序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件

序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析怎样思想，就有怎样的生活序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析怎样思想，就有怎样1第五章序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析第五章2警相似性和同源性关系序列的相似性和序列的同源性有一定的关系,一般来说序列间的相似性越高的话,它们是同源序列的可能性就更高,所以经常可以通过序列的相似性来推测序列是否同源正因为存在这样的关系,很多时候对序列的相似性和同源性就没有做很明显的区分,造成经常等价混用两个名词。所以有出现A序列和B序列的同源性为80%说警相似性和同源性关系3餐序列相似性比较和序列同源性分析序列相似性比较:将待研究序列与DNA或蛋白质序列库进行比较,用于确定该序列的生物属性,也就是找出与此序列相似的已知序列是什么。完成这一工作只需要使用两两序列比较算法。常用的程序包有BLASTFASTA等餐序列相似性比较和序列同源性分析4序列同源性分析:将待研究序列加入到一组与之同源但来自不同物种的序列中进行多序列同时比较,以确定该序列与其序列间的同源性大小。这是理论分析方法中最关键的一步。完成这作须使用多序列比较算法。常用的程序包有CLUSTAI等序列同源性分析:5Blas程序BLAST是一个基于序列相似性的数据库搜索程序。是“局部相似性基本査询工具”(BasiclocalAlignmentSearchTool的缩写。Blast是一个序列相似性搜索的程序包,其中包含了很多个独立的程序,这些程序是根据查询的对象和数据库的不同来定义的。Blas程序6Blas程序的选择Blast是一个序列相似性搜索的程序包,其中包含了很多个独立的程序这些程序是根据查询的对象和数据库的不同来定义的Blas程序的选择7主要的blast程序程序名查询序列数据库搜索方法Blastn核酸核酸核酸序列搜索逐一核酸数据库中的序列Blastp蛋白质蛋白质蛋白质序列搜索逐一蛋白质数据库中的序列Blastx核酸蛋白质核酸序列6框翻译成蛋白质序列后和蛋白质数据库中的序列逐一搜索「Tblastn蛋白质核酸蛋白质序列和核酸数据库中的核酸序列6框翻译后的蛋白质序列逐一比对TBlastx核酸核酸核酸序列6框翻译成蛋白质序列,再和核酸数据库中的核酸序列6框翻译成的蛋白质序列逐一进行比对主要的blast程序8Blas资源主站点:/blaSt/(i网络版)ftp:/ftp,ncbi.nlm./blast/(单机版)Blas资源9其他站点:/blast/nema.cap.ed.ac.uk/ncbi_blast.html其他站点:10Blast结果Blast结果会列出跟查询序列相似性比较高符合限定要求的序列结果,根据这些结果可以获取以下一些信息。查询序列可能具有某种功能查询序列可能是来源于某个物种查询序列可能是某种功能基因的同源基因Blast结果11序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件12序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件13序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件14序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件15序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件16序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件17序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件18序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件19序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件20序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件21序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件22序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件23序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件24序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件25序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件26序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件27序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件28序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件29序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件30序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件31序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件32序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件33序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件34序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件35序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件36序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件37序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件38序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件39序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件40序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件41序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件42序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件43序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件44序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件45序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件46序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件47序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件48序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件49序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件50序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件51序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件52序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件53序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件54序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件55序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件56序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件57序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件58序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件59序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件60序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件61序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件62序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件63序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件64序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件65序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件66序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件67序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件68序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件69序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件70序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件71序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件72序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件73序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件74序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件75序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件76序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件77序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件78序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件79序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件80序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件81序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件82谢谢！21、要知道对好事的称颂过于夸大，也会招来人们的反感轻蔑和嫉妒。——培根

22、业精于勤，荒于嬉；行成于思，毁于随。——韩愈

23、一切节省，归根到底都归结为时间的节省。——马克思

24、意志命运往往背道而驰，决心到最后会全部推倒。——莎士比亚

25、学习是劳动，是充满思想的劳动。——乌申斯基供娄浪颓蓝辣袄驹靴锯澜互慌仲写绎衰斡染圾明将呆则孰盆瘸砒腥悉漠堑脊髓灰质炎(讲课2019)脊髓灰质炎(讲课2019)谢谢！21、要知道对好事的称颂过于夸大，也会招来人们的反感轻83序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析怎样思想，就有怎样的生活序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析怎样思想，就有怎样84第五章序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析第五章85警相似性和同源性关系序列的相似性和序列的同源性有一定的关系,一般来说序列间的相似性越高的话,它们是同源序列的可能性就更高,所以经常可以通过序列的相似性来推测序列是否同源正因为存在这样的关系,很多时候对序列的相似性和同源性就没有做很明显的区分,造成经常等价混用两个名词。所以有出现A序列和B序列的同源性为80%说警相似性和同源性关系86餐序列相似性比较和序列同源性分析序列相似性比较:将待研究序列与DNA或蛋白质序列库进行比较,用于确定该序列的生物属性,也就是找出与此序列相似的已知序列是什么。完成这一工作只需要使用两两序列比较算法。常用的程序包有BLASTFASTA等餐序列相似性比较和序列同源性分析87序列同源性分析:将待研究序列加入到一组与之同源但来自不同物种的序列中进行多序列同时比较,以确定该序列与其序列间的同源性大小。这是理论分析方法中最关键的一步。完成这作须使用多序列比较算法。常用的程序包有CLUSTAI等序列同源性分析:88Blas程序BLAST是一个基于序列相似性的数据库搜索程序。是“局部相似性基本査询工具”(BasiclocalAlignmentSearchTool的缩写。Blast是一个序列相似性搜索的程序包,其中包含了很多个独立的程序,这些程序是根据查询的对象和数据库的不同来定义的。Blas程序89Blas程序的选择Blast是一个序列相似性搜索的程序包,其中包含了很多个独立的程序这些程序是根据查询的对象和数据库的不同来定义的Blas程序的选择90主要的blast程序程序名查询序列数据库搜索方法Blastn核酸核酸核酸序列搜索逐一核酸数据库中的序列Blastp蛋白质蛋白质蛋白质序列搜索逐一蛋白质数据库中的序列Blastx核酸蛋白质核酸序列6框翻译成蛋白质序列后和蛋白质数据库中的序列逐一搜索「Tblastn蛋白质核酸蛋白质序列和核酸数据库中的核酸序列6框翻译后的蛋白质序列逐一比对TBlastx核酸核酸核酸序列6框翻译成蛋白质序列,再和核酸数据库中的核酸序列6框翻译成的蛋白质序列逐一进行比对主要的blast程序91Blas资源主站点:/blaSt/(i网络版)ftp:/ftp,ncbi.nlm./blast/(单机版)Blas资源92其他站点:/blast/nema.cap.ed.ac.uk/ncbi_blast.html其他站点:93Blast结果Blast结果会列出跟查询序列相似性比较高符合限定要求的序列结果,根据这些结果可以获取以下一些信息。查询序列可能具有某种功能查询序列可能是来源于某个物种查询序列可能是某种功能基因的同源基因Blast结果94序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件95序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件96序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件97序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件98序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件99序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件100序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件101序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件102序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件103序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件104序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件105序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件106序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件107序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件108序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件109序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件110序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件111序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件112序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件113序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件114序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件115序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件116序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件117序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件118序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件119序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件120序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件121序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件122序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件123序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件124序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件125序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件126序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件127序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件128序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件129序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件130序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件131序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件132序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件133序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件134序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件135序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件136序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件137序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件138序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件139序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件140序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件141序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件142序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件143序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件144序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件145序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件146序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件147序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件148序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件149序列的同源性比较及分子系统学和分子进化分析共83课件150