PubMed进阶应用(1)课件

PubMed进阶应用朱伟丽中山大学医学文献检索学教研室及EMBASE数据库PubMed知识回顾纸质IM——联机MEDLARS——光盘MEDLINE——网络PubMed(集成于NCBI平台）收录时间范围：1947-，部分期刊回溯至创刊年。数据每日更新(Tuesday–Saturday)世界上权威性的生物医学书目型数据库，收录全世界范围内70多个国家和地区5000多种生物医学相关期刊论文，主要收录英语语种期刊，少部分其他语种期刊学科范围涵盖基础医学、临床医学、护理学、口腔医学、兽医学、营养卫生、药理和药剂学、预防医学、卫生管理、医疗保健和情报科学领域，2000年起新增生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学领域检索功能丰富，具备个性化特点MyNCBI丰富的链接PubMed文献流程PubMed-assuppliedbypublisher(epubaheadofprint)PubMed-inprocessMEDLINEPubMed-assuppliedbypublisher/PubMed未入选Medline入选Medline

无主题词

有主题词PubMed主题词标引流程标引人员通读文章，主要着眼点是title,introduction,material&method及result,注意段落标题、斜体、粗体、图表、表格、注释、实验方法、病例报告等提炼主题概念参考作者提供的关键词参考MeSH词表找最专指的主题词标引全面，一般一篇文章标引５-1５个主题词PubMed主题词标引规则一般原则客观性原则准确性原则专指性原则全面性原则组配原则选词原则尽量选先组主题词,没有时考虑组配标引上位词标引靠词标引自由词或新增主题词标引主题词标引例子"Theliverdisease,chronichepatitisB"

MeSH——HepatitisB,Chronic

MucinousadenocarcinomaoftheovaryMeSH——Adenocarcinoma,Mucinous+OvarianNeoplasms

出血性胃溃疡

MeSH——stomachulcer+pepticulcerhemorrage葡萄糖代谢

MeSH——glucose/metabolismacutepain（靠词标引）

MeSH——pain

如何查主题词利用MeSH词表网络版（肝癌）利用自动词语匹配（细胞粘附分子-1)利用MeSHBrowser/mesh/MBrowser.html通过预检索文献自动词语匹配的好与坏简单（结肠造口术患者护理，colostomy,nursing)MeSH转换表、刊名转换表、作者全名转换表、作者索引表、合作者全名转换表、合作者转换表六大词表的支持查全率高查准率低检索案例1.细胞间黏附分子1基因多态性与类风湿性关节炎的关系。2.检索近十年以来PubMed收录的甘精胰岛素治疗2型糖尿病的临床研究文献。3.西妥昔单抗联合放化疗治疗头颈部鳞癌疗效。引文匹配SinglecitationmatcherBatchcitationmatcherprocnatlacadsciusa|1991|88|3248|mannbj|P32022-1|procnatlacadsciusa|1992|89|3271|gouldse|P26261-1|procnatlacadsciusa|1999|89|3271|gouldse|P26261-1|resmicrobiol|1992|143|467|iveydm|P25966-1|science|1987|235|182|palmenbergac|P12296-2|eschatology|1993|12|22|publicjq|C12233-2|virology|1993|193|492|hardyme|Q02945-1|procnatlacadsciusa|1991|88|3248|mannbj|P32022-1|2014248（PMID号）

procnatlacadsciusa|1992|89|3271|gouldse|P26261-1|1565618

procnatlacadsciusa|1999|89|3271||P26261-1|NOT_FOUND

resmicrobiol|1992|143|467|iveydm|P25966-1|1448623

science|1987|235|182|palmenbergac|P12296-2|3026048

eschatology|1993|12|22||C12233-2|NOT_FOUND;INVALID_JOURNAL

virology|1993|193|492|hardyme|Q02945-1|8382410

检索结果处理显示保存输出MyNCBI检索结果保存检索策略保存（RSS，bookmark）过滤器的设置（filter)Embase简介Embase(ExcerpataMedicaDatabase)是荷兰ElsevierScience出版社建立的生物医学与药学文献数据库，国内称之为“荷兰医学文摘数据库”。该数据库收录的文献内容包括：药物研究、药理学、药剂学、毒理学、药物经济学、人类医学（临床和实验方面）、卫生政策和管理、公共卫生、职业卫生、环境卫生、药物依赖与滥用、精神病学、法医学、生物医学工程和仪器。另外有选择的包含了护理、牙医学、兽医学、心理学和其他相关医学。文献类型包括期刊论文、会议论文、编辑评论、勘误、信件、综述等。整合1966年以来的MEDLINE数据,收录80多个国家和地区的7000多种期刊论文,覆盖各种疾病和药物信息，尤其涵盖了大量欧洲和亚洲医学期刊。独有的主题词表EMtree,覆盖所有的MeSH术语每日新增数据2000多条,80%数据包含作者提供的摘要。Embase特点

突出药物文献的收录和药物信息的反映，具体体现在以下几个方面：

1）收录药物文献多。

2）药物副主题词多。

3）药物信息字段多。

4)对准临床药物深度标引。Embase检索方式检索Search快速检索QuickSearch高级检索AdvancedSearch药物检索DrugSearch疾病检索DiseaseSearch特定文章检索ArticleSearch主题词表检索Emtree期刊浏览Journals著者检索AuthorsEmbase快速检索quicksearch同时检索EM和MEDLINE数据词间空格默认进行and匹配逻辑算符：and,or,not邻近算符：near/next，可与截词符联用，但不能与短语算符联用短语检索：引号或连字符，截词符及邻近算符不能与短语算符联用，字母与数字联合会作为单词或者词组进行检索，如IL2执行的检索为IL2‘IL2’IL-2‘IL2’,如果想在检索词中加-，应该用+如pre+exisiting可以检索出pre-exisiting，如果输入pre-exisiting则检索出‘preexisiting’截词符：*?字段限定：检索词:字段名缩写如：(asthmaaspirin):tiExtensivesearch(字段限定、截词、邻近检索时不扩展）Map：自动匹配到药物或疾病主题词，短语一定要用引号，否则分开检索Explosionsearch：主题词自动扩展检索Keywordsearch：在篇名、摘要、药物名称、作者地址等字段进行自由词检索。Embase高级检索advancedsearch可以输入单个检索词也可以输入检索式，只要不截词、不限定字段，系统自动执行下方设定的匹配模式字段限定：fieldlimitMaptopreferredterminology：自动匹配到药物或疾病主题词Alsosearchasfreetext检索词作为自由词在所有字段检索Includesub-terms/derivatives(explosionsearch)：主题词扩展下位词检索，与map成对出现Searchtermsmustbeofmajorfocusinarticlesfound：主题词必须是主要主题词Searchalsoforsynonyms,explosiononpreferredterminology：进行主题词扩展检索，同时在全字段进行同义词搜索多样化检索限定新药物的检索Embase高级检索advancedsearch药物副主题词1AdversedrugreactionDrugtoxicityClinicaltrialDrugadministrationDruganalysisDrugcombinationDrugcomparisonDrugconcentrationDrugdoseDruginteractionDrugtherapyDrugdevelopmentEndogenouscompoundpharmaceuticsPharmacoeconomicsPharmacokineticsPharmacology药物副主题词2Buccaldrugad口服Epiduraldrugad硬膜外给药Inhalationaldrugad吸入式用药Intraarterialdrugad动脉内注射Intraarticulardrugad关节腔内注射Intrabronchialdrugad支气管给药IntrabursaldrugadIntracameraldrugad前房内注射Intracardiacdrugad心内注射Intracavernousdrugad海绵体内注射Intracerbraldurgad脑内注射IntracerebroventriculardrugIntracisternaldrugad脑池内注射Intradermaldrugad皮内注射Intraduodenaldrugad十二指肠内注射Intragastricdrugad胃肠给药Intralesionaldrugad病灶内给药Intralymphaticdrugad淋巴结内给药Intramusculardrugad肌肉内注射Intranasaldrugad鼻腔给药Intraoculardrugad晶状体内给药Intraosseousdrugad骨内给药Intraperitonealdrugad腹膜内给药Intrapleuraldrugad胸膜给药药物副主题词2Intraspinaldrugad脊髓给药Intrathecaldrugad腱鞘给药Intratrachealdrugad脑池给药Intratumouraldrugad肿瘤内给药Intratympanicdrugad鼓室内给药Intraurethraldurgad经尿道给药Intrauterinedrugad宫内给药Intravaginaldrugad阴道内给药Intravenousdrugad静脉给药Intravesicaldrugad膀胱给药Intravitrealdrugad药物注射Oraldrugad口服药Parenteraldrugad肠外给药Rectaldrugad直肠给药Regionalperfusion区域灌注Retrobulardrugad眼房后给药Subconjunctivaldrugad结膜给药Subcutaneousdrugad皮下注射Sublabialdrugad唇下注射Sublingualdrugad舌下含服Topicaldrugad局部药物注射Transdermaldrug透皮给药Embase疾病检索diseasesearch匹配最优主题词可以输入检索词或者检索式，词组需用引号截词符可关闭自动匹配功能，仅做为自由词检索副主题词ComplicationCongenitaldisorderDiagnosisDiseasemanagementDrugresistanceDrugtherapyEpidemiologyEtilog