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文档简介
(优选)蛋白质合成的生物学机制本文档共39页;当前第1页;编辑于星期三\17点50分氨基酸的活化翻译的起始肽链的延伸肽链的终止4.4蛋白质合成的生物学机制本文档共39页;当前第2页;编辑于星期三\17点50分(一)氨基酸的活化氨基酸+tRNA氨基酰-tRNAATP
AMP+PPi氨基酰-tRNA合成酶本文档共39页;当前第3页;编辑于星期三\17点50分氨基酰-tRNA合成酶对底物氨基酸和tRNA都有高度特异性。氨基酰-tRNA合成酶具有校正活性(proofreadingactivity)。氨基酰-tRNA的表示方法:Ala-tRNAAla
Ser-tRNASerMet-tRNAMet
本文档共39页;当前第4页;编辑于星期三\17点50分原核生物中,起始氨基酸是:起始AA-tRNA是:真核生物中,起始氨基酸是:起始AA-tRNA是:甲酰甲硫氨酸fMet-tRNAfMet甲硫氨酸Met-tRNAMet本文档共39页;当前第5页;编辑于星期三\17点50分第一步反应氨基酸+ATP-E—→氨基酰-AMP-E
+AMP+PPi
本文档共39页;当前第6页;编辑于星期三\17点50分第二步反应氨基酰-AMP-E+
tRNA
氨基酰-tRNA+AMP
+
E本文档共39页;当前第7页;编辑于星期三\17点50分tRNA与酶结合的模型tRNA氨基酰-tRNA合成酶ATP本文档共39页;当前第8页;编辑于星期三\17点50分(二)翻译的起始原核生物(细菌)为例:所需成分:30S小亚基、50S大亚基、模板mRNA、fMet-tRNAfMet、GTP、Mg2+翻译起始因子:IF-1、IF-2、IF-3、本文档共39页;当前第9页;编辑于星期三\17点50分(1)起始因子(initiationfactors,IF)
起始因子:
起始因子是参与蛋白质生物合成起始的可溶性蛋白因子起始复合物:
蛋白质合成的起始,生成核糖体·mRNA·起始-tRNA三元复合物,也叫起始复合物。起始复合物必须在起始因子帮助下才能形成。目前已知原核生物有3种起始因子,而真核生物约有10种。本文档共39页;当前第10页;编辑于星期三\17点50分
原核生物的3种起始因子:
▼
IF-1(9.5×103)为一小的碱性蛋白、已结晶、热稳定、没有专一的功能,只能增加其他两个起始因子的活性。
▼
IF-2(9.0×104~1.18×105,
有IF-2a
和IF-2b
两种形式)热不稳定。IF-2的功能是通过生成IF-2·GTP·Met-tRNAfMet三元复合物,使起始tRNA与核糖体小亚基(30S亚基)结合。▼
IF-3(有IF-3a、IF-3b两种)是个双功能蛋白质,IF-3的功能是促进mRNA与核糖体小亚基(30S亚基)结合,同时还具解离因子活性。
本文档共39页;当前第11页;编辑于星期三\17点50分IF-3IF-1翻译起始(翻译起始复合物形成)又可被分成3步:1.30S小亚基首先与翻译起始因子IF-1,IF-3结合,在通过SD序列与mRNA模板相结合AUG5'3'本文档共39页;当前第12页;编辑于星期三\17点50分S-D序列本文档共39页;当前第13页;编辑于星期三\17点50分IF-3IF-1IF-2GTP2.在IF-2和GTP的帮助下,fMet-tRNAfMet进入小亚基的P位,tRNA上的反密码子与mRNA上的起始密码子配对。AUG5'3'本文档共39页;当前第14页;编辑于星期三\17点50分IF-3IF-1IF-2GTPGDPPi3、带有tRNA、mRNA和3个翻译起始因子的小亚基复合物与50S大亚基结合,GTP水解,释放翻译起始因子。AUG5'3'本文档共39页;当前第15页;编辑于星期三\17点50分IF-3IF-1AUG5'3'IF-2GTPIF-2-GTPGDPPi本文档共39页;当前第16页;编辑于星期三\17点50分真核生物翻译起始的特点
●核糖体较大,为80S;●起始因子比较多(约有10种);●mRNA5′端具有m7Gppp帽子结构●Met-tRNAMet
●mRNA的5′端帽子结构和3′端polyA都参与形成翻译起始复合物;本文档共39页;当前第17页;编辑于星期三\17点50分
真核生物的起始因子对于生成80S核糖体·mRNA·Met-tRNAMet三元起始复合物是必要的。本文档共39页;当前第18页;编辑于星期三\17点50分表4-14a真核细胞中参与翻译起始的蛋白质因子及其功能真核因子功能eIF2促进Met-tRNAMet与核糖体40S小亚基结合。(最重要的)
eIF2B
eIF3是最早与核糖体40S小亚基结合的促进因子,蛋白质合成反应的正常进。eIF4A具有RNA解旋酶活性,解除mRNA模板的次级结构并使之与40S小亚基结合,形成eIF4F复合物。eIF4B与mRNA模板相结合,协助核糖体扫描模板序列,定位AUG。eIF4E与mRNA5'的帽子结构相结合,形成eIF4F复合物。eIF4G与eIF4E和poly(A)结合蛋白(PAB)相结合,形成eIF4F复合物。eIF5促使多个蛋白因子与40S小亚基解体,以此帮助大小亚基结合形成80核糖体,形成翻译起始复合物。eIF6促进没有蛋白质合成活性的80S核糖体解离成40S和60S两个亚基。本文档共39页;当前第19页;编辑于星期三\17点50分真核生物翻译起始复合物形成(区别原核生物)
原核生物中30S小亚基首先与mRNA模板相结合,再与fMet-tRNAfMet结合,最后与50S大亚基结合。而在真核生物中,40S小亚基首先与Met-tRNAMet相结合,再与模板mRNA结合,最后与60S大亚基结合生成80S·mRNA·Met-tRNAMet起始复合物。本文档共39页;当前第20页;编辑于星期三\17点50分内容原核生物真核生物核糖体完整70S80S亚基50S,30S60S,40S起始tRNAfMet-tRNAfMetMet-tRNAiMet起始因子三种至少七种起始复合物生成顺序1.30S-mRNA1.40S-Met-tRNAMet2.30S-mRNA·fMet-tRNAfMet2.40S-mRNA·Met-tRNAMet3.70S-mRNA·fMet-tRNAfMet3.80S-mRNA·Met-tRNAMet原核生物和真核生物蛋白质合成起始的区别本文档共39页;当前第21页;编辑于星期三\17点50分met40SMetMetmRNAelF-3②GDP+Pi各种elF释放elF-5④ATPADP+PielF4E,elF4G,elF4A,elF4B,PAB③MetMet-tRNAMet-elF-2
-GTP真核生物翻译起始复合物形成过程本文档共39页;当前第22页;编辑于星期三\17点50分
肽链延伸由许多循环组成,每加一个氨基酸就是一个循环,每个循环包括:AA-tRNA与核糖体结合、肽键的生成和移位。
延伸因子(elongationfactor,EF)
:
原核生物:EF-T(EF-Tu,EF-Ts)EF-G
真核生物:EF-1、EF-2(三)肽链的延伸本文档共39页;当前第23页;编辑于星期三\17点50分1、AA-tRNA与核糖体A位点的结合
需要消耗GTP,并需EF-Tu、EF-Ts两种延伸因子本文档共39页;当前第24页;编辑于星期三\17点50分延伸因子(elongationfactorsEF)
延伸因子:是一类参与蛋白质合成过程中肽链延伸的蛋白因子。
无论原核或真核生物,延伸因子可分为二类:
一类:是帮助氨酰tRNA(延伸tRNA)进入核糖体与mRNA结合的EF。原核生物EF-Tu、EF-Ts
真核生物EF-1本文档共39页;当前第25页;编辑于星期三\17点50分
另一类:是使肽基tRNA从核糖体的A位向P位移动的EF
原核生物EF-G
真核生物EF-2
▼
在原核生物中:
EF-Tu的功能是按照mRNA上的编码携带aa-tRNA进入A位。EF-Tu有GTP存在下与aa-tRNA形成稳定的三元复合物:
(EF-Tu·GTP·aa-tRNA)本文档共39页;当前第26页;编辑于星期三\17点50分本文档共39页;当前第27页;编辑于星期三\17点50分通过延伸因子EF-Ts再生GTP,形成EF-Tu·GTP复合物
EF-Tu-GDP+EF-TsEF-Tu-Ts+GDP
EF-Tu-Ts+GTPEF-Tu-GTP+EF-Ts重新参与下一轮循环本文档共39页;当前第28页;编辑于星期三\17点50分EF-Tu·GDPEF-TsEF-Tu·GTP
GDPEF-Tu·EF-TsGTP
本文档共39页;当前第29页;编辑于星期三\17点50分
EF-Tu具高度专一性,只能识别并结合除了fMet-tRNAf
Met
外的所有aa-tRNA。
EF-Tu的这一特性保证了起始tRNA携带的fMet不能进入肽链内部,因为无论甲酰或非甲酰的起始tRNA都不能与EF-Tu和GTP生成复合物。
GTP水解后,EF-Tu·GDP从核糖体释放出来。EF-Tu是一个热不稳定的蛋白因子。
EF-Ts则是热稳定的,它不直接与核糖体发生联系,其功能是使EF-Tu·GDP再生为EF-Tu·GTP,然后再参与肽链延伸:本文档共39页;当前第30页;编辑于星期三\17点50分2、肽键形成
是由转肽酶/肽基转移酶催化
本文档共39页;当前第31页;编辑于星期三\17点50分3、移位核糖体向mRNA3’端方向移动一个密码子。需要消耗GTP,并需EF-G延伸因子自第一个肽链合成以后,每增加一个氨基酸,肽基-tRNA都要从A位移至P位,核糖体与mRNA相对移动3个核苷酸(一个密码子)的距离,该过程需要EF-G和GTP。EF-G是一种依赖于核糖体的GTPase它能使GTP水解。本文档共39页;当前第32页;编辑于星期三\17点50分延长因子EF-G有转位酶(translocase)活性,可结合并水解1分子GTP,促进核蛋白体向mRNA的3'侧移动。本文档共39页;当前第33页;编辑于星期三\17点50分fMetAUG5'3'fMetTuGTP本文档共39页;当前第34页;编辑于星期三\17点50分本文档共39页;当前第35页;编辑于星期三\17点50分当mRNA分子上终止密码子出现在核糖体的A位时,在一般情况下由于没有任何氨酰tRNA可以与终止密码子结合,不能把这些密码子翻成氨基酸。释放因子(终止因子:原核RF-1、RF-2、RF-3、真核RF)在GTP存在下能识别终止密码子。
RF
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