实时荧光定量技术的原理及应用

实时荧光定量技术的原理及应用第一页，共三十八页，编辑于2023年，星期二提纲：

实时荧光定量PCR原理数学原理化学原理实时荧光定量PCR的方法应用绝对定量相对定量定量PCR的实验要素平台定量PCR仪器介绍第二页，共三十八页，编辑于2023年，星期二实时荧光定量PCR定义：在PCR反应体系中加入荧光基团，利用荧光信号累积实现了实时监测整个PCR进程，对起始模板进行定量分析的方法。第三页，共三十八页，编辑于2023年，星期二

与普通PCR的区别

普通PCR技术：在PCR结束后对终点产物进行定量分析。实时定量PCR技术：实时检测PCR扩增，在扩增的指数期对起始模板进行定量。第四页，共三十八页，编辑于2023年，星期二第五页，共三十八页，编辑于2023年，星期二第六页，共三十八页，编辑于2023年，星期二第七页，共三十八页，编辑于2023年，星期二荧光阈值是在荧光扩增曲线上人为设定的一个值，它可以设定在荧光信号指数扩增阶段任意位置上，一般荧光域值的设置是基线（背景）荧光信号的标准偏差的10倍。每个反应管内的荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数被称为CT值（thresholdvalue）。第八页，共三十八页，编辑于2023年，星期二第九页，共三十八页，编辑于2023年，星期二

定量PCR的数学原理

第十页，共三十八页，编辑于2023年，星期二第十一页，共三十八页，编辑于2023年，星期二

斜率与扩增效率第十二页，共三十八页，编辑于2023年，星期二第十三页，共三十八页，编辑于2023年，星期二

荧光定量PCR化学原理

非特异性荧光标记：1、SYBRGreen特异性荧光标记：2、TaqMan第十四页，共三十八页，编辑于2023年，星期二1、SYBRGreen法第十五页，共三十八页，编辑于2023年，星期二SYBRGreen熔解曲线分析

第十六页，共三十八页，编辑于2023年，星期二SYBRGreen法优缺点优点:对DNA模板没有选择性适用于任何DNA使用方便--不必设计复杂探针非常灵敏便宜第十七页，共三十八页，编辑于2023年，星期二2、TaqMan探针法

第十八页，共三十八页，编辑于2023年，星期二TaqMan作用机理

第十九页，共三十八页，编辑于2023年，星期二

TaqMan法优缺点

第二十页，共三十八页，编辑于2023年，星期二Real-timePCR方法应用第二十一页，共三十八页，编辑于2023年，星期二•绝对定量(AbsoluteQuantification，AQ)病原体检测转基因食品检测基因表达研究•相对定量(RelativeQuantification，RQ)基因在不同组织中的表达差异药物疗效考核耐药性研究第二十二页，共三十八页，编辑于2023年，星期二

绝对定量与相对定量的定义

第二十三页，共三十八页，编辑于2023年，星期二绝对定量通过标准品定量绝对定量的标准样品：已知拷贝数的质粒DNA，做系列稀释。标准样品的种类：•含有和待测样品相同扩增片段的克隆质粒•含有和待测样品相同扩增片段的cDNA•PCR的产物第二十四页，共三十八页，编辑于2023年，星期二绝对定量：从荧光到拷贝数

第二十五页，共三十八页，编辑于2023年，星期二

相对定量通过内标定量

内标（EndogenousControl）通常是β-actin、GAPDH基因等看家基因在细胞中的表达量或在基因组中的拷贝数恒定，受环境因素影响小内标定量结果代表了样本中所含细胞或基因组数量第二十六页，共三十八页，编辑于2023年，星期二

相对定量：参照因子Calibrator

第二十七页，共三十八页，编辑于2023年，星期二

相对定量分析方法1-ΔΔCt

前提：目标序列和内参序列的扩增效率接近100％且偏差在5％以内1、用内参基因的CT值归一目标基因的CT值：

ΔCT（test)=CT（target,test)-CT（ref,test)ΔCT（calibrator)=CT（target,calibrator)-CT（ref,calibrator)2、用校准样本的ΔCT值归一试验样本的ΔCT值：ΔΔCT=ΔCT（test)-ΔCT（calibrator)3、计算表达水平比率：2–ΔΔCT=表达量的比值第二十八页，共三十八页，编辑于2023年，星期二

相对定量分析方法2：双标准曲线法

目标基因与内参基因扩增效率不同

待测样品目的基因浓度

待测样品内参基因浓度

F=对照样品目的基因浓度对照样品内参基因浓度第二十九页，共三十八页，编辑于2023年，星期二

定量PCR的实验要素第三十页，共三十八页，编辑于2023年，星期二

样品

●DNA纯度：OD260/OD280=1.8，1.6~2.0之间●DNA用量：0.05ng–100ng●RNA纯度：OD260/OD280=2.0●cDNA用量：1-100ng总RNA反转录的cDNA取1uL第三十一页，共三十八页，编辑于2023年，星期二

标准品

第三十二页，共三十八页，编辑于2023年，星期二

标准品梯度稀释方法

第三十三页，共三十八页，编辑于2023年，星期二复管测试●样品和标准品都要重复●重复次数须遵循统计学要求第三十四页，共三十八页，编辑于2023年，星期二平台PCR仪介绍ABI7500fast第三十五页，共三十八页，