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文档简介

蛋白互作网络

圆圈代表 ，线条代表间存在相互作用，圆

圈内部的结果代表蛋白的结构。线头颜色代表证明蛋白之间存在相互作用的不同 。(Aredlineindicatesthepresenceoffusionevidence;agreenline-neighborhood

evidence;ablueline-coocurrenceevidence;apurpleline-experimentalevidence;ayellowline–textminingevidence;alightblueline-databaseevidence;ablackline-coexpressionevidence.)

互作网络柱状图

互作网络邻接 数目柱状图

共表达网络

共表达网络

主要内容

String( )

mirConnX( )

Apackage

一种randomnetwork，即每一个节点的度相对平均。然而第二种图，即scale- network才是一种更稳定的选择。Scale- network具有这样的特点，即存在少数节点具有明显高于一般点的度，这些点被称

为hub。

Correlationanddistancearetransformedasfollows:fortype="unsigned",adjacency=|cor|^power;

fortype="signed",adjacency=(0.5*(1+cor))^power;

fortype="signedhybrid",adjacency=cor^powerifcor>0and0otherwise;andfortype="distance",adjacency=(1-(dis

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