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文档简介
北京大学有机化学22第1页/共55页第一节氨基酸的结构、名称及物理性质第二节氨基酸的性质第三节氨基酸的合成第四节多肽的定义、命名和结构第五节多肽的合成第六节多肽结构的测定第七节蛋白质的结构和特性第八节酶第九节核酸本章提纲第2页/共55页
蛋白质、碳水化合物、脂肪(甘油醇的脂肪酸酯)是人所需营养中的三种要素。第一节氨基酸的结构、名称和物性
羧酸分子中烃基上的一个或几个氢原子被氨基取代生成的化合物叫氨基酸。一定义第3页/共55页按氨基与羧基的相对位置分:α-氨基酸,β-氨基酸按氨基与羧基的数目来分:中性氨基酸、酸性氨基酸,碱性氨基酸三
氨基酸的构型和存在形式构型(用D、L表示)-氨基酸通式 L型-氨基酸D型-氨基酸 L-甘油醛除甘氨酸,天然-氨基酸都是有旋光的,而且都是L型的。二分类第4页/共55页存在形式:氨基酸都以偶极离子的形式存在。
组氨酸谷氨酸 丙氨酸 第5页/共55页四名称和物理性质
名称氨基酸的碳原子(除甘氨酸外)都是手性碳原子。其构型的表示方法与糖一样,用D或L表示。每个氨基酸都有俗名,并都用一个缩写符号表示。
物理性质大部分的氨基酸在水中有一定的溶解度;酸性的氨基酸在水中的溶解度较差;氨基酸在200度以下都是稳定的;氨基酸的pKa为2左右;每一个光学纯的氨基酸都有旋光值。第6页/共55页五八个必需氨基酸缬氨酸亮氨酸异亮氨酸苯丙氨酸苏氨酸蛋氨酸赖氨酸色氨酸第7页/共55页一等电点二与茚三酮反应三氨基酸金属盐络合物的形成第二节氨基酸的性质第8页/共55页谷氨酸 焦谷氨酸总述:具有胺和羧酸的共性。例如形成酰胺2分子甘氨酸 2,5-二嗪哌酮-2H2O-H2O第9页/共55页
一个氨基酸总可以找到一个pH值,在该pH值下,正、负离子的浓度完全相等,此时向阳极移动和向阴极移动的离子彼此抵消(即没有净的迁移),或者说,电场中不显示离子的迁移。将此时的pH值称为该氨基酸的等电点。氨基酸的特殊性质一等电点第10页/共55页中性氨基酸的等电点:pH=6.2~6.8
酸性氨基酸的等电点:pH=2.8~3.2
碱性氨基酸的等电点:pH=7.6~10.8
不同的氨基酸有不同的等电点,所以可以通过测定氨基酸的等电点来鉴别氨基酸。
等电点时,以两性离子形式存在的氨基酸浓度最大(在水溶液中),氨基酸的溶解度最小。第11页/共55页二与茚三酮的反应凡是有游离氨基的氨基酸都可以和茚三酮发生呈紫色的反应。茚 茚三酮水合茚三酮+紫色-CO2,-RCHO-3H2O互变异构第12页/共55页三氨基酸金属盐络合物的形成金属上有空轨道,N上有未共用电子对!
氨基酸金属盐络合物具有很好的结晶形状,该反应可用来沉淀和鉴别某些氨基酸。第13页/共55页一斯瑞克合成法--醛的氨氰化法二赫尔--乌尔哈--泽林斯基α-溴化法三
盖布瑞尔法四
丙二酸酯法第三节氨基酸的合成第14页/共55页改进方法:用NH4CNorNH4Cl+KCN代替HCN+NH3应用:合成比原料醛多一个碳的氨基酸氨基酸的来源:(1)天然产物酸性水解 (2)微生物发酵法 (3)化学合成法一斯瑞克合成法--醛的氨氰化法RCHO+HCN+NH3H3+O第15页/共55页应用盖布瑞尔法可以制备很纯的氨基酸。二
赫尔--乌尔哈--泽林斯基α-溴化法RCH2COOHNH3Br2P在封管或高压釜内进行三盖布瑞尔法H3O+第16页/共55页1.通过酰基丙二酸酯法四丙二酸酯法+NC-CH=CH2H3+OH2/Pt醋酸麦克尔加成碱H2/催加热-CO2第17页/共55页OH-丝氨酸的合成+CH2=OH3+O-CO2丝氨酸(65%)第18页/共55页2.通过溴代丙二酸酯法合成CH2(COOEt)2BrCH(COOEt)2ClCH2CH2SCH3HClBr2CCl4NaNaOH蛋氨酸(50%)
烷基化第19页/共55页谷氨酸的合成+CH2=CHCOOEt麦克尔加成NaOEtH3+O谷氨酸(70%)第20页/共55页脯氨酸的合成H3+ONaOEtBr(CH2)3BrEtOHNaOH脯氨酸70%分子内亲核取代第21页/共55页一个氨基酸的羧基与另一分子氨基酸的氨基通过失水反应,形成一个酰氨键,新生成的化合物称为肽,肽分子中的酰氨键叫肽键。二分子氨基酸失水形成的肽叫二肽,多个分子氨基酸失水形成的肽叫多肽。第四节多肽的定义、命名和结构一定义第22页/共55页二命名甘氨酸 丙氨酸 亮氨酸产物三肽的名称为:甘氨酰-丙氨酰-亮氨酸(甘-丙-亮)(Gly-Ala-Leu)-2H2O肽键C-端N端第23页/共55页1.肽键和肽的几何形状三结构2.二硫键Na+液NH3空气氧化Cys-Tyr-Ile-Glu-Arg-Cys-Pro-Leu-Gly•NH2SS牛催产素第24页/共55页一
氨基的保护二
羧基的保护三
侧链的保护四
接肽方法
1混合酸酐法2活泼酯法、
3碳二亚胺法4环酸酐法、
5固相接肽第五节
多肽的合成第25页/共55页保护基必须具备的条件(1)易在预定的部位引入(2)在某特定的条件下,保护基很易除去(3)引入和除去保护基时,分子中的其它部位不会受到影响,特别是已接好的肽键。多肽合成必须解决下面四个问题1.氨基保护2.羧基保护3.侧链保护4.接肽方法第26页/共55页C6H5CH2OH+COCl2(光气)一氨基的保护1.用氯代甲酸苯甲酯(或称苯甲氧基甲酰氯)保护Benzoxycarbonyl(简写Z)第27页/共55页H2Pd/C+NH3CH2CO2-OH-H+SOCl2+NH3CH2CO2-,OH-H+H+CF3COOH(1mol)上保护基接肽去保护基反应过程:第28页/共55页2用氯代甲酸三级丁酯保护t-Butoxycarbonyl
简写BOC在多肽中的应用:CF3COOHHOAc-OH,25oC上保护基接肽(过程略)去保护基第29页/共55页*1.催化氢化和稀碱都不能除去BOC,通常用温和的酸性水解法除去。*2.若氨基酸中有多个氨基,在接肽前均需保护。*3.用Z保护还是用BOC保护,视实际情况而定。第30页/共55页二羧基的保护使用的酸为:CF3COOHHBr/HOAcA代表:HClCH3OH接肽Na2CO3接肽Pd/H2(CH3)2C=CH2接肽H3+O去保护基去保护基上保护基上保护基上保护基去保护基AAA第31页/共55页例如:三侧链的保护
当氨基酸的侧链带有某些官能团时,在合成多肽时,有时也需要加以保护,保护的方法,要视具体情况而定。巯基经常用苯甲基保护,保护基可以在钠、液氨作用下除去。上保护基去保护基空气中氧化Na,NH3(l)第32页/共55页四接肽的方法1混合酸酐法(活化羧基)-OH,25oCN(C2H5)3-5-0oC-(C2H5)3N•HClH2/Pd-C接肽C6H5CH2OCOCl第33页/共55页2活泼酯法N(C2H5)3H+第34页/共55页3.碳二亚胺法接肽dicyclohexylcarbodimide(DCC)接肽H2/Pd-C去保护基第35页/共55页失水机制二环己基脲第36页/共55页1.保护氨基和活化羧基同时完成2.氨基甲酸不稳定4.环酸酐法接肽-CO2二肽环状酸酐21第37页/共55页5.固相接肽麦尔德发明;解决了蛋白质和多肽的一些合成问题。在不溶的高分子树脂的表面上进行接肽反应称为固相接肽。第38页/共55页测定肽或蛋白质的一级结构需要进行下面几项工作:一测定分子中是否存在二硫键二检测氨基酸的组成及其相对比例三测定肽或蛋白质中各氨基酸的排列顺序第六节多肽结构的测定第39页/共55页一测定分子中是否存在二硫键
多肽或蛋白质分子中有二硫键,需要切断。其方法是用过酸氧化。二检测氨基酸的组成及其相对比例该工作由氨基酸自动分析仪完成第40页/共55页
在N-端引入具有特定基团的标记化合物,这种标记基团有颜色、荧光、紫外吸收等性质,然后分离鉴定具有这种基团的氨基酸衍生物。三测定肽或蛋白质中各氨基酸的排列顺序1.N-端氨基酸单元的分析第41页/共55页DNFB+Gly-Ala-PheDNFB-Gly-Ala-PheDNFB-GlyAlaPheH+
水解105oCpH=8-9室温二硝基氟苯法(桑格尔法)第42页/共55页肼解法:当蛋白质(或多肽)与无水肼在100℃反应5-10h后,除C端氨基酸外,所有氨基酸都转变成相应氨基酸的酰肼,C端氨基酸则以游离氨基酸放出。
2.C-末端测定NH2-NH2100oC5-10hGly-Ala-PheGlyNHNH2AlaNHNH2Phe第43页/共55页第七节蛋白质的结构和特性相对分子质量超过1万的多肽称为蛋白质。蛋白质有两个重要的性质:盐析、变性第44页/共55页蛋白质有四级结构肽链中各种氨基酸相互联接的顺序是蛋白质的初级结构,也叫一级结构。多肽链主链骨架中的若干肽段,通过氢键,形成有规则的构象,这称为二级结构。
α-螺旋 β-折叠在二级结构的基础上,多肽链间通过氨基酸残基侧链的相互作用而进行盘旋和折叠,因而产生的特定的三维空间结构,这称为三级结构,也称为蛋白质的亚基。各个亚基在低聚蛋白中的空间排布及相互作用,称为蛋白质的四级结构。蛋白质的生理活性是由二级、三级、四级结构来决定的。第45页/共55页第八节酶酶:酶是一类在生物体内有催化活性的蛋白质。辅酶:与酶蛋白松弛地结合的辅助因子称为辅酶。辅基:与酶蛋白紧密地结合的辅助因子称为辅基。全酶:酶蛋白与辅助因子结合后形成的复合物称为全酶。第46页/共55页D-2-脱氧核糖的核苷+磷酸第九节核酸D-核糖+碱基结构组成核糖核苷酸核糖核酸D-核糖的核苷+磷酸核酸 脱氧核糖核酸
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