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文档简介
1、第一章 基因工程与食品产业食品基因工程是指利用基因工程的技术及手段,在分子水平上定向重组遗传物质,以改变食品的品质和形状,提高食品的营养价值、储藏加工性状及感官性状的技术。第一节 基因工程概述第二节 DNA分子的提取技术第三节 工具酶和基因载体第四节 基因工程的基本技术第五节 基因工程在食品产业中的应用70年代初,伯格与他的同事们利用限制性内切酶将细菌与病毒的基因连接在一起,首次实现用两个不同物种重组DNA,为基因工程奠定了基础。第一节 基因工程概述1973年,科恩(S.Cohen)等把含有四环素和链霉素的质粒拼接起来,构成一个重组质粒,并将该重组质粒转入大肠杆菌,第一次完整地建立起了基因克隆
2、体系。基因工程的概念按照人们的意愿,进行设计,通过体外DNA重组技术和转基因等技术,有目的的改造生物种性,表达出人类需要的产品或性状或产生新的物种。基因工程的理论基础不同基因具有相同的物质基础基因可切割基因可转移多肽与基因之间存在对应关系遗传密码是通用的基因可以通过复制把遗传信息传递给下一代Mendel G.J. (1822-1884). 1856-1864豌豆杂交实验。Mendel的遗传因子阶段 基因工程的发展历程1866年发表论文,提出分离规律和独立分配规律1900年Mendel遗传规律被重新发现遗传学的元年Mendel提出:生物的某种性状是由遗传因子负责传递的,是颗粒性的,体细胞内成双存
3、在,生殖细胞内成单存在。遗传因子是决定性状的抽象符号。1909年丹麦遗传学家约翰逊首先提出了“基因”的概念,代替了Mendel “遗传因子” 的 概念。但没有提出基因的物质概念。顺反子阶段1957年,本泽尔(Seymour Benzer)以T4噬菌体为材料,在DNA分子水平上研究基因内部的精细结构,提出了顺反子(cistron)概念。顺反子是1个遗传功能单位,1个顺反子决定1条多肽链。 现代基因阶段 1操纵子(启动子操纵基因结构基因)-原核基因 DNA分子中含有特定遗传信息的能够自我复制的一段核苷酸序列,是遗传物质的最小功能单位。 基因的概念一、基因工程的研究发展史一般认为1973年是基因工程
4、诞生的元年(S. Cohen等获得了卡那霉素和四环素双抗性的转化子菌落) 理论上的三大发现和技术上的三大发现对于 基因工程的诞生起到了决定性的作用技术上的三大发现2、DNA连接酶的发现 T4噬菌体连接酶的发现3、载体的发现及其应用基因工程的成就和研究进展成就:在医药领域在农业领域在工业领域研究进展第二节 DNA分子的提取技术Shotgun:将某种生物体的全基因组或单一染色体切成大小适宜的DNA片段,分别连接到载体DNA上转化受体细胞,形成一套重组克隆,从中筛选含有目的基因的期望重组子,进而获得目的基因,也叫做散弹射击法。鸟枪法克隆目的基因的局限性随机性强,工作量较大,需要了解目的基因的背景知识
5、不能获得最小长度的目的基因不能除去真核生物目的基因的内含子结构什么叫做cDNA文库?定义:以mRNA为模板,在体外经逆转录酶催化反转录生成cDNA,与适当载体连接后转化受体菌并繁殖扩增,这样包含着细胞全部mRNA信息的cDNA克隆集合称为该组织细胞的cDNA文库。 可认为是:不包含内含子的基因组文库。构建cDNA文库的基本步骤:制备mRNA;第一链cDNA合成;第二链cDNA的合成;双链cDNA的修饰及克隆;对构建的cDNA文库进行鉴定,测定文库的代表性以及重组cDNA片段的序列完整性。cDNA文库的特点(1)不含内含子序列。 (2)可以在细菌中直接表达。 (3)包含了同一时期所有编码蛋白质的
6、基因。 (4)比基因文库小的多,复杂性低,容易构建。定义:PCR技术又称聚合酶链式反应(polymerase chain reaction),是通过模拟体内 DNA 复制的 方式,在体外选择性地将 DNA 某个特殊区域扩 增出来的技术。 PCR技术:PCR概念的提出1983,Kary Mullis1、PCR技术的基本原理在微量离心管中,加入适量的缓冲液, 微量的模板DNA,四种脱氧单核苷酸,耐热性多聚酶, 一对合成DNA的引物,通过高温变性、低温退火和中温延伸三个阶段为一个循环的反应过程,每一次循环使特异区段的基因拷贝数放大一倍,一般样品是经过30次循环,最终使基因放大了数百万倍; 扩增了特异
7、区段的DNA带。 一、PCR技术的基本原理和工作方式94变性 50-65退火72延伸2.PCR反应过程:20-40个PCR循环PCR用途广泛生命学科医学工程遗传工程疾病诊断法医学考古学定义:某种生物基因组的全部遗传信息通过克隆载体储存于某一受体菌的群体中,这个群体就称为该生物基因组的文库(genomic library)。目的: a)分离有用的目的基因 b)保存某种生物的全部基因一般流程基因组DNA文库构建的程序 载体DNA的制备; 基因组DNA的提取; 基因组DNA的部分酶切、分离与回收; 载体与外源片段的连接与转化或侵染宿主细胞; 重组克隆的挑选和保存。食品中DNA的提取主要用于转基因食品
8、检测提取方法主要有SDS法和CTAB法,但提取前必须进行样品的前处理,减少杂质。CTAB法的全称是十六烷基三甲基溴化铵法,主要用于提取生物DNA。第三节 工具酶和基因工程载体基因工程的四大要素工具酶 tool enzymes目的基因 interested gene载体 vector 受体细胞 receipt cells3-54重组DNA技术中常用的工具酶工 具 酶功 能限制性核酸内切酶识别特异序列,切割DNADNA连接酶催化DNA中相邻的5磷酸基和3羟基末端之间形成磷酸二酯键,使DNA切口封合或使两个DNA分子或片段连接DNA聚合酶合成双链cDNA分子或片段连接Klenow片段又名DNA聚合酶
9、I大片段,具有完整DNA聚合酶I的53聚合、35外切活性,而无53外切活性。常用于cDNA第二链合成,双链DNA 3末端标记等反转录酶合成cDNATaq DNA聚合酶PCR合成DNA片段3-55基因工程实验中常用的工具酶内切酶连接酶聚合酶修饰酶3-56第一个字母取自产生该酶的细菌属名,用大写;第二、第三个字母是该细菌的种名,用小写;第四个字母代表株;用罗马数字表示发现的先后次序。命名Hin d 属 系 株 序Haemophilus influenzae d株流感嗜血杆菌d株的第三种酶限制内切酶的命名EcoRI:Escherichia coli RI HindIII:Haemophilus in
10、fluensae d IIISacI:Streptomyces achromagenes I 3-57II限制性内切核酸酶在DNA上有其特定的识别序列即,回文结构,通常为4-8bp,在特定识别位点处切割DNA。是基因工程中主要使用的酶类。3-58限制酶特点:1.识别-8个相连的核苷酸,以6个多见;限制性内切酶的识别序列 BamH I 5-GGATCC-3 3-CCTAGG-5Not I 5-GCGGCCGC-3 3-CGCCGGCG-52.呈回文结构(palindrome);3.旋转对称性;EcoRI 5-GAATTC-3 3-CTTAAG-5 4.切点大多数在识别顺序之内,也有例外。Fok
11、I 5-GGATGNN -3 3-CCTAC NN-5 外侧,产生3-端突起5. 识别序列严格,少数有变动,序列中的核苷酸被甲基化后,不能被切割。3-59限制性内切酶的切割方式 内切酶切割后产生的三种末端a) 5 突出的粘性末端 如, EcoR I 5-G AATTC-3 3-CTTAA G-5b) 3 突出的粘性末端 如, Pst I 5-CTGCA G-3 3-G ACGTC-5c) 平末端 如, Sma I 5-CCC GGG-3 3-GGG CCC-53-60DNA 连接酶(Ligase) DNA连接酶能利用ATP或NAD+提供的能量催化DNA片段的3-OH和5-P基团之间形成35-磷
12、酸二酯键,把两个DNA片段连接在一起。OH POHP HOPHOPPPOHHO连接酶3-61(1)大肠杆菌连接酶1. 两种DNA连接酶只能连接粘性末端。(2)T4噬菌体的连接酶不但能连接粘性末端,还能连接齐平末端。 DNA连接酶的分类3-62(1)必须是两条双链DNA。(2)DNA3端有游离的-OH, 5端有一个磷酸基团(P)(3)需要能量动物或噬菌体中:ATP大肠杆菌中: NAD+2. 连接条件3-63 DNA聚合酶( Polymerase)基因工程中常用的DNA聚合酶大肠杆菌DNA聚合酶I2. Klenow fragment3. T7 DNA聚合酶4. T4 DNA聚合酶5. 修饰过的T7
13、 DNA聚合酶6. 逆转录酶3-64DNA聚合酶35外切酶活性53外切酶活性聚合速率持续能力大肠杆菌DNA聚合酶低有中低Klenow fragment低无中低T4DNA聚合酶高无中低T7DNA聚合酶高无快高化学修饰T7DNA聚合酶低无快高遗传修饰T7DNA聚合酶无无快高逆转录酶无无低中Taq DNA聚合酶无有快高3. 常用DNA聚合酶的特性比较3-65在基因工程中,通常是把外源DNA片断利用运载工具送入生物细胞。携带外源基因进入受体细胞的这种工具叫做载体(Vector)。载体的本质是DNA。经过人工构建的载体,不但能与外源基因相连接,导入受体细胞,还能利用本身的调控系统,使外源基因在新细胞中复
14、制以致功能的表达。载体(Vector)基因工程中常用的主要载体质粒(Plasmid)噬菌体载体 动物病毒植物病毒载体的功能及特征载体的功能运送外源基因高效转入受体细胞为外源基因提供复制能力或整合能力为外源基因的扩增或表达提供必要的条件载体应具备的条件具有针对受体细胞的亲缘性或亲和性(可转移性) 具有合适的筛选标记 具有较高的外源DNA的载装能力 具有多种单一的核酸内切酶识别切割位点 具有与特定受体细胞相适应的复制位点或整合位点 pBR3224363 bp质粒 (Plasmid)质粒是一种独立于染色体外的小分子环状DNA,一般大小约106108D,可自主复制和表达。基因克隆载体的质粒DNA分子,
15、必定包括:复制基因、选择性标记、克隆位点。 pBR322质粒的三个不同来源的组成部分pBR322质粒载体的优点结构:(1)氨苄青霉素抗性基因(ampr或Apr) 3种限制酶单一识别位点。(2)四环素抗性基因(tetr或Tcr)(3)DNA复制起点(ori) 病毒(virus)质粒载体携带的外源基因限于以下构建基因组文库时,目的DNA10kb,应采用病毒载体。病毒是一类非细胞微生物,能高效率高特异性地侵染宿主细胞(转导),然后或自主复制繁殖,或整合入宿主基因组中潜伏起来,而且在一定的条件下上述两种状态还会相互转化。病毒的上述特性使得它们的DNA能被开发成为基因工程的有用载体,因为:高效率的感染性
16、能使外源基因高效导入受体细胞。自主复制繁殖性能使外源基因在受体细胞中高效扩增。噬菌体l 噬菌体的生物学特性: 生物结构l 噬菌体是大肠杆菌的温和型噬菌体l 噬菌体由外壳包装蛋白和l-DNA组成 l-DNA全长48502个核苷酸l-DNA上至少有50个基因l 噬菌体基因组结构第四节 基因工程的基本技术 基因工程研究的基本技术路线1、从生物体中分离得到目的基因(或DNA片段)。2、在体外,将目的基因插入能自我复制的载体中得到 重组DNA分子。3、将重组DNA分子导入受体细胞中,并进行繁殖。4、选择得到含有重组DNA分子的细胞克隆,并进行大量 繁殖,从而使得目的基因得到扩增。5、进一步对获得的目的基
17、因进行研究和利用。比如, 序列分析、表达载体构建、原核表达以及转基因研究 和利用等。切接转增检重组体分子导入受体细胞的途径 将外源重组体分子导入受体细胞的途包括转化、转染、转导、显微注射、电穿孔等多种方式。这些途径将随载体种类和受体系统的不同而异。转化和转导主要适应于细菌原核细胞和酵母低等真核细胞,而显微注射和电穿孔主要应用于高等动植物的真核细胞。把带有目的基因的重组质粒DNA引入受体细胞的过程称为转化(transformation)。将重组噬菌体DNA直接引入受体细胞的过程称为转染(transfection)。若重组噬菌体DNA被包装到噬菌体头部成为有感染力的噬菌体颗粒,再以此噬菌体为运载体
18、,将头部重组DNA导入受体细胞中,这一过程称为转导(transduction)。基因工程的基本流程基因分离酶切载体酶切基因和载体连接导入细菌重组质粒繁殖重组克隆的选择序列分析和基因表达等研究导入植物细胞第五节 基因工程在食品产业中的应用一、利用基因工程改造食品微生物二、利用基因工程改善食品原料的品质三、利用基因工程改进食品生产工艺四、利用基因工程生产食品添加剂及功能性食品一、利用基因工程改造食品微生物(一)改良微生物菌种(二)改良乳酸菌遗传特性(三)酶制剂的生产 (一)改良微生物菌种 最早成功应用的基因工程菌(采用基因工程改造的微生物)是面包酵母菌。 啤酒生产中要使用啤酒酵母,但由于普通啤酒酵
19、母菌种中不含-淀粉酶,所以需要利用大麦芽产生的-淀粉酶使谷物淀粉液化成糊精,生产过程比较复杂。 采用基因工程技术,将大麦中-淀粉酶基因转入啤酒酵母中并实现高速表达。这种酵母便可直接利用淀粉进行发酵,无需麦芽生产-淀粉酶的过程,可缩短生产流程,简化工序,推动啤酒生产的技术革新。 利用基因工程技术还可将霉菌的淀粉酶基因转入大肠杆菌,并将此基因进一步转入单细胞酵母中,使之直接利用淀粉生产酒精。这样,可以省掉酒精生产中的高压蒸煮工序,可节约能源60,并且生产周期大大缩短。 面包酵母啤酒酵母 此外,食品生产中所应用的食品添加剂或加工助剂,如氨基酸、有机酸、维生素、增稠剂、乳化剂、表面活性剂、食用色素,食
20、用香精及调味料等,也可以采用基因工程菌发酵生产而得到,基因工程对微生物菌种改良前景广阔。 (二)改良乳酸菌遗传特性 1、抗药基因 目前,利用乳酸菌发酵得到的产品很多,如酸奶、干酪、酸奶油、酸乳酒等,已应用的乳酸菌基本上为野生菌株。有的野生菌株本身就抗多种抗生素,因而在其使用过程中,抗药基因将有可能以结合、转导和转化等形式在微生物菌群之间相互传递而发生扩散。 利用基因工程技术可选育无耐药基因的菌株,当然也可去除生产中已应用菌株中含有的耐药质粒,从而保证食品用乳酸菌和活菌制剂中菌株的安全性。2、风味物质基因 乳酸菌发酵产物中与风味有关的物质主要有乳酸、乙醛、丁二酮、3-羟基-2-丁酮、丙酮和丁酮等
21、。可以通过基因工程选育风味物质含量高的乳酸菌菌株。3、产酶基因 乳酸菌不仅具有一般微生物所产生的酶系,而且还可以产生一些特殊的酶系,如产生有机酸的酶系、合成多糖的酶系、降低胆固醇的酶系、控制内毒素的酶系、分解脂肪的酶系、合成各种维生素的酶系和分解胆酸的酶系等,从而赋予乳酸菌特殊的生理功能。 若通过基因工程克隆这些酶系,然后导入到生产干酪、酸奶等发酵乳制品生产用乳酸菌菌株中,将会促进和加速这些产品的成熟。另外,把胆固醇氧化酶基因转到乳酸杆菌中,可降低乳中胆固醇含量。 4、耐氧相关基因 乳酸菌大多数属于厌氧菌,这给实验和生产带来诸多不便。从遗传学和生化角度看,厌氧菌或兼性厌氧菌几乎没有超氧化物歧化
22、酶基因和过氧化氢酶基因或者说其活性很小。若通过生物工程改变超氧化物歧化酶的调控基因则有可能提高其耐氧活性。当然将外源SOD基因和过氧化氢酶基因转入厌氧菌中,也可以起到提高厌氧菌和兼性厌氧菌对氧的抵抗能力。 5、产细菌素基因 乳酸菌代谢不仅可以产生有机酸等产物,还可以产生多种细菌素,然而并不是所有的乳酸菌都产生细菌素,若通过生物工程技术将细菌素的结构基因克隆到生产用菌株中,不仅可以使不产细菌素的菌株获得产细菌素的能力,而且为人工合成大量的细菌素提供了可能。 (三)酶制剂的生产 利用基因工程技术不但可以成倍地提高酶的活力,而且还可以将生物酶基因克隆到微生物中,构建基因工程菌来生产酶。据1995年统
23、计,已有50的工业用酶是用转基因微生物生产的。 转基因微生物生产酶的优点:产量高、品质均一、稳定性好、价格低等。 凝乳酶是第一个应用基因工程技术把小牛胃中的凝乳酶基因转移至细菌或真核微生物生产的一种酶。1990年美国FDA已批准在干酪生产中使用。 重组DNA技术生产小牛凝乳酶,首先从小牛胃中分离出对凝乳酶原专一的mRNA(内含子已被切除),然后借助反转录酶、DNA聚合酶和St核苷酸酶的作用获得编码该酶原的双链DNA,再以质粒或噬菌体为运载体导入大肠杆菌 。 近20年来用基因工程菌发酵生产的食品酶制剂主要有:凝乳酶、淀粉酶、葡萄糖氧化酶、葡萄糖异构酶、转化酶、脂肪酶、半乳糖苷酶、半乳糖苷酶、乙酰
24、乳酸脱羧酶、溶菌酶、碱性蛋白酶等。 例如,蛋白酶可以改善蛋白质的溶解性;转谷氨酰胺酶可以使蛋白质分子间发生交联,可用于增加大豆蛋白的胶凝性能,使肉制品等添加大豆蛋白后具有更好的品质。酶制剂的作用 在食品加工过程中,通过添加一些酶类,可以改善产品的色泽、风味和质构。 如用葡萄糖氧化酶可以去除蛋液中的葡萄糖,改善蛋制品的色泽;用脂酶和蛋白酶可加速奶酪的成熟;葡萄糖苷酶可用于果汁和果酒的增香;木瓜蛋白酶可分解胶原蛋白,用于肉的嫩化。对于含有难消化成分的食品,可以通过添加一些酶类,改善这些食品的营养和消化利用性能。酶制剂的作用 二、利用基因工程改善食品原料的品质(一)改良动物食品性状 (二)改造植物性
25、食品原料(一)改良动物食品性状 为了提高乳牛的产奶量,可将采用基因工程技术生产的牛生长激素(BST)注射到母牛体内,既可达到提高母牛产奶量的目的,又不影响奶的质量。 同样,为了提高猪的瘦肉含量或降低猪脂肪含量,可将采用基因重组技术生产的猪生长激素,注射至猪体内,便可使猪瘦肉型化,有利于改善肉食品质。 (二)改造植物性食品原料 1、提高植物性食品氨基酸含量 例如,可以对赖氨酸代谢途径中的各种酶进行修饰或加工,从而使细胞积累更大量的Lys。 还可针对性地将富含某种特异性的氨基酸的蛋白基因转入目的植物,以提高相应植物中的特定氨基酸的含量。2、增加食品的甜味 非洲有一种植物叫应乐果,研究人员在其果实中
26、发现了一种叫做应乐果蛋白的蛋白质,咀嚼时比蔗糖大约甜1.0万倍,而它所含的蛋白质却又不会在新陈代谢中具有与蔗糖相同的作用,它的这种特性使之成为蔗糖的理想替代品。3、改造油料作物 最易用基因工程方法进行改造的油料作物是油菜,迄今为止,在世界范围内种植的良种油菜有31是转基因品种。用基因工程技术可以提高油脂中抗氧化剂的含量。 4、改良植物食品的蛋白质品质 如秘鲁“国际马铃薯培育中心”培育出一种蛋白质含量与肉类相当的薯类;转移扁豆蛋白基因可获得具有较高贮存蛋白质的转基因向日葵。 我国在此方面也培育出了一批作物新品种,有的已经在生产上推广应用。如山东农业大学将小牛胸腺DNA导入小麦系814527,在第
27、二代出现了蛋白质含量高达16.51的小麦变异株;中国农业科学院作物研究所将大米草DNA引入水稻品种早丰,出现了籽粒蛋白质含量高达12.74的受体变异类型。 基因工程在改善农作物种子蛋白质质量方面发挥着重要作用。 如小麦、玉米等谷物种子缺乏赖氨酸,豆类作物种子缺乏蛋氨酸,将富含赖氨酸和蛋氨酸的种子基因进行分离鉴定,并转入相应的作物中,可得到营养品质较为完全的蛋白质。 如将巴西坚果或豌豆蛋白基因转入大豆中,获得含有较高含硫氨基酸的转基因大豆。4、改良植物食品的蛋白质品质 三、利用基因工程改进食品生产工艺(一)利用DNA重组技术改进果糖和乙醇生产方法(二)改良啤酒大麦的加工工艺(三)改良小麦种子贮藏
28、蛋白的烘烤特性 (四)改善牛乳加工特性三、利用基因工程改进食品生产工艺(一)利用DNA重组技术改进果糖和乙醇生产方法 1、利用微生物培养技术,大量生产所需的酶 2、利用-淀粉酶的高温突变体进行“高温”生产 这种突变体可在8090时起作用,在这种高温下进行液化淀粉,加速淀粉的水解,同时节约正常淀粉酶水解的冷却降温所消耗的能量。 3、改变编码-淀粉酶和葡萄糖淀粉酶的基因 使它们具有同样的最适温度和最适pH值,使液化、糖化在同一条件下进行,减少生产步骤,降低生产成本。 4、利用DNA重组技术获得能够直接分解粗淀粉的酶 可降低能量消耗,提高效率,降低成本。5、寻找或人工“创造”一种分泌葡萄糖淀粉酶发酵
29、微生物 葡萄糖淀粉酶能将淀粉全部水解成葡萄糖。 在发酵过程中可不再添加淀粉酶,直接生产果糖或乙醇。 (二)改良啤酒大麦的加工工艺 啤酒制造对大麦醇溶蛋白含量有一定要求,如果醇溶蛋白含量过高会影响发酵,使啤酒易产生混浊,也会增加过滤的难度。采用基因工程技术,使另一蛋白基因克隆至大麦中,便可相应地降低大麦中的醇溶蛋白含量,以适应生产的要求。 (三)改良小麦种子贮藏蛋白的烘烤特性 小麦种子贮藏蛋白对面包烘烤质量有很大影响,特别是高分子谷蛋白5(x)和10(y)的亚基有助于面包质量的改善,同时谷蛋白的N端和C端含有Cys残基,可形成分子间的二硫键,产生高分子量的聚合物,从而使面团具有较好的弹性。 利用
30、基因工程技术,通过增加谷物蛋白的5(x)和10(y)的亚基的拷贝数、引入Cys残基以及改变交联特性等手段,可使小麦具有更理想的加工特性。 (四)改善牛乳加工特性 在牛乳加工中如何提高其热稳定性是关键问题。牛乳中的酪蛋白分子含有丝氨酸磷酸,它能结合钙离子而使酪蛋白沉淀。 采用基因操作,使酪蛋白分子中Ala-53被Ser所置换,但可提高其磷酸化,使酪蛋白分子间斥力增加,以提高牛奶的热稳定性,这对防止消毒奶沉淀和炼乳凝结起重要作用。 四、利用基因工程生产食品添加剂及功能性食品(一)生产氨基酸(二)生产黄原胶(三)超氧化物歧化酶(SOD)的基因工程(四)应用于生产保健食品的有效成分 由于从植物中提取食品添加剂,来源有限、成本昂贵;化学合成虽成本较低,但常可能危害人体健康。因此,生物技术,特别是发酵工程技术已成为食品添加剂生产的首选方法。目
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