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文档简介

酶切回收连接第1页,共21页,2023年,2月20日,星期四质粒DNA的酶切第2页,共21页,2023年,2月20日,星期四定义:识别dsDNA的特异序列,并在识别位点或其周围切割双链DNA的一类内切酶。限制性核酸内切酶第3页,共21页,2023年,2月20日,星期四Ⅱ类内切酶作用特点能在特殊位点识别和切断dsDNA,识别序列4-6bp,具有回文结构(180度旋转对称结构)HindⅢ产生5'粘性末端AAGCTTTTCGAAAAGCTTTTCGAA第4页,共21页,2023年,2月20日,星期四SstⅠGAGCTCCTCGAG产生3'粘性末端GAGCTCC

TCGAG粘端切口第5页,共21页,2023年,2月20日,星期四GTCCAGHindⅡGTCGACCAGCTGGACCTG+平端切口第6页,共21页,2023年,2月20日,星期四第一个字母取自产生该酶的细菌属名,用大写;第二、第三个字母是该细菌的种名,用小写;第四个字母代表株;用罗马数字表示发现的先后次序。3、命名:HindⅢ

Haemophilusinfluenzaed株流感嗜血杆菌d株的第三种酶属

株序书写方法:前3个字母斜体第7页,共21页,2023年,2月20日,星期四酶活性单位指在限定条件下(温度、Buffer),1hr消化1ugDNA的酶量称为一个酶单位(unit)。实际工作中,为保证消化完全,1ugDNA的消化需要3-5个单位的酶,反应时间也要适度延长,通常是反应过夜。第8页,共21页,2023年,2月20日,星期四酶切反应系统的设计回收DNA通常酶切10μg实际酶的用量应是理论用量的3-5倍。酶通常保存在50%的甘油中,使用时甘油浓度必须小于5%,故酶至少稀释10倍。Buffer通常是10×,使用时稀释10倍。总反应体积20-50ul,不足用tdH2O补足。第9页,共21页,2023年,2月20日,星期四DNA的量酶的用量(U/C)酶在50%甘油中,甘油在总体积的浓度要小于5%反应的总体积Buffer的体积水的体积第10页,共21页,2023年,2月20日,星期四质粒DNA15μl(10μg)HindIII(20U/μl)

1.5μl10×缓冲液E3μl三蒸水9μl_____________________________________总体积

30μlXbaI(20U/μl1.5μl加样顺序加样后混匀,短暂离心,使之至管底。第11页,共21页,2023年,2月20日,星期四DNA片段的

分离纯化第12页,共21页,2023年,2月20日,星期四四、操作步骤:关键操作:点样在加样孔正上方,不要进入孔中甚至戳穿孔底加样器一旦按下,就一定保持按住直至加样器离开加样孔,否则会将样品又吸回到tip中,使加样失败第13页,共21页,2023年,2月20日,星期四载体DNA目的基因第14页,共21页,2023年,2月20日,星期四

bp—1534—994—695—515—377—237

ABCM

第15页,共21页,2023年,2月20日,星期四酚抽提法切下含目的DNA的胶块。加入酚,将胶块没过即可。振荡后低温冻结,视温度而定时间。30℃水浴融化,若体积小,可补加TE。振荡器上振荡。12,000rpm离心5min。取上清200μl。第16页,共21页,2023年,2月20日,星期四用200μl的氯仿:异戊醇抽提(振荡,离心12000rpm,5min,取上清)。加20μlNaAc,400μl无水乙醇沉淀DNA,冰冻约30min甚至过夜。12,000rpm离心10min,弃上清。将DNA溶于约30μlTE中。第17页,共21页,2023年,2月20日,星期四DNA片段的连接反应第18页,共21页,2023年,2月20日,星期四

DNA连接酶ligase催化DNA5'磷酸基与3'羟基之间形成磷酸二酯键(ATP)

5'5'3'3'OHPOHPDNA连接酶DNA连接酶第19页,共21页,2023年,2月20日,星期四总体积20μl载体0.1~0.2μg目的基因:载体mol数=1~5:1H2O10×buffer载体目的基因ligase总体积20μlμlμlμl

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