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文档简介
chymotrypsin胰凝乳蛋白酶2021/5/91胰凝乳蛋白酶的结构
2021/5/92
酶
氨基酸残基数
活性部位的氨基酸残基
核糖核酸镁A124His12,His119,Lys41
溶菌镁129Asp52,Glu35
胰凝乳蛋白酶
241His57,Asp102,Ser195
胰蛋白酶
223His57,Asp102,Ser195
弹性蛋白酶240His57,Asp102,Ser195
胃蛋白酶348Asp32,Asp215HIV-1蛋白酶99×2Asp25
木瓜蛋白酶212Cys25,His159
枯草杆菌蛋白酶275His64,Ser221,Asp32
碳酸酐酶259His94-Zn-Lys96His119
羧肽酶A307Arg127,Glu270,Tyr248,Zn2+
旰乙醇脱氢酶374×2Ser48,His51,NAD+,Zn2+某些酶活性部位的氨基酸残基2021/5/93二、共价催化一、酸碱催化三、金属离子催化2021/5/94酸碱催化
定义:酸碱催化是通过瞬时的向反应物提供质子或从反应物接受质子以稳定过渡态,加速反应的一类催化机制。2021/5/95酶分子中可作为总酸碱催化的功能基团
氨基酸残基广义酸基团(质子供体)广义碱基团(质子受体)2021/5/96胰凝乳蛋白酶通过酸碱催化使肽键断裂
水解2021/5/97共价催化定义:在催化时,亲核催化剂或亲电子催化剂能分别放出电子或汲取电子并作用于底物的缺电子中心或负电子中心,迅速形成不稳定的共价中间复合物,降低反应活化能,使反应加速。2021/5/98
需要金属的酶可以分为:金属酶和金属-激活酶两类
金属离子以3种主要途径参加催化过程(1)通过结合底物为反应定向(2)通过可逆地改变金属离子的氧化态调节氧化还原反应(3)通过静电稳定或屏蔽负电荷金属离子催化2021/5/99胰凝乳蛋白酶酶-底物复合物
疏水口袋催化三联体
活性部位底物(一种多肽)胰凝乳蛋白酶反应的详细机制2021/5/910②Ser195-OH的O与肽键的羰基C共价结合,H结合于His57的N上胰凝乳蛋白酶反应的详细机制
2021/5/911③产物1His提供H给肽键的N形成-NH2,肽键断裂,释放第一个产物胰凝乳蛋白酶反应的详细机制
2021/5/912加水,His-N攻击H2O的H,OH-的O攻击羰基C
胰凝乳蛋白酶反应的详细机制
2021/5/913⑤His-N攻击H2O的H,H2O裂解,OH-的O攻击羰基C胰凝乳蛋白酶反应的详细机制
2021/5/914⑥His-NH提供H给Ser的O,第二个产物形成,但仍与酶结合
胰凝乳蛋白酶反应的详细机制
2021/5/915⑦第二个产物释放,酶再生
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