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文档简介

1、TorquePBS 命令:PBS 4 条命令用于作业管理:qsub(提交(查询、qdel(删除、qmgr(队列管理qsub-a date_time -c interval -C -epath-I-jjoin-kkeep-lresource_list-mmail_options -Muser_list-Nname-opath-ppriority-qdestination-rc -S path_list -u user_list-v variable_list -V-Wadditional_attributes-z 例:# qsub aaa.pbs 提交某作业,系统将产生一个作业号qstat 命令

2、命令格式:qatat -f-a-i -n-s -R -Q-q-B-f - -au -B PBSServer-Qf queue-例:# qstat -f 211 查询作业号为 211 的作业的具体信息。qdel 命令命令格式:qdelW例:# qdel -. qmgr令用于队列qmgr-ccreatequeuebatchqueue_type=execution qmgr -c set queue batch started=trueqmgr -c set queue batch qmgr-c set queue batch qmgr-csetqueuebatchresources_default

3、.walltime=3600 qmgr -c set server default_queue=batchPBS 文件:PBS 文件由选项和运行两部分组成PBS作业选项(若无-C选项,则每项前面加#PBS-a date_time: 选项。(若无此选项,则默认为#PBS )-jjoin:join-k keep:定义在执行结点上保留标准输出和标准错误信息中的哪个文件。 keepoeoeeo n 表示皆不保留。若忽略此选项,二者都不保留。-lresource_list:cput=NNCPU 时间; Nhh:mm:ss 的形式。 nodes=N:ppn=M :请求 N 个结点,每个结点 M 个处理器。

4、-m mail_options :mail_option 为 a -M -N-o-p -q :destination:queue,server,queueserver-r :指明作业是否可运行,y,n-S -u -v -Wadditional_attributes -运同LINUX 下一般的运行文 mpirun_rshnphostfile$PBS_NODEFILEPBS境下运行示aaa.pbs,内容如下: #PBS -N myjob#PBS l nodes=2:ppn=2(存档(原来直接在节点上运行时所在mpirun_rshnp4hostfile$PBS_NODEFILE/home/jz/说明

5、:原先大家都是在中断输入 mpirun_rsh.这些命令执行程序的,现在只要把这些提交命令放在.pbsPBS(自动分配节点和其它件是/home/y.out 文件,大家可以根据自己的需要修改( ,文件名。#PBS l nodes=2:ppn=2,程序需要几个节点只要修改 nodes 后的数字就可以了,ppn=2 保持不变,因为的机器每个节点都是双 cpu 的。mpirun_rshnp4hostfile$PBS_NODEFILE/home/jz/,hostfile序都需要这样一个.pbs 配置文件,也就是说大家原来的操作是:mpirun2向pbs 提交比如物理系运行程序时一般输入令是 RunDMo

6、l3.sh TiFeCp2-pbe-dspp-m=1-opt ,那么配置文件可以这样写:job.pbs,内容如下: #PBS -N physics_job#PBS-o/home/physics/physics_job.out #PBS-e/home/physics/physics_job.err #PBS -l nodes=1:ppn=2#PBS -r (存档原来直接在节点上运行时所在RunDMol3.sh TiFeCp2-pbe-dspp-m=1-说明:说把原来在终端直接输入令RunDMol3.shTiFeCp2-pbe-dspp-m=1-opt放到 pbs 配置文件中,因为只要一个节点,所以 nodes=1,至于用哪个节点系统自如 qstat -n提交作业示例:命令行:#qsub 命令行:#qstat

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