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文档简介

1、生物化学名词解释.氨基酸(am i no acid ): 是含有一个碱性氨基(-N H 2 ) 和一个酸性竣基(-COOH) 的有机化合物,氨基一般连在a -碳上。氨基酸是蛋白质的构件分子.必需氨基酸(essential am i no acid): 指人(或其它脊椎动物)(赖氨酸, 苏氨酸 等)自己不能合成,需要从食物中获得的氨基酸。.非必需氨基酸(n onessential am i no aci d ):指人(或其它脊椎动物)自己能由简 单的前体合成,不需要从食物中获得的氨基酸。.等电点(pI,isoel ectric poi nt):使氨基酸处于兼性离子状态,在电场中不迁移(分子的静电

2、荷为零)的pH值。.苗三酮反应(ninhydrin reacti on ):在加热条件下,氨基酸或肽与苛三酮反应生成紫色(与脯氨酸及羟脯氨酸反应生成黄色)化合物的反应。.层析(ch rom at og raphy ):按照在移动相和固定相(可以是气体或液体)之间的分配比例将混合成分分开的技术。.离子交换层析(ion-exc hange colum n ): 一种用离子交换树脂作支持剂的层析技术。.透析(dialysis ):利用蛋白质分子不能通过半透膜的性质,使蛋白质和其他小分子物质如无机盐、单糖等分开的一种分离纯化技术。.凝胶过滤层析(gel filtration ch rom at og

3、raphy, GPC):也叫做分子排阻层析 /凝胶渗透层析。一种利用带孔凝胶珠作基质,按照分子大小分离蛋白质或其它分子混合物的层析技术。.亲合层析(affinity chrom atog raph ):利用共价连接有特异配体的层析介质,分离蛋白质混合物中能特异结合配体的目的蛋白质或其它分子的层析技术。.高压液相层析(HPLC :使用颗粒极细的介质,在高压下分离蛋白质或其他分子混合物的层析技术。.凝胶电泳(gel elect roph oresis ):以凝胶为介质,在电场作用下分离蛋白质或核酸的分离纯化技术。.SDS-聚丙烯酰氨凝胶电泳 (SDS:在去污剂十二烷基硫酸钠存在下的聚丙烯酰氨 凝胶

4、电泳。SDS只是按照分子的大小,而不是根据分子所带的电荷大小分离的。14.等电聚焦电泳(IEF):利用一种特殊的缓冲液(两性电解质)在聚丙烯酰氨凝胶制造 一个pH梯度,电泳时,每种蛋白质迁移到它的等电点( pI)处,即梯度为某一 pH时, 就不再带有净的正或负电荷了。1 5.双向电泳(tw o-dim ension al electroph orese ):等电聚焦电泳和 SDS的组 合,即先进行等电聚焦电泳(按照pI )分离,然后再进行SDS按照分子大小分离)。 经染色得到的电泳图是二维分布的蛋白质图。1 6.Edm an降解(Edm an deg radation ):从多肽链游离的 N末

5、端测定氨基酸残基的序列的过程。N末端氨基酸残基被苯异硫氟酸酯(PITC)修饰,然后从多肽链上切下修饰的残基,再经层析鉴定,余下的多肽链(少了一个残基)被回收再进行下一轮降解循环。1 7.同源蛋白质(hom olog ous protein ):在不同 生物体内行使相同或相似功能的蛋白质,例如血红蛋白。1 8.构型(configu ration):有机分子中各个原子特有的固定的空间排列。 这种排列不经过共价键的断裂和重新形成是不会改变的。构型的改变往往使分子的光学活性发生变化。1 9.构象(conform ation):由于单键旋转引起的组成原子的不同排列。一种构象改变为另一种构象时,不要求共价

6、键的断裂和重新形成。构象改变不会改变分子的光学活性。.蛋白质一级结构(prim ary structure ):指多肽链的氨基酸序列。.蛋白质二级结构:蛋白质主链的折叠产生由氢键维系的有规则的构象。常见的二级结构有a -螺旋、3 -折叠片、3 -转角和无规卷曲。.蛋白质三级结构(prot ein tertiary structure ):多肽链借助各种非共价键弯曲、折叠成具特定走向的紧密球状构象。它包括一级结构中相距较远的肽段之间的几何相互关系和侧链在三维空间中彼此间的相互关系。三级结构主要是靠氨基酸侧链之间的疏水相互作用、氢键、范德华力和盐键(离子键)维持的。.蛋白质四级结构(prot ei

7、n quatern ary structure ):寡聚蛋白质所有,eg:血红蛋白,寡聚蛋白质中各亚基之间在空间上的相互关系和结合方式。. a -螺旋(a -h eliv ):蛋白质中常见的一种二级结构,肽链主链绕假想的中心轴盘 绕成螺旋状,一般都是右手螺旋结构,螺旋是靠链内氢键维持的。每个氨基酸残基(第n个)的玻基氧与多肽链C端方向的第4个残基(第n+4个)的酰胺氮形成氢键。在典型的右手a -螺旋结构中,螺距为 0.54nm,每一圈含有3.6个氨基酸残基,每个残基沿着螺旋的 长轴上升0.15nm。.超二级结构(super-sec ondary structure ):在蛋白质中, 特别是球蛋

8、白中, 经常 可以看到由若干相邻的二级结构单元组合在一起,彼此相互作用, 形成有规则的, 种类不多的二级结构组合或二级结构串,在各种蛋白质中充当三级结构的构件。分为a a ,3 a 3,33 三种.结构域(domain ):多肽链在二级结构或超二级结构的基础上形成三级结构的局部折叠 区,它是相对独立的紧密球状实体。.疏水相互作用(hydroph obi c interaction ):水介质中球状蛋白质的折叠总是倾向于把疏水残基埋藏在分子的内部的现象。.蛋白质变性(denatu ration ):天然蛋白质受到某些物理因素如加热、紫外线照射、高温和表面张力等或化学因素如有机溶剂、月尿、月以 酸

9、、碱等的影响时,生物活性丧失,溶解度降低,不对称程度增高以及其他的物理化学常数发生改变,这种过程称蛋白质变性。其实质是次级键被破坏,但一级结构仍完好。.蛋白质的三维结构:蛋白质分子所有原子和基团在三维空间结构的构象及走向。.肌红蛋白(m yoglobi n ):是由一条肽链和一个血红素辅基组成的结合蛋白,是肌肉内储存氧的蛋白质,它的氧饱和曲线为双曲线型。31复性(renat uration ):当变性因素除去后,变性的生物大分子恢复成具有 生物活性的天然构象的现象。.波尔效应(B ohr effect ):增加CO2浓度和降低pH都能提高血红蛋白亚基的协同 效应,引起红细胞内血红蛋白氧亲和力下

10、降,促进血红蛋白释放氧,反之,增加氧气的浓度,使血红蛋白释放H+及CO2,这种现象称波尔效应。.血红蛋白(hemogl obin ):是由含有血红素辅基的4个亚基组成的结合蛋白。血红蛋白负责将氧由肺运输到外周组织,它的氧饱和曲线为 S型。.别构效应(allosteric effect ):又称为变构效应,寡聚蛋白质一般具多个结合部位,结合在蛋白质分子的特定部位上的配体对该分子的其他部位所产生的影响。.酶(enzym e):由活细胞产生的在细胞内、外一定条件下,都能起催化作用,具有极高的催化效率的高度专一性的生物大分子。它使错综复杂的生化反应变得顺利和迅速。.全酶(holoenzym e ):脱

11、辅酶与辅因子结合后形成的复合物。.活性部位(中心)(active energy ):酶中含有底物结合部位和参与催化底物转化为产 物的氨基酸残基部分。活性部位通常位于蛋白质的结构域或亚基之间的裂隙或是蛋白质表面的凹陷部位,通常都是由在三维空间上靠得很近的一些氨基酸残基组成。.酸-碱催化(acid-base cat alysis ):质子转移加速反应的催化作用。.共价催化(c ovalent catalysis ): 一个底物或底物的一部分与催化剂形成共价键,然后被转移给第二个底物。许多酶催化的基团转移反应都是通过共价方式进行的。.靠近效应(proxim i ty effect ):非酶促催化反应

12、或酶促反应速度的增加是由于底物靠近活性部位,使得活性部位处反应剂有效浓度增大的结果,这将导致更频繁地形成过度O41寡聚蛋白质:两条或两条以上的具三级结构的多肽链组成的蛋白质。.米氏方程(Michaelis-Ment ent equation ):表示一个酶促反应的起始速度(u )与 底物浓度(s)关系的速度方程:u = u m axs/(Km +s).米氏常数(Mich aelis constant ):对于一个给定的反应,酶促反应的起始速度 (u 0)达到最大反应速度(u m ax ) 一半时的底物浓度。.有氧氧化:葡萄糖在有氧条件下彻底氧化成H 2O和CO2并放出大量能量的过程。.双倒数彳

13、图(double-reciprocal plot ):又称为 Li new eaver_Burk 作图。 一个酶 促反应的速度的倒数(1/V)对底物浓度的倒数(1/LSF)的作图。x和y轴上的截距 分别代表米氏常数和最大反应速度的倒数。.竞争性抑制作用(com petitive inhibition ):通过增加底物浓度可以逆转的一种酶促反应抑制类型。竞争性抑制剂通常与正常的底物或配体竞争同一个蛋白质的结合部位。这种抑制使K m增大而u m ax不变。.非竞争性抑制作用(non com petitive inhibition ):抑制剂不仅与游离酶结合,也可以与酶-底物复合物结合的一种酶促反应

14、抑制作用。这种抑制使Km不变而u m ax变小。.反竞争性抑制作用(un com petitive in hibition ):抑制剂只与酶-底物复合物结合 而不与游离的酶结合的一种酶促反应抑制作用。这种抑制使Km和u m ax都变小但u max/K m不变。.酶原(zym og en):通过有限蛋白水解,能够由无活性变成具有催化活性的酶前体。50.调节酶(reg ulatory enzym e ):位于一个或多个代谢途径内的一个关键部位的酶,它的 活性根据代谢的需要而增加或降低。51别构酶(allosteric enzym e ):活性受结合在活性部位以外的部位的其它分子调节的 酶。.抗体酶

15、(abzym e):又称催化性抗体,为在易变区被赋予了酶属性的免疫球蛋白。.同工酶(isoen zym e isozym e ):催化相同的化学反应但其在蛋白质分子结构、理化性质和免疫性能等方面都存在着明显差异的一组酶。.别构调节酶/剂(allosteric m odulat or):称为别构效应物。结合在别构酶的调节部 位,调节酶催化活性的 生物分子。别构调节物可以是是激活剂,也可以是抑制剂。55.维生素(vitam in ):维持细胞正常功能所必需的需要量很小、机体不能合成或合成量 很小,需由食物中供给的一类小分子有机化合物。56水溶性维生素(w at er-soluble vitam i

16、 n ) 一类能溶于水的有机营养分子。其中包 括在酶的催化中起着重要作用的B族维生素以及抗坏血酸(维生素C)及硫辛酸。57脂溶性维生素(lipid vitam in ):由长的碳氢链或稠环组成的聚戊二烯化合物。脂溶性维生素包括 A, D, E,和K,这类维生素能被动物贮存。58辅酶(conzym e):某些酶在发挥催化作用时所需的一类辅助因子,其成分中往往含有维生素。辅酶与酶结合松散,可以通过透析除去。59辅基(prosth etic g roup ):是与酶蛋白质共价结合的金属离子或一类有机化合物, 用透析法不能除去。辅基在整个酶促反应过程中始终与酶的特定部位结合。.尼克酰胺腺喋吟二核甘酸(

17、NAD+和尼克酰胺腺喋吟二核甘酸磷酸( NADP+ :含有尼 克酰胺的辅酶,在某些氧化还原中起着氢原子和电子载体的作用,常常作为脱氢酶的辅酶。.黄素单核甘酸(FMN 一种核黄素磷酸,是某些氧化还原反应的辅酶。.硫胺素焦磷酸(t hiam i n e phosphate ): 是维生素B 1的辅酶形式,参与转醛基反应。.黄素腺喋吟二核甘酸(FAD:是某些氧化还原反应的辅酶,含有核黄素。.磷酸口比哆醛(pyidoxal ph osphat e ): 是维生素B 6 (口比哆醇) 的衍生物,是转氨 酶,脱竣酶和消旋酶的酶。.生物素(biotin ):参与脱竣反应的一种酶的辅助因子。.辅酶A(coen

18、zym e A): 一种含有泛酸的辅酶,在某些酶促反应中作为酰基的载体。.转氨酶(t ransam i nase):称为氨基转移酶,在该酶的催化下,一个a -氨基酸的氨基可转移给别一个a-酮酸。.糖类:多羟醛或多羟酮及其缩聚物和某些衍生物的总称。.变旋(m utarotation ):一种具旋光性的物质的溶液,经放置,其旋光率发生改变的现象。.糖昔(dlyc oside ):单糖半缩醛羟基与另一个分子的羟基,胺基或疏基缩合形成的含糖衍生物。71肽聚糖(peptidog lycan ) : N-乙酰葡萄糖胺和N-乙酰胞壁酸交替连接的杂多糖与不 同的肽交叉连接形成的大分子。肽聚糖是许多细菌细胞壁的

19、主要成分。.糖蛋白(glycoprotein ):含有共价连接的葡萄糖残基的蛋白质。.糖胺聚糖:由含己糖醛酸和己糖胺成分的重复二糖单位构成。.蛋白聚糖(proteoglycan ): 一类特殊的糖蛋白,由一条或多条糖胺聚糖和一个核心蛋白共价连接而成。.三脂酰甘油(triacylglyc erol ):称为甘油三酯。一种含有与甘油酯化的三个脂酰基的酯。脂肪和油是三脂酰甘油的混合物。.生物膜(bioligic al m em brane ):镶嵌有蛋白质的脂双层,起着划分和分隔细胞和细胞器作用,生物膜也是与许多能量转化和细胞内通讯有关的重要部位。.内在膜蛋白(integ ral m em bran

20、 e prot ein ):插入脂双层的疏水核和完全跨越脂双层的膜蛋白。.外周膜蛋白(periph eral m em brane protei n ):通过与膜脂的极性头部或内在的膜蛋白的离子相互作用和形成氢键与膜的内或外表面弱结合的膜蛋白。.流动镶嵌模型(fluid m osaic m odel ):针对生物膜的结构提出的一种模型。在这个模型中,生物膜被描述成镶嵌有蛋白质的流体脂双层,脂双层在结构和功能上都表现出不对称性。有的蛋白质“镶“在脂双层表面,有的则部分或全部嵌入其内部,有的则横跨整个膜。另外脂和膜蛋白可以进行横向扩散。.通透系数(perm eability coefficient

21、 ):是离子或小分子扩散过脂双层膜能力的一种量度。通透系数大小与这些离子或分子在非极性溶液中的溶解度成比例。.通道蛋白(ch an nel prot ein ):是带有中央水相通道的内在膜蛋白,它可以使大小适合的离子或分子从膜的任一方向穿过膜。.(膜) 孔蛋白(pore protein ):其含意与膜通道蛋白类似,只是该术语常用于细菌。.被动转运(passive transport ):称为易化扩散。是一种转运方式,通过该方式溶质特异的结合于一个转运蛋白上,然后被转运过膜,但转运是沿着浓度梯度下降方向进行的,所以被动转达不需要能量的支持。.主动转运(active transport ): 一种

22、转运方式,通过该方式溶质特异的结合于一个 转运蛋白上然后被转运过膜,与被动转运运输方式相反,主动转运是逆着浓度梯度下降方向进行的,所以主动转运需要能量的驱动。在原发主动转运过程中能源可以是光,ATP或电子传递;而第二级主动转运是在离子浓度梯度下进行的。.协同运输(c ont ransport ): 两种不同溶质的跨膜的耦联转运。可以通过一个转运蛋白进行同一方向(同向转运)或反方向(反向转运)转运。.胞吞(信用)(en docytosis ):物质被质膜吞入并以膜衍生出的脂囊泡形成(物质在 囊泡内)被带入到细胞内的过程。.核昔(n ucl eoside ):是喋吟或喀咤碱通过共价键与戊糖连接组成

23、的化合物。核糖与碱基一般都是由糖的异头碳与喀咤的N-1或喋吟的N-9之间形成的3 -N-糖键连接。.核甘酸(un cleoside ):核昔的戊糖成分中的羟基磷酸化形成的化合物。89.cAMP(cycleAMP): 3 ,5 -环腺甘酸,是细胞内的第二信使,由于某部些激素或其它分子信号刺激激活腺甘酸环化酶催化ATP环化形成的。.磷酸二酯键(ph osph odiest er linkage ): 一种化学基团,指一分子磷酸与两个醇(羟基) 酯化形成的两个酯键。该酯键成了两个醇之间的桥梁。例如一个核昔的3 /羟基与另一个核昔的 5,羟基与同一分子磷酸酯化,就形成了一个磷酸二酯键。.脱氧核糖核酸(

24、DNA :含有特殊脱氧核糖核甘酸序列的聚脱氧核甘酸,脱氧核甘酸之间是是通过3 ,5 -磷酸二酯键连接的。DNA是遗传信息的载体。.核糖核酸(RNA :通过3 ,5 -磷酸二酯键连接形成的特殊核糖核甘酸序列的聚核 糖核甘酸。.核糖体核糖核酸(rRNA,ribonu cleic aci d ): 作为组成成分的一类 RNA, rRNA是 细胞内最丰富的 RNA .信使核糖核酸(m RNA,messen ger ribonu cleic acid): 一类用作蛋白质合成模板的 RNA 95.转移核糖核酸(tRNA,transfer ribonu clei c acid ): 一类携带激活氨基酸,将它

25、带到蛋白质合成部位并将氨基酸整合到生长着的肽链上RNA。tRNA含有能识别模板mRNA上互补密码的反密码。.转化(作用)(transform ation ): 一个外源DNA通过某种途径导入一个宿主菌,引起该菌的遗传特性改变的作用。.转导(作用)(transducti on ):借助于病毒载体,遗传信息从一个细胞转移到另一个细胞。.碱基对(base pair ):通过碱基之间氢键配对的核酸链中的两个核甘酸,例如A与T或U ,以及G与C配对。.DNA的双螺旋(DNAdou ble helix ):两条反向平行的多核甘酸链相互缠绕形成一个右 手的双螺旋结构。碱基位于双螺旋内侧,磷酸与糖基在外侧,通

26、过磷酸二酯键相连,形成核酸的骨架。双螺旋的直径为2n m ,碱基堆积距离是 0.34nm ,两核甘酸之间的夹角是 36。,每对螺旋由10对碱基组成,碱基按A=T, G-C配对互补,彼此以氢键相联系。 维持DNA 双螺旋结构的稳定的力主要是碱基堆积力。.熔解温度(m elting tem peratu re,Tm ): 在DNA热变性中,紫外吸收增加的中点值所对应的温度。或称热解链温度。.增色效应hyperch rom i c effect:当DNA变性后,对260n m 处紫外光光吸收度增加的现象。.减色效应(hypoc hrom i c effect ):随着核酸复性,紫外吸收降低的现象。.

27、核酸内切酶(exonu clease ):核糖核酸酶和脱氧核糖核酸酶中能够水解核酸分子内 磷酸二酯键的酶。.核酸外切酶(exonu clease ):从核酸链的一端逐个水解核甘酸的酶。.限制性内切酶 r restriction endon uclease ): 一种在特殊核甘酸序列处水解双链 DNA 的内切酶。 I型限制性内切酶既能催化宿主 DNA的甲基化, 又催化非甲基化的 DNA的 水解;而H型限制性内切酶只催化非甲基化的 DNA的水解。.重组 DNA技术 (rec om bination DNA technology ): 也称之为基因工程 (genom i c en gin eerin

28、 g ).利用限制性内切酶和载体,按照预先设计的要求, 将一种生物的某种目的基因和载体DNA重组后转入另一 生物细胞中进行复制、转录和表达的技术。.基因(gen e):泛指被转录的一个 DNA片段。 在某些情况下,基因常用来指编码一个功能蛋白或DNA分子的DNA片段。.新陈代谢:生物体与外界环境不断进行的物质和能量交换过程。.巴斯德效应(Pasteur effect ): 氧存在下,酵解速度放慢的现象。.糖醛酸途径(gluc uronate pat hw ay ):从葡萄糖-6-磷酸或葡萄糖-1 -磷酸开始,经UDP葡萄糖醛酸生成葡萄糖醛酸和抗坏血酸的途径。但只有在植物和那些可以合成抗坏血酸的

29、动物体内,才可以通过该途径合成维生素Co.呼吸电子传递链/(氧化) 呼吸链: 需氧细胞内代谢物被脱氢酶脱氢,经一系列电子传递体(递氢体+递电子体)传递作用,最终将质子和电子传递给被激活的氧原子,从而生成H 2O,并放出能量的全过程.酮体(acet on e body):在肝脏中由乙酰 CoA合成的燃料分子(3 -羟基丁酸,乙酰乙酸和丙酮)。在饥饿期间酮体是包括脑在内的许多组织的燃料,酮体过多会导致中毒。.生物固氮作用(bi ologic al nitrogen fi xatio ):大气中的氮被原还为氨的过程。物固氮只发生在少数的细菌和藻类中。.尿素循环(u rea cycle ):是一个由4

30、步酶促反应组成的,可以将来自氨和天冬氨酸的氮转化为尿素的循环。此循环是发生在脊椎动物的肝脏中的一个代谢循环。.脱氨(deam i nation ):在酶的催化下从 生物分子(氨基酸或核甘酸)中除去氨基 的过程。.氧化脱氨(oxidative deam i nation ) : a -氨基酸在酶的催化下脱氨生成相应的 a -酮酸的过程。 氧化脱氨实际上包括氧化和脱氨两个步骤。(脱氨和水解).转氨(transam i nation ): 一个a -氨基酸的a -氨基借助转氨酶的催化作用转移 到一个a -酮酸的过程。.生糖氨基酸(gluc on genic am i n o acid):降解可生成能

31、作为糖异生前体的分子,例如丙酮酸或柠檬酸循环中间代谢物的氨基酸。.生酮氨基酸(acet one genic ami no acid):降解可生成乙酰 CoA或酮体的氨基酸。.核甘酸磷酸化酶(n ucl oside ph osph oryalse ): 能分解核昔生成含氮碱基和戊糖 的磷酸酯的酶。.核昔水解酶(nu closide hydrolase ):能分解核昔生成含氮碱基和戊糖的酶。.从头合成(de novo synt hesis ):生物体内用简单的前体物质合成生物分子的途径,例如核甘酸的从头合成。.激素(h orm on e): 一类由内分泌器官合成的微量的化学物质,它由血液运输到靶组

32、织起着信使的作用,调节靶组织(或器官)的功能。.激素受体(h orm on e rec ept or ):位于细胞表面或细胞内,结合特异激素并引发细胞响应的蛋白质。.第二信使(sec on d m essen ger ):响应外部信号(第一信使),例如激素,而在细胞内合成的效应分子, 例如cAMP,肌醇三磷酸或二酰基甘油等。第二信使再去调节 靶酶,引起细胞内各种效应。.级联放大(cascade amplification ):在体内的不同部位,通过一系列酶的酶促反应来传递一个信息,并且初始信息在传递到系列反应的最后时,信号得到放大,这样的 一个系列叫作级联系统。. G蛋白(Gprotein )

33、:地细胞内信号传导途径中起着重要作用的GTP结合蛋白,由“ ,3 , 丫三个不同亚基组成。激素与激素受体结合诱导GTP跟G蛋白结合的GDP进行交换结果激活位于信号传导途径中下游的腺甘酸环化酶。G蛋白将细胞外的第一信使肾上腺素等激素和细胞内的腺甘酸环化酶催化的腺甘酸环化生成的第二信使cAMP联系起来。G蛋白具有内源GTP酶活性。.半保留复制(sem i conservative replication ) : DNA复制的一种方式。 每条链都可用作合成互补链的模板,合成出两分子的双链 DNA,每个分子都是由一条亲代链和一条新合成的链组成。. DNA聚合酶(DNApolym erase):以DNA

34、为模板,催化核甘酸残基加到已存在的聚核甘酸3 ,末端反应的酶。某些DNA聚全酶具有外切核酸酶的活性,可用来校正新合成的核甘酸的序列。.前导链(leadin g stran d ):与复制叉移动的方向一致,通过连续的5 x -3 x聚合合成的新的DNA链。.滞后链(l aggin g stran d ):与复制叉移动的方向相反,通过不连续的5 -3,聚合合成的新的 DNA链。.复制体(replisom e): 一种多蛋白复合体, 包含DNA聚合酶, 引发酶, 解旋酶, 单链结合蛋白和其它辅助因子。 复制体位于每个复制叉处进行细菌染色体 DNA复制的聚合 反应。.单链结合蛋白(SSB : 一种与单

35、链DNA结合紧密的蛋白,它的结构可以防止复制叉处单链DNA本身重新折叠回双链区。.逆转录酶(reverse transcript ase ): 一种催化以 RNA为模板合成 DNA的DNA聚 合酶, 具有RNA指导的DNA合成, 水解RNA和DNA指导的DNA合成的酶活性。.互补NDA (cDNA : 通过逆转录酶由 m RNA模板合成的双链 DNA。.聚合酶链式反应(PCR :扩增样品中的 DNA量和富集众多 DNA分子中的一个特定的 DNA序列的一种技术。在该反应中,使用与目的DNA序列互补的寡核甘酸作为引物,进行多轮的DNA合成。其中包括DNA变性,引物退火和在 Tap DNA聚合酶催化

36、下的 DNA合 成。.遗传学中心法则(g en etic central dogm a ): 描述从一个基因到相应蛋白质的信 息流的途径。遗传信息贮存在 DNA中,DNA被复制传给子代细胞,信息被拷贝或由DNA转录成RNA,然后RNA翻译成多肽。 不过,由于逆转录酶的反应,也可以以RNA为模板合成DNA=.转录(transcription ): 在由RNA聚合酶和辅助因子组成的转录复合物的催化下, 从双链DNA分子中拷贝生物信息生成一条 RNA链的过程。.模板链(t em plate strand ): 可作为模板转录为 RNA的那条链该链与转录的 RNA 碱基互补(A-U, G-C)。在转录

37、过程中,RNA聚合酶与模板链结合,并沿着模板链的3一5方向移动, 按照5 一3方向催化RNA的合成。.编码链(coding strand ): 双链DNA中, 不能进行转录的那一条DNA链, 该链的核昔酸序列与转录生成的RNA的序列一致(在 RNA中是以U取代了 DNA中的T)。.核心酶(c ore enzym e): 大肠杆菌的 RNA聚合酶全酶由5个亚基组成(a 2 3, 3 8 ),没有8基的酶叫核心酶。 核心酶只能使已开始合成的 RNA链延长, 但不具有 起始合成RNA的能力,必须加入8 基才表现出全部聚合酶的活性。. RNA聚合酶(RNA polym erase ):以一条DNA链或

38、RNA为模板催化由核昔-5-三 磷酸合成RNA的酶。.启动子(prom ot er ):在DNA分子中,RNA聚合酶能够结合并导致转录起始的序 列。.内含子(intron ):在转录后的加工中,从最初的转录产物除去的内部的核甘酸序列。 术语内含子也指编码相应RNA外显子的DNA中的区域。.外显子(exon):既存在于最初的转录产物中,也存在于成熟的 RNA分子中的核昔酸序列。术语外显子也指编码相应RNA内含子的DNA中的区域。.终止因子(term i nation factor ): 协助RNA聚合酶识别终止信号的的辅助因子 (蛋白质)。.核酶(ribozym e ): 具有催化功能的 RNA

39、分子。.翻译(translation ):在蛋白质合成期间,将存在于m RNA上代表一个多肽的核甘酸残基序列转换为多肽链氨基酸残基序列的过程。.遗传密码(gen etic c ode ):核酸中的核甘酸残基序列与蛋白质中的氨基酸残基序 列之间的对应关系。;连续的3个核甘酸残基序列为一个密码子,特指一个氨基酸。标准的遗传密码是由 64个密码子组成的,几乎为所有 生物通用。.起始密码子(iniation c odon ):指定蛋白质合成起始位点的密码子。最常见的起始密码子是蛋氨酸密码:AU Go.终止密码子(term i nation codon): 任 何tRNA分子都不能正常识别的,但可被特殊

40、的蛋白结合并引起新合成的肽链从翻译机器上释放的密码子。存在三个终止密码子:UAG ,UAA 和 UGA=.密码子(c on don) : m RNA (或DNA) 上的三联体核甘酸残基序列,该序列编码着一个指定的氨基酸 ,tRNA的反密码子与m RNA的密码子互补。.反密码子(antic odon ) : tRNA分子的反密码子环上的三联体核甘酸残基序列。在翻译期间,反密码子与 m RNA中的互补密码子结合。.简并密码子(de generate c odon): 也称为同义密码子。是指编码相同的氨基酸的几个不同的密码子。. SD序列(Shine-Dalg arno sequ en ce) :

41、m RNA中用于结合原核 生物核糖体的序列。.信号月太(sign al pepti de):常指新合成多肽链中用于指导蛋白质跨膜转移(定位)的N-末端氨基酸序列(有时不一定在N端)。.转录因子(transcription fact or ): 在转录起始复合物的组装过程中,与起动子区结合并与RNA聚合酶相互作用的一种蛋白质。某些转录因子在RNA延伸时一直维持着结合状态。.操纵子(operon ):是由一个或多个相关基因以及调控他们转录的操纵因子启动子序 列组成的基因表达单位。.操纵因子 (operat or ):与特定阻遏蛋白相互作用调控一个基因或一组基因表达的 DNAJXo.结构基因(str

42、uctu ral g en e ): 编码一个蛋白质或一个 RNA的基因。165一阻遏物(repressor ):与一个基因的调控序列或操纵基因结合以阻止该基因转录的 一类蛋白质。.脂肪动员:贮存在脂肪细胞中的甘油三酯中激素敏感脂肪酶(HSD 的催化下水解并释放出脂肪酸,供给全身各组织细胞摄取利用的过程。. a -氧化: 脂肪酸在微粒体中由单加氧酶和脱竣酶催化生成a-羟脂肪酸或少一个碳原子的脂肪酸的过程。.三竣酸循环(TCA。:在线粒体中, 乙酰CoA首先与草酰乙酸缩合生成柠檬酸,然后经一系列代谢反应, 乙酰基被氧化分解, 而草酰乙酸再生的循环反应过程,或称柠檬酸循环/Krebs循环。. DN

43、A探针: 被32P、35S或生物素标记单链末端或全链的一小段多聚核甘酸。.分子杂交: 利用核酸变性、 复性的性质, 根据碱基互补配对原则, 将两条不同来源 的核甘酸链在试管中经变性后慢慢冷却让其复性,若这些异源DNA之间在某些区域有相同的序列, 则可形成杂合双链分子,发生于DNA与DNA或DNA与RNA间。.酶的专一性:酶对催化的反应和反应物有严格的选择性,其往往只能催一种或一类反应,作用于一种或一类物质。包括结构专一性和立体异构专一性(旋光异构专一性+几何异构专一性)。.多酶体系:是由几种酶彼此嵌合形成的复合体。它有利于一系列反应的连续进行。.逆向转录:在逆转录酶作用下,以RNA为模板,按照

44、RNA中的核甘酸顺序合成 DNA,这与通常转录过程中遗传信息流从DNA到RNA的方向相反。.不对称转录:转录通常只在 DNA的任一条链上进行。.糖酵解:葡萄糖在无氧条件下,在细胞质一系列酶的作用下,生成丙酮酸并释放出能量的过程。.戊糖磷酸途径(PPP :葡萄糖在细胞质内直接氧化分解,并以戊糖磷酸为重要中间产物的有氧呼吸途径。又称己糖磷酸途径(H MB。.乙醛酸循环(GAC :脂肪酸氧化分解生成的乙酰CoA,在乙醛酸体内生成琥珀酸、乙醛酸和苹果酸等化合物的循环过程。其中生成的琥珀酸可用以生成糖,二竣酸与三竣酸循环。此循环发生仅在某些植物和微生物中。.糖异生作用:生物体中多种非糖物质(乳酸、丙酮酸

45、、 生糖氨基酸及甘油)转变为糖的过程。.生物氧化:糖、脂肪、蛋白质等物质在生物体内通过酶的催化,实现的一系列释放能量的化学反应过程。.氧化磷酸化: 在线粒体内膜上经电子传递链传递给分子氧生成水,并偶联ADP和Pi生成ATP的过程。 它是需氧生物生物氧化生成ATP的主要方式。181一底物水平磷酸化:ATP的形成直接与一中间代谢物上的磷酸基团的转移相偶联的作用。182.P/O比:在氧化磷酸化中,一对电子呼吸链传递至氧时所产生的ATP分子数,每消耗1 m ol氧原子产生 ATP的摩尔数。.反馈调节:指反应体系中的某些中间产物或终产物对其前面某一步反应速度的影响。使反应加速的物质称为正效应物。.温度系

46、数(Q1 0):表示生物体内的生化反应与温度关系的指标,指温度每升高1 00 C,呼吸速率所增加的倍数。其关系式为:Q1 0=(t +1 0)0C 时的速率/t0C 时的速率。.乳酸循环(可立氏循环):肌肉缺氧条件下产生大量乳酸,大部分经血运到肝脏,通过糖异生作用肝糖原或葡萄糖补充血糖,血糖可再被肌肉利用,这样形成的循环称乳酸循环。.分子伴侣:一类能特异地结合和释放底物蛋白的蛋白分子,它们帮助底物蛋白实现正确折叠、寡聚体组装、向特定细胞器转运或变换活化 /去活化构象等.肽平面:由于肽键具有部分双键性质,不能自由旋转,所以连接在肽键两端的基团处于一个平面上,这个平面称为肽平面。.联合脱氨基作用:

47、许多氨基酸不能直接进行氧化脱氨基作用,但可以和a -酮戊二酸进行转氨基作用,生成相应的a -酮酸和谷氨酸.谷氨酸可在谷氨酸脱氢酶的作用下进行氧化 脱氨基作用,又生成a -酮戊二酸,并放出氨,谷氨酸脱出的氨实际来自a -酮戊二酸进行转氨基作用的氨基酸.可见,转氨基作用与谷氨酸氧化脱氨基作用联合作用,此过程称氨基酸的联合脱氨基作用.凡能与a -酮戊二酸进行转氨基作用的氨基酸,都可以通过联合脱氨基作用分解为a -酮酸和氨,所以这种作用是谷氨酸以外的多种氨基酸脱氨基的主要方式。.谷胱甘肽(GSH):是由谷、 半胱的甘氨酸组成的三肽。半胱氨酸的疏基是该化合物的主要功能基团。GSH的前基具有还原性,可作为

48、体内重要的还原剂保护体内蛋白质或酶分子中疏基免被氧化,使蛋白质或酶处于活性状态。.脂肪酸的3 -氧化:长链脂肪酸降解首先在邻近竣基的第二个 C原子(3位)开始 脱氢氧化后, 经一系列反应逐步氧化成乙酰 CoA的过程, 由于氧化作用是从3 -C开始 的,故称3 -氧化。.粘性末端:当一种限制性内切酶在一个特异性的碱基序列处切断DNA时, 就可在切口处留下几个未配对的核甘酸,叫做粘性末端。故称半保留. DNA半保留半不连续复制:DNA复制时子链双链中有一条链来源于母链,故称半保留复制。以DNA母链双链为模板合成子链时,其中一条子链的合成是不连续的,而另一条链的合成是连续的,故称半不连续复制,合称半

49、保留半不连续复制。.共价修饰调节:酶蛋白分子中的某些基团可以在其他酶的催化下发生共价修饰,从而导致酶活性的改变,称为共价修饰调节。其特点是:酶以两种不同修饰和不同活性的形式存在;有共价键的变化;受其他调节因素的影响(如激素);一般为耗能过程;存在放大效应。.寡聚酶:有几个或多个亚基组成的酶。其中亚基可以相同,也可以不同亚基间以共价键结合,容易为酸碱及高浓度的盐或其他的本性剂分离。.增强子:是一种能够提高转录效率的顺式调控元件。其在多种真核 生物,甚至在原核生物中也发现有增强子。. C3植物:植物通过还原型戊糖磷酸循环而进行CO2固定的植物。.同促效应:别构效应可分为同促效应和异促效应两类。相同

50、配体引起的反应称为同促效应,例如寡聚酶或蛋白质各亚基之间的协同作用即是同促效应。其是同一种物质作用于不同 亚基的相同部位而发生影响,因此属别构效应。.转换数:酶的催化效率可用酶的转换数表示,在酶浓度一定,底物浓度大大大于酶浓度Et 情 况下,Vmax=K 3Et.K 3表示酶被底物完全饱和时,每单位时间内、 每个酶分子所能转化底物的分子数,称为转换数(TN ),也称催化常数(Kcat).它相当于一旦底物-酶中间物形成后,酶对特定底物的最大反应速度(Vm ax)也是 一个常数。此时酶将底物转化为产物的效率,K cat值愈大表示酶的催化效率愈高。.暗反应(dark reactions ):利用光反

51、应生成的 ATP和NADPHH勺化学能使 CO2还原成糖 或其它有机物的一系列酶促过程。.光反应(light reactions ):合色素将光能转变成化学能并形成ATP和NADPH勺过程。.氨基酸臂(amino arm):也称之接纳茎(acceptor stem) 。 tRNA分子中靠近 3,端的 核甘酸序列和5,端的序列碱基配对,形成的可接收氨基酸的臂(茎)。.氨酰-tRNA (aminoacyl-tRNA ):在氨基酸臂的 3 ,端的腺甘酸残基共价连接了氨基酸 的tRNA分子。.氨酰-tRNA合成酶(aminoacyl-tRNA synthetase ):催化特定氨基酸激活并共价结合 在

52、相应的tRNA分子3 /端的酶。.摆动(wobble):处于密码子 3/端的碱基和与之互补的反密码的5/端的碱基之间的碱基配对有一定的宽容性,即处于反密码的5,端的碱基(也称之摆动位置),例如 I可以与密码子上3,端的J C和A配对。由于存在摆动现象所以使得一个tRNA反密码子可以和一个以上的 mRN的码子结合。.伴娘蛋白(chaperone ):与一种新合成的多肽链形成复合物并协助它正确折叠成具有 生物功能构象的蛋白质。伴娘蛋白可以防止不正确折叠中间体的形成和没有组装的蛋白亚基的不正确的聚集,协助多肽链跨膜转运以及大的多亚基蛋白质的组装和解体。.半乳糖血症(galactosemia ):人类

53、的一种基因型遗传代谢缺陷,特点是由于缺乏1-磷酸半乳糖尿甘酰转移酶导致婴儿不能代谢奶汁中乳糖分解生成的半乳糖。.苯酮尿症(phenylketonuria ):是由于苯丙氨酸羟化酶缺乏引起苯丙酮酸堆积的代谢 遗传病。缺乏苯丙氨酸羟化酶,苯丙氨酸只能靠转氨生成苯丙酮酸,病人尿中排出大量苯丙酮酸。苯丙酮酸堆积对神经有毒害,智力发育出现障碍。.比活(specific activity ):每分钟每毫克酶蛋白在25c下转化的底物的微摩尔数(科m)。比活是酶纯度的测量。.别喋吟醇(allopurinol ):是结构上(喋吟环上第 7位是C,第8位是N)类似于次黄 喋吟的化合物,对黄喋吟氧化酶有很强抑制作用

54、,常用来治疗痛风。.补救途径(salvage pathway ):与从头合成途径不同,生物分子的合成,例如核甘酸 可以由该类分子降解形成的中间代谢物,如碱基等来合成,该途径是一个再循环途径。.查格夫法则(Chargaffs rules ):所有DNA中腺喋吟与胸腺喀咤的摩尔含量相等,(A=T),鸟喋吟和胞喀咤的摩尔含量相等(G= C),即喋吟的总含量与口咤的总含量相等( A+ G= T+Q 。 DNA勺碱基组成具有种的特异性,但没有组织和器官的特异性。另外生长发 育阶段、营养状态和环境的改变都不影响DNA的碱基组成。.初速度(initial velocity ):酶促反应最初阶段底物转化为产物

55、的速度,这一阶段产 物的浓度非常低,其逆反应可以忽略不计。.错配修复(mismatch repair ):在含有错配碱基的DNA分子中使正常核甘酸序列恢复的修复方式。这种修复方式的特点是:识别出正确的链,切除掉不正确链的部分,然后通过DNAm合酶和DNA连接酶的作用合成正确配对的双链DNA.大沟(major groove )和小沟(minor groove ):绕B-DNA双螺旋表面上出现的螺旋槽 (沟),宽的沟称之大沟,窄沟称之小沟。大沟、小沟都是由于碱基对堆积和糖-磷酸骨架扭转造成的。.单糖(monosaccharide ):由三个或更多碳原子组成的具有经验公式( CH2O n的简单 糖。

56、.寡糖(oligoccharide ):由2个20个单糖残基通过糖昔键连接形成的聚合物。.淀粉(starch ): 一类可作为植物中贮存多糖的葡萄糖残基的同聚物。由两种形式的淀粉:一种是直链淀粉,是没有分支的只是通过“-(1-4)糖昔键连接的葡萄糖残基聚合物。另一种是支链淀粉,是含有分支的a - (1-4)糖昔键连接的葡萄糖残基聚合物,支链在分 支点处通过a - (1-6)糖昔键与主链相连。.等电点(pI , isoelectric point ):使分子处于兼性分子状态,在电场中不迁移(分 子的净电荷为零)的 pH值。.读码框(reading frame ):代表一个氨基酸序列的mRNA子的

57、非重叠密码序列。一个mRNA勺读码框是由转录起始位置(通常是AU儒码)确定的。.多糖(polysaccharide ) : 20个以上的单糖通过糖昔键连接形成的聚合物。多糖链可 以是线性的或带有分支的。.二硫键(disulfide bond):通过两个(半胱氨酸)疏基的氧化形成的共价键。二硫键在稳定某些蛋白的三维结构上起着重要的作用。.发酵(fermentation ):营养分子(例如葡萄糖)产能的厌氧降解,在乙醇发酵中,丙酮酸转化为乙醇和CO2.翻译起始复合体(translation initiation complex ):由核糖体亚基、一个mRNA板、一个起始的tRNA分子和起始因子组成

58、并组装在蛋白质合成起始点的复合体.反馈抑制(feedback inhibition ):催化一个代谢途径中前面反应的酶受到同一途径 的终产物抑制的现象。.反向重复序列(inverted repeat sequence ):在同一多核甘酸链内的相反方向上存在 的重复的核甘酸序列。在双链DNA中反向重复可能引起十字形结构的形成。.光合磷酸化(photophosphorylation ):在叶绿体 ATP合成酶催化下依赖于光的由ADP和Pi合成ATP的过程。.光呼吸(photorespiration ):植物依赖光摄取氧进行磷酸乙醇酸代谢的过程。光呼吸之所以发生是由于 O2可以与CO2竞争核酮糖-1

59、,5-二磷酸竣化氧化酶的活性部位。.滚环复制(rolling-circle replication):复制环状 DNA的一种模式,在该模式中,DNAm合酶结合在一个缺口链的 3,端,绕环合成与模板链互补的 DNA每一轮都是新合成 的DNA取代前一轮合成的 DNA.化学渗透理论(chemiosmotic theory ): 一种学说,主要论点是底物氧化期间建立的 质子浓度梯度提供了驱动由AD刖Pi形成ATP的能量。.还原糖(reducing sugar):厥基碳(异头碳)没有参与形成糖昔键,因此可被氧化充当还原剂的糖。.回补反应(anaplerotic reaction ):酶催化的补充柠檬酸循

60、环中间代谢物的供给的反应,例如由丙酮酸竣化生成草酰乙酸的反应。.合成代谢反应(anabolic reaction ):合成用于细胞维持和生长所需要的分子的代谢反应。.顺反子(cistron )。泛指被转录的一个DNM段。在某些情况下,基因常用来指编码一个功能蛋白或 RNA分子的DNM段。.激素受体(hormone receptor ):位于细胞表面或细胞内结合特异激素并引发细胞响应 的蛋白质。.激素效应元件(hormone response elements, HRE :是指类固醇、甲状腺素等激素受体结合的一段短的DNA列(1220bp),这类受体结合 DN而可改变相邻基因的表达。.极限糊精(

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