免疫球蛋白基因组

免疫球蛋白基因组第一页，共十九页，2022年，8月28日ImmunoglobulinStructuresHeavychainandlightchain(λandκ)ConstantregionClass:IgA,IgD,IgE,IgGandIgMVariableregion–Antigenbindingsite第二页，共十九页，2022年，8月28日GenerationofdiversitiesAIDN-Regions第三页，共十九页，2022年，8月28日Part1Immunoglobulingermlinegenerepertoirestudy第四页，共十九页，2022年，8月28日IGHVgenerepertoireHighlypolymorphic226reportedgenesandallelicvariants104wasreportedinerror12putativenewpolymorphisms,3havebeensequencedConclusion:TheexistingIGHVgenerepertoireisfullofincorrectlyreportedsequences.第五页，共十九页，2022年，8月28日IGKVgenerepertoireanalysisCompilationofDatabase1863rearrangedIGKVsequencesfromtheEMBL66germlinegenesfromtheIMGTAlignmentsusingSmith-Watermanalgorithm.UnreportedIGKVallelesIGKValleleswithlownumberofunmutatedsequenceswerecollectedMultiplealignmentSharedmismatchesSequencingfromgenomicDNA第六页，共十九页，2022年，8月28日JunctionanalysisofIGKgenes435lowmutationsequences(<3IGKVmutations)wererealignedtodetermineIGKJgenesusingV-QUESTVJgeneuseageN-Region第七页，共十九页，2022年，8月28日第八页，共十九页，2022年，8月28日Results5reportedgenesmaybetheresultofsequencingerrorsIGKV1D-13*01andIGKV1-37*01maybefunctionalinsomeindividualsUnreportedpolymorphisms:IGKV1-16*02andIGKV2-30*02.TheexistingIGKVrepertoireisrelativelycompleteandaccurate第九页，共十九页，2022年，8月28日第十页，共十九页，2022年，8月28日ConclusionsNotonlyistherelittlediversityinthegermlinegenesofthekappalocus,butlittlejunctionaldiversityisgeneratedduringtheprocessofgenerearrangement.Theimmunoglobulingenerepertoirecanthereforebecharacterisedashavingextraordinarydiversityintheheavychain,andlimiteddiversityinthelightchain.第十一页，共十九页，2022年，8月28日Part2Sequencingimmunoglobulingenesfromallergicandparasitisedindividuals第十二页，共十九页，2022年，8月28日IgEandAllergyNaturalfunctionofIgE–ParasiteinfectionsIgEandAllergicdiseaseAntigenselectioninIgETherelationshipbetweenIgEandIgG4第十三页，共十九页，2022年，8月28日UnderstandingIgEmutationsinPNGPNGIgEvsPNGIgGOtherFactorsExposuretopathogensAge第十四页，共十九页，2022年，8月28日TwoQuestionsIsthereahigherlevelofmutationinantibodiesofPNGvillagers,comparedtoAustraliaurbanindividuals?Arehighernumbersofmutationsseeninolderindividuals?第十五页，共十九页，2022年，8月28日第十六页，共十九页，2022年，8月28日SampleNameIgEIgGNo.ofIgAverageMutationNo.No.ofIgAverageMutationNo.Australia1812.85217.6A000001019.5A0021102418.8A006910.61815.1A007815.600PNG2017.76619.8P002(Old)423620.3P008(Old)1417.11423.1P011(young)211.54618.8第十七页，共十九页，2022年，8月28日AcknowledgementsAndrewCollinsWilliamSewellKatherineJacksonVivekaSingh