• 现行
  • 正在执行有效
  • 2018-02-06 颁布
  • 2018-09-01 实施
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文档简介

ICS07080

A40.

中华人民共和国国家标准

GB/T35890—2018

高通量测序数据序列格式规范

Technicalspecificationofhighthroughputsequencingdataformat

2018-02-06发布2018-09-01实施

中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局发布

中国国家标准化管理委员会

GB/T35890—2018

前言

本标准按照给出的规则起草

GB/T1.1—2009。

本标准由全国生化检测标准化技术委员会提出并归口

(SAC/TC387)。

本标准起草单位深圳华大基因研究院中国计量科学研究院

:、。

本标准主要起草人梁鑫明刘心蒋慧杜佳婷谢强李倩一李岱怡王晶

:、、、、、、、。

Ⅰ

GB/T35890—2018

高通量测序数据序列格式规范

1范围

本标准规定了高通量测序数据的序列格式包括序列描述格式规范和高通量测序数据整体格式

,

规范

。

本标准适用于规范生物体高通量测序数据序列格式

DNA。

2规范性引用文件

下列文件对于本文件的应用是必不可少的凡是注日期的引用文件仅注日期的版本适用于本文

。,

件凡是不注日期的引用文件其最新版本包括所有的修改单适用于本文件

。,()。

高通量基因测序技术规程

GB/T30989

信息技术信息交换七位编码字集

ISO/IEC646ISO(Informationtechnology—ISO7-bitcoded

charactersetforinformationinterchange)

3术语和定义

下列术语和定义适用于本文件

。

31

.

高通量测序high-throughputsequencing

以一次并行几十万到几百万条核酸分子序列测定和一般读长较短等为标志适用于的测序

,DNA

技术

。

注改写定义

:GB/T30989—2014,3.1.9。

32

.

测序片段reads

高通量测序平台产生的含有碱基序列和质量值的序列片段

。

33

.

双末端测序paired-endsequencing

对模板链和互补链分别测序并得到两条链成对测序片段的测序技术

DNA,。

34

.

插入片段长度insertsize

双末端测序中从模板链测序的测序片段左端到互补链测序的测序片段右端的距离

,。

35

.

测序片段识别码readsidentifier

用以识别一段测序片段的具有唯一性的字符串

。

36

.

碱基序列basesequence

测序片段中记录碱基排列的字符串碱基序列中的每个碱基应使用大写字母和或

,(A、T、C、GN)

小写字母和其中字母和表示腺嘌呤字母和表示胸腺嘧啶字母和表示胞

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