基于深度测序技术的非侵入性胎儿染色体非整倍体检测课件

1、中南大学湘雅医院产前诊断中心湖南家辉遗传专科门诊部邬玲仟 基于深度测序技术的非侵入性胎儿染色体非整倍体检测染色体非整倍体定义：体细胞染色体数目增加或减少一条或数条的个体类型：a. 单体型：2n-1；X，21，22号丢失常见。b. 三体型：2n+1；常染色体13、18、21三体常见，性染色体三体型有XXX、XXY、XYY。c. 多体型：仅见于性染色体；如48，XXXX49，XXXYY。21三体综合征唐氏综合征（Downs Syndrome， DS）先天愚型足月新生儿最常见的染色体疾病，发病率1/700至今没有根治方法我国每年约2000万新生儿,每年约有26600个DS儿出生。我国有大约60万以上

2、的DS患者。特殊面容：面部扁平、鼻梁低平、眼距宽、外眦上斜、内眦赘皮、张口吐舌等智力障碍：患者智商（IQ）通常为3060。生长发育迟缓和肌张力减退：出生体重偏低，肌张力低下，身材矮小，短颈，颈背皮肤松垂，手短而宽、通贯掌、小指弯曲等。至少1/3的患者伴发先天性心脏病。十二指肠闭锁和气管食管瘘等伴发症也较其它疾病常见。患白血病的风险为正常人群的15倍。 临床表现18三体综合征18三体综合征是次于先天愚型的第二种常见染色体三体征。新生儿发生率约为1/7500。主要临床表现: 智力障碍、生长发育迟缓、胸骨短、严重的心脏畸形以及肌张力亢进等。颅面部的畸形包括小颌畸形、枕部突出、小耳以及低位耳等。双手呈

3、特征性的握拳状，摇椅足。13三体综合征发病率为1/2000025000。主要临床表现：严重的中枢神经系统畸形，内脏畸形，颅面部的畸形，手足畸形等；13三体综合征 血清学筛查存在的问题孕周的确定不准确许多单位未严格控制孕期筛查的时限取血时间与开单时间，称体重时间不一致的问题实验室操作缺乏统一的技术规范染色体综合征侵入性产前诊断侵入性产前诊断的利与弊47, XY, +21利：目前金标准弊：a）一定的流产风险：1% b）报告周期长：1个月 c）孕妇和家属承受较大思想压力 主要参考文献：Tabor A, et al. RCT of amniocentesis in 4606 low risk wome

4、n. Lancet 1986;1:1287-93母体血浆DNA的存在形式分娩后母体cffDNA快速降解Lo et al. Am J Hum Genet 1998; 62:768cffDNA半衰期16.3min，2h后检测不到 VS 母血胎儿细胞持续存在数年血浆DNA的高母体DNA背景血浆母体 DNA胚胎 DNA20% 胚胎 DNA母体DNA高背景带来的检测难度血浆20% 胚胎 DNA1011第二代测序技术用于检测胚胎染色体拷贝数变化采集母体血浆提取血浆DNA制备测序文库在第二代测序仪上测序测得的序列与人的参考基因组比对并作统计分析 母血胎儿游离DNA拷贝数检测技术平台抽取外周血 分离血浆文库制

5、备 生物信息分析新一代测序自2008年以来医学遗传学国家重点实验室已经收集了700多份各类孕妇外周血桨，同时，所有样本均有金标准的核型分析数据。通过与北京贝瑞和康生物技术有限公司技术合作，成功地完成了其中401例样本的双盲检测，结果显示13、18、21、X、Y五大染色体检测的灵敏度达到100%，特异性99%以上，处在国际领先水平。研究结果检测结果总结假阴性：0/28 = 0%假阳性：0/373 = 0%47,XY,+2126/46,XY24：Z = 4.7746,XX,der(21;21)+21 : Z = 9.59T21检测结果假阴性：0/3 = 0%假阳性：0/398 = 0%假阴性：0/12 = 0%假阳性：0/389 = 0%T13检测结果T18检测结果X/Y染色体检测结果基于新一代测序技术的非侵入性产前非整倍体检测的优点非侵入性，避免流产，感染等风险，降低孕妇心理担忧高灵敏度，高特异性检测周期短5天通量大，质控容易合作单位北京贝瑞和康生物技术有限公司周代星高扬侯颖张建光王珺田凤周可香港中文大学 (CUHK)