上海交大生化笔记

电子穴(Electronsink):活性部位的赖氨酸或另一位置碱性基团起来此作用,有利于醛亚胺-酮亚胺的转化.PLP也起着电子穴的作用钴铵素(维生素B12):是治疗恶性贫血的,它的核心带有一个中心钴原子的咕啉环高氨血症(Hyperammonemia):是因为血液中NH4+含量过高所致.家族性高胆固醇血症:是由于血浆中LDL-胆固醇的浓度高,胆固醇在各种组织中沉织,患者的分子缺陷是不具备或缺乏功能完善的LDL受体天冬氨酸转氨甲酰酶(ATC酶):是嘧啶生物合成的关键步骤,此酶起氨甲酰化作用.它也是一种有趣的调节酶.PRPP:全称5-磷酸核糖-1-焦磷酸,是组氨酸和色氨酸生物合成中的关键性中间产物,是核苷酸中核糖磷酸部份的供体.它也参与多种生物合成.补救途径(Salvagepathway):嘌呤核苷酸可以通过此途径事先形成碱基的合成,它比从头合成途径的反应简单.反应里,PRPP的核糖磷酸部份转移给嘌呤,形成相应核苷酸.莱纳二氏综合症(Lesch-Nyhansyndrome):是因为几乎没有次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶而带来的破坏性后果,是先天性代谢紊乱.它病征是强制性自残行为,也有彼此寻衅的倾向,同时也会智力缺陷和痉挛葡萄糖激酶：是为糖原的合成提供葡萄糖6-磷酸，在葡萄糖供应有限时，肝脏中葡萄糖激酶的高KM就给大脑和肌肉以需要萄萄糖的第一个信号西佛碱：二羟丙酮磷酸与动物醛缩酶活性部位的专一的赖氨酸残基形成质子化西佛碱烯醇化阴离子：质子化的西佛碱在催化作用中促进二羟丙酮酸形成烯醇化阴离子负碳离子：TPP（硫胺素焦磷酸）电离的，与丙酮酸的羰基加成铁硫簇：电子又由FMNH2传递到一系列的铁硫复合物，是NADH-Q还原酶中的第二种类型的辅基苹果酸-天冬氨酸穿梭:在肝脏和心脏中,来自细胞质的NADH的电子由它带到线粒体中去的产热蛋白(thermogenin):Theinnermitochondrialmembranecontainsalargeamountofit,generatesheatbyshort-circuitingthemitochondrialprotonbattery.无效循环:又叫底物循环,象果糖6-磷酸磷酸化为果糖1,6-二磷酸和后者又水解为果糖6-磷酸这样的一切反应.被认为是代谢控制中的缺陷.其生物学作用是:(1)放大代谢信号;(2)由ATP水解产生热科里循环(CoriCycle):由肝脏给收缩中的肌肉提供葡萄糖,肌肉由于糖酵解中葡萄糖转变为乳酸而产生ATP,然后肝脏又再从乳酸合成葡萄糖的过程1． 利用维生素B12(钴胺素)衍生物做辅酶地反应（1）甲基丙二酰CoA变位酶methylmelonylCoAmutase25章D型——L型异构化（2）高半胱氨酸甲基转移酶homocysteinemethyltransferase高半胱氨酸——甲硫氨酸2． 奇数FA可以生成Glc脂肪：甘油——DHAP——糖酵解/糖异生FA——酮体（偶数）/酮体+糖（奇数）3． CDP-DAG，UDP-Glc，UDP-choline(1)均为活性中间物(2)底物均为核苷三磷酸与磷酸化底物(3)与羟基反应（Ser/Glc）4．3HMGCoA(1)酮体合成（线粒体）（2）胆固醇合成（胞液）5．血浆中三大抗氧化解毒剂：胆红素尿酸维生素C细胞内：谷胱甘肽6．多功能每：（1）FAsynthase(2)PFK2，FBPase3(3)胺甲酰磷酸合成酶，天冬氨酸转胺甲酰酶，二氢乳清酸酶（4）转移酶，1，6-葡萄糖苷酶（5）异柠DHKinase/phosphatase7．RNA是初始遗传物质的证据：（1）重要辅酶为其衍生物（2）DNA合成经由RNA脱氧（3）dTMP经由dUMP甲基化8．抗癌药物：氟尿嘧啶氨基蝶呤氨甲蝶呤9．芳环脱环反应的双加氧酶10．酶的共价修饰：糖原磷酸化酶腺苷酰化酶11．二十多种遗传病的原因12．GMP/AMP的合成及增效抑制13．PLP辅酶的反应糖原磷酸解/转氨酶/磷脂酰丝氨酸/AA合成14．TPP辅酶反应转酮醇酶/α-KGDH/PyrDH/Pyr——乙醛15．脱羧推动的反应：OAA——PEP/FAelongationPPi水解推动的反应：一、名词解释（30分）1.鞘磷脂(4分)2.外显子(4分)3.LDL受体(4分)4.结构域(4分)5.细胞内信使(4分)6.反转录病毒(5分)7.激素反应元件8.一碳单位(4分)二、问答题(50分)1.简述DNA双螺旋结构模式的要点及春与DNA生物学功能的关系。(8分)2.糖在机体内的主要代谢途径有哪些？其生物学意义是什么？（8分）3.简述蛋白质生物合成的分子机理和主要过程。（8分）4.简述重组DNA技术的概念、主要过程和应用。（8分）5.简述体内ATP生成的方式。（8分）6.简述真核细胞基历组结构特点及基因表达调控方式。（10分）三、填空（10分）1.蛋白质主链构象的结构单元有:_________，_________，_________，_________。（2分）2.酮体生成的直接原料是_________，其限速酶是_________。（2分）3.酶活性的快速调节方式包括_________和_________。（2分）4.PCR包括三个步骤①_________，②_________，③_________。（2分）5.变性蛋白质同天然蛋白质的区别是_________，_________，_________，_________。四、选择一个最佳答案（10分）1.真核细胞mRNA的加互修饰不包括:A.除去非结构信息部分B.在mRNA的3'末端加poly尾巴C.经过较多的甲基化过程D.在mRNA的5'末端形成帽子结构E.mRNA由核内不均一RNA转变而来2.带电颗粒在电场中的泳动度首先取决于下列哪项因素A.电场强度B.支持物的电渗作用C.颗粒所带净电荷数及其大小，形状D.溶液的pH值E.溶液的离子强度3.某一符合米曼氏方程的酶，当[S]=2Km时，其反应速度V等于：A．VmaxB.2/3VmaxC3/2VmaxD.2VmE.1/2Vmax4.胆固醇合成的限速酶为A.乙酰CoA羧化酶B.琥珀酰CoA转硫酶C.HMGCoA还原酶E.HMGCoA合成酶F.HMGCoA裂解酶5.下列哪个过程是酶原的激活过程A.前胶原→原胶原B.胰岛素原→胰岛素C.凝血因子I→IaD.凝血因子II→IiaE.糖原合成D→I6.人体内不能合成的脂肪酸是A．油酸B.亚油酸C.硬脂酸D.软脂酸E.月桂酸7.Km值是指A.酶-底物复合物的解离常数B.酶促反应达到最大速度时所需底物浓度的一半C.达到1/2Vamx时所需的底物浓度D.酶促反应的底物常数E.酶与底物的亲和常数8.患溶血性黄疽时:A.血中结合胆红素增高B.尿中胆红素增高C.粪中胆素原减少D.尿中胆素原减少F.血清凡登伯间接反应阳性9.有关PCR的描述下列哪项不正确:A.是一种酶促反应B.引物决定了扩增的特异性C.扩增的产量按Y=m(1+X)nD.扩增的对象是氨基酸序列E.扩增的对象是DNA序列10.转氨酶的辅酶是A.焦磷酸硫胺素B.磷酸吡哆醛C.硫辛酸D.四氢叶酸E.辅酶A11.指导合成蛋白质的结构基因大多数为:A.单考贝顺序B.回文顺序C.高度重复顺序D.中度重复顺序12.下面哪些因素可防止DNA上的一个点突变表现在蛋白质的一级结构?A.DNA的修复作用B.密码的简并性C.校正tRNA的作用D.核糖体对mRNA的校正E.以上都正确13.下列哪一项不是呼吸链的组成部分:A.NADHB.NADPHC.FADH2D.FMNH2E.Cytaa314．某一蛋白质分子中一个氨基酸发生了改变，这个蛋白A.二级结构一定改变B.二级结构一定不变C.三级结构一定改变D.功能一定改变E.功能不一定改变15．下列哪种化合物不是磷脂：A．脑苷脂B.醛缩磷酯C.神经鞘磷脂D.脑磷酸E.卵磷脂《生物化学》考试大纲

生物化学的定义、研究对象和任务、生物化学的发展简史、生物化学与工农医的关系。

第一章蛋白质

1、蛋白质的化学组成及分类；蛋白质的分子大小与形状；蛋白质生物功能的多样性；

2、氨基酸的基本结构；氨基酸的分类：20种氨基酸的英文名称、缩写符号及结构式及其分类标准；氨基酸的理化性质；氨基酸的分离和分析鉴定。

3、肽的化学结构；肽的物理化学性质；天然存在的活性肽；多肽合成；肽链上氨基酸的排列顺序，N端、C端；氨基酸顺序测定的一般步骤；

4、蛋白质空间构象的研究方法；多肽链折叠的空间限制；蛋白质的二级结构；纤维状蛋白；а-角蛋白和β-角蛋白，胶原蛋白与三股螺旋构象，弹性蛋白、肌纤维。超二级结构、结构域和三级结构，球状蛋白质构象的基本特征、蛋白质分子中的次级键、次级键在维系蛋白质空间构象中的作用；蛋白质的变性和复性。

5、寡聚蛋白质的构象和四级结构；蛋白质一级结构决定高级结构；细胞色素c的种属差异与生物进化；蛋白质一级结构的变异与分子病；肌红蛋白与血红蛋白的结构和功能；蛋白质的分离纯化和鉴定。

第二章酶学

酶在生命活动中的重要性；酶催化作用的特点；酶的化学本质及其分子组成；酶的命名和分类；酶的专一性；酶活力测定和酶的分离纯化；核酶和抗体酶；酶促反应动力学；酶的作用机理和酶的调节；酶的活性中心；酶促反应机理；酶活性的调节控制；同工酶、诱导酶的定义及生物学意义。第三章维生素和辅酶

脂溶性维生素的结构和功能；水溶性维生素的结构和功能

第四章核酸

1、核酸的分类、分布

2、核酸的生物学功能：DNA是遗传物质的基础（细菌的转化实验、病毒转导），RNA与蛋白质合成。

3、核酸的结构：核酸的基本组成单位---核苷酸；核酸的一级结构；Chargaff法则；DNA双螺旋结构模型、左手螺旋（Z-DNA），DNA的三级结构---超螺旋。RNA的高级结构。RNA的类型，RNA的碱基组成等

4、核酸的理化性质：核酸的水解；核酸的酸碱性质；核酸的紫外吸收特性；核酸的变性、复性和分子杂交；热变性和Tm值，DNA复性动力学。核酸的分离提纯与定量测定。

5、核酸的研究方法：核酸酶；核酸的凝胶电泳。

第五章代谢总论：新陈代谢的基本概念；新陈代谢的普遍原理与特点；研究中间代谢的方法；人类基因组的研究与代谢研究的关系。

第六章生物能学

有关热力学和能的一些基本概念；化学反应中自由能的变化和意义；高能磷酸化合物的定义、类型、ATP的结构特征及其自由能释放、ATP重要生物学功能及系统的动态平衡。

第七章糖代谢

1、糖酵解：酵解与发酵，酵解途径，酵解过程中ATP的合成，丙酮酸的去路，酵解途径的调节。

2、三羧酸循环：丙酮酸脱氢酶系及其调控；三羧酸循环途径；三羧酸循环的ATP生成、三羧酸循环中的酶的立体专一性、三羧酸循环的回补反应、三羧酸循环的调节。

3、其它途径：磷酸戊糖途径、磷酸戊糖途径的生理意义；糖醛酸途径；糖异生途径、糖异生途径的前体、糖异生途径的生理意义及调节。糖原合成与分解的途径、调节等。

第八章氧化磷酸化

1、生物氧化的基本概念；氧化还原电势概念、标准氧化还原电势在生物氧化中的意义、标准电动势和平衡常数的关系。

2、电子传递过程和氧化呼吸链：线立体的结构、氧化磷酸化的概念、P/O比和由ADP形成ATP的部位、氧化磷酸化速率的调节、氧化磷酸化的解偶联剂和抑制剂。

第九章脂类代谢

三酰甘油和甘油的分解代谢；饱和和不饱和脂肪酸的氧化；磷脂的分解代谢；脂肪酸和三酰甘油的合成；胆固醇的代谢；磷脂的生物合成；脂类代谢的调节和紊乱。

第十章蛋白质及氨基酸的分解代谢

氨基酸的脱氨基作用；氨基酸的转氨基作用、联合脱氨基作用及其重要作用。氨基酸的脱羧基作用。氨的转运、尿素循环及其生理意义与调控、尿素循环-三羧酸循环的偶联。氨基酸碳骨架的氧化途径；一些重要的氨基酸衍生物；氨基酸代谢缺乏症；脂肪族氨基酸的生物合成途径；芳香族氨基酸及组氨酸的生物合成途径；氨基酸生物合成的调节控制。

第十一章核酸的降解和核苷酸代谢

核酸的降解和核苷酸的分解代谢；核苷酸的生物合成；某些重要的辅酶核苷酸的生物合成。

第十二章DNA复制和修复

DNA复制：DNA的半保留复制、复制的起点和单位、DNA聚合反应有关的酶、DNA的半不连续复制、DNA复制的拓扑性质、DNA复制的调控；DNA的损伤和修复；在RNA指导下DNA的合成；RNA的生物合成；RNA的转录后加工。

第十三章蛋白质的生物合成

信使RNA；遗传密码；核糖体；蛋白质合成机理；多肽在合成后的定向输运与转译后加工名词解释（15题每题2分），全部英文，全部为硕士真题04-08年上出现过的

HIV-1蛋白酶，诱导契合，CAD蛋白，ELISA，抗体酶，γ羧基谷氨酸，prpp，割裂基因，其他忘了

二、填空（10题，每题2分）很少来自硕士真题上

1.PPi水解，联系了两个反应，一个是尿素循环上的，另一个忘了

2.核酸的碱基和嘌呤，嘧啶连接方式，N9,N1，C1

3.好的胆固醇，坏的胆固醇

4.高血氨症的两个酶

其他忘了

三、不定项选择，部分为硕士真题上，不过有的选项改了

丝氨酸蛋白酶

HB和MB

糖异生发生哪些细胞器上

血红素和细胞色素

过渡态底物类似物，好像有

蛋白激酶A，好像有

四，问答题，三题，

1.就是那个长而灵活的分子线及作用，三个地方出现过，（TCA，脂肪分解，）自己总结

2.06年硕士真题801，就是那个人类基因组文库切成4kb可不可以，

3.计算题，通过一个蛋白分子量计算出DNA分子量，其中需要考虑的是外显子和内含子各一半，所以要乘2，RNA的数目是DNA的一般，也要乘二，简单1，8种必须氨基酸2，等电点的计算，就是两个加一下，然后除以23，氨基酸和印三酮的反应，看看4，蛋白质的结构层次，以及维持稳定的作用力5，蛋白质变性的定义6，核甘酸的写法，5，3顺序7，双螺旋结构特点以及稳定作用力8，RNA三种9，tRNA结构的特点（三叶草）10，mRNA的结构特点：帽子以及polyA结构11，核酸的反应（太芬兰，二苯胺还有反应的颜色）12，Tm的影响因素（稍微看看，我们当时没有考）13，探针定义（我们考了，可惜不会……）14，限制性内切酶（定义）15，还原性的单糖，寡糖，稍微记一下16，RNA剪切的四种方法：核酶，套索，SnRNA，内切酶（我觉得是重点）17，米氏方城（很简单，但是一定要会）18，抑制的几种曲线的特点19，别构酶，以及别构效应20，重要的磷脂（我们考了，好像是第一个，忘记了）21，模酯特点：两亲性，部队称，流动性22，必须脂肪酸（亚油酸，花生四喜酸，亚麻酸）23，维生素的种类以及应用（好多，不过肯定会考的，多背背书上的表，重要记那些相同作用的或者有相识作用的，比如脱羧酶，脱氢酶几种）24，能量计算（NADH×2.5＋FADH×1.5）25，底物水平磷酸化定义（我觉得挺重要）26，糖孝解得几种途径（z、最好都记下来，虽然不可能全部会考，但是不知道她会考那一段）27，三羧循环（不知道会考什么形式，什么产生能量的几部，或者消耗能量的几部，都记了好了）28，脂肪酸的氧化的能量计算（特别是不饱和的要注意）29，转氨的反应30，尿素循环的意义31，半保留复制的特点定义32，刚七片断定义以及合成的时候5，3方向33，集中聚合酶的作用1，8种必须氨基酸，半必需氨基酸（人体可以合成，但是婴儿时候合成速度不快，所以需要补充）2，等电点的计算，就是两个加一下，然后除以23，氨基酸和印三酮的反应，看看4，蛋白质的结构层次，以及维持稳定的作用力5，蛋白质变性的定义6，核甘酸的写法，5，3顺序7，双螺旋结构特点以及稳定作用力8，RNA三种9，tRNA结构的特点（二级结构三叶草，三级结构倒L）10,mRNA的结构特点：3末端polyA结构，以及5末端帽子结构11，核酸的反应性质（台芬兰，二苯胺以及反应的颜色）12，核酸的稳定作用力13，Tm和变性的关系，Tm的影响因素(DNA的均一性，G—C含量，介质的离子强度)14，探针的定义（我们考过的，不过我不会）15，限制性内切酶定义16，还原性的单糖，多糖了解一下，知道哪个是哪个就好17，RNA剪切的四种方法：（核酶，套索结构，SnRNA+Pr，内切酶）18，米氏方程（很简单，但是肯定会考）19，几种抑制曲线的不同21，别构酶定义22，重要的磷脂（稍微记一下大致结构）23，膜脂