我的生物化学笔记

20蛋白质含量=含氮量*6.25.（16%）三级结构：一条多肽链中所有原子在三的整体排布为三级结构。主要通过非共α－螺旋：1.3.60.54nm2.相邻螺旋圈之间形成许多氢键3.右手螺旋4.侧链基团位于螺旋的外侧9N1C1DNA）：DNA（ATCG）及其排列顺序。脱氧核苷DNA1）两条链方向相反、相互平行、主链是磷酸戊糖链，处于螺旋外侧。2）碱基在螺旋内侧并配对存在，ATGC对，AT（A-T），GC（G-C）。3）螺旋直径2nm，0.34mm，10bp3.4nm4）稳定因素主要是碱1．tRNA（分子量最小）：1.含较多稀有碱基；2.mRNA（含量最少，原核生物不需要进行加工即帽子结构和尾构）tRNA四个环的作用？见237页真核生物的mRNA（最短）结构特点：1、帽尾结构：5'-末端（首部）有m7-Gppp的帽子，3'-末端（尾部）有20-200多聚A的尾巴（polyA）2、.子：mRNA从5'-端起rRNA（5SRNA多）真核生物（5s、5.8s、18s、23s）原核生物（5s、16s、23s）素：加热或化学处理（如尿素、甲酰胺等）260nm收值增加。变性温度：也称（用Tm表示），紫外吸收值达最大增加值一半时的温度。DNADNAG-C，TmDNA，Tm时，TmDNATm260nmDNADNARNADNADNA-RNA（分子杂1.RNA23’，DNA2.假尿苷中糖苷C-C3.DNAB-DNAC-DNAA-DNA。(Z-DNADNA1）ATP、UTP、CTP2）辅酶类：NADH、FAD、COA）第二信使：cAMP、CGMP酶的作用特点:1.2.．高度的特异性(结构专一性又分绝对专一性和相对专一性。1.氧化还原酶。2．转移酶。34.5.异6．合成酶（必需基团—--结合基团、催化酶促反应动力学是研究酶促反应的速率和影响此速率的各种因素：1.2.3.pH4.激活剂对反应速5.H4）二）Km1．当V=1/2VmaxKm=[S],KmvV3．Km无关。KmKm》[s]呈线性关系，km《[s]零级反应。4.对底物的亲和力，Km（一）（二）3Km，Vmax2）KmVmx（3）KmVmax也变。1.较酶制的纯度用比，2最适温度（H）不酶的特性常1.发生部位：胞液2.两次低位水平磷酸化：磷酸烯醇式酸-- 酸1，3-二磷酸甘油酸- - 1，6-二磷酸果糖，磷酸烯醇式酸- 葡萄糖-----6-磷酸葡萄糖-6-磷酸果糖--- 1，6-二磷酸果糖--2分子磷酸丙-----1，3-二磷酸甘油酸------3-磷酸甘油酸--------2-磷酸甘油酸-酸烯醇式酸--酸1.糖酵解的生理意义：1.2.正常情况如红细胞下3.糖酵解是糖有氧氧化的前段过程，其一些中间代谢物是脂的反应。它们是糖无氧酵解途径的三个调节点，其中以6-磷酸果糖激酶1的活性是该途径中的主要调节点.F-2，6-BP是6-磷酸果糖激酶1最激活剂.酸的去路：1.在无氧条件下生成乳酸、乙醇2.在有氧条件下生成乙酰COA进入TCA循3.4.转氨基生成氨基酸酶有TPP，硫辛酸，FAD，NAD+，辅酶A。酸最后接受脱去的氢的是NAD+此过程也可TCA循环：1.发生部位：粒体，2.消耗一的乙酰COA3.四次脱氢、两次脱羧、一次底物水平磷酸化(琥珀酰COA—>琥珀酸)4.生成一FADH2.三NADH+H、2分子co2、1GTP，5.关键酶：柠檬酸合酶、异柠檬酸脱氢酶、α6.1COA10ATP7.三步不可逆反应：柠檬酸的生成、α-酮戊二酸的生COATCATCA循环的生理意义：（1）三是糖、脂和蛋白质三大物质代谢的最终代谢通路。糖、脂和蛋白质在体内代谢都最终生成乙酰辅酶A，然后进入三彻底氧化分解成水、CO2和产生能量。（2）三是糖、脂和蛋白质三大物质代谢的枢纽。(3) 一5-磷酸核糖糖异生：1.由非糖物质转变为葡萄糖或糖原的过程称为糖异生。2酸和生糖氨基酸等。3.4.反应特点：酸羧激酶。2.磷酸烯醇式酸、酸、草酰乙酸三者之间的反应构成酸羧化支路。3.此途径克服了两大，能量的及膜的。使糖酵解进行逆转，非糖物质转变成糖。如乳酸、甘油糖异生的生理意义：1.维持血糖水平恒定。糖异生的主要原料为2.GUDPGG3.UDPG 2.COA（为限速酶，生物素为其辅酶，长链脂肪酰COACOACOA）和脂肪酸合酶（ACP）的限速步骤，丙二酸COA抑制脂酰肉碱脂酰转移酶I活性，酯酰coA进入线粒体进行β—氧化）Iβ4步连续反应后，生成少2个碳原子的脂酰CoA。○4.每次β氧化生成1分子NADH，1分子FADH21CoA2CoA软脂酸：106ATP奇数碳原子最后生成乙酰COA和丙酰COA(丙酰COA羧化酶)珀酰COA 乙酰COA的去路：1.生成脂肪酸2.生成胆固醇3进入TCA.氧化供能4.生成（并不是脂肪代谢的物质）是脂肪酸在肝脏不完全氧化的中间产物1,。包括：乙酰乙酸，β-羟丁酸和2.原料：乙酰CoA3.部位：肝4.关键酶：HMG-CoA合成酶5利乙酰COA-乙酰乙酰COA+乙酰 HMG-CoA-乙酰乙酸-- 氨的去向1.重新利用合成氨基酸、核酸。2.Gln，Asn高等植物将氨基氮以Gln，Asn的形式在体内。（3）排出体外排氨动物以氨的形式排出。排尿酸动物：鸟类、爬虫类，以尿酸形式排出。排尿动物：以尿素形式排N5N10，SAM1.转氨偶联氧化脱氨基（主要在肝、肾）2.AMP（主要在天冬氨酸脱羧生成βGABA(神经性抑制剂)；组氨酸脱羧生成组胺（过敏、血压下降）；5-羟色胺（血压升高）氨的转运：12、谷氨酰胺转运（氨甲酰磷酸是高能化合物）I的。（I：II：存NI、II（鸟氨酸转氨甲酰酶）成瓜氨酸。瓜氨酸形成后就离开线粒体，进入细胞液。（总结：形成一分子尿素可清除2分子氨（一来自游离的氨，一来自天冬氨酸）及CO23ATP4TCA（包括尿素）也是嘌呤代谢的终产苷酸还原酶）；dUMPTMPN5，N10-甲烯四氢叶酸。CO2PRPP(5-磷酸核糖焦磷酸)IMP（次黄嘌呤核苷酸）XMP（黄嘌呤核苷酸GMP一、在细胞内，DNA的合成方式有两种：1.DNA2.逆转录３．ＰＣＲ（扩增）二、DNA（一）DNA的半保留：每个子代DNA分子的一条链来自亲代，另一条则是新合成的，这样的合成方式称为半保留。①解链酶结合于起始区，开DNA双链。然后，单链结合蛋白（ＳＳＢ）结合到发体结合于被打开的DNA单链上，合成出小段RNA引物。③DNA旋转酶在叉前面特定位点解旋，以释放叉前进过程中产生的张力。④DNA聚合酶Ⅲ进入起点，它识别3´-OHdNTP5´3´-OH长。⑤聚合反应继续到新链与前一个片段的RNA引物5'-端相遇时，DNA聚合酶Ⅲ脱离。⑥DNA聚合酶Ⅰ以其5´→3´外切酶切除RNA引物，产生的空缺也由DNA聚合酶ⅠRNADNA指导的RNA由RNA聚合酶催化，以NTP为底物DNA模板不需要引rRNA、mRNA、tRNARNA。1：RNADNA1、转录开始，RNA聚合酶σ因子识别启动子－35碱基序列，导致RNA聚合酶全酶与启动子特定部位紧密结合，并在－10序列局部打开DNA双螺旋，第一个G或A核苷三磷酸底物插入转录起始部位，与模板配对结合使转录开始。2、RNARNARNA5´3´-OH3´，5´-RNANTPRNA3、RNA到一定程度，σ因子从全酶脱落，由酶催化继续延伸4、刚合成的RNA与模板DNA之间形成杂交双链，但这种双螺旋不稳定，酶移过一段后，杂交双螺旋解开，两条DNARNA当酶沿模板3´→5´方向移动到终止信号区域时，转录终止。提供终止信号的DNA序列终止子在终止位点之前有一个二重对称序列(即回文序列)，当这段序列被转录，RNA由RNA聚合酶转录生成的RNA分子往往是，不具有生物活性的分子量较大的前体RNA。前体RNA一般需经加工才能变成具有生物活性的RNA。不同RNA分子加工过程有所不同，常ｍＲＮＡ的加工有１．内含子被切除，并将外显子连接起来２．３’端加尾巴（起缓冲答○1在中，DNA链解开，两条链分别作为模板；而转录则是不对称的，只有一条链作为模板②时两条链保持分开，DNA-DNA子螺旋稳定；而转录时形成的DNA-RNA杂种双链不稳定，RNA链很快从杂交链释放出来。③DNA时，子代DNA分子大小与亲代相DNARNADNA得多。④原料不同：RNANTPDNAdA－U，dG－C，dT－A，dC－G的互补原则合成出rRNA、mRNA、tRNA三类RNA。DNA的：四种dNTP（以四种脱氧核苷三磷酸(dNTP)5´-3´-OHDNA结合蛋白，DNA，DNA（原核生物主要聚合酶），DNA（修复3'模板，在其上也是从5'→3'合成DNA新链，但新链合成的方向与叉移动的方向正好相反，所以随叉的移动只能合成出许多不连续的DNA片段，该片段称为片段。片段在DNA连接酶的作用下，连成一条完整的DNA链，该链称为滞后链。先导链的是连续的而滞后链的是不连续的，故这种模式称为半不连续。⑧RNA3→5´5→3´Mg2Mn2+参与1．遗传2.三联体３．开放阅读框架4.遗传的特性１．通用性２连续性、３蛋白质的合成方向从N C,原核生物其实氨基酰-tRNA是甲硫氨酰-ｔＲＮＡ,氨基酸与tRNA的3’-OH形成酯键为子所特定的氨基酸tRNA结合到白体的A位，称为进位。氨基酰tRNA在进位前GTPEF-TuGTPtRNAAGTPGDP，EF-TuGDPAtRNAACP:酰基载体蛋白AMP:腺嘌呤核苷一磷酸ATP：腺嘌呤核苷三磷酸B:生物素羧基载体蛋白：环化腺苷酸