HBV基因分型的检测方法和临床意义课件

HBV的基因型和分布根据ＨＢＶ全基因核苷酸序列异源性≥８％或者Ｓ基因区核苷酸序列异源性≥４％，将不同病毒株分为不同的基因型，迄今为止，ＨＢＶ可以分为８个基因型，即Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄ、Ｅ、Ｆ、Ｇ和Ｈ型。

2.A型：西欧,北欧、北美洲及非洲地区;B型和C型：亚洲,澳大利亚;D型：中东、北非和南欧;E型：非洲撒哈拉沙漠地带;F型：美国;G型：法国和美国;H型：尼加拉瓜、墨西哥,及美国加里弗尼亚地区。HBV的基因型和分布17.281.4533212.284.70%20%40%60%80%100%中国(上海）台湾日本其他基因型HBV基因型CHBV基因型B亚洲部分地区的基因型分布国内部分地区基因型分布100%80%60%40%20%

沈阳北京广州上海HBV基因型的临床意义近年来研究发现,HBV基因型具有如下意义HBV标志物清除病毒致病性乙型肝炎的病程及转归药物敏感性与HBV血清型比较,HBV基因型具有更加重要的意义。HBV基因型和ＨＢｅＡｇ的清除的关系临床资料显示，ＨＢｅＡｇ的清除可能与ＨＢＶ基因型有关。与Ｂ基因型相比，Ｃ基因型有更高的ＨＢｅＡｇ阳性率，分别为１６％与５３％。Ｂ基因型的自发性ＨＢｅＡｇ清除要比C基因型早１０年，并且在

ＨＢｅＡｇ清除后，肝脏生物化学指标持续正常。HBV标志物清除

HBeAg累积清除率JournalofMedicalVirology70:350–354(2003)HBV标志物清除

*

AmongpatientswithsinglegenotypeBorC,thosewithHBsAgseroclearancehadahigherproportionof

genotypeBandlowerproportionofgenotypeCwhencomparedtocontrols;oddsratio3.41;(95%CI,1.26-9.28);P=.014.

No.ofPatientsPatientsWithHBsAgSeroclearance(n=30)PatientsWithoutHBsAgSeroclearance(n=50)Singlegenotype*

A(%)1(3.3)2(4)

B(%)16(53.3%)15(30%)

C(%)10(33.3%)32(64%)

D(%)2(6.7)

-

Mixedgenotypes

A+D(%)1(3.3)

-

B+C(%)

-

1(2)HBV基因型与HBsAg转阴的关系Hepatology.2004Jun;39(6):1694-701.HBV标志物清除HBV基因型与病毒致制病性的关系日本学者Shiina分析了1744例HBsAg阳性者的基因型与肝功能异常的关系后发现,与B基因型相比,C基因型的肝功能异常更为常见。

C基因型引起的临床表现及组织学损伤更严重。

HBV基因型与肝硬化的关系病毒致病性KAO等在进一步对67例无症状HBV携带,103例慢性肝炎,32例肝硬化,20例肝细胞癌患者进行基因分型研究中发现,各组均以B/C型为主,C基因型所占比例按上述顺序逐渐增大,而B基因型的比例逐渐减小;与B基因型比较,C基因型在肝硬化及50岁以上的肝细胞癌患者中比例较高,而B基因型与50岁以下,特别是35岁以下的肝细胞癌患者有关。HBV基因型和肝细胞癌的关系病毒致病性HBV基因型与抗病毒药物敏感性的关系

不同基因型HBV感染对干扰素治疗的反应有差别

Kao对58例慢性乙型肝炎患者给予干扰素治疗48周,B基因型和C基因型的完全应答率(血清ALT恢复正常,HBeAg消除,HBVDNA转阴)分别为41％和15％,说明干扰素对B基因型治疗效果较好。KaoJH,etal.JHepatol2000;33:998–1002.核苷类药物疗效与HBV基因型的关系。Intervirology2003;46:373–376注：最近文献倾向于没有两者没有差异，但是基因型B除外。检测基因分型的常见方法基因测序法

PCR-RFLPELISA

生物芯片

实时荧光PCR法核酸序列测定法检测HBV基因分型方法首先采用末端终止法，获得待检样本的核酸序列，通常按照国际惯例选择HBVS区基因进行扩增，获得HBVS区的序列，然后将该序列与国际基因库中HBV各个基因型的标准序列进行比对，建立亲缘树，分析待检HBV与何种基因型的遗传距离最近，即判断为该种基因型。HBV亲缘树分析B基因型C基因型B、C混合型荧光PCR检测特点：1.准确性好:与核酸序列测定分型比较，两者结果吻合率100%。2.有效防污染:PCR反应和分析在完全闭管条件下进行，同时采用了d-UTP-UNG系统，有效防范PCR产物污染，提高检测结果的可靠性。3.操作简单、耗时短、结果判断直