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文档简介
周俊宜
分子生物学基本技能和策略生化技术电泳层析离心分光光度基因操作其它基因工程
分切接转筛表
电泳层析离心分光光度基因操作其它
分(离目的基因)切(割目的基因和载体)
接(连目的基因和载体)
转(化宿主细胞)
筛(选阳性克隆)表(达目的基因)基本模式“纵向”体系“横向”体系基因工程原理基因重组:不同的DNA分子间发生共价连接形成重组DNA分子。重组DNA质粒DNA基因片段1972年,P.Berg:构建第一个DNA重组分子1997年,动物克隆:克隆羊多莉1977年,基因工程产品的出现
H.W.Boyer,第一个基因工程产品(SS)1973年,S.S.Cohen:第一个基因克隆实验2001年,人类基因组计划pSC101抗四环素pR6-5抗卡那霉素DNA连接酶重组DNA分子EcoRI抗卡那霉素基因培养平皿卡那霉素基因四环素\卡那霉素基因大肠杆菌四环素平板抗四环素抗卡那霉素抗四环素\抗卡那霉素大肠杆菌SS蛋白重组体+SS基因大肠杆菌SS蛋白重组体+SS基因目的基因基因载体
目的基因基因载体重组体分切接转筛表总体技术路线1)化学合成法:较短的基因(60-80bp)用途:PCR引物测序引物定点突变核酸杂交探针2)基因文库限制性内切酶……克隆、转化、培养、鉴定基因组DNA基因文库基因组DNA文库限制性内切酶基因组DNA基因重组转化细菌体外包装引物引物3’5’5’5’3)PCR技术基因组PCR技术的基本过程模板DNAdNTP引物Buffer预变性模板DNAdNTP引物BufferTaqDNA聚合酶循环仪94oC5’94℃55℃72℃2载体DNA的选择功能:
为目的基因提供进入受体细胞的转移能力。为目的基因提供在受体细胞中的复制能力或整合能力。为目的基因提供在受体细胞中的扩增和表达能力。理想载体的基本条件:可转移性合适的复制位点多克隆位点:广泛、特异选择标志,便于筛选和鉴定分子较小,可容纳较大的外源DNA质粒噬菌体腺病毒载体逆转录病毒载体……种类:宿主细胞ori抗Amp宿主细菌含Amp培养基多种酶切口多克隆位点限制性内切酶单一酶切口多克隆位点ori复制起始点遗传标记Amppolylinker基因载体
噬菌体载体50kb+LARALARAEcoRⅠEcoRⅠlacZcI限制性内切酶酶切切酶切限制性内切核酸酶
在特异位点上切割DNA分子分三类,常用为Ⅱ类酶识别序列呈回文对称命名:酶来源的生物名称缩写属名-种名-株名-发现次序
5’-GAATTC-3’3’-
CTTAAG-5’5’-GTTAAC-3’3’-
CAATTG-5’EcoRⅠ的识别序列HaeⅠ的识别序列5’NNNNNNNGAATTCNNNNNNNN3’3’NNNNNNNCTTAAGNNNNNNNN5’5’NNNNNG
3’NNNNNCTTAApEcoRⅠ的识别序列和酶切切口(粘端)pAATTCNNNNNN3'GNNNNNN5’
5’NNNNNNGTTAACNNNNN3‘
3’NNNNNNCAATTGNNNNN5‘5’NNNNNGTT
pAACNNNNN3’3‘NNNNNCAAp
TTGNNNNN5’HaeⅠ的识别序列和酶切切口(平端)磷酸二酯键的形成DNA连接酶DNA连接酶DNA连接酶目的基因与载体的连接接
T4-DNA连接酶:T4-噬菌体连接温度:不高于粘性末端熔点温度(Tm)≤15℃:15℃/6h;12℃/8h;8℃/12h;连接方式:
相同粘性末端的连接平头末端的连接不同粘性末端的连接人工粘性末端的连接
粘端连接CCGGCCGGGGCCGGCC
CGGC
CGGCCGGC
CGGC
CCGG
GGCCHapⅡT4-DNA连接酶平端连接
AGCT
TCGAAluⅠDNA连接酶AGCTAGCTTCGATCGA重组体的转化受体细胞转JM109感受态含氨苄平板Am重组质粒感受态原核细胞的转化(细菌转化)1)受体细胞的选择限制缺陷型:避免修饰和降解重组缺陷型:避免重组整合转化亲和型:较高的可转化性遗传互补型:利于筛选感染缺陷型:防止感染2)转化方法CaCl2诱导转化电穿孔PEG介导转化人工体外包装特殊处理受体细胞细胞膜特性改变CaCl2处理受体细菌50-100mmol/LCaCl2
感受态细菌重组体转入细菌基因重组转染体外包装噬菌体噬菌体体外包装3)转化率:转化细胞/细胞总数影响因素:
载体:载体性质、空间结构、分子大小等受体细胞转化过程含氨苄平板连接目的基因基因载体连接酶转化重组体克隆的筛选与鉴定筛宿主细胞转化后的克隆群体:1遗传检测法1)抗药性标志的选择pBR322AmpTet插入片段Amp平板Tet平板2)标志补救(ß-半乳糖苷酶法)lacZAmN2H片段COOH片段X-galLacZ蓝色化合物X-gal(LacZ基因N端序列)插入片段(LacZ基因失活)LacZ基因N端序列LacZ酶2电泳检测法凝胶电泳检测加样孔DNAMarker空质粒重组质粒重组质粒酶切重组质粒的PCR扩增片段原位杂交3菌落杂交筛选法4免疫化学检测法放射性抗体检测法滤膜(固定抗体)+5DNA序列检测ACTGAAGGCT外源基因在宿主细胞中的表达重组子目的基因的mRNA表达蛋白质大肠杆菌(E.coli)受体细胞表1E.coli表达体系优势:
一种成熟的基因克隆表达的受体细胞繁殖迅速,培养代谢易于控制易于进行遗传操作和高效表达不足之处:1)缺乏适当的转录后和翻译后加工机制。2)缺乏表达蛋白质复性系统,表达蛋白无特异性空间结构。3)表达产物不稳定,易被细菌蛋白酶降解。2目的基因在E.coli中的高效表达三个因素:
强化蛋白质的生物合成抑制蛋白质的降解恢复蛋白质的空间构象3目的基因表达产物的检测1)蛋白质的PAGE对照样品Marker2)表达蛋白生物学功能检测淀粉酶基因表达4目的蛋白的分离纯化分子筛亲和柱离子交换抗原抗体目的蛋白基因载体目的基因
质粒噬菌体病毒PCRcDNA人工合成基因文库限制性内切酶有切口的载体有切口的目的基因DNA连接酶
重组体
转化
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