽,由11~50个氨基酸残基组成的肽称为多肽,由50个以上的氨基酸残基组成的肽通常被称为蛋白质。肽的化学结构与命名二肽肽键H2N一CH-CNH-CH-C-OHCHCOOH★除了少数环状肽链以外,其它肽链都Ala-Asp含有不对称的两端:丙氨酰天冬氨酸其中含有自由α-氨三肽基的一端被称为氨肽键肽键基端或N端,含有自由α-羧基的一端H2N一CH—C-NH—CH—C—NH—CHoH称为羧基端或C端。CHOHCHSHCH,CNH2Ser-Cys-Asn丝氨酰半胱氨酰天冬酰胺非核糖体合成肽与核糖体合成肽类型和种类来源类别功能备注非核糖体合成肽胱甘肽动植物细胞肽抗氧化第一个肽键为γ-肽键短杆菌肽S细菌环状十肽抗菌含有D-氨基酸肽聚糖分子中的寡肽细菌细胞壁小肽形成细菌细胞壁的含有D-氨基酸网络结构肌肽肌肉细胞肽不明含有β丙酸核糖体合成多肽促甲状腺素释放因子下丘脑三肽促进甲状腺素释放N-端发生焦谷氬酰化,C-端发生酰胺化催产素脑垂体后叶八肽刺激子宮收编排乳、促进遗忘加压素脑垂体后叶八肽升血压、抗利尿、促进记忆Wa鹅膏蕈碱鬼笔鹅蕈环状八肽真核RNA聚合类真菌酶Ⅱ的强抑制剂寒肽的理化性质1.两性解离肽也有等电点,其中小肽的pl的计算方法与氨基酸相似,但复杂的寡肽只能与多肽和蛋白质一样不能计算,只能测定(如使用等电聚焦的手段)。2.手性与旋光性爻3.双缩脲反应凡含有两个肽键的肽含有与双缩脲结构相似的肽键(至少含有两个肽键,故二肽不行),都能发生此反应。4.水解5.具有特定的生物学功能蛋白质的一般概念⊙1830年,Mulder研究生物体在去除糖、脂和盐等物质以后剩余的成分焖⊙1838年,Berzelius使用蛋白质这个词。希腊语中的表示最重要的意思⊙蛋白质是氨基酸的线性多聚物(>51aa)x⊙1958年,Watson.提出“中心法则”:DNA→RNA→蛋白质(信息流)DNA的功能在于其一级结构;蛋白质的功能在其三维结构。蛋白质的多样性★组成的多样性★大小的多样性★结构的多样性★功能的多样性蛋白质组成的多样性★蛋白质可能含有一条或多条肽链1.一条多肽链-单体蛋白2.不止一条多肽链-寡聚蛋白:同源寡聚体-同种肽链异源寡聚体-两种或多种不同的肽链;血红蛋白是一种异源四聚体:2条α链,2条β链★蛋白质可能含有非蛋白质成分1.多肽