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文档简介

第五章遗传信息的表达第一页,共三十七页,2022年,8月28日1中心法则:prDNARNA转录逆转录翻译

第一节转录(transcription)以DNA为模板合成RNA的过程第二页,共三十七页,2022年,8月28日2第三页,共三十七页,2022年,8月28日3(4)模板:复制:两条全部DNA分子;转录:一条DNA分子的部分与复制的相同之处:(1)都以DNA为模板.(2)都以nt为原料,合成方向都是5'3'.(3)都服从碱基配对原则不同之处:(1)四种原料不同:DNAdNTP,RNANTP(2)配对碱基不同:A=T;A=U(3)酶不同: DNA聚合酶;RNA聚合酶第四页,共三十七页,2022年,8月28日4一、原核生物RNA的生物合成(一)RNA聚合酶(RNApolymerase):1种RNA合成的错误率为10-6(DNA合成的错误率为10-9-10-10)大肠杆菌中:全酶为:五聚体(2'):

:识别结合启动子

2:启动子上游

:催化形成二酯键

':酶与模板的结合部位需Mg2+,Mn2+,无校对功能第五页,共三十七页,2022年,8月28日5(二)转录模板基因1:链2:转录模板链(templatestrand)or反意义链(antisensestrand)链1:信息链or有意义链(sensestrand)or编码链(codingstrand)基因2:链1:转录模板链(templatestrand)or反意义链(antisensestrand)链2为信息链or有意义链(sensestrand)or编码链(codingstrand)第六页,共三十七页,2022年,8月28日6(三)转录过程

1、起始阶段:不需要引物,全酶中识别并结合启动子DNA构象发生变化RNA聚合酶催化两个相邻的nt与模板配对第一个nt为5'pppGorpppA,第二个nt有游离3'-OH继续加入NTP,延长几个nt之后因子脱落全酶-DNA-pppGpN'-OH称为起始复合物第七页,共三十七页,2022年,8月28日72、延长阶段:核心酶(coreenzyme)沿模板3'5'滑行,RNA按5'3'方向合成>12nt,RNA5'端与DNA模板脱离mRNA:45nt/sec,rRNA:90nt/sec3、.终止阶段两种方式:因子不依赖终止

因子依赖终止第八页,共三十七页,2022年,8月28日8RNA酶行进到模板的终止子部位(富含GC,可在RNA上形成发夹结构)发夹结构影响RNA酶的行进RNA链先从DNA上释放,再与核心酶分离终止转录(1)因子不依赖终止图5-1第九页,共三十七页,2022年,8月28日9

因子与RNA聚合酶结合(终止子)使RNA-DNA杂交体解开因子、RNA聚合酶与DNA分离转录终止(2)因子依赖终止图5-2第十页,共三十七页,2022年,8月28日10第十一页,共三十七页,2022年,8月28日11(四)、转录后加工初级转录产物(primarytranscrips):一个操纵子转录出的一条完整RNA。mRNA:不需要加工rRNA:需加工、修饰tRNA:需加工、修饰6个基因:3个tRNA16srRNA23srRNA称为30sRNA5srRNA间隔序列如大肠杆菌rrnD操纵子(rRNA、tRNA混排)图5-3第十二页,共三十七页,2022年,8月28日12第十三页,共三十七页,2022年,8月28日1330sRNA核酸内切酶(RNaseP)16s、23s、5srRNA前体+tRNA前体

(内、外切酶)(1)剪切作用:多余序列切除原间隔序列(2)添加和修复3‘端CCA序列(3)某些碱基的化学修饰

成熟16s、23s、5srRNA成熟tRNA第十四页,共三十七页,2022年,8月28日14二、真核生物RNA的生物合成(一)RNA聚合酶pol1:核仁:5.8S、18S、28SrRNApol2:核浆:mRNApol3:核浆:tRNA(二)转录单位:为一个基因(一个结构基因加相应调控元件)三、转录过程:第十五页,共三十七页,2022年,8月28日151.起始阶段:需一些蛋白质参与,称转录因子(transcrptionfactor,TF)(1)mRNA前体的转录图5-4:pol2TF2D(含一个TATAbox结合蛋白(TBP)和多个TBP结合因子(TAF))+TATAboxTF2A,TF2B结合TF2DTF2F+pol2结合TF2BTF2E、TF2H加入,形成起始复合物第十六页,共三十七页,2022年,8月28日16第十七页,共三十七页,2022年,8月28日17人基因:核心启动子+上游调控元件(UCE)转录因子:上游结合因子(UBF1)、选择因子1(selectivityfactor1,SL1)(含一个TBP和3个TBP结合因子)(2)rRNA前体的转录:pol1UBF1与核心启动子和UCE结合SL1与UBF1结合pol1与SL1中的TBP结合起始转录第十八页,共三十七页,2022年,8月28日18第十九页,共三十七页,2022年,8月28日19基因:Abox、BboxTF3C结合与BboxTF3B结合与启动子pol3进入(3)tRNA、5SrRNA:pol3第二十页,共三十七页,2022年,8月28日203、终止阶段:机制不清2、延长阶段:与原核生物相似,方向5'3'第二十一页,共三十七页,2022年,8月28日217mG:5'-5'磷酸二酯键(正常:3'-5'磷酸二酯键)(四)转录产物的加工5'端加帽子1.mRNA前体的加工:3'端加尾巴(polyA)去除内含子拼接外显子(1)5'端加帽子(capping)图5-51型帽子结构:m7G-nt1(2'-OH被甲基化)2型帽子结构:m7G-nt1(2'-OH被甲基化)-nt2(2’-OH被甲基化)两种:第二十二页,共三十七页,2022年,8月28日22(2)3'端加尾巴(polyAtail)图5-6mRNA中AAUAAA序列被核酸内切酶识别并在其下游11nt-30nt处切断,在polyA聚合酶作用下加入polyA.第二十三页,共三十七页,2022年,8月28日23(3)去除内含子拼接外显子(splicing):图5-7剪接反应:在剪接体(spliceosome)中进行(两步)SnRNA:U1,U2,U3…..U6蛋白质内含子的结构:5'GU------------------A-------AG3'(5'剪切位点)(分支点)(3'剪切位点)第二步:5'外显子攻击3'剪接位点,两个外显子拼接,同时释放套索状中间产物.第一步:分支点A攻击5'侧剪接位点G,释放5'外显子.第二十四页,共三十七页,2022年,8月28日24mRNA内含子的自我剪接第二十五页,共三十七页,2022年,8月28日25特点:内含子自我剪接/核酶产物:套索结构(4)化学修饰:主要是甲基化修饰(5)RNA的编辑(RNAediting)隐蔽基因(cryptogene)产物如线粒体细胞色素氧化酶C亚基mRNA:在145个不同位点插入407个U,在9个不同位点删除19个U,编辑nt占成熟mRNA的一半以上。第二十六页,共三十七页,2022年,8月28日26(2)tRNA前体的加工A:tRNA前体的剪接:去除内含子和5'侧先导序列。B:添加或修复3'端CCA序列。C:化学修饰:形成稀有碱基。(3)rRNA前体的加工:A:rRNA前体的剪接;B:化学修饰第二十七页,共三十七页,2022年,8月28日27第三节翻译一、原核生物蛋白质的生物合成(一)蛋白质生物合成体系1、mRNA:(1)密码子(codon):每三个相邻的nt决定一个氨基酸。(2)开放阅读框(openreadingframe,ORF):从起始密码子到终止密码子。第二十八页,共三十七页,2022年,8月28日28(3)遗传密码:64个密码子的统称。密码子表(P78)

(1)起始密码子:AUG-met;(2)终止密码子:UAG,UAA,UGA(3)读写方向:5'3';(4)连续性;(5)兼并性:几个密码子决定同一个氨基酸;(6)通用性;特点:(7)摆动性(wobble):密码子的第三位与反密码子的第一位碱基的配对不十分严格。第二十九页,共三十七页,2022年,8月28日29第一位(5端)碱基第二位(中间)碱基第三位(3端)碱基

A

G

U

C

AAAA赖氨酸AAG赖氨酸

AAU天冬酰胺AAC天冬酰胺AGA精氨酸AGG精氨酸

AGU丝氨酸AGC丝氨酸AUA异亮氨酸AUG甲硫氨酸+起始信号AUU异亮氨酸AUC异亮氨酸ACA苏氨酸ACG苏氨酸

ACU苏氨酸ACC苏氨酸AG

UC

GGAA谷氨酸GAG谷氨酸GAU天冬氨酸GAC天冬氨酸GGA甘氨酸GGG甘氨酸GGU甘氨酸GGC甘氨酸GUA缬氨酸GUG缬氨酸GUU缬氨酸GUC缬氨酸GCA丙氨酸GCG丙氨酸GCU丙氨酸GCC丙氨酸AGUC

UUAA终止信号UAG终止信号UAU酪氨酸UAC酪氨酸UGA终止信号UGG色氨酸UGU半胱氨酸UGC半胱氨酸UUA亮氨酸UUG亮氨酸UUU苯丙氨酸UUC苯丙氨酸UCA丝氨酸UCG丝氨酸UCU丝氨酸UCC丝氨酸AGUC

CCAA谷氨酰胺CAG谷氨酰胺CAU组氨酸CAC组氨酸CGA精氨酸CGG精氨酸CGU精氨酸CGC精氨酸CUA亮氨酸CUG亮氨酸CUU亮氨酸CUC亮氨酸CCA脯氨酸CCG脯氨酸CCU脯氨酸CCC脯氨酸AGUC第三十页,共三十七页,2022年,8月28日30主要活性部位:A位(受位acceptorsite):氨酰tRNA(tRNA-a.a)进入的部位.P位(供位donorsite,peptidesite):肽酰tRNA(tRNA-a.a-a.a-a.a-a.a…a.a)占据的部位.2.核糖体(ribosome):rRNA+prs:是蛋白质合成的场所3.tRNA:氨基酸的运输工具,细菌中约30种-40种。4.各种蛋白质:起始因子:IF:IF-1;IF-2;IF-3。延伸因子:EF:EF-Tu;EF-Ts;EF-G。终止因子:RF:RF-1;RF-2;RF-3。第三十一页,共三十七页,2022年,8月28日315.氨基酰-tRNA合成酶:催化氨基酸与tRNA结合形成tRNA-a.a,具有特异性.1.起始阶段:IF-3+30SmRNAfmet-tRNAfmet-IF-2-GTP(IF-1促进该三元复合物形

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