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文档简介
酶催化反应动力学研究包括哪些内容?重要(1)底物浓度(2)酶浓度(3)抑制剂(4)温度(5)
pH影响因素(6)激活剂酶促反应速度目的和意义
找到适宜的反应条件提高或抑制酶催化反应效率
了解酶在生理代谢过程中的作用和某些药物的作用机制等定义:酶催化反应动力学是研究酶促反应速度以及影响此速度的各种因素的科学。目前一页\总数四十九页\编于六点1酶催化反应速率与酶活力的测定酶活力是指酶催化某一化学反应的能力,其大小可以用在一定条件下该酶所催化的某一化学反应的反应速度(reactionvelocity)来表示,酶活力的高低和化学反应的反应速度的大小两者呈线性关系。目前二页\总数四十九页\编于六点1.1酶催化反应速率随时间的变化酶催化的反应速度可用在单位时间内底物的减少量或者产物的增加量来表示。如图3-1所示的曲线图。酶促反应速度随反应时间延长而降低。图3-1酶促反应的速度曲线目前三页\总数四十九页\编于六点(1)底物浓度的降低、产物浓度增加从而加速了逆反应的进行;(2)产物对酶的抑制作用;(3)随着反应时间的延长引起酶的部分失活等。引起酶促反应速度随反应时间延长而降低的原因?测定反应初速度的方法来测定相关制剂中酶的含量(活性)。如何避免影响?目前四页\总数四十九页\编于六点1.2酶活力的测定原理酶蛋白的含量很低,很难直接测定其蛋白质的含量,且常与其他各种蛋白质混合存在,将其提纯耗时费力。故不能直接用重量或体积等指标来衡量。分光光度法荧光法同位素法电化学方法其他方法:如旋光法、量气法、量热法和层析法等测定酶活力常用的方法:测定酶活力的基本原理测定底物减少量测定产物增加量目前五页\总数四十九页\编于六点1.3酶活力测定时需注意:(1)选择反应的最适温度,根据不同的底物和缓冲液选择反应的最适pH。(2)速度要快,取反应的初速度(3)底物浓度要足够大(一般在10Km以上)使酶被底物饱和,以充分反映待测酶的活力目前六页\总数四十九页\编于六点2底物浓度对酶促反应速度的影响目前七页\总数四十九页\编于六点2.1中间络合物学说中间络合物学说最早是由Henri和Wurtz两位科学家提出的。在1903年,Henri在用蔗糖酶水解蔗糖实验研究化学反应中底物浓度与反应速度的关系时发现,当酶浓度不变时,可以测出一系列不同底物浓度下的化学反应速度,以该反应速度对底物浓度作图,可得到如图3-2所示的曲线。
图3-2底物浓度对酶促反应速度的影响目前八页\总数四十九页\编于六点根据这一实验结果,Henri和Wurtz提出了酶促化学反应的酶底物中间络合物学说。该学说认为:当酶催化某一化学反应时,酶(E)首先需要和底物(S)结合生成酶底物中间络合物即中间复合物(ES),然后再生成产物(P),同时释放出酶。该学说可以用下面的化学反应方程式来表示:酶底物中间络合物学说E+S
k1k2k3ESE+P目前九页\总数四十九页\编于六点酶底物中间络合物学说酶还未被底物所饱和酶已全部被底物所饱和目前十页\总数四十九页\编于六点2.2酶促反应的动力学方程式(米氏方程)1913年Michaelis和Menten两位科学家在前人工作的基础上,根据酶促反应的中间络合物学说,推导出一个数学方程式,用来表示底物浓度与酶反应速度之间的量化关系,通常把这个数学方程式称为米氏方程:[S]:底物浓度
V:不同[S]时的反应速度Vmax:最大反应速度(maximumvelocity)Km:米氏常数(Michaelisconstant)目前十一页\总数四十九页\编于六点米氏常数Km的含义Km值就代表着反应速度达到最大反应速度一半时的底物浓度,单位是mol/L。
。2=Km+[S]
Vmax
Vmax[S]Km=[S]Km值的推导:目前十二页\总数四十九页\编于六点米氏常数的应用价值Km是酶的一个特征性常数:也就是说Km的大小只与酶本身的性质有关,而与酶浓度无关。Km值还可以用于判断酶的专一性和天然底物,Km值最小的底物往往被称为该酶的最适底物或天然底物。Km可以作为酶和底物结合紧密程度的—个度量指标,用来表示酶与底物结合的亲和力大小。已知某个酶的Km值,就可以计算出在某一底物浓度条件下,其反应速度相当于Vmax的百分比。
Km值还可以帮助我们推断具体条件下某一代谢反应的方向和途径,只有Km值小的酶促反应才会在竞争中占优势。目前十三页\总数四十九页\编于六点米氏方程的双倒数作图双倒数作图法(doublereciprocalplot),又称为林-贝氏(Lineweaver-Burk)作图法
Vmax[S]Km+[S]V=(林-贝氏方程)+1/V=KmVmax1/Vmax1/[S]两边同取倒数-1/Km1/[S]1/V0目前十四页\总数四十九页\编于六点3酶浓度对反应速度的影响当[S]>>[E],酶可被底物饱和的情况下,反应速度与酶浓度成正比关系式为:
V=K3[E]0
V
[E]
当[S]>>[E]时,Vmax=k3[E]酶浓度对反应速度的影响E+S
k1k2k3ESE+P目前十五页\总数四十九页\编于六点4抑制剂对酶促反应速度的影响区别于酶的变性抑制剂对酶有一定选择性引起变性的因素对酶没有选择性酶的抑制剂(inhibitor):凡能使酶的催化活性下降而不引起酶蛋白变性的物质称为酶的抑制剂。目前十六页\总数四十九页\编于六点(1)是研究酶的结构与功能、酶的催化机制以及阐明机体代谢途径的基本手段。(2)可以为医药产业中设计新药物和农业生产中设计新农药提供重要的理论依据。(3)在食品生产和保鲜中控制酶的催化效率。研究抑制剂的意义目前十七页\总数四十九页\编于六点4.1抑制作用的类型及鉴别根据抑制剂与酶的作用方式的区别以及抑制作用是否可逆,我们可以将抑制作用分为两大类,即:不可逆的抑制作用(irreversibleinhibition)可逆的抑制作用(reversibleinhibition)目前十八页\总数四十九页\编于六点鉴别不可逆抑制作用抑制剂与酶的必需基团以共价键的形式结合而引起酶活力降低或丧失。是不可逆的。本质上来说就是酶的修饰抑制可逆抑制作用由于抑制剂与酶以非共价键的形式结合而引起酶活力降低或丧失。是可逆的。鉴别方法(1)能否用透析、超滤和凝胶过滤等物理方法除去抑制剂?(2)化学动力学的方法(见下图)如何鉴别?目前十九页\总数四十九页\编于六点图3-4可逆抑制剂与不可逆抑制剂的区别(一)曲线1,无抑制剂;曲线2,不可逆抑制剂;曲线3,可逆抑制剂目前二十页\总数四十九页\编于六点4.2不可逆的抑制作用根据不可逆抑制剂选择性的差异,通常把不可逆抑制剂分为两种类型,即非专一性不可逆抑制剂和专一性不可逆抑制剂。目前二十一页\总数四十九页\编于六点①非专一性不可逆抑制剂有机磷化合物有机汞、有机砷化合物重金属盐烷化剂硫化物、氰化物和CO非专一性青霉素与丝氨酸羟基共价结合与半胱氨酸的巯基共价结合使酶蛋白变性与酶多个必须基团结合与酶中金属离子形成稳定络合物机理与糖肽转肽酶丝氨酸羟基结合目前二十二页\总数四十九页\编于六点举例1:有机磷化合物对羟基酶的抑制
有机磷化合物羟基酶解毒------解磷定(PAM)目前二十三页\总数四十九页\编于六点路易士气失活的酶巯基酶失活的酶酸BAL巯基酶BAL与砷剂结合物举例2:有机砷对巯基酶的抑制砷化合物巯基酶解毒------二巯基丙醇(BAL)目前二十四页\总数四十九页\编于六点②专一性不可逆抑制剂a) Ks型不可逆抑制剂:具有与底物相类似的结构例如:对甲苯磺酰-L-赖氨酰氯甲酮(TLCK)和胰蛋白酶的底物对甲苯硫磺-L-赖氨酰甲酯(TLME)具有相似化学结构b) Kat型不可逆抑制剂:不但具有与天然底物相类似的结构,而且抑制剂本身也是酶的底物,专一性极高,因此也被称为自杀性底物。例如:β-卤代-D-Ala是丙氨酸消旋酶的不可逆抑制剂目前二十五页\总数四十九页\编于六点4.3可逆的抑制作用根据可逆抑制剂与底物的关系,我们将可逆抑制作用分为三种类型。竞争性抑制1非竞争性抑制2反竞争性抑制3目前二十六页\总数四十九页\编于六点①竞争性抑制(competitiveinhibition):是最常见的一种可逆抑制作用。大多数竞争性抑制剂与底物的结构相似,能与底物竞争酶的活性中心,从而阻碍酶底物复合物的形成,使酶的活性降低。这种抑制作用称为竞争性抑制作用。其抑制程度取决于底物和抑制剂的相对浓度,可以通过增加底物浓度的方法来解除这种抑制作用。目前二十七页\总数四十九页\编于六点竞争性抑制反应模式在竞争性抑制中,底物(S)或抑制剂(I)与酶(E)的结合都是可逆的,因此存在着如下的化学平衡式:[S]>>[I]:高浓度的底物可解除抑制目前二十八页\总数四十九页\编于六点图3-5竞争性抑制曲线⑴Vm值不变,(表观)Km值增大;⑵Km随抑制剂浓度[I]的增加而增加;⑶双倒数作图所得直线相交于纵轴;⑷抑制作用可以被高浓度的底物减低以致消除。特点:目前二十九页\总数四十九页\编于六点与对氨基苯甲酸竞争性抑制二氢叶酸合成酶举例:磺胺类药物的抑菌机制目前三十页\总数四十九页\编于六点②非竞争性抑制(noncompetitiveinhibition):非竞争性抑制剂(I)和底物(S)可以同时与酶(E)结合,两者之间不存在竞争关系。但是在酶与抑制剂结合后,还可以进一步与底物结合形成酶-底物-抑制剂复合物ESI;酶与底物结合后,也可以进一步与抑制剂结合形成酶-底物-抑制剂复合物ESI。这种中间的三元复合物,即酶-底物-抑制剂复合物ESI不能进一步分解产生产物,因此相应的酶促反应速度下降。目前三十一页\总数四十九页\编于六点非竞争性抑制反应模式在非竞争性抑制中,抑制剂(I)与酶(E)或酶-底物复合物(ES)以及底物(S)与酶-抑制剂复合物(EI)的结合都是可逆的,因此存在着如下的化学平衡式:+
S-S+
S-S+ESIEIEESEP目前三十二页\总数四十九页\编于六点图3-6非竞争性抑制曲线⑴Vm值降低,Km值不变;Vm随[I]的增加而降低;⑵双倒数作图所得直线相交于横轴;⑶抑制剂对酶与底物的结合无影响,故底物浓度的改变对抑制程度无影响;抑制程度取决于抑制剂的浓度。特点:目前三十三页\总数四十九页\编于六点这类抑制最典型的例子是亮氨酸是精氨酸酶的一种非竞争性抑制剂。有某些重金属离子如Ag+、Cu2+、Hg2+、Pb2+等对酶的抑制作用也属于这一类。EDTA对金属酶的抑制。举例:目前三十四页\总数四十九页\编于六点③反竞争性抑制(uncompetitiveinhibition):这类抑制作用的特点是只有在酶(E)与底物(S)结合后,才能与抑制剂(I)结合,形成酶-底物-抑制剂复合物ESI,与非竞争性抑制相似,这种中间的三元复合物,即酶-底物-抑制剂复合物ESI不能进一步分解产生产物,因此相应的酶促反应速度下降。目前三十五页\总数四十九页\编于六点反竞争性抑制反应模式反竞争性抑制的特点是,酶(E)必须先与底物(S)结合,然后才与抑制剂(I)结合,即抑制剂(I)与酶-底物复合物(ES)的结合是可逆的,因此存在着如下的化学平衡式:++ESESESIEP目前三十六页\总数四十九页\编于六点图3-7反竞争性抑制曲线⑴Vm值和Km值都随[I]的增加而降低;⑵双倒数作图所得为一组平行线;⑶必须有底物存在,抑制剂才能对酶产生抑制作用;抑制程度随底物浓度的增加而增加。特点:目前三十七页\总数四十九页\编于六点举例:这种抑制作用在单底物反应中比较少见,而常见于多底物反应中。目前已经证明,肼类化合物对胃蛋白酶的抑制作用、氰化物对芳香硫酸酯酶的抑制作用、L-Phe和L-同型精氨酸等多种氨基酸对碱性磷酸酶的抑制作用都属于反竞争性抑制。目前三十八页\总数四十九页\编于六点为了方便理解和记忆,我们现将无抑制剂和有抑制剂等不同情况下的米氏方程和Vmax及Km的变化总结归纳在表3-1中。总结:目前三十九页\总数四十九页\编于六点5其它因素对酶促反应速度的影响其它各种影响酶促反应速度的因素主要包括:温度、pH和激活剂等。目前四十页\总数四十九页\编于六点5.1温度对酶促反应速度的影响温度对酶促反应的双重影响:一、当温度升高时,与一般化学反应一样,反应速度加快(Q10一般等于2)。二、温度升高随着温度逐渐升高,酶蛋白会因逐渐变性而失活)。目前四十一页\总数四十九页\编于六点图3-9温度对酶促反应速度的影响酶在固体状态下比在溶液中对温度的耐受力更高。酶的冰冻干粉制剂通常在冰箱中可存放几个月以上,而酶溶液一般在冰箱中只能保存数周。所以酶制剂以固体保存为佳。目前四十二页\总数四十九页\编于六点一般来说,动物细胞内的酶最适温度一般为35~40℃,植物细胞中的酶最适温度较动物细胞中稍高,通常在40~50℃之间,而微生物中的酶最适温度差别则较大,如用于进行PCR反应的TaqDNA聚合酶的最适温度可高达70℃。目前四十三页\总数四十九页\编于六点5.2pH对酶促反应速度的影响通常在一定pH下,酶会表现出最大活力,而一旦高于或低于此pH,酶活力就会降低,我们把表现出酶最大活力时的pH称为该酶的最适pH。在不同pH条件下进行某种酶促化学反应,然后将所测得的酶促反应速度相对于pH来作图,即可得到如图3-10所示的钟罩形曲线。图3-10pH对酶活力的影响目前四十四页\总数四十九页\编于六点pH影响酶活力的原因可能包括以下3个方面:(1)过酸或过碱使酶的空间结构遭到破坏,引起酶变性从而导致酶构象的改变、酶活性随之丧失。(2)pH影响了底物的解离状态或酶分子活性部位上有关基团
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