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文档简介

第三章_核酸的结构与功能详解演示文稿目前一页\总数五十二页\编于六点优选第三章_核酸的结构与功能目前二页\总数五十二页\编于六点核酸的分类及分布

90%以上分布于细胞核,其余分布于核外,如线粒体、叶绿体、质粒等。携带遗传信息,决定细胞和个体的基因型。分布于胞核、胞液。参与细胞内DNA遗传信息的表达。某些病毒RNA也可作为遗传信息的载体。(DNA)(RNA)脱氧核糖核酸

核糖核酸目前三页\总数五十二页\编于六点4第一节核酸的化学组成及其一级结构TheChemicalComponentandPrimaryStructureofNucleicAcid目前四页\总数五十二页\编于六点5一、核酸的化学组成1.

元素组成C、H、O、N、P(9~10%,定磷法测核酸含量。)2.

分子组成组成单位——核苷酸戊糖:核糖,脱氧核糖碱基:嘌呤碱,嘧啶碱磷酸目前五页\总数五十二页\编于六点6嘌呤(purine)腺嘌呤(adenine,A)鸟嘌呤(guanine,G)(一)碱基目前六页\总数五十二页\编于六点

嘧啶(pyrimidine)胞嘧啶(cytosine,C)尿嘧啶(uracil,U)胸腺嘧啶(thymine,T)稀有碱基!!!,次黄嘌呤等目前七页\总数五十二页\编于六点8(二)戊糖(五碳糖)(构成RNA)1´2´3´4´5´核糖(ribose)(构成DNA)脱氧核糖(deoxyribose)目前八页\总数五十二页\编于六点9核苷:AR,GRUR,CR脱氧核苷:dAR,dGR,dTR,dCR(三)核苷核苷(ribonucleoside)的形成碱基和核糖(脱氧核糖)通过糖苷键连接形成核苷(脱氧核苷)目前九页\总数五十二页\编于六点10核苷酸:AMP,GMP,

UMP,CMP脱氧核苷酸:dAMP,dGMP,dTMP,dCMP

核苷(脱氧核苷)和磷酸以磷酸酯键连接形成核苷酸(脱氧核苷酸)。

(四)核苷酸(ribonucleotide)目前十页\总数五十二页\编于六点Pi糖苷键OOHOCH2HOHNNNH2O磷酸酯键OPOOOHOHOCH2HOHNNNH2O目前十一页\总数五十二页\编于六点重要的核苷酸衍生物12

多磷酸核苷酸:NMP,NDP,NTPADPATPNOCH2OOHOHNNNNH2POOHOPOOHOPOOHOH目前十二页\总数五十二页\编于六点5´端3´端(五)核苷酸的连接1.核苷酸之间以磷酸二酯键连接形成多核苷酸链,即核酸。CANH2NNOPOHHOOOH3COOHPHOOOH3COOHNH2NNNN磷酸二酯键目前十三页\总数五十二页\编于六点A

G

P5PT

PG

PC

PTPOH3书写方法5pApGpTpGpCpT-OH

35

AGT

G

C

T

3目前十四页\总数五十二页\编于六点第二节DNA的结构与功能(StructureandFunctionofDNA)一、DNA的一级结构(一)定义核酸(DNA或RNA)中核苷酸从5’末端到3’末端的排列顺序。由于脱氧核苷酸间的差异主要是碱基不同,所以也称为碱基序列。DNA:A、T、G、CRNA:A、U、G、C目前十五页\总数五十二页\编于六点16二、DNA的二级结构——双螺旋结构目前十六页\总数五十二页\编于六点1.定义即平行反向的右手双螺旋结构。Watson,Crick于1953提出。2.研究背景(1)碱基组成分析Chargaff规则:[A]=

[T][G]

[C](2)碱基的理化数据分析A-T、G-C以氢键配对较合理(3)X-线衍射图谱分析

目前十七页\总数五十二页\编于六点18(二)DNA双螺旋结构模型要点DNA分子由两条相互平行但走向相反的脱氧多核苷酸链组成两链以-脱氧核糖-磷酸-为骨架,以右手螺旋方式绕同一中心轴。螺旋直径为2.4nm.螺旋表面形成大沟(majorgroove)及小沟(minorgroove)相间。沟状与DNA、蛋白质之间的相互作用有关。目前十八页\总数五十二页\编于六点19碱基垂直螺旋轴居双螺旋内側,与对側碱基形成氢键配对(互补配对形式:A=T;GC)。相邻碱基平面距离0.34nm,螺旋一圈螺距3.54nm,一圈10.5对碱基。(二)DNA双螺旋结构模型要点目前十九页\总数五十二页\编于六点20氢键维持双链横向稳定性,碱基堆积力维持双链纵向稳定性。(二)DNA双螺旋结构模型要点ATCGHNNNNNHOHNNCH3ONNNNOHHNHNNNOHH目前二十页\总数五十二页\编于六点(三).DNA双螺旋结构的多样性不同类型DNA的结构参数

A型-DNAB型-DNAZ型-DNA螺旋旋向右手螺旋右手螺旋左手螺旋螺旋直径2.55nm2.37nm1.84nm每一螺旋的碱基对数目1110.412螺距2.53nm3.54nm4.56nm相邻碱基对之间的垂直间距0.23nm0.34nm0.38nmWatson和Crick当年提出的是理想化的DNA双螺旋模型,后来发现其各项参数均与实际的DNA双螺旋结构有一定差异。

目前二十一页\总数五十二页\编于六点(四)DNA的高级结构1.原核生物DNA的超螺旋结构(1)定义即在DNA二级结构的基础上进一步折叠成环状或麻花状的超螺旋结构(superhelix或supercoil)。环状麻花状

目前二十二页\总数五十二页\编于六点(3)意义DNA超螺旋结构整体或局部的拓扑学变化及其调控对于DNA复制和RNA转录过程具有关键作用。①正超螺旋(positivesupercoil)盘绕方向与DNA双螺旋方同相同。②负超螺旋(negativesupercoil)盘绕方向与DNA双螺旋方向相反。(2)种类目前二十三页\总数五十二页\编于六点242.DNA在真核生物细胞核内的组装真核生物染色体由DNA和蛋白质构成,其基本单位是核小体(nucleosome)。目前二十四页\总数五十二页\编于六点

核心颗粒核小体连接区核心颗粒:由长约150bp的双螺旋DNA以超螺旋方式缠绕组蛋白八聚体1.75圈组成。连接区:由连接区DNA和组蛋白H1组成连接区DNA:连接相邻两个核心颗粒25核小体的构成

连接区DNA(约60bp)组蛋白H1DNA(约150bp)组蛋白八聚体目前二十五页\总数五十二页\编于六点组蛋白(histone)组蛋白种类:

H1、H2A、H2B、H3、H4组蛋白八聚体(核心组蛋白):由各二分子H2A、H2B、H3、H4组成八聚体H1

:位于连接区26H1

目前二十六页\总数五十二页\编于六点27StructureandFunctionofRNA第三节RNA的结构与功能目前二十七页\总数五十二页\编于六点28RNA的种类、分布、功能目前二十八页\总数五十二页\编于六点29*mRNA结构特点1.大多数真核mRNA的5´末端均在转录后加上一个7-甲基鸟苷三磷酸,形成帽子结构:m7GpppN。2.大多数真核mRNA的3´末端有一个多聚腺苷酸(polyA)结构,称为多聚A尾。一、信使RNA的结构与功能目前二十九页\总数五十二页\编于六点真核生物mRNA的帽子结构5'5'3.帽子结构和多聚A尾的功能mRNA核内向胞质的转位;mRNA的稳定性维系;翻译起始的调控。目前三十页\总数五十二页\编于六点31

转录核内DNA遗传信息的碱基排列顺序,并携带至细胞质,指导蛋白质合成中的氨基酸排列顺序。

DNAmRNA蛋白转录翻译原核细胞mRNA的功能遗传密码:每三个相邻的核苷酸组成碱基三联体,决定蛋白质中氨基酸的排列顺序。

目前三十一页\总数五十二页\编于六点1.tRNA分子含有较多的稀有碱基含10-20%稀有碱基,如DHU3´末端为—CCA-OH32二、转运RNA的结构与功能目前三十二页\总数五十二页\编于六点

稀有碱基目前三十三页\总数五十二页\编于六点tRNA的二级结构

tRNA的二级结构为平面卷曲的三叶草构型。(2)由单链卷曲形成局部环状双链。(3)反密码环,带有反密码子可破译遗传密码。(4)氨基酸臂,直接结合被活化的氨基酸。2.tRNA的二级结构目前三十四页\总数五十二页\编于六点352.tRNA的二级结构

——三叶草形茎环结构(发夹结构)氨基酸臂

DHU环反密码环附加叉(额外环)

TΨC环额外环氨基酸臂DHU环反密码环环TΨC环反密码子5'目前三十五页\总数五十二页\编于六点363.tRNA的三级结构——

倒L形*tRNA的功能搬运氨基酸到核糖体和识别密码子,参与蛋白质的翻译。目前三十六页\总数五十二页\编于六点4、氨基酸通过酯键连接在3’末端的2’-OH或3’-OH上。有的AA有一种tRNA载体,有的AA则有多个tRNA载体。5、

tRNA的功能破译遗传密码;活化、搬运氨基酸到核糖体,参与蛋白质的翻译。目前三十七页\总数五十二页\编于六点38*rRNA的结构*rRNA的功能参与组成核蛋白体,作为蛋白质生物合成的场所。目前三十八页\总数五十二页\编于六点(二)rRNA由单链卷曲构成的多茎环结构。(三)rRNA参与组成核糖体的大、小亚基,作为蛋白质生物合成的场所。(一)rRNA占总RNA的80%以上。三、核糖体RNA的结构与功能目前三十九页\总数五十二页\编于六点40(四)rRNA的种类(根据沉降系数)真核生物5SrRNA28SrRNA5.8SrRNA18SrRNA原核生物5SrRNA23SrRNA16SrRNA目前四十页\总数五十二页\编于六点41核糖体的组成原核生物(以大肠杆菌为例)真核生物(以小鼠肝为例)小亚基30S40SrRNA16S1542个核苷酸18S1874个核苷酸蛋白质21种占总重量的40%33种占总重量的50%大亚基50S60SrRNA23S5S2940个核苷酸120个核苷酸28S5.8S5S4718个核苷酸160个核苷酸120个核苷酸蛋白质31种占总重量的30%49种占总重量的35%目前四十一页\总数五十二页\编于六点四、小分子核内RNA与RNA组学(一)snmRNAs

除了上述三种RNA外,细胞的不同部位存在的许多其他种类的小分子RNA,统称为小非信使RNA(smallnon-messengerRNAs,snmRNAs)。包括核内小RNA、核仁小RNA、胞质小RNA、催化性小RNA、小片段干涉RNA。参与hnRNA和rRNA的加工和转运。(二)RNA组学RNA组学是研究细胞中snmRNAs的种类、结构和功能。生物的不同细胞、不同时间、不同状态下snmRNAs的表达具有时间和空间特异性。

目前四十二页\总数五十二页\编于六点43核酸的理化性质ThePhysicalandChemicalCharactersofNucleicAcid第四节目前四十三页\总数五十二页\编于六点

核酸是含磷酸和碱基的两性电解质,通常表现为较强的酸性。可用电泳和离子交换分离纯化核酸。在碱性条件下,RNA不稳定,可在室温下水解。利用这个性质可以测定RNA的碱基组成,也可清除DNA溶液中混杂的RNA。核酸是线性的大分子,其在溶液中的粘度很高。RNA分子比DNA短,在溶液中的粘度低于DNA。一、核酸的一般理化性质目前四十四页\总数五十二页\编于六点45一、核酸的一般理化性质中性条件下,核酸最大紫外吸收峰在260nm附件。目前四十五页\总数五十二页\编于六点461.DNA或RNA的定量OD260=1.0相当于50μg/ml双链DNA40μg/ml单链DNA(或RNA)20μg/ml寡核苷酸2.判断核酸样品的纯度DNA纯品:OD260/OD280=1.8RNA纯品:OD260/OD280=2.0OD260的应用目前四十六页\总数五十二页\编于六点二、DNA的变性与复性(一)变性

(denaturation)1.定义在某些理化因素作用下,DNA双链解开成两条单链的过程。本质是双链间氢键的断裂。3.变性后其他理化性质变化①OD260增高②浮力密度升高 ③粘度下降④酸碱滴定曲线改变⑤比旋度下降⑥生物活性丧失 (1)理化性质变化2.因素强酸,强碱,高温,高压,变性试剂如尿素以及某些有机溶剂如乙醇等。目前四十七页\总数五十二页\编于六点DNA变性的本质是双链间氢键的断裂目前四十八页\总数五十二页\编于六点(2)增色效应:

DNA变性时,更多的共轭双键暴露,其溶液OD260增高的现象。DNA的紫外吸收光谱200

2502603001.51.00.5波长(nm)吸光度值变性状态天然状态目前四十九页\总数五十二页\编于六点(3)Tm:紫外光吸收值达到最大值的50%时的温度称为DNA的解链温度,又称融

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