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文档简介
一、生物化学、化学生物学、分子生物学,三者联系与区别欧洲化学生物学的一个专门刊名为ChemBioChem刊物,这部刊Lehn教授和AlanR.Fersht[1]时指出:ChemBioChem意指化学生物学和生物化学,其使命是涵盖从复杂的碳水化合物、多肽蛋白质到DNA/RNA想到拿这个题目出来介绍是因为这是我在第一节课课堂讨论中生物化学(BiologicalChemistry)[1]纳了一下,其研究的基本内容包括对生物体的化学组成的鉴定,对1酶催化,生物膜和生物力学,激素与维生素,生命的起源与进化。生物化学对其他各门生物学科的深刻影响首先反映在与其关系(/view/253496.htm)化学生物学(ChemicalBiology)化学生物学是使用小分子作为工具解决生物学的问题或通过干扰/[1]物学的奠基人Schreiber化学生物学是对分子。”化学生物学是近年来出现的新兴研究领域,它融合了化学、生物学、物理学、信息科学等多个相关学科的理论、技术和研究方法,是一个有活力、有应用前景的新学科。它主要研究的内容包括[3]:—,细胞过程基因表达的小分子调控2(3),学基础研究从自然界发现新的生物活性物质,寻找它们在生物体中的靶位点,研究小分子与生物大分子之间的相互作用、构效关系和作用机制,进一步在分子和化学键水平上研究它们在调控生理过程中的分子识别、信息传递分子进化及其系统工程的研究分子进化是研究生命起源的重要内容,揭示通过DNARNA质和糖等生物大分子的突变和选择改变生物表型和性状进化的分子机制。分子生物学(MolecularBiology))的结构、功能和生物合成等,从这些方面来阐明各2050子生物学是生物学的前沿与生长点,其主要研究领域包括蛋白质体-核酸体系()脂质体系(即生物膜。(/view/2461.htm)三者之间的联系与区别3联系:化学生物学虽然目前探讨比较热烈联系:化学生物学虽然目前探讨比较热烈,但它仍然是一个新的、定义不太明确的领域,化学生物学这个名词对于不同的人有不同的含义。从它与其它学科的联系来看,化学生物学是化学生物学是一门新物学的含义有较大的重叠,它强调的是化学与生物学的交叉与融合[2]。区分。之前已经提到Schreiber采用化学的手段,区分。之前已经提到Schreiber采用化学的手段,如运用小分子或人工设计合成的分子作为配体来直接改变生物分子功能”,这是化学生物学的核心。因此,化学生物学的中心任务[2]是采用小分子达到对生物通路的调控。合成和筛选生物活性小分子,生物靶分子相互作用、分子识别、信息传递、生命过程的小分子调控的差别了:物,范围也更广泛些,探讨更多的是关于生物体的化学组成结构,以及作用过程的化学本质和机理;4构与功能,以及化学合成(光合作用等。采用定点突变的方法来改变生物分子如蛋白质和核酸的功能,所谓定点突变(/view/274624.htm?fr=ala0_1_1)是指通过聚合酶链式反应(PCR)等方法向目的DNA片段(可以是基因组,也可以是质粒)中引入所需变化(通常是表征有利方向的变化,包括碱基的添加、删除、点突变等。定点突变能迅速、高效的提高DNA所表,以及阐明生物分子间相互识别、相互——,或以天然化合物为模板设计合成而创制的天然化合物类的新颖分子作为探针,去探讨生物体中的分子间相互作用和细胞发育与分化的调控作用范围和前两者不同。相辅相成,互为补充和发展前提的,只有三门学科得共同的进步,化学生物学的研究才能迈上一个新的台阶。二、中外化学生物学教学对比相辅相成,互为补充和发展前提的,只有三门学科得共同的进步,化学生物学的研究才能迈上一个新的台阶。二、中外化学生物学教学对比由于化学生物学是一门多交叉学科,同时又是新兴学科,教学历5史比较短,不像其他课程的教学那样有成熟的教学大纲及知识点体表一中外化学生物学教学对比[3-5]国内 国外湖北大学最早于1997年开始招生的理科化学生物学基础科学研究与教学人才培养试点班2003
1995年Harvard大学率将其化学系改名为化学与化学生物学系(Department 开设时间
清华大学开设化学—生物
ChemistryBiology)
and Chemical学基础科学班招收本科生2001研究所建立了化学生物学会化学生物学专业委员会成立6
1996年美国加州ScrippsSkaggs物学研究所。象置
设立了化学生物学硕士和始面向本科生方面的课程程占较大比重相关的选修课程综合化学实验中设置化学生物学实验部分或者单独开设化学生物学综合实验7
主要是研究生,并且要求具有良好的化学和生物学背景,多各有侧重的课程加州大学伯克利分校模式:1)某些领域进行深入讲解;3)专题研讨耶鲁大学模式:理论课和实验课并开(教材选择
编)术》(科学出版社;申泮文主编)实验教材实验教程》(化工出版社;)以上仅供参考
教材选择是多样化的,没有统一的标准,界限也比较模糊。没有一所大学采用直接命名为“化学生物学”的书作为教材,大多数是选择与其教学内容相关的教材。先修要求
化学专业仍是其主导专业,主要是有机化学,生物化学在此基础之上来加强生物分子生物学物理化学等可以学知识。 一般了解低年级课程有普通生涉及领域
物学化学原理高年级有 课题集中在生物体内的有机化学物理化学生物信息流信号转导生物识化学细胞生物学分子生以及化学分子在这些过程中8物学等核心基础课程以及的作用、核酸和蛋白质的折比较专业的选修课程为学叠、化学遗传学及基因组学生进入高层次学习深造提 酶的三维结构催化机制及调供条件在原有课程实验保控蛋白质与其他生物分子相留的情况下在高年级开设互作用药物的开发用化学综合化学实验和综合化学生物学实验。加强实验教学。调整和融合知识体系特点 加强课程建设,强化程之间的联系
注重采用化学方法来解释,焦点类,这是整个学科的基础。关注学科领域的前沿,教师一般会给学生提供较多近期发表的论文,进行专题研讨,这些必然指向学科的前沿。对比分析:开设时间和科研单位开设时间:从上表可以看出化学生物学作为一个新兴的交叉学9ft东大学微生物国家重点实验室建立的“工业生物技术与环境化学生物学”研究组,华中师范大学组建的“农药与化学生物学”教育部重点实[3]ft东大学微生物国家重点实验室建立的“工业生物技术与环境化学生物学”研究组,华中师范大学组建的“农药与化学生物学”教育部重点实[3]1995年Harvard大学率先将化学系改名为化学与化学学生物学研究所等[3-5]。这一点上可以看出我国比较偏重于本国特色”州Scripps研究所的Skaggs化学生物学研究所和康奈尔大学建立的化学生物学研究所等[3-5]。这一点上可以看出我国比较偏重于本国特色课程对象及专业设置要是研究生,并且要求选课的学生具有良好的化学和生物学背景。这个原因归结为:化学生物学是一门新兴交叉学科,涉及的面非常广阔,所以学生在选修化学生物学课程之前,必须有很好的化学知要是研究生,并且要求选课的学生具有良好的化学和生物学背景。这个原因归结为:化学生物学是一门新兴交叉学科,涉及的面非常广阔,所以学生在选修化学生物学课程之前,必须有很好的化学知识背景和生物学知识背景,通常本科生要到高年级才能修完,而且本10科阶段,科阶段,主要任务是学习通识课程,对于自己学科和研究体系有一个大致的了解,从而培养一种科学的思维方式,还有救市这门课需要了解很多前沿知识,要关注新的研究动向致的了解,从而培养一种科学的思维方式,还有救市这门课需要了解很多前沿知识,要关注新的研究动向,阅读大量文献,有时还需要通过实验来验证。从这些方面来看,学习这门课程比较适合于研究生。应该占据主要地位。Harvard大学率ft[4]Harvard大学率先将其化学系改名为化学与化学生物学系[5]。重视程度不同。课程设置和教学手段国内在课程设置和教学上有如下特点[4]:化学生物学的教材目前国内有《化学生物学导论》以及《化)两本,而化学生物学实验的教材只有一本程教材的缺乏。课程设置中与交叉学科相适应的课程占较大比重,包括生物学课程。设置了一些与学科拓展相关的选修课程,包括高级化学、应11用化学、生物技术和药学类的一些课程。化学生物学专业包括化学类和生物类两方面的课程。化学类置化学生物学实验部分或者单独开设化学生物学综合实验。国外特点[5]:化学生物学课程的教材选择是多样化的,没有统一的标准,化学生物学”的书作是与上课内容相关的参考书,不是真正的教材。3种。一种是像哈佛大学那样,的同时开设实验课。每个学校的主要领域和题目的选择与教师的研究兴趣密切相及讨论的展开,也利于启迪学生。可以看出,国外大学化学生物学教材以及开设的与化学生物学相12对比之后的启发与思考在教材选择方面,可以学习国外模式,在使用教材或参考资可达到学好化学生物学这门强交叉性和综合性课程的目的。,常常按照学科的分类成立各种院系,,化学生物学研究室[3]。很多学化学的不会转入生物学研究,这种,无法深入完结构”和反应性”生物化学功13能和生物学功能”的思维模式有机的结合起来[4]。三、小分子探针药物研究方面的进展和展望以上是我对文献的一些总结和个人的一些看法,想法还比较浅引用一些西方成功范例。取长补短,对自身学习会有很大帮助!三、小分子探针药物研究方面的进展和展望”Schreiber的文章中当今创新药物的发现越来越依赖于靶点的发现以及靶点与活性”Schreiber的文章中究方面的进展和展望作一个介绍。药物研究与靶点PPT中141药物研究流程图DNA等。药物[6]。小分子探针在靶点发现等方面的应用何种蛋白质是针对某种疾病的小分子药物的靶点,在目前基因15[7]。利用——[8]。什么是小分子探针探针分子一般是以其母体化合物(最初的活性化合物)根据初步的构效关系设计合成的。设计的探针分子应具有适当的活[6]:活性化合物中含有某些反应基团,可以与靶点蛋白的活性部位发生反应形成共价键(2)的;-偶极相互作用、范弱、不稳定,是可逆的。162[6]分子探针可以快速、灵敏、实时获得这些信息,目前常用的分[7]Kramer等首次设计合成的分子信标核酸探FloridaTan等利用分子信标制作成了世界上最小的DNA分子马达。另一种核酸探针是能与蛋白质等配体AptamerAptamer对靶分子的高识别能蛋白质探针。小分子探针的作用在药物发现过程中,化学小分子探针主要有以下几个方面的作用[6]:1)面的研究:了解药物分子与靶点作用部位的结构信息,为进一步的结构改造提供帮助;17入研究蛋白质的功能;利用探针分子进行细胞或体内的标记实验,可能会发现一些与活产生的毒副作用提供预测。2)对于体内作用靶点未知,有药理活性的化合物,特别是来自模型,为先导物的结构优化服务。展望以上就是我对小分子探针已有进展的初步了解和对知识简单的1)虽然现在已经用小分子探针进行了大量研究,但如果能建立一个2)DNA并且找出可以按次序选择识别不同DNA和蛋白质的分子探针会有很大帮助。3)蛋白质与探针分子的相互作用的研究涉及许多相关学科,就像课18化学、物理学及计算机科学等,必将推动这一研究领域的进步。4)2003年之前化学小分子探针标记实验大部分还在体外进行,只能大致的揭示活细胞或体内蛋白质的功能状态。美国Scripps研究所Cravatt等将“click”[6]。关于点击化学在我所读的文Clickchemistry(简称CC),又称点击化学,是最近几年发展起来的一种化2001ScrippsSharpless[9]等提出这中最重要的“click”反应是指炔基在Cu(I)催化下与叠氮基形成稳定的1,2,3-(也称Huisgen1,3-)的反应,在组合5)19子探针与大分子相互作用的原理,探讨生物体系中分子识别和信息传递的机制,从而阐明中药中更多未知的机理。参考文献:王世敏,,李玲.[J].工,2002,4:1-3吴厚铭.——[J].2000,423-430马林.[J].2006,18(4):514-518池泉.[J]
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