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文档简介
第二十章蛋白质和核酸
氨基酸是羧酸分子中碳链上的氢原子被氨基取代后的生成物。分子中含有氨基和羧基两种官能团。(1)按氨基酸按分子中所含-NH2和-COOH的相对位置,可将其分为:与人关系最为密切的是α-氨基酸。它是构成蛋白质的基本单元。
一
氨基酸(一)氨基酸的分类与命名1.分类在这20种α-氨基酸中,有八种是人体所需要的必需氨基酸(即人体本身不能合成的氨基酸)。它们是:(3)按烃基类型可分为:脂肪族氨基酸,芳香族氨基酸,含杂环氨基
2.命名:氨基酸可以按照系统命名法,以羧酸为母体,氨基酸为取代基来命名。但α-氨基酸通常按其来源或性质所得的俗名来称呼。例如:门冬氨基酸最初是由天门冬的幼苗中发现的;甘氨酸是因为具有甜味而得名。
NH2CH2COOH
α-氨基乙酸甘氨酸HOOC—CH2—CH2—CH—COOHNH2
α-氨基戊二酸谷氨酸NH2CH2CH2COOHβ-氨基丙酸丙氨酸NH2CH2CH2CH2CH2CHCOOHNH2α,ε二氨基已酸赖氨酸
蛋白质水解可以得到各种α-氨基酸的混合物。除甘氨酸外,所有的氨基酸分子的α-碳原子都具手性碳原子。因而都具有旋光性。而且发现主要是L型的(也有D型的,但很少)。
3氨基酸的构型用D/L体系表示——在费歇尔投影式中氨基位于横键右边的为D型,位于左边的为L型。用R、S命名的则L构型的氨基酸多为S型,只有L-半光氨酸为R型。1)形成内盐2)成盐3)氨基酸存在形式
氨基酸在溶液中存在下列平衡:溶液pH<等电点等电点(pI)溶液pH>等电点
4)等电点调节溶液的pH值,使-NH2和-COOH的离子化程度相等(即氨基酸分子所带电荷呈中性——处于等电状态)时溶液的pH值称为氨基酸的等电点。常以pI表示。
1)等电点为电中性而不是中性(即pH=7),在溶液中加入电极时其电荷迁移为零。中性氨基酸pI=4.8-6.3酸性氨基酸pI=2.7-3.2碱性氨基酸pI=7.6-10.82)等电点时,偶极离子在水中的溶解度最小,易结晶析出。可用调节氨基酸等电点的方法分离氨基酸的混合物。
注意:3氨基酸的反应(1)氨基酰化乙酰氯、醋酸酐、苯甲酰氯邻苯二甲酸酐等都可用作酰化剂。在蛋白质的合成过程中为了保护氨基则用苄氧甲酰氯作为酰化剂。1)氨基的反应(2)氨基的烃基化氨基酸与RX作用则烃基化成N-烃基氨基酸:氟代二硝基苯在多肽结构分析中用作测定N端的试剂。(3)与亚硝酸反应反应是定量完成的,衡量的放出N2,测定N2的体积便可计算出氨基酸中氨基的含量。受热反应3)与茚三酮反应(鉴别α-氨基酸的灵敏方法)PH5~7茚三酮紫色N-取代的α-氨基酸如脯氨酸,β-氨基酸、γ-氨基酸都不与茚三酮反应。1由醛制备(斯瑞克法)
醛在氨存在下加氢氰酸生成α-氨基腈,后者水解生成α-氨基酸。2α-卤代酸的氨化(赫尔-乌尔哈-泽林斯基法)(三)氨基酸的制备方法合成法合成的氨基酸是外消旋体,拆分后才能得到D-和L-氨基酸。二多肽
一分子氨基酸中的羧基与另一分子氨基酸分子的氨基脱水而形成的酰胺叫做肽,其形成的酰胺键称为肽键。(一)肽和肽键由2分子氨基酸缩合而成的肽称为二肽;
由3个氨基酸缩合而成的肽称为三肽;由n个氨基酸缩合而成的肽称为n肽;由多个氨基酸缩合而成的肽称为多肽。一般把含100个以上氨基酸的多肽(有时是含50个以上)称为蛋白质。无论肽链有多长,在链的两端,一端有游离的氨基(-NH2),称为N端;链的另一端有游离的羧基(-COOH),称为C端。C—端:保留游离的羧基;N—端:保留游离的氨基。由氨基酸组成的多肽数目惊人,情况十分复杂。假定100个氨基酸聚合成线形分子,可能具有20100中多肽。例如:由甘氨酸、缬氨酸、亮氨酸三种氨基酸就可组成六种三肽。甘-缬-亮;甘-亮-缬;缬-亮-甘;缬-甘-亮;亮-甘-缬;亮-缬-甘。三、多肽结构的测定和端基分析1多肽结构的测定主要是作如下工作:①了解某一多肽是由哪些氨基酸组成的。②各种氨基酸的相对比例。③确定各氨基酸的排列顺序。2多肽结构测定工作步骤如下:1)测定分子量(相对分子质量)2)氨基酸的定量分析将水解后的氨基酸混和液用氨基酸分析仪进行分离和测定。2)测定C端(1)多肽与肼反应所有的肽键(酰胺)都与肼反应而断裂成酰肼,只有C端的氨基酸有游离的羧基,不会与肼反应成酰肼。这就是说与肼反应后仍具有游离羧基的氨基酸就是多肽C端的氨基酸。(2)羧肽酶水解法
在羧肽酶催化下,多肽链中只有C端的氨基酸能逐个断裂下来。4.肽链选择性地裂解并鉴定上述测定多肽结构顺序的方法,对于分子量大的多肽是不适用的。对于大分子量多肽顺序的测定,是将其多肽用不同的蛋白酶进行部分水解,使之生成二肽、三肽等碎片,再用端基分析法分析个碎片的结构,最后将各碎片在排列顺序上比较并合并,即可推出多肽中氨基酸的顺序。部分水解法常用的蛋白酶有:胰蛋白酶——只水解羰基属于赖氨酸、精氨酸的肽键。糜蛋白酶——水解羰基属于苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸的肽键。溴化氰———只能断裂羰基属于蛋氨酸的肽键。例:某八肽
完全水解后,经分析氨基酸的组成为:丙、亮、赖、苯丙、脯、丝、酪、缬。端基分析:N-端丙……
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