分子生物学期中考试整理资料

----------------------------------------------------分子生物学期中考试整理资料请阐明DNA双螺旋模型的主要内容什么是转座子？可分为哪些种类？请说明核小体的结构组成阐述DNA的几种修复方式P50简述原核生物DNA复制的基本特点P43转座子有什么结构特征？比较插入序列与复合转座子之间的异同引起DNA突变的原因或来源有哪些？突变结果如何原核生物与真核生物基因组的区别重组有哪些种类原核与真核生物中的DNA聚合酶有哪些？功能如何？DNA复制方式有哪些？有何区别？一章1、重组有哪些种类？同源转座位点专一性异常重组2、什么是转座子？种类？转座子：是存在于染色体DNA上可自主复制和移位的基本单位种类：插入序列（IS因子）和复合型转座子3、转座子的结构特点？比较插入序列与复合转座子之间的异同？转座子可以在不同复制子之间转移，以非正常重组方式从一个位点插入到另外一个位点，对新位点基因的结构与表达产生多种遗传效应。转座子的基本结构特点1、自身携带有转座酶基因2、两端有20-40个倒转重复序列3、转座后两端有正向重复序列转座子的类型（一）细菌转座子1、IS（插入序列,insertionsequences）特点：（1）比较小（2）只有转座酶基因（3）两端有反向重复序列;2、Tn（复合转座子）特点：（1）两端有两个相同或高度同源IS序列（2）含转座酶基因/抗生素基因3、TnA（TnAfamily）特点：（1）两端IR相似或相同；两端无IS组件;（2）转座酶基因/解离酶基因/抗生素基因（二）真核生物转座子1、特点：（1）两端有IR，（2）内部有转座酶等基因；2、核小体的组成？由H2A、H2B、H3、H4各两个分子生成的八聚体和由大约200bp的DNA组成3、4章1．RNA的种类和功能RNA分子有三大类，即信使RNA（mRNA）、核糖体RNA(rRNA)和转移RNA（tRNA）。mRNA是蛋白质生物合成的直接模板，tRNA主要起转运氨基酸的作用，rRNA不仅是核糖体的重要结构成分，也是核糖体发挥生理功能的重要元件。2．与mRNA序列相同的那条链是什么链编码链或有意义链3．什么是DNA模板与mRNA及蛋白质产物之间的共线性关系4．转录一般分为那几个步骤转录的基本过程包括模板识别、转录起始、通过启动子及转录的延伸和终止。5．原核生物RNA聚合酶有几个亚基组成由五种亚基组成，即2个α亚基、一个β亚基、一个β’亚基和一个ω亚基组成核心酶，加上一个σ亚基后则成为聚合酶全酶。6．启动子的一般构造启动子(promoter，P)是指能被RNA聚合酶识别、结合并启动基因转录的一段DNA序列。原核生物的启动子：在RNA合成开始位点的上游大约10bp和35bp处有两个共同的序列，称为-10和-35序列。（1）-35序列：又称为Sextama框，其一致序列为TTGACA。它是RNA聚合酶的初始结合位点，RNA聚合酶依靠其σ亚基识别该位点，因此又称为RNA聚合酶的识别位点。（2）-10序列：又称为Pribnow框，其一致序列为TATAAT或是稍有不同的变化形式。它是RNA聚合酶的牢固结合位点，简称结合位点。-10序列富含AT碱基对，DNA双链容易被打开。RNA聚合酶结合于-35序列，然后才结合于-10序列。真核生物有三种RNA聚合酶，每种酶都有自己识别的启动子。7．转录终止子与翻译终止密码的结构特点在DNA模板的特异位点处终止RNA的合成，称为终止子(terminator)：转录终止信号分为两类，一类是不依赖ρ因子的终止，另一类是依赖ρ因子的终止。1、不依赖ρ因子的终止两个特征：[1]DNA序列有富含GC的回文结构（集中在15-20核苷酸上），位于RNA尾部之前。[2]回文序列之后有一串约4-8个A的碱基，转录为RNA3'末端的一连串U。2、依赖ρ因子的终止1.遗传密码有哪些特性遗传密码的基本特点：1、无标点符号，即两种密码子之间无任何核苷酸或其它成分加以分离；2、一般情况下遗传密码是不重叠的，即碱基的使用不发生重复。但在少数大肠杆菌噬菌体的基因组中，部分基因的遗传密码却是重叠的。3、密码子有兼并性(degeneracy)，一种氨基酸有几个密码子，或者几个密码子代表一种氨基酸的现象称为密码子的兼并性。除了Met和Trp只有一个密码子外，其它氨基酸均有二个以上密码子，例如Arg有6个密码子。4、密码子的摆动性：即密码的第一、第二碱基是必需严格按标准配对(A-U、G-C)而第三碱基配对可以有一定程度的摆动灵活性。5、共有64个密码子，其中AUG不仅是Met的密码子，也是肽链合成的起始密码子；UAA、UAG和UGA为终止密码子，不代表任何氨基酸。６、密码子具有方向性，即mRNA从5‘端到3’端的核苷酸排列顺序就决定了多肽链中从N端到C端的氨基酸排列顺序。７、密码子是近于完全通用的，所谓密码的通用性是指不论是病毒、原核生物还是真核生物可共用同一套密码。2.什么是分子伴侣，其功能分子伴侣(或称监护分子，molecularchaperone)：广泛存在于原核和真核生物中，由若干在结构上不相关的蛋白质家族组成的。它们能结合其它蛋白质并使其稳定处于非天然态构象，然后通过有控制地释放而促进这些蛋白质的正确折叠，但自身并不成为被折叠的蛋白质的一部分。3.tRNA在组成和结构上有哪些特点虽然tRNA分子各自的序列不同，但所有的tRNA都具有共同的特征：存在经过特殊的修饰碱基，tRNA的3’端都以CCA-OH结束，该位点是tRNA与相应氨基酸结合的位点。1、tRNA的一级结构:tRNA一般由73-93个核苷酸组成，其中有15-16个核苷酸为固定核苷酸，即在绝大多数tRNA上这些核苷酸的种类和位置不变。tRNA一般有10-15个稀有碱基，如假鸟苷（ψ），各种甲基化的嘌呤和嘧啶核苷，二氢尿嘧啶(DHU)等。这些稀有碱基的功能不十分清楚。2、tRNA的二级结构——三叶草结构:1)二氢尿嘧啶环(D环)(2)反密码子环(3)额外环或可变环(4)TψC环：由7个不配对的碱基组成，几乎总是含5‘GTψC3’序列。(5)3‘端含CCA-OH序列：称为氨基酸接受茎。3、tRNA的三级结构——"倒L形"：(1)氨基酸接受臂CCA序列和反密码子处于倒L的两端。(2)D环和TψC环形成了倒L的角。(3)绝大多数形成的三级结构的氢键涉及的碱基种类不同于标准的A-U和G-C碱基对；还有少数三级结构反应涉及核糖体-磷酸骨架中的基团，包括核糖的2‘4.比较原核与真核的核糖体组成原核生物核糖体由约2/3的RNA及1/3的蛋白质组成。真核生物核糖体中RNA占3/5，蛋白质占2/5。已知大肠杆菌核糖体小亚基由21种r-蛋白组成，大亚基由36种r-蛋白组成。真核生物细胞核糖体蛋白质中，大亚基含有49种r-蛋白，小亚基有33种r-蛋白。5.什么是SD序列？其功能在mRNA分子中起始密码子的上游8-13个核苷酸处有一段富含嘌呤核苷酸的顺序，它可以与30S亚基中的16SrRNA3'端富含嘧啶的尾部互补，形成氢键结合，因此有助于mRNA的翻译从起始密码子处开始。上述mRNA分子的序列特征1974年由J.Shine和L.Dalgarno发现，故称为SD序列。后来在E.coli的多种mRNA分子中证实均存在SD顺序。6.核糖体有哪些活性中心7.真核生物与原核生物在翻译的起始过程中有哪些区别原核生物的起始tRNA是fMet-tRNAfMet,真核生物是Met-tRNAMet。原核生物中30S小亚基首先与mRNA模板结合，再与fMet-tRNAfMet结合，最后与50S大亚基结合。而在真核生物中，40S小亚基首先与Met-tRNAMet，再与模板mRNA结合，最后与60S大亚基结合生成80S·mRNA·Met-tRNAMet起始复合物。真核生物蛋白质生物合成的起始机制与原核生物基本相同，其差异主要是核糖体较大，有较多的起始因子参与，其mRNA具有m7GpppNp帽子结构，Met-tRNAMet不甲酰化，mRNA分子5’端的“帽子”和3’端的多聚A都参与形成翻译起始复合物。8.链霉素为什么能够抑制蛋白质的合成链霉素是一种碱性三糖，可以多种方式抑制原核生物核糖体，能干扰fMet-tRNA与核糖体的结合，从而阻止蛋白质合成的正确起始，也会导致mRNA的错读。若以ployU作模板，则除苯丙氨酸（UUU）外，异亮氨酸（AUU）也会被掺入。链霉素的作用位点在30S亚基上。9.什么是信号肽？它在序列组成上有哪些特点？有什么功能绝大多数被运入内质网内腔的蛋白质都具有大约１５－３０个氨基酸的N端信号序列——信号肽，①其靠近N端常常有1个或数个带正电荷的赖氨酸和精氨酸；②后半段一般带有约10-15个疏水氨基酸。③C-末端靠近蛋白酶切割位点处带数个极性氨基酸。信号肽是启动蛋白质转录的一段多肽。10.简述叶绿体蛋白质的跨膜转运机制叶绿体多肽在胞质中的游离核糖体上合成后脱离核糖体并折叠成具有三级结构的蛋白质分子，多肽上某些特定位点结合于只有叶绿体膜上才有的特异受体位点。叶绿体定位信号肽一般有