序列分析(一)一一序列比对课件

序列分析(一)一一序列比对序列分析(一)一一序列比对序列分析(一)一一序列比对序列分析(一)序列比对生物信息学研究的三个层面初级层面:基于现有的生物信息数据库和资源:利用成熟的生物信息学工具(专业网站、软件)解决生物信息学问题生物信息数据库(NCBI、EBI、DBJ、UniProt等)基因组序列分析、序列比对软件(BLAST、CLUSTAL等)系统发育树构建软件的简单使用(PHYLIP、PAM等)搜集、整理有特色的生物信息学数据库随着国家对农村学校教育改革力度的加大、基础教育课程改革实验的推动，体育课程教学受到了高度重视。体育课堂是学校课程体系的重要组成部分，是实施素质教育和培养德智体美全面发展人才不可缺少的重要途径。体育教学的顺利开展，是促进中小学生心理、身体健康发展的有效手段，更是中小学生形成终身体育锻炼习惯的重要基础。1对农村中小学体育教学现状原因分析1.1学校领导重视不够在部分领导的脑海中只要中考，高考成绩好，其他的就不是太重要。相应的，体育教师认为体育课就是那么回事，无论你怎么做都是不到学校领导和学生的承认。这样一来，农村中学的体育教学就形成了一个恶性循环，放羊式教学越演越烈。13.2和9.1学校领导和班主任对体育锻炼进行干预。致使大多数学生想参加体育训练但又不敢参加，即使参加也不能善始善终。1.2农村中学的场地和器材也受到极大的限制乡镇中学处在比较偏僻的乡村，交通、地理位置不便，学校的场地规模不大，在一定程度上影响了学校体育课的开展。体育场地器材设施拥有率低。据调查可知，山东农村中小学校最普遍的体育场馆设施是：篮球场（80.12?和54.16?）、乒乓球台（57.13?和57.12?）、300米操场（52.16?和41.10?）、400米操场（38.17?和42.13?）。学校只具有简易体育器材（29.16?和24.18?），体育课堂常用器材的具备率不高（39.10%和38.14%），传统体育器材还占有一定的比例（10.12%和11.19%）；另外学校课外体育活动常用器材不足（14.13%和13.10%），且健身房（8.11%和7.17%）、体操房（7.14%和5.19%）等器材设施的拥有率低。按照国家标准的要求，中小学生对学校体育设施的需求要体现出“适合年龄特征、有安全保护措施、娱乐且品种多样”的特征，而目前我省农村中小学的体育环境极不平衡，迫切需要改建、充实和发展。1.3教师影响因素学校对体育教学的投入很少，这在一定程度上降低了体育教师的热情，导致体育教学上的缺少和不合理，一言堂、大而统、以师为中心、为主角的行为偏执性；以及随性情而实施教学的情绪化工作等等与当前体育教学改革不协调的缺少现象，令人担忧。1.4体育竟赛活动现状学校竞赛活动往往要规定人数、参赛项目，使得一些单项突出的学生不得不放弃参与，只能让一部分优秀的同学参加，而大部分学生成了“看客”。1.5家长的传统观点长期影响着孩子的锻炼习惯研究发现，农村中学生、小学生家长对学生体育锻炼的支持率分别是680%和791%，一个月内，偶尔参与孩子体育锻炼的分别为67.6%60.7%；从不陪孩子一起进行体育锻炼的高达140%和228%，但对学生体育锻炼行为采取沉默态度的分别为30.1%和18.9%，再者，中学生、小学生“选择与家人一起进行体育锻炼”的比例仅占5.6%、8.9%。这说明家长对孩子身体锻炼的认识付诸行动的很少。2对于发展农村中小学体育教学的对策探索2.1加强体育宣传的力度首先学校的教师（特别是班主任老师）要对体育学科有一个正确的认识，顾励学生加强锻炼，积极上好体育课；其次，要使学生能够真正懂得德、智、体、美、劳全面发展的重要性。进一步激发全体学生体育学习与锻炼的内驱力，使学生在平时的学习中在意体育课和体育成绩。2.2各级学校要进一步提高对学校体育工作的认识，把体育工作列入学校的议事日程，关心和支持体育教师的工作各级教育主管部门应加大对中小学体育卫生工作的督导、检查与评估，促进学校体育工作的健康发展。加大对体育设施的投入，在这里说的不单是对体育经费的投入，而且更应加强对体育老师业务素质的培养。2.3要从各地的实际出发，因地制宜，开展特色体育注意对体育场地、器材设施的管理和维修，提高体育场地和器材的利用率。学校领导和体育教师应从实际出发，充分利用当地的自然条件，发掘体育课程资源，选择贴近学生生活的体育形式，充实和丰富体育课程堂教学,召开展对场地要求不高的乒乓球、羽毛球等的教学，以缓解农村学校体育经费、场地器材缺乏的状况，同样可以达到锻炼身体和促进体育教学的目的。2.4制定体育师资的发展规划，有领导、有计划地发展体育师资队伍计划地增加学校体育经费投入，以满足体育教师再教育的需要。采取有效措施，运用各种激励手段，以调动广大体育教师的积极性。2.5广大体育教师要加强自身的专业发展平时注重对自己业务素质的培养，加强自身的培训提高；同时，转变教师的教育观念和教学行为，把体育课堂归还给学生，让学生成为真正意义上的课堂主人。注重对体育差生的转化，利用合作小组实现对体育差生的转化，发挥合作小组的优势，培养学生主动参与的能力；利用体育竞赛的形式激发学生的学习动力，逐步培养学生的自信力。2.6在公开公平的原则下进行考试目前，初中体育考试成绩为30分，没有人可以作假，必须靠自己的实力来得分。所以，学生就会重视体育课，在初一就开始锻炼，争取达到国家体育锻炼标准。三年后，学生自觉形成了体育习惯和意识，为养成终身锻炼的习惯打下基础。总之，体育教学是农村中学教育中薄弱的一环。只有加强了农村中学体育的发展，才能真正实现教育公平，做到城市学生和农村学生协调发展，培养高素质的公民，促进我国体育事业的发展和全民健身计划的实施。高职院校的重要基础课程是高等数学，这门学科与其他专业紧密联系，对培养高素质人才和高应用意识人才具有重大作用。高职院校数学教学的主要目标是培养学生的应用意识，锻炼学生分析问题和解决问题的能力，同时在实践发展中有所创新。而体验式教学符合当前高职院校数学教育理念，即培养具有创新意识和实践能力强的学生。这一教育理念要求学生积极主动参与整个数学教学过程，让学生在体验中感受数学的魅力，主动进行探究，体验探究的乐趣。因此，笔者在创新高职院校数学教学策略时，特提出采用体验式进行数学教学，让学生真正在做中学。1目前高职院校数学教学现状目前我国高职院校虽然重视数学教学的发展，并采取一系列措施提高数学教学效率，也取得一定的成效，但是从整体上来看，目前高职院校数学教学现状不容乐观，具体表现在以下四个方面。1.1学生数学学习兴趣低下一般而言，进入高职院校的学生数学基础普遍较差，而当学习更深一层次的知识时，往往会出现畏难情绪，进而导致对数学学习提不起兴趣，渐渐丧失学习数学的兴趣与信心。此外，高职院校以基础课程形式开展数学教学，学校重视度较低，学生普遍表现出学习积极性不高的状态，考试只求通过。因此，学生陷入学习数学的恶性循环当中，逐渐失去学习数学的兴趣。1.2教师教学方法单一传统的数学教学方法就是教师讲解，学生倾听，注重结果，而忽视学生学习的过程。此种方法属于填鸭式教学方法，结果就是课堂45分钟都是教师在讲解公式、原理、例题，学生成为知识被动接收者。这样的教学方法过于单一，加上缺乏与学生之间的交流与互动，很难提高课堂教学效率。1.3教学内容和教学体系滞后随着社会的进步，数学也以较快的发展步伐继续前进，其应用领域也随着拓宽。但是由于高职院校所采用的数学教材更新缓慢，导致内容上缺乏时代性与应用性，还只是停留在微积分、线性代数等知识的学习层面上，所以教学内容和教学体系明显滞后于社会的发展步伐和发展需求。1.4师资队伍建设滞后数学师资队伍是学生学习数学的关键，但目前高职院校普遍存在师资队伍建设滞后的问题。大多数数学教师教授不同专业的数学课程，忙碌于备课和上课，基本没有时间去研究如何提升自身素质。此外，高职院校没有定期对数学教师进行培训，或者提供教师深造的机会，导致整体数学师资队伍建设滞后。2高职院校数学教学应该遵循的原则2.1层次性原则高职院校学生基础参差不齐，因此数学教师必须根据学生基础、专业特点和发展方向进行因材施教，使教学更加有针对性，尽量照顾每一层次的学生。教师可以选择分层教学，努力让不同基础的学生都能在数学学习中有所提高。2.2循序渐进原则辩证唯物主义认为，任何事物的发展都具有规律性。同样地，数学教学也一样，都必须在遵循认识的基础上进行教学，循序渐进，由浅及深，由易到难，层层推进，逐渐提高学生的数学学习水平。2.3发展性原则高职院校的教育目标是全面发展学生，促进学生应对社会的发展变化而变化。高职学校阶段是学生终身教育的一个重要阶段，但高职学习并不是学习教育的终点，教师应该教会学生用发展的眼光看问题。社会处于不断变化发展当中，唯有积极应对变化，不断创新，使教学不再是以就业为导向，转变思想观念，使学生积极主动接受发展性教育，顺应社会的发展潮流。因此，高职院校的数学教学必须遵循发展性原则。总之，高职院校应该遵循这三个原则进行数学教学，但必须明确这三个原则并不是孤立存在的，它们相互依存、相互促进，教师必须灵活遵循各个原则，努力提高高职数学教学效率和教学水平。3创新高职院校数学教学策略分析3.1积极采用分层次教学，实施因材施教基于高职院校学生基础不同的现状，笔者认为可以积极采用分层教学，实施因材施教。分层教学法主要是在学生差异性较大的情况下使用，如学生的智力因素、非智力因素和基础水平不同，针对这样的状况，教师采取分层教学，使教学更有针对性。该种教学方法必须注重因材施教，全面实现从备课、授课和指导的分层。如以高职数学课堂教学分层教学模式为例，教师在讲解极限定义的时候，教师首先明确极限定义可以分为数列极限和函数极限，然后依据学生的思维能力和观察能力对学生进行分层，然后分组进行探讨，分别找出极限的描述性定义和精准性定义，以满足不同层次学生的学习需求。3.2引用体验式教学，提高数学实践性数学体验式教学主要是指教师在进行数学教学中，积极创设教学情境，引导学生自然进入教师所创设的教学氛围中，在学习过程中不断激发学生学习数学的内驱力，使学生主动进行数学学习，体验数学学习的过程，并在体验过程中领悟数学，感受到体验式教学的快乐，促进学生数学学习的发展，从而提高学生对学习数学的认识。例如教师可以把数学建模引进课堂教学，让学生真正体验应用数学解决实际的快乐。在数学建模过程中，教师让学生全程参与数学建模的抽象、简化、假设、引进变量等处理过程，教师将生活上的实际问题灵活的运用数学方式表达出来，还可以让学生提出实际问题，并用数学方式表达，逐步建立起数学模型，然后再采用现代计算机技术和相关的数学方法进行求解。学生全程参与了数学建模的过程，体验到数学建模的改革流程，并从中提出问题，动脑筋思考，从而提高数学的实践性和实际分析能力。学生在体验过程中，通过参与分析问题和解决问题，可以获得一定的成就感，从而增强学习数学的信心，同时提高了数学的趣味性。3.3优化教学内容，提高内容的针对性和实用性优化教学内容的第一步是教材的选择。高职院校应该结合本校学生专业特点和发展方向有针对性的选择教材，而不再是像传统的做法，即统一教材、教纲和教案。选择符合学生发展和专业特点的教材既可以提升学生的数学基础，同时又可以使教学内容更加具有针对性，实用性更加强。如果高职院校自身资费充足和人员开发力量足够，可以结合时代的发展特点，编写符合自身发展特点的数学教材，为国家培养应用性强的高素质人才。此外，高职院校数学教师必须合理选择和安排教材内容，多教授具有实际用处的内容，少一些理论性强，实用性不强的内容。在内容的选择上，由于每个专业的侧重点有所不同，因此，数学教学必须结合学生的专业特点，选择与学生专业性密切相关的内容进行授课。3.4加强数学教师队伍建设，提高整体师资水平高职院校必须高度重视数学教师师资队伍的建设，通过各种途径、各种方法提高整体师资水平。首先，高职院校必须让数学教师深刻认识到数学这门学科在整个高职院校教育的重要地位，明确高职院校人才的培养目标。其次，高职院校应该定期举行专题培训，加强数学教师的理论知识，逐步形成系统性知识，更好掌握专业与数学课程之间的知识，促使数学教学灵活运用教材，变更教学手段和教学方式，提高课堂教学效率。最后，高职院校还应该提供机会让数学教师得到更多实践的机会，让数学教师在实践中加深对理论知识的理解，提高运用数学知识解决实际问题的能力，提高自身的专业水平。只有从多方位全面提升高职院校数学教师的整体素质，才能逐步打造出一支理论性强、实践性强的教师队伍，最终实现整体师资水平提高的目标。值得注意的是，高职院校应该注重培养青年数学教师，鼓励青年教师多参加学术交流活动，切实做好后备工作。总之，数学作为高职院校的基础课程，其重要性不言而喻。高职院校必须高度重视数学教学各项工作，正视教学中存在的问题，并努力结合自身院校的发展提出可行性解决策略。笔者认为，在遵循层次性原则、循序渐进原则和发展性原则的基础上，教师可以创新数学教学策略，如积极采用分层教学法、体验式教学法来丰富教学方法策略，激发学生学习数学的兴趣，优化数学课堂教学过程，真正让学生体验到数学学科的实用性，从而变被动学生为主动学习，为国家输送具有数学意识的应用型人才。序列分析(一)一一序列比对序列分析(一)一一序列比对序列分析1序列分析(一)序列比对序列分析(一)2生物信息学研究的三个层面初级层面:基于现有的生物信息数据库和资源:利用成熟的生物信息学工具(专业网站、软件)解决生物信息学问题生物信息数据库(NCBI、EBI、DBJ、UniProt等)基因组序列分析、序列比对软件(BLAST、CLUSTAL等)系统发育树构建软件的简单使用(PHYLIP、PAM等)搜集、整理有特色的生物信息学数据库生物信息学研究的三个层面3中级层面:利用数理统计方法和相关的工具,研究生物信息学问题概率、数理统计基础现有的数理统计和科学计算工具(EXCEL、SPSS等)中级层面:4高级层面:提出有重要意义的生物信息学问题;自主创新,发展新方法,开发新工具,引领生物信息学领域研究方向。面向生物学领域,解决重要生物学问题利用数学、物理、化学、计算科学等思想和方法建立模型,发展算法自行编程,开发软件高级层面:5序列分析内容与DNA和protein序列相关的研究都可称为序列分析。主要包括:1.序列比对2.基因组序列分析3.蛋白质序列分析4.综合序列分析序列分析内容6为什么要进行序列比对???序列拼接数据库搜索方面进化方面功能方面为什么要进行序列比对???7与进化相关的几个概念同源性与相似性:极易被混淆的两个概念!!!同源性(homology):是指序列们是由共同祖先进化而来,讲两条序列的同源关系,只有两种情况:同源、不同源。相似性:指序列间的差别,是一个度量。同源与相似的关系:一般认为序列相似性达到定程度,即可认为是同源,但不绝对。与进化相关的几个概念8Ortholog(直系同源)两个基因通过物种形成的事件而产生,或源于不同物种的具有共同祖先的两个基因,或者两个物种中的同一基因一般具有相同的功能Paralog(旁系同源)指相同的基因组内因基因复制形成的多个具有不同功能的基因Xenolog(异同源):由某一个水平基因转移事件而得到的同源序列Convergence(趋同)序列的相似性是由随机因素产生。Ortholog(直系同源)9第一节、双序列比对点阵分析动态规划第一节、双序列比对101.点阵分析用途1.寻找两条序列间所有可能的比对;2.寻找蛋白质、DNA序列上正向或反向的重复序列;3发现RNA上可能存在的互补区域优点1.可以找到两个序列间所有可能的残基匹配;2.简单、易懂3.直观、整体性强工具:ebi.ac.uk/tools/emboss/index.html1.点阵分析11序列分析(一)一一序列比对课件12序列分析(一)一一序列比对课件13序列分析(一)一一序列比对课件14序列分析(一)一一序列比对课件15序列分析(一)一一序列比对课件16序列分析(一)一一序列比对课件17序列分析(一)一一序列比对课件18序列分析(一)一一序列比对课件19序列分析(一)一一序列比对课件20序列分析(一)一一序列比对课件21序列分析(一)一一序列比对课件22序列分析(一)一一序列比对课件23序列分析(一)一一序列比对课件24序列分析(一)一一序列比对课件25序列分析(一)一一序列比对课件26序列分析(一)一一序列比对课件27序列分析(一)一一序列比对课件28序列分析(一)一一序列比对课件29序列分析(一)一一序列比对课件30序列分析(一)一一序列比对课件31序列分析(一)一一序列比对课件32序列分析(一)一一序列比对课件33序列分析(一)一一序列比对课件34序列分析(一)一一序列比对课件35序列分析(一)一一序列比对课件36序列分析(一)一一序列比对课件37序列分析(一)一一序列比对课件38序列分析(一)一一序列比对课件39序列分析(一)一一序列比对课件40序列分析(一)一一序列比对课件41序列分析(一)一一序列比对课件42序列分析(一)一一序列比对课件43序列分析(一)一一序列比对课件44序列分析(一)一一序列比对课件45序列分析(一)一一序列比对课件46序列分析(一)一一序列比对课件47序列分析(一)一一序列比对课件48序列分析(一)一一序列比对课件49序列分析(一)一一序列比对课件50序列分析(一)一一序列比对课件51序列分析(一)一一序列比对课件52序列分析(一)一一序列比对课件53序列分析(一)一一序列比对课件54序列分析(一)一一序列比对课件55序列分析(一)一一序列比对课件56序列分析(一)一一序列比对课件57序列分析(一)一一序列比对课件58序列分析(一)一一序列比对课件59序列分析(一)一一序列比对课件60序列分析(一)一一序列比对课件61序列分析(一)一一序列比对课件62序列分析(一)一一序列比对课件63序列分析(一)一一序列比对课件64序列分析(一)一一序列比对课件65序列分析(一)一一序列比对课件66序列分析(一)一一序列比对课件67序列分析(一)一一序列比对课件68序列分析(一)一一序列比对课件69序列分析(一)一一序列比对课件70序列分析(一)一一序列比对课件71序列分析(一)一一序列比对课件72序列分析(一)一一序列比对课件73序列分析(一)一一序列比对课件74序列分析(一)一一序列比对课件75序列分析(一)一一序列比对课件76序列分析(一)一一序列比对课件77序列分析(一)一一序列比对课件78序列分析(一)一一序列比对课件7966、节制使快乐增加并使享受加强。——德谟克利特

67、今天应做的事没有做，明天再早也是耽误了。——裴斯泰洛齐

68、决定一个人的一生，以及整个命运的，只是一瞬之间。——歌德

69、懒人无法享受休息之乐。——拉布克

70、浪费时间是一桩大罪过。——卢梭66、节制使快乐增加并使享受加强。——德谟克利特80序列分析(一)一一序列比对序列分析(一)一一序列比对序列分析(一)一一序列比对序列分析(一)序列比对生物信息学研究的三个层面初级层面:基于现有的生物信息数据库和资源:利用成熟的生物信息学工具(专业网站、软件)解决生物信息学问题生物信息数据库(NCBI、EBI、DBJ、UniProt等)基因组序列分析、序列比对软件(BLAST、CLUSTAL等)系统发育树构建软件的简单使用(PHYLIP、PAM等)搜集、整理有特色的生物信息学数据库随着国家对农村学校教育改革力度的加大、基础教育课程改革实验的推动，体育课程教学受到了高度重视。体育课堂是学校课程体系的重要组成部分，是实施素质教育和培养德智体美全面发展人才不可缺少的重要途径。体育教学的顺利开展，是促进中小学生心理、身体健康发展的有效手段，更是中小学生形成终身体育锻炼习惯的重要基础。1对农村中小学体育教学现状原因分析1.1学校领导重视不够在部分领导的脑海中只要中考，高考成绩好，其他的就不是太重要。相应的，体育教师认为体育课就是那么回事，无论你怎么做都是不到学校领导和学生的承认。这样一来，农村中学的体育教学就形成了一个恶性循环，放羊式教学越演越烈。13.2和9.1学校领导和班主任对体育锻炼进行干预。致使大多数学生想参加体育训练但又不敢参加，即使参加也不能善始善终。1.2农村中学的场地和器材也受到极大的限制乡镇中学处在比较偏僻的乡村，交通、地理位置不便，学校的场地规模不大，在一定程度上影响了学校体育课的开展。体育场地器材设施拥有率低。据调查可知，山东农村中小学校最普遍的体育场馆设施是：篮球场（80.12?和54.16?）、乒乓球台（57.13?和57.12?）、300米操场（52.16?和41.10?）、400米操场（38.17?和42.13?）。学校只具有简易体育器材（29.16?和24.18?），体育课堂常用器材的具备率不高（39.10%和38.14%），传统体育器材还占有一定的比例（10.12%和11.19%）；另外学校课外体育活动常用器材不足（14.13%和13.10%），且健身房（8.11%和7.17%）、体操房（7.14%和5.19%）等器材设施的拥有率低。按照国家标准的要求，中小学生对学校体育设施的需求要体现出“适合年龄特征、有安全保护措施、娱乐且品种多样”的特征，而目前我省农村中小学的体育环境极不平衡，迫切需要改建、充实和发展。1.3教师影响因素学校对体育教学的投入很少，这在一定程度上降低了体育教师的热情，导致体育教学上的缺少和不合理，一言堂、大而统、以师为中心、为主角的行为偏执性；以及随性情而实施教学的情绪化工作等等与当前体育教学改革不协调的缺少现象，令人担忧。1.4体育竟赛活动现状学校竞赛活动往往要规定人数、参赛项目，使得一些单项突出的学生不得不放弃参与，只能让一部分优秀的同学参加，而大部分学生成了“看客”。1.5家长的传统观点长期影响着孩子的锻炼习惯研究发现，农村中学生、小学生家长对学生体育锻炼的支持率分别是680%和791%，一个月内，偶尔参与孩子体育锻炼的分别为67.6%60.7%；从不陪孩子一起进行体育锻炼的高达140%和228%，但对学生体育锻炼行为采取沉默态度的分别为30.1%和18.9%，再者，中学生、小学生“选择与家人一起进行体育锻炼”的比例仅占5.6%、8.9%。这说明家长对孩子身体锻炼的认识付诸行动的很少。2对于发展农村中小学体育教学的对策探索2.1加强体育宣传的力度首先学校的教师（特别是班主任老师）要对体育学科有一个正确的认识，顾励学生加强锻炼，积极上好体育课；其次，要使学生能够真正懂得德、智、体、美、劳全面发展的重要性。进一步激发全体学生体育学习与锻炼的内驱力，使学生在平时的学习中在意体育课和体育成绩。2.2各级学校要进一步提高对学校体育工作的认识，把体育工作列入学校的议事日程，关心和支持体育教师的工作各级教育主管部门应加大对中小学体育卫生工作的督导、检查与评估，促进学校体育工作的健康发展。加大对体育设施的投入，在这里说的不单是对体育经费的投入，而且更应加强对体育老师业务素质的培养。2.3要从各地的实际出发，因地制宜，开展特色体育注意对体育场地、器材设施的管理和维修，提高体育场地和器材的利用率。学校领导和体育教师应从实际出发，充分利用当地的自然条件，发掘体育课程资源，选择贴近学生生活的体育形式，充实和丰富体育课程堂教学,召开展对场地要求不高的乒乓球、羽毛球等的教学，以缓解农村学校体育经费、场地器材缺乏的状况，同样可以达到锻炼身体和促进体育教学的目的。2.4制定体育师资的发展规划，有领导、有计划地发展体育师资队伍计划地增加学校体育经费投入，以满足体育教师再教育的需要。采取有效措施，运用各种激励手段，以调动广大体育教师的积极性。2.5广大体育教师要加强自身的专业发展平时注重对自己业务素质的培养，加强自身的培训提高；同时，转变教师的教育观念和教学行为，把体育课堂归还给学生，让学生成为真正意义上的课堂主人。注重对体育差生的转化，利用合作小组实现对体育差生的转化，发挥合作小组的优势，培养学生主动参与的能力；利用体育竞赛的形式激发学生的学习动力，逐步培养学生的自信力。2.6在公开公平的原则下进行考试目前，初中体育考试成绩为30分，没有人可以作假，必须靠自己的实力来得分。所以，学生就会重视体育课，在初一就开始锻炼，争取达到国家体育锻炼标准。三年后，学生自觉形成了体育习惯和意识，为养成终身锻炼的习惯打下基础。总之，体育教学是农村中学教育中薄弱的一环。只有加强了农村中学体育的发展，才能真正实现教育公平，做到城市学生和农村学生协调发展，培养高素质的公民，促进我国体育事业的发展和全民健身计划的实施。高职院校的重要基础课程是高等数学，这门学科与其他专业紧密联系，对培养高素质人才和高应用意识人才具有重大作用。高职院校数学教学的主要目标是培养学生的应用意识，锻炼学生分析问题和解决问题的能力，同时在实践发展中有所创新。而体验式教学符合当前高职院校数学教育理念，即培养具有创新意识和实践能力强的学生。这一教育理念要求学生积极主动参与整个数学教学过程，让学生在体验中感受数学的魅力，主动进行探究，体验探究的乐趣。因此，笔者在创新高职院校数学教学策略时，特提出采用体验式进行数学教学，让学生真正在做中学。1目前高职院校数学教学现状目前我国高职院校虽然重视数学教学的发展，并采取一系列措施提高数学教学效率，也取得一定的成效，但是从整体上来看，目前高职院校数学教学现状不容乐观，具体表现在以下四个方面。1.1学生数学学习兴趣低下一般而言，进入高职院校的学生数学基础普遍较差，而当学习更深一层次的知识时，往往会出现畏难情绪，进而导致对数学学习提不起兴趣，渐渐丧失学习数学的兴趣与信心。此外，高职院校以基础课程形式开展数学教学，学校重视度较低，学生普遍表现出学习积极性不高的状态，考试只求通过。因此，学生陷入学习数学的恶性循环当中，逐渐失去学习数学的兴趣。1.2教师教学方法单一传统的数学教学方法就是教师讲解，学生倾听，注重结果，而忽视学生学习的过程。此种方法属于填鸭式教学方法，结果就是课堂45分钟都是教师在讲解公式、原理、例题，学生成为知识被动接收者。这样的教学方法过于单一，加上缺乏与学生之间的交流与互动，很难提高课堂教学效率。1.3教学内容和教学体系滞后随着社会的进步，数学也以较快的发展步伐继续前进，其应用领域也随着拓宽。但是由于高职院校所采用的数学教材更新缓慢，导致内容上缺乏时代性与应用性，还只是停留在微积分、线性代数等知识的学习层面上，所以教学内容和教学体系明显滞后于社会的发展步伐和发展需求。1.4师资队伍建设滞后数学师资队伍是学生学习数学的关键，但目前高职院校普遍存在师资队伍建设滞后的问题。大多数数学教师教授不同专业的数学课程，忙碌于备课和上课，基本没有时间去研究如何提升自身素质。此外，高职院校没有定期对数学教师进行培训，或者提供教师深造的机会，导致整体数学师资队伍建设滞后。2高职院校数学教学应该遵循的原则2.1层次性原则高职院校学生基础参差不齐，因此数学教师必须根据学生基础、专业特点和发展方向进行因材施教，使教学更加有针对性，尽量照顾每一层次的学生。教师可以选择分层教学，努力让不同基础的学生都能在数学学习中有所提高。2.2循序渐进原则辩证唯物主义认为，任何事物的发展都具有规律性。同样地，数学教学也一样，都必须在遵循认识的基础上进行教学，循序渐进，由浅及深，由易到难，层层推进，逐渐提高学生的数学学习水平。2.3发展性原则高职院校的教育目标是全面发展学生，促进学生应对社会的发展变化而变化。高职学校阶段是学生终身教育的一个重要阶段，但高职学习并不是学习教育的终点，教师应该教会学生用发展的眼光看问题。社会处于不断变化发展当中，唯有积极应对变化，不断创新，使教学不再是以就业为导向，转变思想观念，使学生积极主动接受发展性教育，顺应社会的发展潮流。因此，高职院校的数学教学必须遵循发展性原则。总之，高职院校应该遵循这三个原则进行数学教学，但必须明确这三个原则并不是孤立存在的，它们相互依存、相互促进，教师必须灵活遵循各个原则，努力提高高职数学教学效率和教学水平。3创新高职院校数学教学策略分析3.1积极采用分层次教学，实施因材施教基于高职院校学生基础不同的现状，笔者认为可以积极采用分层教学，实施因材施教。分层教学法主要是在学生差异性较大的情况下使用，如学生的智力因素、非智力因素和基础水平不同，针对这样的状况，教师采取分层教学，使教学更有针对性。该种教学方法必须注重因材施教，全面实现从备课、授课和指导的分层。如以高职数学课堂教学分层教学模式为例，教师在讲解极限定义的时候，教师首先明确极限定义可以分为数列极限和函数极限，然后依据学生的思维能力和观察能力对学生进行分层，然后分组进行探讨，分别找出极限的描述性定义和精准性定义，以满足不同层次学生的学习需求。3.2引用体验式教学，提高数学实践性数学体验式教学主要是指教师在进行数学教学中，积极创设教学情境，引导学生自然进入教师所创设的教学氛围中，在学习过程中不断激发学生学习数学的内驱力，使学生主动进行数学学习，体验数学学习的过程，并在体验过程中领悟数学，感受到体验式教学的快乐，促进学生数学学习的发展，从而提高学生对学习数学的认识。例如教师可以把数学建模引进课堂教学，让学生真正体验应用数学解决实际的快乐。在数学建模过程中，教师让学生全程参与数学建模的抽象、简化、假设、引进变量等处理过程，教师将生活上的实际问题灵活的运用数学方式表达出来，还可以让学生提出实际问题，并用数学方式表达，逐步建立起数学模型，然后再采用现代计算机技术和相关的数学方法进行求解。学生全程参与了数学建模的过程，体验到数学建模的改革流程，并从中提出问题，动脑筋思考，从而提高数学的实践性和实际分析能力。学生在体验过程中，通过参与分析问题和解决问题，可以获得一定的成就感，从而增强学习数学的信心，同时提高了数学的趣味性。3.3优化教学内容，提高内容的针对性和实用性优化教学内容的第一步是教材的选择。高职院校应该结合本校学生专业特点和发展方向有针对性的选择教材，而不再是像传统的做法，即统一教材、教纲和教案。选择符合学生发展和专业特点的教材既可以提升学生的数学基础，同时又可以使教学内容更加具有针对性，实用性更加强。如果高职院校自身资费充足和人员开发力量足够，可以结合时代的发展特点，编写符合自身发展特点的数学教材，为国家培养应用性强的高素质人才。此外，高职院校数学教师必须合理选择和安排教材内容，多教授具有实际用处的内容，少一些理论性强，实用性不强的内容。在内容的选择上，由于每个专业的侧重点有所不同，因此，数学教学必须结合学生的专业特点，选择与学生专业性密切相关的内容进行授课。3.4加强数学教师队伍建设，提高整体师资水平高职院校必须高度重视数学教师师资队伍的建设，通过各种途径、各种方法提高整体师资水平。首先，高职院校必须让数学教师深刻认识到数学这门学科在整个高职院校教育的重要地位，明确高职院校人才的培养目标。其次，高职院校应该定期举行专题培训，加强数学教师的理论知识，逐步形成系统性知识，更好掌握专业与数学课程之间的知识，促使数学教学灵活运用教材，变更教学手段和教学方式，提高课堂教学效率。最后，高职院校还应该提供机会让数学教师得到更多实践的机会，让数学教师在实践中加深对理论知识的理解，提高运用数学知识解决实际问题的能力，提高自身的专业水平。只有从多方位全面提升高职院校数学教师的整体素质，才能逐步打造出一支理论性强、实践性强的教师队伍，最终实现整体师资水平提高的目标。值得注意的是，高职院校应该注重培养青年数学教师，鼓励青年教师多参加学术交流活动，切实做好后备工作。总之，数学作为高职院校的基础课程，其重要性不言而喻。高职院校必须高度重视数学教学各项工作，正视教学中存在的问题，并努力结合自身院校的发展提出可行性解决策略。笔者认为，在遵循层次性原则、循序渐进原则和发展性原则的基础上，教师可以创新数学教学策略，如积极采用分层教学法、体验式教学法来丰富教学方法策略，激发学生学习数学的兴趣，优化数学课堂教学过程，真正让学生体验到数学学科的实用性，从而变被动学生为主动学习，为国家输送具有数学意识的应用型人才。序列分析(一)一一序列比对序列分析(一)一一序列比对序列分析81序列分析(一)序列比对序列分析(一)82生物信息学研究的三个层面初级层面:基于现有的生物信息数据库和资源:利用成熟的生物信息学工具(专业网站、软件)解决生物信息学问题生物信息数据库(NCBI、EBI、DBJ、UniProt等)基因组序列分析、序列比对软件(BLAST、CLUSTAL等)系统发育树构建软件的简单使用(PHYLIP、PAM等)搜集、整理有特色的生物信息学数据库生物信息学研究的三个层面83中级层面:利用数理统计方法和相关的工具,研究生物信息学问题概率、数理统计基础现有的数理统计和科学计算工具(EXCEL、SPSS等)中级层面:84高级层面:提出有重要意义的生物信息学问题;自主创新,发展新方法,开发新工具,引领生物信息学领域研究方向。面向生物学领域,解决重要生物学问题利用数学、物理、化学、计算科学等思想和方法建立模型,发展算法自行编程,开发软件高级层面:85序列分析内容与DNA和protein序列相关的研究都可称为序列分析。主要包括:1.序列比对2.基因组序列分析3.蛋白质序列分析4.综合序列分析序列分析内容86为什么要进行序列比对???序列拼接数据库搜索方面进化方面功能方面为什么要进行序列比对???87与进化相关的几个概念同源性与相似性:极易被混淆的两个概念!!!同源性(homology):是指序列们是由共同祖先进化而来,讲两条序列的同源关系,只有两种情况:同源、不同源。相似性:指序列间的差别,是一个度量。同源与相似的关系:一般认为序列相似性达到定程度,即可认为是同源,但不绝对。与进化相关的几个概念88Ortholog(直系同源)两个基因通过物种形成的事件而产生,或源于不同物种的具有共同祖先的两个基因,或者两个物种中的同一基因一般具有相同的功能Paralog(旁系同源)指相同的基因组内因基因复制形成的多个具有不同功能的基因Xenolog(异同源):由某一个水平基因转移事件而得到的同源序列Convergence(趋同)序列的相似性是由随机因素产生。Ortholog(直系同源)89第一节、双序列比对点阵分析动态规划第一节、双序列比对901.点阵分析用途