生物信息学期末期末复习

■、择:以哪一个是条序号：J01536

■

C.D.AAB134506确某个基因在哪些组织中表达的最直接获取相关信息方式是：■Unigene

C.LocusLinkD.一基因可能对应两个吗？■可能

不能下哪种数据库源于mRNA信：■

C.HTGS下哪个数据库面向人类疾病构建：EST

■OMIM

HTGS和GenBank什么区别：包括了全世界各个实验室和测序项目提交DNA序列

GenBank提的是非冗余序列■Refseq源于GenBank，供非冗余序列信息

GenBank源Refseq如你需要查询文献信息，下列哪个数据库是你最佳选择：OMIMB.

■PubMedPROSITE比从和ExPASy提取有关蛋白质序列信息的方法，下列哪种说法正确：因为的数据比EMBL更出的搜索结果将更多搜结果很可能一样，因GenBank和的列数据实际一样■搜索结果应该相当，但是xPASy中SwissProt录的输出格式不同天酰胺、色氨酸和酪氨酸的单字母代码分别对应于：■Q/W/YC.F/W/YQ/N/W10.直同定义为：■不物种中具有共同祖先的同源序列具有较小的氨基酸一致性但是有较大的结构相似性的同源序列C.同一物种中由基复制产生的同源序列同物种中具有似的并且通常是冗余的功能的同源序列11.下那氨基酸最不容易突变：丙氨酸

谷酰胺

C.甲氨酸

■半氨酸12.矩定义的进化距离为两同源序列在给定的时间有多少百分比的氨基酸发生改变：B.20%

■.80%

13.下哪句子最好的描述了两个序列全局比对和局部比对的不同：全局比对通常用于比对DNA序，而局部比通常用于比对蛋白质序列全比对允许间隙部比对不允许

C.全比对寻找全最大化部对寻找局部最大化■全局比对比对整体序列，而局部比对寻找最佳匹配子序列14.假你两条远源相关蛋白质序列。为了比较它们，最好使用下列哪和矩阵：■BLOSUM45和C.BLOSUM80和PAM250

和PAMBLOSUM10和PAM115.与打分矩阵比较分矩阵的最大区别是：最好用于比对相关性高的蛋白■它基于远相关蛋白的局部多序列比对

它基于近相关蛋白的全局多序列比对它合了全局比和局部比对16.如有段序列，它可能编码多少种蛋白质序列：

C.3

■/

17.要数库查询一段与某NA序编码蛋白质最相似的序列，应选择：B.blastp

C.tblastn■18.为么ClustalW一个采用了Feng-Doolittle渐比算法的程序）不报告值：ClustalW报告E

■使了全局比对

C.使了局部比对

因是多序列比对19.方提出“一旦是空隙，永远是空隙”规则的依据是：保证空隙不会引物序列加入而填充■假定最近序列空隙应该保留20.根分钟假说：所有蛋白质都保持一个相同的恒定进化速率

假进化早期分歧的序列有较高优先级别假最远序列空应该保留所有蛋白质的进化速率都与化石记录相符合C.对于每一个给定蛋白质，分子进化的速率是逐渐减慢的，就如同不准时的钟■对每一个给定的蛋白质，其分子进化的速率在所有的进化分支上大致是恒定21.系发树的两个特征是：进化分支和进化节点■树拓扑结构和分支度C.进分支和树根

序比对和引导测方法22.下哪个是基于字母特征的系统发生分析的算法：邻位连接）

Kimura算■最大然）

非权平均UPGMA23.基字特征和基于距离的系统发生分析的算法的基本差异是：■基于字母特征的算法没有定义分支序列的中间数据矩阵基字母特征的算法可应用DNA或蛋白质序列，而于距离仅能用C.基字母特征的法无法运用简约算法24.一操分类单元）指：

基字母特征的法的进化分支与进化时间无关多序列比对■蛋质序列25.构进树最直接的错误来源是：

C.进分支

进节点■多序列比对错误

采样的算法差异

C.假进化分支是一起源

尝推测基因的进化关系26.第个完整测定的基因组序列是：啤酒酵母的3号色体

流病毒■ФX174人类基因组27.普的核生物线粒体基因组编码大约多少个蛋白质：■10100C.1000028.根基组序列预测蛋白质编码基因的算法的最大问题是：软件太难使用■.假性率太高，许多不是显子的序列部分被错误指定C.假阳性率太高，多不是外显子功能未知29.HIV毒亚型的系统演化研究可以：证实HIV病是由牛病毒演化而来■.用指导开发针对保守蛋白的疫苗C.证实哪些人类组最容易遭受病毒侵染30.一典的细菌基因组大小约为多：

假性率太高，失太多外显子位点20000

■C.20000002000000031.细基组与真核生物基因组分析工具存在较大差异的主要原因是：细菌拥有不同的密码子

细菌没有细胞核C.细菌很少有基因真核同源■菌DNA的因含量、组成结构很不一32.下具最小基因组的原核生物可能是：嗜极生物

病■内细菌

杆/

33.要明大肠杆菌中的某个基因是水平转移而来，需要：分析该大肠杆菌中该基因的G含量与其他基因是否有很差异分析该大肠杆菌中该基因的密码子使用与其他基因是否有很大差C.系统发生分析该因与其他物种中基因的同源关系■获取以上三个方面的信息34.值盾是指：某些基因组中核苷C的量少

真生物基因组大小同编码蛋白质的基因个数没有相关性■真核生物基因组大小同屋中的复杂性相关性很小35.成上个的复序列元最可能出现在：

真生物基因组小同进化上的年龄相关性小散布性重复序列中

假基因中■端粒中

片复制区域36.从预真核基因的原因有：外显/内含子边界难以确定

内子长度可能只有几个碱基对C.编码区域的含量并不总是与非编码区相同■以三个方面的原因37.人基组大小大约是多Mb

B.

■3000D.3000038.各重元件在人类基因组中大约占的百分比为：A.5%

■D.39.蛋质码区域占人类基因组百分比是：■40.人基组中GC含高的区域：

5-10%10-20%D.基因密度相对较低■因密度相对较高

C.基密度多变

基所含密码子相对较少41.人复孟德尔遗传的基因疾病约占疾病基因的：■42.单因病趋向于：

C.50%60%■在通人群较少见，并且发生时间较早C.在普通人群较少，并且发生时间较晚

在通人群较常见，并且发生时间较早在通人群较常，并且发生时间较晚名解生物息（bioinformatics是一门结合生物技术和信息技术从而揭示生物学中新原理的科学。鸟枪测（shotgunmethod一种测序方法，包括从基因组获得随机的、已测序的克隆片段，并且对初始基因的位置一无所知。：本局部相似性比对搜索工具列数据库中快速查找与给定的序列具有最优局部对准结果的序列的一种序列对算法。整体配alignment对两个核苷酸或蛋白质序列的全长所进行的比对。FASTA是第一个被广泛使用的数据库相似性搜索算法，这个程序通过扫描序列中“词”的小配对，而寻找最优局部比对。算法在计算机程序中包含的一种固定过程。序列对alignment将两个或多个序列排在一起，以达到最大一致性的过程（对于氨基酸序列是比较他们的保守性评序间的相似性和同源性。多序比（sequencealignment三个或多个序列之间的比对，如果序列同一列有相同结构位置的残基和（或）祖传的残基，则会在该位置插入空位。最佳配alignment两个序列之间有高打分值的排列。10.空位gap：两条序列比对过程中需要在检测序列或目标列中引入空位，以表示插入或删除。11.模块换阵在替换矩阵中，每个位置打分是在相关蛋白局部比对模块中观察到的替换的频率而获得的，每个矩阵被修改成一个特殊的进化距离。12.可接点变（一个用于衡量蛋白质序列的进化突变程度的单位。13.互补列complementarysequence）能够与其他DNA片根据碱基互补序列A与T配对G与/

配对）形成两练结构的核苷酸序列。14.保守列conserved）DNA分中的一个核苷酸片段者蛋白质中氨基酸片段，它们在进化过程中基本保持不变。15.邻接段一组在染色体上有重叠区域DNA片的克隆；16.支架由序列重叠拼接而成。17.注释annotation）数据库中原始的DNA基序列添加相关信息（比如编码的基因，氨基酸序列等）或其他的注解。18.基因测（geneprediction）计算机程序对可能的基因所做的预测，它是基DNA片段与已知基因序列的匹配程度的。19.直系源（指不同类的同源序列们在物种的形成事件中从一个祖先序列独立化而成的，可能有相似功能，也可能没有。20.旁系源paralogous是通过类似因复制的机制产生的同源序列。21.替换）指定的位置不相同的氨基酸进行连配，如果联配的残基相似的物化性质，那么替换是保守的。22.表达列签（EST一种短的片段，是cDNA分子的一部分，可用来鉴定基因，通常用于基因定位和基因图谱中。23.多态（）个个体之间的异多态性。24.序列式Motif）白质序列中短的保守区域，它们是结构域中保守性很高的部分。25.结构（：白质在折叠时候与其它部分相独立的一个不连续部分，他有自己独特的功能。26.开放读（位于DNA或起始密码子与终止密码子之间的序列。27.表达（profile）一个显示某个同源家族中指定位打分值和空位罚分的表格，可以用于搜索序列数据库。28.分子（molecularclock）于每一个给定基因（或蛋白质）其分子进化率大致是恒定的。29.系统生）指生物种族的进化历史，亦即生物体在整个进化谱30.分子化在研究物进化和系