标准解读

《LY/T 3191-2020 林木DNA条形码构建技术规程》是由国家林业和草原局提出并归口的一项标准，旨在规范林木DNA条形码的构建过程。该标准详细规定了从样本采集到数据处理的一系列步骤和技术要求，适用于森林资源调查、林木种质资源保护与利用等领域中的物种鉴定工作。

在样本采集方面，标准强调了选取具有代表性的个体进行采样，并对不同类型的植物材料（如叶片、果实等）提出了具体的保存方法，以保证后续实验中DNA的质量。对于DNA提取，则推荐使用高效且适合多种植物材料的方法，并对试剂的选择、操作流程进行了指导，确保能够获得足够纯度和浓度的DNA用于分析。

PCR扩增是构建DNA条形码的关键步骤之一。本标准列出了几个常用的基因片段作为候选条形码区域，并针对每个区域给出了相应的引物序列；同时，也提供了关于反应体系优化、退火温度设置等方面的建议，以提高扩增效率和特异性。

测序完成后，需要将原始数据转化为可比对的标准格式。《LY/T 3191-2020》介绍了如何去除低质量读段、拼接contig等基础生物信息学处理手段，并指出应利用公共数据库或自建参考库来比对未知样本的序列，从而实现准确分类。此外，还特别提到了建立和完善本地化林木DNA条形码数据库的重要性，这对于促进国内相关研究领域的发展具有重要意义。


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....

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  • 现行
  • 正在执行有效
  • 2020-03-30 颁布
  • 2020-10-01 实施
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文档简介

ICS65020

B60.

中华人民共和国林业行业标准

LY/T3191—2020

林木DNA条形码构建技术规程

TechnicalregulationsofDNAbarcodesinwoodyspecies

2020-03-30发布2020-10-01实施

国家林业和草原局发布

LY/T3191—2020

前言

本标准按照给出的规则起草

GB/T1.1—2009。

本标准由国家林业和草原局提出

。

本标准由全国林木种子标准化技术委员会归口

(SAC/TC115)。

本标准起草单位中国林业科学研究院热带林业研究所湖南省林业科学院中国科学院华南植物

:、、

园中国科学院植物研究所江西农业大学林学院

、、。

本标准主要起草人裴男才梁军生陈步峰葛学军米湘成刘娟

:、、、、、。

Ⅰ

LY/T3191—2020

林木DNA条形码构建技术规程

1范围

本标准规定了林木条形码构建中样本采集策略核心条形码片段选取标准提取

DNA、DNA、DNA

技术和保存序列测定和编辑方法系统发育关系构建等技术要求

、、。

本标准适用于林木条形码的构建

DNA。

2规范性引用文件

下列文件对于本文件的应用是必不可少的凡是注日期的引用文件仅注日期的版本适用于本文

。,

件凡是不注日期的引用文件其最新版本包括所有的修改单适用于本文件

。,()。

本文件无规范性引用文件

。

3术语和定义

下列术语和定义适用于本文件

。

31

.

DNA条形码DNAbarcodes

从线粒体叶绿体或核基因组区域中筛选的一段短的通用的序列以期对现存生物在物种水

、DNA,

平上进行快速而准确的识别和鉴定

。

32

.

引物primer

一小段单链或作为复制的起始点在核酸合成反应时作为每个多核苷酸链进

DNARNA,DNA,,

行延伸的出发点而起作用的多核苷酸链

。

33

.

聚合酶链式反应polymerasechainreactionPCR

;

一种体外酶促合成特异片段的方法由高温变性低温退火及适温延伸等几步反应组成一个

DNA,、

周期循环进行使目的得以迅速扩增具有特异性强灵敏度高操作简便省时等特点

,,DNA,、、。

34

.

DNA序列DNAsequence

多核苷酸链中的核苷酸的排列顺序可能的字母只有和分别代表组成的四种核

。A、C、GT,DNA

苷酸腺嘌呤胞嘧啶鸟嘌呤胸腺嘧啶无间隔地排列在一起例如序列

———、、、,,AAAGTCTGAC。

35

.

DNA测序DNAsequencingtechnology

对分子的核苷酸排列顺序的测定也就是测定组成分子的的排列顺序

DNA,DNAA、T、G、C。

36

.

系统发育关系phylogeny

生物有机体随着时间变

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