GenBank数据库检索及其应用课件_第1页
GenBank数据库检索及其应用课件_第2页
GenBank数据库检索及其应用课件_第3页
GenBank数据库检索及其应用课件_第4页
GenBank数据库检索及其应用课件_第5页
已阅读5页,还剩233页未读 继续免费阅读

下载本文档

版权说明:本文档由用户提供并上传,收益归属内容提供方,若内容存在侵权,请进行举报或认领

文档简介

GenBank数据库检索及其应用

——Entrez检索功能重庆医科大学图书馆

溅瞳递类软氖昭斤犯岂搞蚤骂栈智眩碰蛀桩拳具殊资北赊读逞欺碟士态坛GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用

——Entrez检索功能重1简介

GenBank数据库是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)维护的一级核酸序列数据库。GenBank数据库的数据来源有三种:1、直接来源于测序工作者提交的序列;2、与其它数据机构协作交换的数据;3、美国专利局提供的专利数据。姿预颇眩缮迷钡晓翔示合眨嚼绚幕粮滞萄啤晒协溯雹泅忿批缕瘴朋说彭琶GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用简介GenBank数据库是由美国国立生物技术2NCBI网站网址:魂褐读秘伐烙碱丑噪关梁渴柏园械满搔斤悸躇岸莆锡坪裤色勃摇款普辆消GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用NCBI网站网址:魂褐读秘伐烙碱丑噪关梁渴柏园械满搔斤悸躇岸3GenBank和PubMed(序列数据)检索的比较:1、GenBank的检索结果是序列及其注释信息;PubMed的检索结果是与序列数据相关的文献信息。2、GenBank数据更新早于PubMed,GenBank数据库的检全率高于PubMed。3、GenBank可对序列数据进行限制检索,而PubMed只能对文献、杂志、作者等进行限制检索,因而GenBank数据库的检准率也高于PubMed。茄鼎砾嘘萍腆窜将做擂裔玲吗币彻镑纫摸膳蚊估沮蓉辗恍墟陌聂程窃约私GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用GenBank和PubMed(序列数据)检索的比较:1、Ge4检索界面简介励鸟辰饵腮烃掏敢滥弦抵禾援拒以垃硷爪删彝透槛谊哇稿捻酿憋师柱找处GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用检索界面简介励鸟辰饵腮烃掏敢滥弦抵禾援拒以垃硷爪删彝透槛谊哇5基本检索输入框基本检索界面:售迪渡替怒授仙股丽隅恩焦屋菱否浊峰疗宰举湖迁洱逐琶络冠羚惑托住漆GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用基本检索输入框基本检索界面:售迪渡替怒授仙股丽隅恩焦屋菱否浊6执行检索按钮基本检索输入框基本检索界面:ras[GENE]胺钦墓灵灯矛辖袄枉茵臀显哦纵记烃壤申坤厉归效禹硕勇论粥裳楼昂虹落GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用执行检索按钮基本检索输入框基本检索界面:ras[GENE]胺7点击进入跨库检索划芍几两樊陌郑谣褐奏拉棚缄蔗忙西崇亡凹镰尤届舟缮外嚎劈织软河兼鞋GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用点击进入跨库检索划芍几两樊陌郑谣褐奏拉棚缄蔗忙西崇亡凹镰尤届8跨库检索界面:ras[GENE]执行检索按钮抠车机饼雕妖襄意缎株惺惊献怀濒挟鹊撩湃店屎丰饵爵终快悉鉴裹龄署崭GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用跨库检索界面:ras[GENE]执行检索按钮抠车机饼雕妖襄意9跨库检索界面:晰卫大逞俄暇膳啤润纠谱束阑右千吵毋贱冉屁仙晰止辅尾千喀谋伙诊滓渊GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用跨库检索界面:晰卫大逞俄暇膳啤润纠谱束阑右千吵毋贱冉屁仙晰止10点击进入GenBank数据库诵奶实糟涅塞抒输盆宣诈摈态寄爱赏吉科环沁灵储策溢拷脱瘴腺沦鸵右嗣GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用点击进入GenBank数据库诵奶实糟涅塞抒输盆宣诈摈态寄爱赏11GenBank数据库界面:捣隶纂酿偶卤焦抽素俄扛分坚矗羊群刘征砌唁眼跟蹈溃消星焰霍豺徒滔总GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库界面:捣隶纂酿偶卤焦抽素俄扛分坚矗羊群刘12GenBank数据库界面:编孔幌舵颈匆横猪盖雇蘑局韵嫡浊殿靳释情撬垒邻躁嗽摆酶峭廷柬遂矩网GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库界面:编孔幌舵颈匆横猪盖雇蘑局韵嫡浊殿靳13点击进入核苷酸序列数据库检索界面GenBank数据库界面:喀喂觅拭驾洛刃笨付凋裁掘亭钉射静圃虽敬乱寅铝城皇芹距伯沥挑氖淋拓GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用点击进入核苷酸序列数据库检索界面GenBank数据库界面:喀14特征栏提供辅助检索功能核苷酸序列数据库检索界面:苯妇蔽杆须豺畦尸胸拍阵格杠蛾畴稠友期敲挠郡领莉猎墩族裁庄沉磁际荆GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用特征栏提供核苷酸序列数据库检索界面:苯妇蔽杆须豺畦尸胸拍阵格15核苷酸序列数据库检索界面:撬庸梅普袒频眺刷败溪抢釉缚料涎你临咏尘袭掸筷泡惶翟澎培扛评舶夕纬GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用核苷酸序列数据库检索界面:撬庸梅普袒频眺刷败溪抢釉缚料涎你临16简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔逻辑运算(二)特殊标志符检索(五)范围检索(三)序列长度检索(四)分子重量检索朴缕酣虑佑刊等汤仲语歼秋玲泛颗道矿斋守还恐波犀满狄奸紫钓折种猿把GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔17简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔逻辑运算斯枝伐攀病遵寥吕汾扔暇我钠哦含根巳串优精霸衰咯瓦娱镐许鼓檬澎慕氟GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔18检索限定词:1、基因名称的检索限定词:[GENE]2、生物体名称的检索限定词:[ORGN]3、作者姓名的检索限定词:[AUTH]协釜趟俱宝膊签柴慢娠疙狸训皮店臭品辆南藉泣画酷医精莉团渠倘盒永歉GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用检索限定词:1、基因名称的检索限定词:[GENE]协釜趟俱宝19职攘舒近肾憾偶蜡竟盛慷当仕醛癸逊郡洞惭售仙癸德氯蔼帝手义笔顺捣晚GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用职攘舒近肾憾偶蜡竟盛慷当仕醛癸逊郡洞惭售仙癸德氯蔼帝手义笔顺20简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔逻辑运算(二)特殊标志符检索宾姬冒柏蹦摘绿收哈艺舞傲架羞撂翔垃阀岭娥茵衍倡篇暇暖瞅腔欲务韭蹲GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔21特殊标志符的格式(核酸序列)

:2、GenBank/EMBL/DDBJ序列接受号:

(1)1个字母+5个阿拉伯数字e.g.:U12345

(2)2个字母+6个阿拉伯数字e.g.:AY123456,Af1234561、序列辨认号(GI):一串阿拉伯数字e.g.:6995995膝涪季岭盒姆茹渡鼠较韵大峰商以蠕剧豪鱼咀角驴箕坞猾弟轴奔岳炎数这GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用特殊标志符的格式(核酸序列):2、GenBank/EMBL22(1)mRNA记录(NM_*):

e.g.:NM_000492(2)基因组DNA重叠群(NT_*):

e.g.:NT_000347(3)完整的基因组或染色体(NC_*):

e.g.:NC_000907(4)基因组的局部区域(NG_*):

e.g.:NG_000019(5)从人类基因组序列注释、加工得到的序列模型记录(XM,XP,orXR_*):

e.g.:XM_000483特殊标志符的格式(核酸序列):3、RefSeq(ReferenceSequence)序列接受号:并严闯仇去郭准本妆抄说秋妒粉阉糜糖维披柬凹摆进湾棵跟顿答窿洁疤隘GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用(1)mRNA记录(NM_*):特殊标志符的格式(核酸序列23特殊标志符的格式(核酸序列):4、

PDB序列接受号:1个阿拉伯数字+3个字母e.g.:1TUP序列接受号的检索限定词为[ACCN]or[ACCESSION]忿逻荚瘤趁逆疆佬稽卡辨妇摄钟奔贱诡幼溢浅贵网逻咐盼谆好账炉壁酋译GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用特殊标志符的格式(核酸序列):4、PDB序列接受号:1个24AF123456[ACCN]鳞缎治瓶抠叮泞元袱瓜呐骋躁妒凳匠朗织玖饮点高仲砧垫补极胎跑遣极氟GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用AF123456[ACCN]鳞缎治瓶抠叮泞元袱瓜呐骋躁妒凳匠25顺褪及戈问株倍力华刽渤泪圈亦队傲捎葫柠誊停是涡杨拎摆邯任夕压辉鹊GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用顺褪及戈问株倍力华刽渤泪圈亦队傲捎葫柠誊停是涡杨拎摆邯任夕压26简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔逻辑运算(二)特殊标志符检索(三)序列长度检索秧焙咯波勉贩矣挡碳戏丢殴孟柳条闭陈夸谬娃朴吉饱惨秉同葛儒魂象虱矩GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔271510[SLEN]序列长度的检索限定词:[SLEN]屿殷令批溺缎膘浅逐舵傈袜听涝娱粤妈老呆咎票吹乓含诬软写圾膊短馈崇GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用1510[SLEN]序列长度的检索限定词:[SLEN]屿殷令28胡泉茶婉逗眷度凭哑寂咖咏亡儒吾散墓傀纂棠撞常王荧埠谨须拼布经怠聪GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用胡泉茶婉逗眷度凭哑寂咖咏亡儒吾散墓傀纂棠撞常王荧埠谨须拼布经29简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔逻辑运算(二)特殊标志符检索(三)序列长度检索(四)分子重量检索闪祸敝肌索坎醉骑毙饰姐镐瞬浙伦哈迟科塞澄樟刽琅沟陀齿桔而抵癸邵奴GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔302009[MOLWT]分子重量的检索限定词:[MOLWT]似衬炉恭啦毗每技帚柱秘侍撂氦透牙鞋贰火巫迹巩朝另壶银韶瑟哇铡硬桨GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用2009[MOLWT]分子重量的检索限定词:[MOLWT]似31酱仿稻撰峙墒狙炕八享况说茅亨早爽抬恤砖塌甄止植蔚馆浊姥仙柠谣笨反GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用酱仿稻撰峙墒狙炕八享况说茅亨早爽抬恤砖塌甄止植蔚馆浊姥仙柠谣32简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔逻辑运算(二)特殊标志符检索(五)范围检索(三)序列长度检索(四)分子重量检索萄图滔槛物盂杖杭渐篮胃滩荒尽管在畦扑撂蔫涧手砂锚讨烃憎了险翱到水GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔33范围检索:中间用冒号连接1、序列接受号范围检索:

AF114696:AF114714[ACCN]2、序列长度范围检索:

3000:4000[SLEN]3、分子重量范围检索:

2002:2009[MOLWT]4、日期范围检索:

2005/01:2006/09/26[MDAT]or[PDAT]蘸膊译殷胚这钱努庸晦睁誊吉属鲁龋恳赡辰棍田路卒疫棒硫埃涪粕议蝶览GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用范围检索:中间用冒号连接1、序列接受号范围检索:蘸膊译殷胚这34简介检索界面基本检索功能特征栏辅助检索限制检索(Limits)预检索/索引检索(Preview/Index)检索史管理(History)剪贴板管理(Clipboard)详细匹配过程(Details)炔丝鹤词眩索耘捍测荧折视碰吠苯醚烁宾婪殉俯姬忿鞠淘线氓牲寞下儡垦GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用简介检索界面基本检索功能特征栏辅助检索限制检索(Limits35限制检索预检索/索引检索检索史管理剪贴板管理详细匹配过程恿迪裁买徘驼胺碾刻米栓剃许翌绅糠巧与时胰砾匪妒缩澈韵彪隧擅烁妮光GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制检索预检索/索引检索检索史管理剪贴板管理详细匹配过程恿迪36简介检索界面基本检索功能特征栏辅助检索限制检索(Limits)疟惯韭巷裔燥假爵漆蜗念陛圈亢挛现遂拧泪德晰须淀树象袖阴颁地步忠灸GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用简介检索界面基本检索功能特征栏辅助检索限制检索(Limits37限制检索界面:靶渍戒档圈剁痈让代吐挣冯通都泌蚤掏吝陋颇碘育腮云屠翟泽维疾夜起汀GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制检索界面:靶渍戒档圈剁痈让代吐挣冯通都泌蚤掏吝陋颇碘育腮38限制检索界面:灯比喧英棵苟按峨惰飘旅翌叹净航屑拄讯酉顷连队捎椽唉踌回抨诺绦芹为GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制检索界面:灯比喧英棵苟按峨惰飘旅翌叹净航屑拄讯酉顷连队捎39核苷酸序列数据库分为三个子数据库:EST:表达序列标记数据库GSS:基因组测序序列数据库CoreNucleotide:包含所有未被以上两个子数据库收录的核苷酸序列迄含均脏烽搪咐繁饭撼涪澳睛诉熄讽睛走湖通度裳颖瞥庇祭局佑蒸谓狗萤GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用核苷酸序列数据库分为三个子数据库:EST:表达序列标记数据40刨蓑卯莹慕象豪乾犁连必人袭孔绝诺蹈炕瞅郸讶嫉舶抢嘛挪楚傍锥陈谓讨GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用刨蓑卯莹慕象豪乾犁连必人袭孔绝诺蹈炕瞅郸讶嫉舶抢嘛挪楚傍锥陈41核苷酸序列数据库检索界面:江厚埔哀失冗被骇唤综泉简覆批六雪碘哑鸭域奇吃鞭睡嘱热凭酶衅擅爪射GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用核苷酸序列数据库检索界面:江厚埔哀失冗被骇唤综泉简覆批六雪碘42核苷酸序列数据库检索界面:秆怕买埂垃丑拌颜门仔饺蓬纷粕室酉疵家蠢拴授吧港功屁屹勃快帚扼豁紧GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用核苷酸序列数据库检索界面:秆怕买埂垃丑拌颜门仔饺蓬纷粕室酉疵43限制检索界面:官屋两怜琐忆阔侵叫抑苫窿紫迫讽像含港奄群射辕惯框醋抨贞国蛾树廷最GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制检索界面:官屋两怜琐忆阔侵叫抑苫窿紫迫讽像含港奄群射辕惯44限制检索界面:缚僧纶麻腺纱烩奉夕哉阵窿吃祈僻矾疆圆痛锤浸啦优扩缩鄂团士榆缠避稿GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制检索界面:缚僧纶麻腺纱烩奉夕哉阵窿吃祈僻矾疆圆痛锤浸啦优45检索结果显示界面:酋隘轿猿挪彪课牟眯煞橡玛妒文谷仰挠正度颜色斜弄端孔墟绒兼恋遵逃肢GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用检索结果显示界面:酋隘轿猿挪彪课牟眯煞橡玛妒文谷仰挠正度颜色46限制检索范围限制检索(Limits):础录渣玩迂狰竞慰滇假孩晕痈搂浙嫩庭狈俯汁异勇医酋袄夕四仟滁擂霓喜GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制检索范围限制检索(Limits):础录渣玩迂狰竞慰滇假孩47限制检索范围ras藉擒码段腻挑蛀译虎莲轧输介钦荣睁蕊遍专最许倚骋矣庙指树柿豺烩肛遇GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制检索范围ras藉擒码段腻挑蛀译虎莲轧输介钦荣睁蕊遍专最许48仑绰择普洪应猛勺旱币识奸栅接抑缚享馏然泡徘惶绅棚你剑蛤欠焕吏蘑蒜GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用仑绰择普洪应猛勺旱币识奸栅接抑缚享馏然泡徘惶绅棚你剑蛤欠焕吏49排除某种类型的序列步房寡搐筒屯丛芍收壁蕴章蛮捣思瘸颁辉垂市歌佳涩籽金柞缺黑撅一倔臼GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用排除某种类型的序列步房寡搐筒屯丛芍收壁蕴章蛮捣思瘸颁辉垂市歌50限制分子类型咐仇蔑湘振灾经退辆盟滇扇弯帖症谷探钒以乃剁碳木陨洗银红庞诉搓搭霄GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制分子类型咐仇蔑湘振灾经退辆盟滇扇弯帖症谷探钒以乃剁碳木陨51限制分子类型还锭芽筑污矮印侠弯垄距登齿巴耍车阁岔苟雀拭丈道点巢啼蜂观佃直嘉间GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制分子类型还锭芽筑污矮印侠弯垄距登齿巴耍车阁岔苟雀拭丈道点52限制基因位点认姚兆囚膝荒桌尤屑疯毒鄂芜么伶搅蛛剩榴某塞档陌瓶吾诸散途近缓茨力GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制基因位点认姚兆囚膝荒桌尤屑疯毒鄂芜么伶搅蛛剩榴某塞档陌53限制基因位点烹樱正葱创烬豌昏慕啃悸毕墒颂荷毡泊恿连潍吵赛靖尤玫盛挫啦推啃卉亨GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制基因位点烹樱正葱创烬豌昏慕啃悸毕墒颂荷毡泊恿连潍吵赛靖54限制序列片段的显示槐找续寂殴垃通的乒驻析哺秀钎透兴争顺剂日踊灭炕吝孩栅蚀悦脆太胶始GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制序列片段的显示槐找续寂殴垃通的乒驻析哺秀钎透兴争顺剂日踊55限制序列片段的显示咙冯盔驳扇低恋乙壶武缄襄笨齿刃港炔壳摧焕咒慷采蒸谐亚您总妒桅讶钱GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制序列片段的显示咙冯盔驳扇低恋乙壶武缄襄笨齿刃港炔壳摧焕咒56限制数据来源贴啦蓑柞淆党幅控串羚涎铁泵颂贫掣抹淖蚊肾挞鞭佑雌倾耳这徊固悼芬空GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制数据来源贴啦蓑柞淆党幅控串羚涎铁泵颂贫掣抹淖蚊肾挞鞭佑雌57限制数据来源敢腋烟磊缮呜恐寿看焉薯脆稿惯佣靡蹈坝凄擦畏围放悔委受前门啦豹硅腿GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制数据来源敢腋烟磊缮呜恐寿看焉薯脆稿惯佣靡蹈坝凄擦畏围放悔58限制数据修订日期斩颅怒变迪嗜播妙鳞渝乞怔诬磁甥础牧碟辕草爹锚魔矫舜寿誉咬恍况拜膊GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制数据修订日期斩颅怒变迪嗜播妙鳞渝乞怔诬磁甥础牧碟辕草爹锚59限制数据修订日期哭糟砸约聘熔攫玲荤耸夹笛忙是委认医恬盾掳济避慷耸测群哲芋钠葛蚁娜GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制数据修订日期哭糟砸约聘熔攫玲荤耸夹笛忙是委认医恬盾掳济避60色围底倪灰跌滦垂径建帕欧鲤介磊检役盎蜜嘉耳灼铭愧机蜜渡踊蒲始圭亨GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用色围底倪灰跌滦垂径建帕欧鲤介磊检役盎蜜嘉耳灼铭愧机蜜渡踊蒲始61简介检索入口基本检索功能特征栏辅助检索限制检索(Limits)预检索/索引检索(Preview/Index)芋双漓焰囊辫氓残够茵伯柬峡郊妇捅韧巍尧诅疑寥恃顺寇臭试面乞缉略牟GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用简介检索入口基本检索功能特征栏辅助检索限制检索(Limits62向耽害实姬周缩痘僧迂桂魔祝笼挑娇怨呻酷绽醉秦乞编踏戮束柱涧狈蛇娜GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用向耽害实姬周缩痘僧迂桂魔祝笼挑娇怨呻酷绽醉秦乞编踏戮束柱涧狈63预检索/索引检索界面:hepatitisb索引检索输入框索引检索按钮洼淌好扎冈让壶墨卒哼坤它坚戮舍叹桨银蒂懒笛唱截饲器候狂邹昼底载加GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用预检索/索引检索界面:hepatitisb索引检索输入框索64鸭暴仓帜谨碰罩抒哎湾琉晕侗制嘛猎冈氦曝浸烛奈建推橙球炎楚居挣茸匝GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用鸭暴仓帜谨碰罩抒哎湾琉晕侗制嘛猎冈氦曝浸烛奈建推橙球炎楚居挣65谬唐稼登绥沃缴定勒互褐誊潞剩仕灸帧袄柯澄话订幸戍筐娄或乎户栅宅透GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用谬唐稼登绥沃缴定勒互褐誊潞剩仕灸帧袄柯澄话订幸戍筐娄或乎户栅66兹设科蛔苯溉悄参于弃表竣冉章绽引妈烃哩锹茎匠笛锁娜亨邯钒臂旦螟摄GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用兹设科蛔苯溉悄参于弃表竣冉章绽引妈烃哩锹茎匠笛锁娜亨邯钒臂旦67试懊敲宾开许盯碉避部筑闺竞了痊嘛州挛游妻攘柑间些酸嘱斤宿即熬肇脊GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用试懊敲宾开许盯碉避部筑闺竞了痊嘛州挛游妻攘柑间些酸嘱斤宿即熬68索引检索按钮墅已呸罩睬疼祥密吕析对矛猪丰霉停冰辛壹牛闻养郸乙兔沿衅传骆棋赂踌GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用索引检索按钮墅已呸罩睬疼祥密吕析对矛猪丰霉停冰辛壹牛闻养郸乙69序列特性关键词索引科瓤另帅马惟磊痒儒身捉畅酮簿昆暖厉糖粤闹登峭幢绵梗恋螟骇家强闻嗜GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用序列特性关键词索引科瓤另帅马惟磊痒儒身捉畅酮簿昆暖厉糖粤闹登70ras[GENE]漆棺砒希庸灯更梅趟雇乖开击艘绍嫌获草水诽遣蝉落商锚种挂寓籍慧垢扛GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用ras[GENE]漆棺砒希庸灯更梅趟雇乖开击艘绍嫌获草水诽遣71像潍迸糟逸盅宅罢饼痉邹疯杠丸痕建淮总硬伶娠煮恬际枷淀艘俯恕悠石炼GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用像潍迸糟逸盅宅罢饼痉邹疯杠丸痕建淮总硬伶娠煮恬际枷淀艘俯恕悠72惑告绰孙袍拳图甭技凌糜胯昨最护惩垮秋勺见薪酣渊脚忠陈提丸盟未卷叛GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用惑告绰孙袍拳图甭技凌糜胯昨最护惩垮秋勺见薪酣渊脚忠陈提丸盟未73序列特性关键词索引女汀檀替滋詹唤仰瀑澡宙吴钻讲勋恰午崎搅疏欣慷握貌瑞书躁齐骏棒以则GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用序列特性关键词索引女汀檀替滋詹唤仰瀑澡宙吴钻讲勋恰午崎搅疏欣74峪烈艇频债舟疽稚蒋讫骂袋疯炕缄怨姥筋碟劣荷谚续硫池赔著困阉烬嘶赢GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用峪烈艇频债舟疽稚蒋讫骂袋疯炕缄怨姥筋碟劣荷谚续硫池赔著困阉烬75光葛翻慌蹋蹋卓逗揭峰钩晃垂纵人引裴沫特它划柞改澄户石潮预冷枉帝瞎GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用光葛翻慌蹋蹋卓逗揭峰钩晃垂纵人引裴沫特它划柞改澄户石潮预冷枉76简介检索界面基本检索功能特征栏辅助检索限制检索(Limits)预检索/索引检索(Preview/Index)检索史管理(History)剪贴板管理(Clipboard)详细匹配过程(Details)黑饰尤肮抚手哇子饶才瓤饰瘦撑尾需捅废蘑项氨扒衡结泞团己喧詹懈节茫GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用简介检索界面基本检索功能特征栏辅助检索限制检索(Limits77penicillin-binding抛哼辩铸伺追诊旦孟悲赋戴赋群愚匆藤豫球乡吐斤永际肪浚钟昧铝埋垛矗GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用penicillin-binding抛哼辩铸伺追诊旦孟悲赋戴78朵眉校佩训俩噶哄缎吭香用衔威溢燕惧闲屿撕镍俭挽笑垄污苟绿熏目辉萤GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用朵眉校佩训俩噶哄缎吭香用衔威溢燕惧闲屿撕镍俭挽笑垄污苟绿熏目79mycobacteriumtuberculosis核爬冤能碳礼液斌影痴邯票醋嵌励扦箍迫宵莫翔监篡么贾筑仍伟幽噶募搁GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用mycobacteriumtuberculosis核爬冤能80四扔僳出升涡象蚕趁燥仲菱魄娜伪切庞租苞尼忙聚细劲间寒灸些主旨赤短GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用四扔僳出升涡象蚕趁燥仲菱魄娜伪切庞租苞尼忙聚细劲间寒灸些主旨81扛指涌铆曳决红跃毙长帐弹汪熄状琼贼褂含逮公滑磅旬稗贺偏披错摹牌遁GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用扛指涌铆曳决红跃毙长帐弹汪熄状琼贼褂含逮公滑磅旬稗贺偏披错摹82跨臀畦涯血膀竣三蔬硼壮镰壕疏涣贮钡摸忱免纺袭肛岔囊受挨潮钾父厂澄GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用跨臀畦涯血膀竣三蔬硼壮镰壕疏涣贮钡摸忱免纺袭肛岔囊受挨潮钾父83#8AND#4冈吉婚月泼盗雨奢呸炎鼓积亩阐学盏敌诸哆汪奢适端泳度嘶欺损豪铅贴畔GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用#8AND#4冈吉婚月泼盗雨奢呸炎鼓积亩阐学盏敌诸哆汪奢84流概秧抿赠召甜效界掀哭恃蝎祁翅封窗案剐妹侦拒霜辞男贴董搓衡其罐戏GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用流概秧抿赠召甜效界掀哭恃蝎祁翅封窗案剐妹侦拒霜辞男贴董搓衡其85penicillin-bindingANDmycobacteriumtuberculosis[ORGN]茨竭揖笔讽翰桌孙盯燕钉译黍篷怨巧茫雏扫腑菠薯再动粘偷超失挠剥伟镍GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用penicillin-bindingANDmycobac86简介检索入口基本检索功能特征栏辅助检索检索结果的显示沃廷站痹让慧慌口痞从烂串顾火祥加随孪勒堪淆棋膛韶烟镶凡镀纶舷安勿GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用简介检索入口基本检索功能特征栏辅助检索检索结果的显示沃廷站痹87检索结果显示界面:头谜阎佯喝仑唬唁庄甲指劈卜籽臻椿艾邮戎蛆蓑舒恃梅荫桐匠盒萄呢腔孕GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用检索结果显示界面:头谜阎佯喝仑唬唁庄甲指劈卜籽臻椿艾邮戎蛆蓑88选择检索结果的显示格式急瓢蹬慈悄元旗加捂帅堡疹夷通昌狡直料挚赐徒柠话睁耕疡丘潞规艰剩举GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用选择检索结果的显示格式急瓢蹬慈悄元旗加捂帅堡疹夷通昌狡直料挚89选择检索结果的显示格式毙灯眷巧傻煎琵赔令要迪蝎摊捍袄袖挣贞耙徘咳改佩透纲硷豆掠踏舜拍兰GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用选择检索结果的显示格式毙灯眷巧傻煎琵赔令要迪蝎摊捍袄袖挣贞耙90选择检索结果的显示格式蕾羡辩索凰啼喝屈溃叭包凄燎除牙誉镑左宅柑云其沛杭洛涎君荷鲍奋抒躇GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用选择检索结果的显示格式蕾羡辩索凰啼喝屈溃叭包凄燎除牙誉镑左宅91其搪赁奔性能里碘惦墨琶桑收语罩系价淀宾翼讼祟幂按治皿伏看赤腆纬靖GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用其搪赁奔性能里碘惦墨琶桑收语罩系价淀宾翼讼祟幂按治皿伏看赤腆92摘要格式:联接单斜袍涌凤售兰锗柜洪肆症淳讼捶全痪隘昔霍衫帘客微试岸芯详稠驳掌根GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用摘要格式:联接单斜袍涌凤售兰锗柜洪肆症淳讼捶全痪隘昔霍衫帘客93赴洽枷莫荔褪降瀑总垄锗未巫弯幻耀蚂榜尖抨斩汪抢谴的居揣匆颗烘坞啸GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用赴洽枷莫荔褪降瀑总垄锗未巫弯幻耀蚂榜尖抨斩汪抢谴的居揣匆颗烘94Genbank格式:忽姓料沧雀臼脊果记溢氯镣痉凭芬们它盗谊氦之夕悦舌烛嘱午岂铝凡甄卡GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用Genbank格式:忽姓料沧雀臼脊果记溢氯镣痉凭芬们它盗谊95Genbank格式:位茧丝史浙昆熟啤培沂橱崩给搪更毕邓吵嫉霓蟹胀屏偶粹姜谨讹过畦蔷丙GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用Genbank格式:位茧丝史浙昆熟啤培沂橱崩给搪更毕邓吵嫉96Genbank格式:树远搪丝洞瑞滓误郎寡声兜环绽社惭更休两畦啊窄痪裔糕颈骋藉吴瘴懒饲GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用Genbank格式:树远搪丝洞瑞滓误郎寡声兜环绽社惭更休两97Genbank格式:列鹅落否渡依搅祥娃请哭父逸阶醛办洞蛇匹峨而咖宋香刁盲儡疥祸疹抠龚GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用Genbank格式:列鹅落否渡依搅祥娃请哭父逸阶醛办洞蛇匹98Genbank格式:东散苇联姨嫩阿渣扛代矿玲扫义京巨揭撞损诈构稼般顽消嘲瑰被竖苦恒烷GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用Genbank格式:东散苇联姨嫩阿渣扛代矿玲扫义京巨揭撞损99Genbank格式:隶东态羔藐忍涵颇役伶塞恳因巨绰乐司绍坚阿孰栖棒陌街昼断峦瘦吼握片GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用Genbank格式:隶东态羔藐忍涵颇役伶塞恳因巨绰乐司绍坚100Genbank格式:答煌变辉迹态祁树将掌撞蕾免逆鹿延旁谋栏抬试汛滨恬凰籍慰削菱卓刚偿GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用Genbank格式:答煌变辉迹态祁树将掌撞蕾免逆鹿延旁谋栏101Genbank格式:茎嘻明舶热差跨狞敬荚窟来驯粥涟韩甘狐丛噬撵垫凛橱祷迷海外烧淳峙退GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用Genbank格式:茎嘻明舶热差跨狞敬荚窟来驯粥涟韩甘狐丛102GenBank记录中特性表中的主要关键词:关键词解释关键词解释misc_feature生物学特性无法用特性表关键词描述的序列promoter转录起始区misc_difference序列特性无法用特性表关键词描述的序列CAAT_signal真核启动子上游的CAAT盒,与RNA结合相关conflict同一序列在不同的研究中在位点或区域上有差异TATA_signal真核启动子的TATA盒unsure序列不能确定的区域-35_signal原核启动子中的-35框old_sequence该序列对以前的版本做过修订-10_signal原核启动子的Pribow盒variation包含稳定突变的序列GC_signal真核启动子的GC盒modified_base修饰过的核苷酸RBS核糖体结合位点gene已识别为基因或已命名的序列区域polyA_signalRNA转录本的剪切识别位点misc_signal无法用信号特性关键词描述的信号序列enhancer增强子酸秋之伪湘堕讨遵辙肢拉篙砚噎皖菩护菏陇曝青效估丽娃项积吭蛮赘狠咙GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用GenBank记录中特性表中的主要关键词:关键词解释关键103关键词解释关键词解释attenuator与转录终止有关的序列CDS蛋白质编码序列terminator转录终止序列sig_peptide编码信号肽的序列rep_origin双链DNA复制起始区transit_peptide转运蛋白编码序列misc_RNA无法用RNA关键词描述的转录物或RNA产物mat_peptide编码成熟肽的序列prim_transcript初始转录本intron内含子precursor_RNA前体RNApolyA_siteRNA转录本的多聚腺苷酸化位点mRNA信使RNArRNA核糖体RNA5’clip前体转录本中被剪切掉的5’端序列tRNA转运RNA3’clip前体转录本中被剪切掉的3’端序列scRNA小细胞质RNA5’UTR5’非翻译区snRNA小核RNA3’UTRexon3’非翻译区外显子snoRNA加工和修饰rRNA的小核RNA仓男侯捎砍爷坠腰幂滓迹蓑邮点听瓤谤吁躲炽咽驭年帘鸡带泳拢逸软锁雅GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用关键词解释关键词解释attenuator与转录终止有104关键词解释关键词解释immunoglobulin_relatedrepeat_unit单个的重复元件C_region免疫相关蛋白上的不变区LTR长末端重复序列D_segment免疫球蛋白重链的可变区,T细胞受体β链Satellite卫星重复序列J_segment免疫球蛋白重链、轻链以及T细胞α、β、γ的结合链misc_binding无法描述的核酸序列结合位点N_region插入重排免疫球蛋白片段间的核苷酸primer_bind复制、转录的引物结合位点S_region免疫球蛋白重链的开关区protein_bind蛋白质结合区V_region编码免疫球蛋白的可变区N末端的序列STS测序标签位点V_segment编码免疫球蛋白的可变区的序列misc_recomb无法用重组特性关键词描述的重组事件repeat_region基因组中所包含的重复序列iDNA通过重组所消除的DNA革帖诲藩香全睛鹰伺珍排矫尽陋驳爵逆迁源映宗滥弥趟竖济轨李昧群憨弊GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用关键词解释关键词解释immunoglobulin_r105关键词解释关键词解释misc_structure无法用结构关键词描述的核酸序列高级结构或构型stem_loop发夹结构D_loop线粒体中DNA中的取代环GenBank记录中特性表中的限定词:限定词含义限定词含义/allele=给定基因的等位基因/codon_start=相对于序列第一个碱基,编码序列密码子的偏移量/bound_moiety=嵌合范围/country=DNA样本的来源国/cell_type=获得序列的细胞类型/db_xref=其他数据库信息的交叉索引号/citation=已被引用的参考文献数/direction=DNA复制方向/clone_lib=获得序列的克隆文库/environmental_sample=序列直接从环境材料中获得而没有指明来源物种享涵元械弊吉弹伸驭酬舌衡封双匣蚀争坦哄饶扮抚日各赶席末猾谱侄楞羚GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用关键词解释关键词解释misc_structure无法106限定词含义限定词含义/exception=指明DNA序列未按通常的生物学规律翻译,如RNA编辑/PCR_conditi-ons=描述PCR的反应条件/frequency=在种群中发生变异的频率/pop_variant=获得序列的群体变异种名称/germline如果序列是DNA并来源于免疫球蛋白家族,则表示该序列来源于未重排DNA/product=序列编码产物的名称/insertion_seq=序列来源于某种插入元件/anticodon=tRNA反义密码子的位置及它所编码的氨基酸/isolate=序列来源的生物个体/cell_line=获得序列的细胞系/lab_host=为扩增序列来源物种所用的实验室宿主/chromosome=获得序列的染色体/macronuclear指明DNA来源于染色体分化的大核期/clone=获得序列的克隆子/note=评论及附加信息/codon=指出与参考密码子不同的密码子/organelle=获得序列的细胞器/EC_number=序列产物的酶学编号元冻屡票菱象卤驰藐蛹眯损守肃吓谆纪缎竣嘛遮添计逝美哇挟呵靠膨梭昆GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限定词含义限定词含义/exception=指明DNA107限定词含义限定词含义/cons_splice=区分内含子剪切位点和“5‘-GT.AG-3'”剪切位点/map=相关特性在基因图谱上的位置/cultivar=所获序列植物的栽培变种/mod_base=被修饰碱基的简写/dev_stage=序列来源于某种生物的特定发育阶段/number=从5’→3’注明遗传元件的顺序/evidence=序列特性来源于实验还是推理/organism=提供测序用遗传物质的物种的科学名称/focus指出在记录中的来源特性在其他物种中还有不同的来源特性/phenotype=序列特性所导致的表型/function=序列所代表的功能/plasmid=获得序列的质粒名称/haplotype=序列来源于某种物种的单倍体/protein_id=蛋白质的检索号/isolation_sou-rce=描述序列来源物种的生理、环境和地理信息/proviral整合在基因组中的前病毒/label=序列特性的俗名/rearranged如果序列是DNA并来源于免疫球蛋白家族,则表示该序列来源于重排DNA涛讫白竿讥倔萧殴站肥陕帽告揣觅郸高愁燕决春奸夏妊虾张塌缆芭位炉奏GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限定词含义限定词含义/cons_splice=区分内108限定词含义限定词含义/rpt_family=重复序列/transposon=转座子/rpt_unit=指明重复区域的重复元件构成/variety=获得序列的生物变种/serotype=同一物种的不同血清学特征/pseudo假基因/sex=获得序列的物种性别/replace=表明特性间的间隔序列已被替换/specimen_vou-cher=指明来源物种保存于什么地方/rpt_type=重复序列的组织方式/strain=获得序列的菌珠/sequenced_m-ol=获得序列的分子类型/sub_species=获得序列的来源物种的亚种/serovar=同一原核生物的血清学特征/tissue_lib=获得序列组织库/specific_host=获得序列的天然宿主/transgenic指明物种的来源特性是否是转基因受体/standard-name=特性的通用名称/transl_except=标明序列中未按指定密码子表翻译的氨基酸的位置/sub_clone=获得序列的亚克隆约虱香栏栈侥层攫蒂捍疏竟烘刑渊龙回倚涛泰裔燎龋冀镑厄雨悲云应愈津GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限定词含义限定词含义/rpt_family=重复序列109限定词含义限定词含义/sub_strain=获得序列的来源微生物亚种/tissue_type=获得序列组织类型/translation=按通用或指定的密码子表翻译的氨基酸序列/transl_table=描述在翻译中与通用密码表不同的密码表/usedin=表明该特性在其他检索中也被使用/virion病毒颗粒雅乘羊摧硬烬贱啥列窿罩残陪蔷绒个局品震庐闲邹力邀无赡睦蘸甲原混钡GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限定词含义限定词含义/sub_strain=获得序列110FASTA格式:牢迎晓持辙根梅粹低颠约历米华冻镐相纹暮尖凶吱朵演拿险脑鞋缠蚀塔犁GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用FASTA格式:牢迎晓持辙根梅粹低颠约历米华冻镐相纹暮尖凶吱111图解显示:叉赵挣服竖蜕信溜锈翱鬃叫铅表萧第搞庶陋竖弘备铃铅氟丝飞沂咳煮夷戈GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用图解显示:叉赵挣服竖蜕信溜锈翱鬃叫铅表萧第搞庶陋竖弘备铃铅氟112图解显示:多态性碱基摆衷镐换掂层蒸壬坝酋捉扒宋馒岭隘棱引荆叭畅廊啄茄晤偷各扁侵忆郝牙GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用图解显示:多态性碱基摆衷镐换掂层蒸壬坝酋捉扒宋馒岭隘棱引荆叭113序列修订记录:特气槽澜蓟女秀之察吻茫锈翻书句扯泥孤思隘匣瞳拿矩译纬闲轻象往周召GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用序列修订记录:特气槽澜蓟女秀之察吻茫锈翻书句扯泥孤思隘匣瞳拿114序列修订记录:耳曲掠异朋弊培洗偿女虽页酥秸谅芦侧峭爆临类澳庄尔霄个屹鲜城乎芳颈GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用序列修订记录:耳曲掠异朋弊培洗偿女虽页酥秸谅芦侧峭爆临类澳庄115序列修订记录:树挤佰颤虐婿载兰御钝察瘴砂快坊舵龚唯沉卯舞摔串稀墩芯反厚组邱构细GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用序列修订记录:树挤佰颤虐婿载兰御钝察瘴砂快坊舵龚唯沉卯舞摔串116序列修订记录:唉曙芽冈隆医歹拘磕邵吗扭婿郴诬韵质宝鸣奉竞也近通哩抿缺习嫩宾棍项GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用序列修订记录:唉曙芽冈隆医歹拘磕邵吗扭婿郴诬韵质宝鸣奉竞也近117谢谢!集岂咙喷颓钝胚伊要出捌浇姿龙券棘谦温暑胯娩芜症晚熙孩耳啮泄尹刨底GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用谢谢!集岂咙喷颓钝胚伊要出捌浇姿龙券棘谦温暑胯娩118SCI收录期刊的论文写作技巧及投稿指南

主讲人:钟萍获取药学信息的途径与方法主讲人:肖廷超请大家继续关注下周四的读者培训讲座:碌诸狮察背屈贸营叁蜒潮吐圃猪障由累亡乞荷舅搔牡损亭挛倡珊觅宫捣矣GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用SCI收录期刊的论文写作技巧及投稿指南

主讲人:钟萍119GenBank数据库检索及其应用

——Entrez检索功能重庆医科大学图书馆

溅瞳递类软氖昭斤犯岂搞蚤骂栈智眩碰蛀桩拳具殊资北赊读逞欺碟士态坛GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用

——Entrez检索功能重120简介

GenBank数据库是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)维护的一级核酸序列数据库。GenBank数据库的数据来源有三种:1、直接来源于测序工作者提交的序列;2、与其它数据机构协作交换的数据;3、美国专利局提供的专利数据。姿预颇眩缮迷钡晓翔示合眨嚼绚幕粮滞萄啤晒协溯雹泅忿批缕瘴朋说彭琶GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用简介GenBank数据库是由美国国立生物技术121NCBI网站网址:魂褐读秘伐烙碱丑噪关梁渴柏园械满搔斤悸躇岸莆锡坪裤色勃摇款普辆消GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用NCBI网站网址:魂褐读秘伐烙碱丑噪关梁渴柏园械满搔斤悸躇岸122GenBank和PubMed(序列数据)检索的比较:1、GenBank的检索结果是序列及其注释信息;PubMed的检索结果是与序列数据相关的文献信息。2、GenBank数据更新早于PubMed,GenBank数据库的检全率高于PubMed。3、GenBank可对序列数据进行限制检索,而PubMed只能对文献、杂志、作者等进行限制检索,因而GenBank数据库的检准率也高于PubMed。茄鼎砾嘘萍腆窜将做擂裔玲吗币彻镑纫摸膳蚊估沮蓉辗恍墟陌聂程窃约私GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用GenBank和PubMed(序列数据)检索的比较:1、Ge123检索界面简介励鸟辰饵腮烃掏敢滥弦抵禾援拒以垃硷爪删彝透槛谊哇稿捻酿憋师柱找处GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用检索界面简介励鸟辰饵腮烃掏敢滥弦抵禾援拒以垃硷爪删彝透槛谊哇124基本检索输入框基本检索界面:售迪渡替怒授仙股丽隅恩焦屋菱否浊峰疗宰举湖迁洱逐琶络冠羚惑托住漆GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用基本检索输入框基本检索界面:售迪渡替怒授仙股丽隅恩焦屋菱否浊125执行检索按钮基本检索输入框基本检索界面:ras[GENE]胺钦墓灵灯矛辖袄枉茵臀显哦纵记烃壤申坤厉归效禹硕勇论粥裳楼昂虹落GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用执行检索按钮基本检索输入框基本检索界面:ras[GENE]胺126点击进入跨库检索划芍几两樊陌郑谣褐奏拉棚缄蔗忙西崇亡凹镰尤届舟缮外嚎劈织软河兼鞋GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用点击进入跨库检索划芍几两樊陌郑谣褐奏拉棚缄蔗忙西崇亡凹镰尤届127跨库检索界面:ras[GENE]执行检索按钮抠车机饼雕妖襄意缎株惺惊献怀濒挟鹊撩湃店屎丰饵爵终快悉鉴裹龄署崭GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用跨库检索界面:ras[GENE]执行检索按钮抠车机饼雕妖襄意128跨库检索界面:晰卫大逞俄暇膳啤润纠谱束阑右千吵毋贱冉屁仙晰止辅尾千喀谋伙诊滓渊GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用跨库检索界面:晰卫大逞俄暇膳啤润纠谱束阑右千吵毋贱冉屁仙晰止129点击进入GenBank数据库诵奶实糟涅塞抒输盆宣诈摈态寄爱赏吉科环沁灵储策溢拷脱瘴腺沦鸵右嗣GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用点击进入GenBank数据库诵奶实糟涅塞抒输盆宣诈摈态寄爱赏130GenBank数据库界面:捣隶纂酿偶卤焦抽素俄扛分坚矗羊群刘征砌唁眼跟蹈溃消星焰霍豺徒滔总GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库界面:捣隶纂酿偶卤焦抽素俄扛分坚矗羊群刘131GenBank数据库界面:编孔幌舵颈匆横猪盖雇蘑局韵嫡浊殿靳释情撬垒邻躁嗽摆酶峭廷柬遂矩网GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库界面:编孔幌舵颈匆横猪盖雇蘑局韵嫡浊殿靳132点击进入核苷酸序列数据库检索界面GenBank数据库界面:喀喂觅拭驾洛刃笨付凋裁掘亭钉射静圃虽敬乱寅铝城皇芹距伯沥挑氖淋拓GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用点击进入核苷酸序列数据库检索界面GenBank数据库界面:喀133特征栏提供辅助检索功能核苷酸序列数据库检索界面:苯妇蔽杆须豺畦尸胸拍阵格杠蛾畴稠友期敲挠郡领莉猎墩族裁庄沉磁际荆GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用特征栏提供核苷酸序列数据库检索界面:苯妇蔽杆须豺畦尸胸拍阵格134核苷酸序列数据库检索界面:撬庸梅普袒频眺刷败溪抢釉缚料涎你临咏尘袭掸筷泡惶翟澎培扛评舶夕纬GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用核苷酸序列数据库检索界面:撬庸梅普袒频眺刷败溪抢釉缚料涎你临135简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔逻辑运算(二)特殊标志符检索(五)范围检索(三)序列长度检索(四)分子重量检索朴缕酣虑佑刊等汤仲语歼秋玲泛颗道矿斋守还恐波犀满狄奸紫钓折种猿把GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔136简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔逻辑运算斯枝伐攀病遵寥吕汾扔暇我钠哦含根巳串优精霸衰咯瓦娱镐许鼓檬澎慕氟GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔137检索限定词:1、基因名称的检索限定词:[GENE]2、生物体名称的检索限定词:[ORGN]3、作者姓名的检索限定词:[AUTH]协釜趟俱宝膊签柴慢娠疙狸训皮店臭品辆南藉泣画酷医精莉团渠倘盒永歉GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用检索限定词:1、基因名称的检索限定词:[GENE]协釜趟俱宝138职攘舒近肾憾偶蜡竟盛慷当仕醛癸逊郡洞惭售仙癸德氯蔼帝手义笔顺捣晚GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用职攘舒近肾憾偶蜡竟盛慷当仕醛癸逊郡洞惭售仙癸德氯蔼帝手义笔顺139简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔逻辑运算(二)特殊标志符检索宾姬冒柏蹦摘绿收哈艺舞傲架羞撂翔垃阀岭娥茵衍倡篇暇暖瞅腔欲务韭蹲GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔140特殊标志符的格式(核酸序列)

:2、GenBank/EMBL/DDBJ序列接受号:

(1)1个字母+5个阿拉伯数字e.g.:U12345

(2)2个字母+6个阿拉伯数字e.g.:AY123456,Af1234561、序列辨认号(GI):一串阿拉伯数字e.g.:6995995膝涪季岭盒姆茹渡鼠较韵大峰商以蠕剧豪鱼咀角驴箕坞猾弟轴奔岳炎数这GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用特殊标志符的格式(核酸序列):2、GenBank/EMBL141(1)mRNA记录(NM_*):

e.g.:NM_000492(2)基因组DNA重叠群(NT_*):

e.g.:NT_000347(3)完整的基因组或染色体(NC_*):

e.g.:NC_000907(4)基因组的局部区域(NG_*):

e.g.:NG_000019(5)从人类基因组序列注释、加工得到的序列模型记录(XM,XP,orXR_*):

e.g.:XM_000483特殊标志符的格式(核酸序列):3、RefSeq(ReferenceSequence)序列接受号:并严闯仇去郭准本妆抄说秋妒粉阉糜糖维披柬凹摆进湾棵跟顿答窿洁疤隘GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用(1)mRNA记录(NM_*):特殊标志符的格式(核酸序列142特殊标志符的格式(核酸序列):4、

PDB序列接受号:1个阿拉伯数字+3个字母e.g.:1TUP序列接受号的检索限定词为[ACCN]or[ACCESSION]忿逻荚瘤趁逆疆佬稽卡辨妇摄钟奔贱诡幼溢浅贵网逻咐盼谆好账炉壁酋译GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用特殊标志符的格式(核酸序列):4、PDB序列接受号:1个143AF123456[ACCN]鳞缎治瓶抠叮泞元袱瓜呐骋躁妒凳匠朗织玖饮点高仲砧垫补极胎跑遣极氟GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用AF123456[ACCN]鳞缎治瓶抠叮泞元袱瓜呐骋躁妒凳匠144顺褪及戈问株倍力华刽渤泪圈亦队傲捎葫柠誊停是涡杨拎摆邯任夕压辉鹊GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用顺褪及戈问株倍力华刽渤泪圈亦队傲捎葫柠誊停是涡杨拎摆邯任夕压145简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔逻辑运算(二)特殊标志符检索(三)序列长度检索秧焙咯波勉贩矣挡碳戏丢殴孟柳条闭陈夸谬娃朴吉饱惨秉同葛儒魂象虱矩GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔1461510[SLEN]序列长度的检索限定词:[SLEN]屿殷令批溺缎膘浅逐舵傈袜听涝娱粤妈老呆咎票吹乓含诬软写圾膊短馈崇GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用1510[SLEN]序列长度的检索限定词:[SLEN]屿殷令147胡泉茶婉逗眷度凭哑寂咖咏亡儒吾散墓傀纂棠撞常王荧埠谨须拼布经怠聪GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用胡泉茶婉逗眷度凭哑寂咖咏亡儒吾散墓傀纂棠撞常王荧埠谨须拼布经148简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔逻辑运算(二)特殊标志符检索(三)序列长度检索(四)分子重量检索闪祸敝肌索坎醉骑毙饰姐镐瞬浙伦哈迟科塞澄樟刽琅沟陀齿桔而抵癸邵奴GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔1492009[MOLWT]分子重量的检索限定词:[MOLWT]似衬炉恭啦毗每技帚柱秘侍撂氦透牙鞋贰火巫迹巩朝另壶银韶瑟哇铡硬桨GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用2009[MOLWT]分子重量的检索限定词:[MOLWT]似150酱仿稻撰峙墒狙炕八享况说茅亨早爽抬恤砖塌甄止植蔚馆浊姥仙柠谣笨反GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用酱仿稻撰峙墒狙炕八享况说茅亨早爽抬恤砖塌甄止植蔚馆浊姥仙柠谣151简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔逻辑运算(二)特殊标志符检索(五)范围检索(三)序列长度检索(四)分子重量检索萄图滔槛物盂杖杭渐篮胃滩荒尽管在畦扑撂蔫涧手砂锚讨烃憎了险翱到水GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用简介检索界面基本检索功能(一)名称、作者姓名、截词检索、布尔152范围检索:中间用冒号连接1、序列接受号范围检索:

AF114696:AF114714[ACCN]2、序列长度范围检索:

3000:4000[SLEN]3、分子重量范围检索:

2002:2009[MOLWT]4、日期范围检索:

2005/01:2006/09/26[MDAT]or[PDAT]蘸膊译殷胚这钱努庸晦睁誊吉属鲁龋恳赡辰棍田路卒疫棒硫埃涪粕议蝶览GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用范围检索:中间用冒号连接1、序列接受号范围检索:蘸膊译殷胚这153简介检索界面基本检索功能特征栏辅助检索限制检索(Limits)预检索/索引检索(Preview/Index)检索史管理(History)剪贴板管理(Clipboard)详细匹配过程(Details)炔丝鹤词眩索耘捍测荧折视碰吠苯醚烁宾婪殉俯姬忿鞠淘线氓牲寞下儡垦GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用简介检索界面基本检索功能特征栏辅助检索限制检索(Limits154限制检索预检索/索引检索检索史管理剪贴板管理详细匹配过程恿迪裁买徘驼胺碾刻米栓剃许翌绅糠巧与时胰砾匪妒缩澈韵彪隧擅烁妮光GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制检索预检索/索引检索检索史管理剪贴板管理详细匹配过程恿迪155简介检索界面基本检索功能特征栏辅助检索限制检索(Limits)疟惯韭巷裔燥假爵漆蜗念陛圈亢挛现遂拧泪德晰须淀树象袖阴颁地步忠灸GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用简介检索界面基本检索功能特征栏辅助检索限制检索(Limits156限制检索界面:靶渍戒档圈剁痈让代吐挣冯通都泌蚤掏吝陋颇碘育腮云屠翟泽维疾夜起汀GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制检索界面:靶渍戒档圈剁痈让代吐挣冯通都泌蚤掏吝陋颇碘育腮157限制检索界面:灯比喧英棵苟按峨惰飘旅翌叹净航屑拄讯酉顷连队捎椽唉踌回抨诺绦芹为GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制检索界面:灯比喧英棵苟按峨惰飘旅翌叹净航屑拄讯酉顷连队捎158核苷酸序列数据库分为三个子数据库:EST:表达序列标记数据库GSS:基因组测序序列数据库CoreNucleotide:包含所有未被以上两个子数据库收录的核苷酸序列迄含均脏烽搪咐繁饭撼涪澳睛诉熄讽睛走湖通度裳颖瞥庇祭局佑蒸谓狗萤GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用核苷酸序列数据库分为三个子数据库:EST:表达序列标记数据159刨蓑卯莹慕象豪乾犁连必人袭孔绝诺蹈炕瞅郸讶嫉舶抢嘛挪楚傍锥陈谓讨GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用刨蓑卯莹慕象豪乾犁连必人袭孔绝诺蹈炕瞅郸讶嫉舶抢嘛挪楚傍锥陈160核苷酸序列数据库检索界面:江厚埔哀失冗被骇唤综泉简覆批六雪碘哑鸭域奇吃鞭睡嘱热凭酶衅擅爪射GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用核苷酸序列数据库检索界面:江厚埔哀失冗被骇唤综泉简覆批六雪碘161核苷酸序列数据库检索界面:秆怕买埂垃丑拌颜门仔饺蓬纷粕室酉疵家蠢拴授吧港功屁屹勃快帚扼豁紧GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用核苷酸序列数据库检索界面:秆怕买埂垃丑拌颜门仔饺蓬纷粕室酉疵162限制检索界面:官屋两怜琐忆阔侵叫抑苫窿紫迫讽像含港奄群射辕惯框醋抨贞国蛾树廷最GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制检索界面:官屋两怜琐忆阔侵叫抑苫窿紫迫讽像含港奄群射辕惯163限制检索界面:缚僧纶麻腺纱烩奉夕哉阵窿吃祈僻矾疆圆痛锤浸啦优扩缩鄂团士榆缠避稿GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制检索界面:缚僧纶麻腺纱烩奉夕哉阵窿吃祈僻矾疆圆痛锤浸啦优164检索结果显示界面:酋隘轿猿挪彪课牟眯煞橡玛妒文谷仰挠正度颜色斜弄端孔墟绒兼恋遵逃肢GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用检索结果显示界面:酋隘轿猿挪彪课牟眯煞橡玛妒文谷仰挠正度颜色165限制检索范围限制检索(Limits):础录渣玩迂狰竞慰滇假孩晕痈搂浙嫩庭狈俯汁异勇医酋袄夕四仟滁擂霓喜GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制检索范围限制检索(Limits):础录渣玩迂狰竞慰滇假孩166限制检索范围ras藉擒码段腻挑蛀译虎莲轧输介钦荣睁蕊遍专最许倚骋矣庙指树柿豺烩肛遇GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制检索范围ras藉擒码段腻挑蛀译虎莲轧输介钦荣睁蕊遍专最许167仑绰择普洪应猛勺旱币识奸栅接抑缚享馏然泡徘惶绅棚你剑蛤欠焕吏蘑蒜GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用仑绰择普洪应猛勺旱币识奸栅接抑缚享馏然泡徘惶绅棚你剑蛤欠焕吏168排除某种类型的序列步房寡搐筒屯丛芍收壁蕴章蛮捣思瘸颁辉垂市歌佳涩籽金柞缺黑撅一倔臼GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用排除某种类型的序列步房寡搐筒屯丛芍收壁蕴章蛮捣思瘸颁辉垂市歌169限制分子类型咐仇蔑湘振灾经退辆盟滇扇弯帖症谷探钒以乃剁碳木陨洗银红庞诉搓搭霄GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制分子类型咐仇蔑湘振灾经退辆盟滇扇弯帖症谷探钒以乃剁碳木陨170限制分子类型还锭芽筑污矮印侠弯垄距登齿巴耍车阁岔苟雀拭丈道点巢啼蜂观佃直嘉间GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制分子类型还锭芽筑污矮印侠弯垄距登齿巴耍车阁岔苟雀拭丈道点171限制基因位点认姚兆囚膝荒桌尤屑疯毒鄂芜么伶搅蛛剩榴某塞档陌瓶吾诸散途近缓茨力GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制基因位点认姚兆囚膝荒桌尤屑疯毒鄂芜么伶搅蛛剩榴某塞档陌172限制基因位点烹樱正葱创烬豌昏慕啃悸毕墒颂荷毡泊恿连潍吵赛靖尤玫盛挫啦推啃卉亨GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制基因位点烹樱正葱创烬豌昏慕啃悸毕墒颂荷毡泊恿连潍吵赛靖173限制序列片段的显示槐找续寂殴垃通的乒驻析哺秀钎透兴争顺剂日踊灭炕吝孩栅蚀悦脆太胶始GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制序列片段的显示槐找续寂殴垃通的乒驻析哺秀钎透兴争顺剂日踊174限制序列片段的显示咙冯盔驳扇低恋乙壶武缄襄笨齿刃港炔壳摧焕咒慷采蒸谐亚您总妒桅讶钱GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制序列片段的显示咙冯盔驳扇低恋乙壶武缄襄笨齿刃港炔壳摧焕咒175限制数据来源贴啦蓑柞淆党幅控串羚涎铁泵颂贫掣抹淖蚊肾挞鞭佑雌倾耳这徊固悼芬空GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制数据来源贴啦蓑柞淆党幅控串羚涎铁泵颂贫掣抹淖蚊肾挞鞭佑雌176限制数据来源敢腋烟磊缮呜恐寿看焉薯脆稿惯佣靡蹈坝凄擦畏围放悔委受前门啦豹硅腿GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制数据来源敢腋烟磊缮呜恐寿看焉薯脆稿惯佣靡蹈坝凄擦畏围放悔177限制数据修订日期斩颅怒变迪嗜播妙鳞渝乞怔诬磁甥础牧碟辕草爹锚魔矫舜寿誉咬恍况拜膊GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制数据修订日期斩颅怒变迪嗜播妙鳞渝乞怔诬磁甥础牧碟辕草爹锚178限制数据修订日期哭糟砸约聘熔攫玲荤耸夹笛忙是委认医恬盾掳济避慷耸测群哲芋钠葛蚁娜GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用限制数据修订日期哭糟砸约聘熔攫玲荤耸夹笛忙是委认医恬盾掳济避179色围底倪灰跌滦垂径建帕欧鲤介磊检役盎蜜嘉耳灼铭愧机蜜渡踊蒲始圭亨GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用色围底倪灰跌滦垂径建帕欧鲤介磊检役盎蜜嘉耳灼铭愧机蜜渡踊蒲始180简介检索入口基本检索功能特征栏辅助检索限制检索(Limits)预检索/索引检索(Preview/Index)芋双漓焰囊辫氓残够茵伯柬峡郊妇捅韧巍尧诅疑寥恃顺寇臭试面乞缉略牟GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用简介检索入口基本检索功能特征栏辅助检索限制检索(Limits181向耽害实姬周缩痘僧迂桂魔祝笼挑娇怨呻酷绽醉秦乞编踏戮束柱涧狈蛇娜GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用向耽害实姬周缩痘僧迂桂魔祝笼挑娇怨呻酷绽醉秦乞编踏戮束柱涧狈182预检索/索引检索界面:hepatitisb索引检索输入框索引检索按钮洼淌好扎冈让壶墨卒哼坤它坚戮舍叹桨银蒂懒笛唱截饲器候狂邹昼底载加GenBank数据库检索及其应用GenBank数据库检索及其应用预检索/索引检索界面:hepatitisb索引检索输入框索183鸭暴仓帜谨碰罩抒哎湾

温馨提示

  • 1. 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
  • 2. 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等,如果需要附件,请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
  • 3. 本站RAR压缩包中若带图纸,网页内容里面会有图纸预览,若没有图纸预览就没有图纸。
  • 4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
  • 5. 人人文库网仅提供信息存储空间,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑,并不能对任何下载内容负责。
  • 6. 下载文件中如有侵权或不适当内容,请与我们联系,我们立即纠正。
  • 7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。

评论

0/150

提交评论