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文档简介
动物生物化学知识点复习第1章绪论生物化学(Biochemistry):是生命的化学,是从分子水平上阐明生命有机体的化学规律以揭示生命现象本质的科学。生物化学研究生命有机体的化学组成及其结构与功能的关系,研究细胞中的物质代谢和与之相伴随的能量转换过程,研究机体组织器官机能的生化机理。研究生物体内各种化合物的结构、化学性质和功能(主要有糖类、脂类、蛋白质、核酸、酶、维生素和激素)研究构成生物体的基本物质在生命活动中进行的化学变化,即新陈代谢及代谢过程中能量的转换和调节静态生物化学动态生物化学生物化学研究的内容代谢与能量糖类化学脂类化学蛋白质化学核酸化学酶学静态生物化学动态生物化学糖类代谢脂类代谢蛋白质代谢核酸代谢代谢调节蛋白质的降解氨基酸代谢蛋白质的生物合成核酸的降解核苷酸代谢核酸的生物合成生物化学研究的内容第2章生命的化学特征2.2生物体系中的非共价作用力存在于生物分子中主要的非共价相互作用力包括:氢键、离子键、范德华力、疏水力。2.4生物能量学
AdenosineTriphosphate,ATP:三磷酸腺苷第3章蛋白质(protein)3.3蛋白质的化学组成
主要的:CHO
N
S
50~55%6~8%20~23%15~18%
0~4%微量的:PFeCuZnMoISe3.3.1元素组成各元素的百分比对于大多数蛋白质都较相似,大多数蛋白质含氮量较恒定,平均16%,即1g氮相当于6.25g蛋白质。6.25称为蛋白质系数。这可用于测定蛋白质的含量——凯氏定氮法。样品中蛋白质含量=样品中的含氮量6.25
×第3章蛋白质(protein)3.3.2蛋白质的基本结构单元蛋白质的基本结构单元是氨基酸aminoacid多个氨基酸首尾连结(连接方式:肽键)形成长而不分支的多聚物——多肽链多肽链再折叠卷曲,形成蛋白质第3章蛋白质(protein)20种氨基酸分类氨基酸的主要理化性质蛋白质的结构、理化性质定义——1969年,国际纯化学与应用化学委员会(IUPAC)规定:蛋白质的一级结构指蛋白质多肽连中AA的排列顺序,包括二硫键的位置。
一、蛋白质的一级结构2.一级结构的意义
蛋白质的一级结构是指蛋白质肽链中氨基酸的排列顺序。蛋白质的化学结构包括肽链数目、端基组成、氨基酸序列和二硫键的位置,又称共价结构。蛋白质的一级结构是最基本的结构,它决定着蛋白质高级结构。一级结构中包含的共价键主要指肽键和二硫键。
蛋白质的二级结构是指蛋白质多肽链主链原子局部的空间结构,但不包括与其他肽段的相互关系及侧链构象的内容。(一)二级结构的概念
二.蛋白质的二级结构
天然蛋白质包括α-螺旋、
β-折叠、
β-转角、
无规则卷曲等二级结构。1.超二级结构的定义指蛋白质中相邻的二级结构单位(即单个-螺旋或-转角)组合在一起,形成有规则的在空间上能辩认的二级结构组合体。三.蛋白质的超二级结构和结构域2.结构域(domain)指多肽链在二级结构或超二级结构的基础上形成三级结构的局部折叠区,它是相对独立的紧密球状实体,称为结构域(domain)或功能域。四.蛋白质的三级结构
三级结构:指的是多肽链在二级结构、超二级结构和结构域的基础上,主链构象和侧链构象相互作用,进一步盘曲折叠形成球状分子结构。(一)三级结构的概念(三)维持三级结构的作用力二硫键
——共价键疏水作用非共价键(次级键)氢键离子键范德华力稳定蛋白质三维结构的作用力1离子键2氢键3疏水作用4范德华引力5二硫键五.蛋白质的四级结构(一)四级结构的概念
四级结构:由两条或两条以上具有三级结构的多肽链聚合而成、有特定三维结构的蛋白质构象。每条多肽链又称为亚基。血红蛋白由四条多肽链形成,是一种寡聚蛋白质。这四条链主要通过非共价键相互作用缔合在一起。血红蛋白分子上有四个氧的结合部位,因为每条链上含有一个血红素辅基。(一)四级结构的概念(1)有关四级结构的一些概念亚基(单体),同多聚,杂多聚(2)四级缔合的驱动力主要有范氏作用力,氢键,离子键和疏水作用力,其中疏水作用力最为重要,二硫键对于稳定四级结构有重要意义。(3)亚基相互作用的方式
亚基之间的分布有各种各样的对称关系。第4章核酸核酸的一级结构:一分子核苷酸的3’-位羟基与另一分子核苷酸的5’-位磷酸基通过脱水可形成3’,5’-磷酸二酯键,将两分子核苷酸连接起来。核酸就是由多个核苷酸单位通过3’,5’-磷酸二酯键连接起来形成的不含侧链的长链状化合物。核酸是有方向性的长链状化合物,多核苷酸链的两端,一端称为5’-端,另一端称为3’-端。核酸是生物体内的高分子化合物,包括脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)两大类。一、元素组成 组成核酸的元素有C、H、O、N、P等,与蛋白质比较,其组成上有两个特点:一是核酸一般不含元素S,二是核酸中P元素的含量较多并且恒定,约占9-10%(通常取9.5%)。因此,核酸定量测定的经典方法,是以测定P含量来代表核酸量。二、化学组成与基本单位 核酸经水解可得到很多核苷酸,因此核苷酸是核酸的基本单位。核酸就是由很多单核苷酸聚合形成的多聚核苷酸。核苷酸可被水解产生核苷和磷酸,核苷还可再进一步水解,产生戊糖和含氮碱基。两类核酸的分子组成RNADNA组分磷酸磷酸戊糖核糖脱氧核糖碱基嘌呤嘧啶AGUCT核苷酸的紫外吸收
碱基中含有共轭双键,最大吸收峰
260nm左右核酸溶液紫外吸收以摩尔磷的吸光度表示,摩尔磷即相当于摩尔核苷酸。ε:摩尔吸光系数A:吸收值
W:每升溶液磷重量L:比色杯内径
由于共振作用,所有核苷酸的碱基都吸收紫外光,核酸在260nm附近有强大光吸收。第5章糖类
单糖是指最简单的糖,即在温和条件下不能再分解成更小的单体糖,如葡萄糖、果糖等。按碳原子的数目单糖又可分为三碳(丙)糖、四碳(丁)糖、五碳(戊)糖、六碳(已)糖、七碳(庚)糖等。
糖类的本质:多羟基醛、多羟基酮多羟基醛或多羟基酮的衍生物三糖甘油醛
二羟丙酮一、一些重要单糖的结构五碳糖核糖核酮糖木糖六碳糖葡萄糖果糖一、一些重要单糖的结构
麦芽糖α-葡萄糖(1→4)葡萄糖苷一、一些重要双糖的结构
蔗糖α-葡萄糖(1→2)β-果糖苷一、一些重要双糖的结构
乳
糖乳糖(半乳糖--1,4-葡萄糖)
一、一些重要双糖的结构
淀粉直链:
a-1,4-糖苷键分支点:
a-1,6-糖苷键一、一些重要多糖的结构
淀粉直链:
a-1,4-糖苷键分支点:
a-1,6-糖苷键
纤维素b-1,4-糖苷键一、一些重要多糖的
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