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文档简介
§2
BiosynthesisofRNATranscriptionReplicationreversetranscript一、转录(Transcription)概念:DNA的遗传信息转移到RNA分子中的过程,即通过酶促合成与基因编码链碱基序列相同的RNA链,转录产物有3种RNA:mRNA,rRNA,tRNA。DNA-DependentSynthesisofRNA不对称转录
在生物体内,DNA的两条链中只有一条用于转录,另一条链可能对转录起调节作用。用于转录的链为模板链(templatestrand)/负链/反义链/非编码链;另一条链称为非模板链/正链/有义链/编码链。
由于转录只在DNA的一条链进行,所以称为不对称转录。基因的有义链并不总是在染色体DNA的同一条链上。基因的转录是有选择的:时间(不同的发育时期)、空间(不同的器官组织/细胞)。 区别于复制!
转录单位
(transcript):被转录成单个RNA分子的一段DNA
|||
||5'终止序列promoter起始位点调节区转录因子:参与RNA聚合酶进行转录活动的辅助因子,为蛋白质。终止子:提供转录停止信号的DNA序列(核苷酸片段)。upstream-112downstream(一)RNA合成的酶促反应n1ATPn2GTPn3CTPn4UTP+DNAtemplate
AMPn1GMPn2CMPn3UMPn4RNARNApolymeraseMg2+,Zn2++(n1+n2+n3+n4)PPiRNAIsSynthesizedbyRNAPolymerase新合成链的5’端常是GTP或ATP,它们的5’–三磷酸基团在转录过程中保留完整。转录时,DNA双链只部分解链,新RNA链与模板链形成RNA-DNA杂交链。底物:NTP;方向:5’→3’有转录起始位点,合成不需要引物,RNA聚合酶“无校正功能”碱基配对:dT-A,dA-U,dC-G,dG-C基本特点!σ因子转录开始时识别转录起始点,使全酶结合在起始位点上,形成全酶-DNA复合物,而在转录合成开始后被释放,由核心酶催化RNA的合成。结合调控序列催化磷酸二酯键形成与模板DNA结合识别启动子,起动合成σ因子先识别-35区保守序列,并与之结合,该区是聚合酶的初始识别位点。原核中,-35与-10区之间的距离(16~19bp)对于转录很重要,而之间的碱基序列对转录并不重要。转录过程起始延长终止转录起始σ因子识别DNA上的起始位点形成全酶-DNA二元复合物DNA解链,形成转录泡(transcriptionbubble)β亚基催化形成RNA的第一个核苷三磷酸(GTP或ATP),形成启动子、全酶和核苷三磷酸组成的三元起始复合物合成8-9ntRNA后,σ亚基被释放脱离核心酶
ρ-非依赖性终止子:在终止点之前具有一段富含G-C的回文序列;富含G-C的区域之后是一连串的dA碱基序列,它们转录的RNA链的末端为一连串U(连续6个)。转录出的RNA形成的发夹结构中断了DNA-RNA杂合体的形成ρ-依赖性终止子
有的终止子要因子的帮助才能终止转录。其回文结构不富含G-C区,其后无寡聚U。细菌中少见,噬菌体中广泛存在。
(三)真核生物转录作用真核生物有三种RNA聚合酶:RNA聚合酶I、II、IIIP562~565真核生物的启动子由转录因子而不是RNA聚合酶所识别对α-鹅膏蕈碱的敏感性不敏感敏感中等敏感(四)转录过程的选择性抑制剂按照作用的对象、性质不同,分为2种:一、模板功能的抑制剂嵌合剂:如放线菌素D(p266)嵌入dG-dC之间溴乙锭EB为高灵敏度荧光试剂
吖啶二、RNA聚合酶的抑制剂原核生物:利福霉素(衍生物:利福平)真核生物:-鹅膏蕈碱1.rRNA前体的转录后加工(1)
原核生物rRNA前体的加工30S→16S、23S、5S、tRNA(2)真核生物rRNA前体的加工45S→5.8S、18S、28S(5SrRNA由其它途径产生)甲基化修饰:修饰在碱基(原)、核糖(真)上
剪切作用:需专一核酸酶参与
自我剪接:一种核酶的作用(真)加工过程2.tRNA前体的加工
细胞内tRNA种类多,各种tRNA加工方式不同,但主要方式有以下几种:除去前体5’和3’端多余的核苷酸(有时tRNA分子酶解产生2个或更多的tRNA)3’末端加上CCA碱基的修饰:甲基化、脱氨和还原作用碱基甲基化修饰:甲基供体是SAM(S-腺苷甲硫氨酸)。ProcessingoftRNAsinbacteriaandeukaryotesRNaseP(5’成熟酶)、RNaseD(3’成熟酶)均识别tRNA空间结构;碱基甲基化修饰:甲基供体是SAM(S-腺苷甲硫氨酸)。m7Gppp5’端加帽子结构5′,5′–三磷酸桥5’端加帽反应在RNA合成了30核苷酸后就开始进行。甲基化反应由SAM(S-腺苷甲硫氨酸)提供甲基。5‘端为三磷酸嘌呤核苷3’端加polyAa.thecleavagesignalsequencesisboundbyanenzymecomplex.b.TheRNAiscleavedbytheendonucleaseatapoint10to30nucleotides3‘to(downstreamof)thesequenceAAUAAA.c.Thepolyadenylatepolymerase(多聚腺苷酸聚合酶)synthesizesapoly(A)tail80to250nucleotideslong,beginningatthecleavagesite.RNASplicing:在基因转录过程中,内含子与外显子同时被转录,产物为RNA前体,切除前体中的内含子,将外显子连接形成成熟RNA的过程。*RNA剪接与RNA修饰无关,对不存在Cap、polyA的mRNA序列同样可以剪接。*真核生物细胞核mRNA前体的剪接是在形成剪接体(spliceosome)后才能进行。剪接体是包括mRNA前体在内的多组分复合物。*内含子一般以GU开始到AG结束。类型Ⅰ自我剪接两次转酯反应亲核试剂来自鸟苷酸真核生物细胞器基因,低等真核生物核rRNA基因,细菌和噬菌体个别基因。例:四膜虫6400nt
pre-rRNA的加工类型Ⅱ自我剪接两次转酯反应亲核试剂来自内含子真菌线粒体,植物叶绿体基因RNAediting:RNA编码序列的改变。RNArecoding:RNA读码和编码方式的改变。以RNA携带遗传信息,并能通过RNA复制与自身相同RNA分子的生物,如(+)RNA和(-)RNA:通常将具有mRNA功能的链称为(+)RNA,而它的互补链为(-)RNA。带(+)RNA的病毒可直接进行与病毒繁殖有关的蛋白质合成。1.(+)RNA病毒:不含复制酶,如灰质炎病毒和噬菌体Qβ。2.(-)RNA病毒:含有复制酶,如狂犬病病毒,H1N1流感病毒。3.(±)RNA病毒:含双链RNA和复制酶,如呼肠孤病毒。4.逆转录病毒:致癌RNA病毒,如白血病病毒,AIDS病毒。RNA复制类型以病毒RNA直接作为复制的模板;以病毒RNA为模板逆转录出cDNA,然后再从DNA转录出病毒RNA。特殊的复制方式三、逆转录(reversetranscription)
——RNA指导的DNA合成
1970年,Temin、Mizufani、Baltimore同时分别从致癌RNA病毒中发现RNA指导的DNA聚合酶——逆转录酶(reversetranscriptase),有利地证明了Temin于1964年提出的前病毒学说(previrustheory)。
(1975年获NobelPrize)
前病毒学说:致癌RNA病毒的复制需经过一个DNA中间体即前病毒,此中间体可部分或全部整合到细胞DNA中,并随细胞增殖而传递至子代细胞,细胞的恶性转化就是由前病毒引起的。所有已知的致癌RNA病毒都含有逆转录酶,因此被称为逆转录病毒(retrovirus),基因组均由两条相同的(+)RNA链所组成。逆转录酶是一种多功能酶,兼有3种酶活:RNA指导的DNA聚合酶活性DNA指导的DNA聚合酶活性核糖核酸酶H活性n1dATPn2dGTPn3dCTPn4dTTP+RNAtemplate
dAMPn1dGMPn2dCMPn3dTMPn4DNADNApolymerasePrimer,Zn
2++(n1+n2+n3+n4)PPi逆转录:以RNA为模板在逆转录酶的催化下合成与其碱基互补的DNA的过程。合成的DNA称cDNA(complementaryDNA)。逆转录过程需要引物
(tRNA)两次转换模板Primerbindingsite,PBSPolypurinetract,PPT1234/5RNA指导的DNA聚合酶活性核糖核酸酶H活性No3
-5proofreading1errorper20,000fasterrateofviralevolution6789/10Longterminalrepeat,LTRDNA指导的DNA聚合酶活性逆转录现象并不仅限于病毒。如后来发现的逆转座子,表明逆转录过程在细胞中频繁发生。但在一般的细胞中并无可觉察的逆转录酶活性。其实端粒酶就是一种逆转录酶,其活性只存在于胚胎和肿瘤细胞中,可能细胞的逆转录酶只在一定条件下才能表达,这也是细胞染色体遗传信息得以保持相对稳定的一个原因。OVER基因重组与DNA“克隆”geneticrecombination
and
DNAclone基因重组(geneticrecombination):染色体DNA分子内或分子间发生交换。自然界的基因转移和重组是无目的基因工程有目的1865年G.J.Mendel的豌豆杂交试验1944年O.T.Avery的肺炎球菌转化实验基因工程大事记1973Cohen第一例成功的克隆实验(美斯坦福大学)1978Genentech公司人胰岛素世界上第一种基因工程蛋白药物(美)
1982第一个基因工程药物--重组人胰岛素在英、美获准使用
1985第一批转基因家畜(兔、猪和羊),中国水生所不育转基因鱼1993保鲜延熟型西红柿在美国上市1999.9中国获准加入人类基因组计划,负责测定人类基因组全部序列的1%2000.6.26科学家公布人类基因组工作草图2001.2.11公布人类基因组基本信息克隆(clone)来自同一始祖的相同副本或拷贝的集合。获取同一拷贝的过程称为克隆化(cloning),即无性繁殖。DNA克隆DNA克隆应用酶学的方法,在体外将各种来源的遗传物质(同源的或异源的、原核的或真核的、天然的或人工的DNA)与载体DNA接合成一具有自我复制能力的DNA分子,继而通过转化或转染宿主细胞,筛选出含有目的基因的转化子细胞,再进行扩增提取获得大量同一DNA分子,也称基因克隆或重组DNA(recombinantDNA)。
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