基础学习实验 7-DNS-AA双向聚酰胺薄膜层析凝胶层析分离Hb与鱼精蛋白课件

1、转录因子DNA结合位点预测分析DNS-氨基酸的双向聚酰胺薄膜层析 凝胶层析分离血红蛋白与鱼精蛋白DNA亲和层析分离目标转录因子蛋白综合性设计性实验-7此实验共包括如下三个部分第一部分，转录因子DNA结合位点预测分析第二部分， DNS-氨基酸的双向聚酰胺薄膜层析、凝胶层析分离血红蛋白与鱼精蛋白第三部分，DNA亲和层析分离目标转录因子蛋白第一部分，转录因子DNA结合位点预测分析基因表达的调控关键在于转录起始水平的调控。转录因子结合位点的预测是研究基因转录调控的重要环节。准确的预测将有助于人们认识和研究不同转录因子对目标基因的转录调控的时空性。第二部分， DNS-氨基酸的双向聚酰胺薄膜层析凝胶层析分

2、离血红蛋白与鱼精蛋白背 景层析法也称色谱法，是1906年俄国植物学家Michael Tswett发现并命名的。他将植物叶子的色素通过装填有吸附剂的柱子，各种色素以不同的速率流动后形成不同的色带而被分开，由此得名为“色谱法”（Chromatography) 。后来无色物质也可利用吸附柱层析分离。英国生物学家Martin和Synge。他们首先提出了色谱塔板理论。1944年出现纸层析以后，层析法不断发展，相继出现薄层层析、亲和层析、凝胶层析、气相层析、高压液相层析等。叶绿素通过碳酸钙管柱所形成的色谱图按层析过程的机理分类：分配层析: 根据不同组分在不同溶剂中分配系数不同而使物质分离的方法称为分配层析

3、。吸附层析:吸附是两相成一界面，溶质在表面密集的现象。以吸附剂为固定相，根据待分离物与吸附剂之间吸附力不同而达到分离目的的一种层析技术称为吸附层析。常用吸附剂：活性碳、硅。离子交换层析: 是以离子交换剂为固定相，根据物质酸碱度、极性和分子大小差异而将物质予以分离的一种方法。凝胶层析（分子筛）利用凝胶颗粒形成具有三维空间多孔性网络结构的物质，不带电荷，可起滤过或“筛”的作用。亲和层析是利用生物分子间所具有的专一性亲和力的层析技术。层析法分类层析法分类按两相所处的状态分类：流动相有两种状态：液体作为流动相 气体作为流动相固定相也有两种状态：固体吸附剂作为固定相 以吸附在固体上的液体作为固定相按两相

4、所处的状态分为：液相层析和气相层析 流动相固定相 液体 （液相层析) 气体 （固相层析） 液 体 液-液层析气-液层析 固 体 液-固层析气-固层析层析法分类名称操作形式适用范围柱层析将固定相装于柱内，使样品沿一个方向移动而达到分离的目的。柱层析是常用的层析形式，适用于大量样品分析、分离。生物化学中常用的凝胶层析、离子交换层析、亲和层析、高效液相色谱等都通常采用柱层析形式。薄层层析将适当粘度的固定相均匀涂铺在薄板上，点样后用流动相展开，使各组份分离薄层层析主要适用于小分子物质的快速检测分析和少量分离制备，通常为一次性使用。按操作形式不同分类：吸附层析原理：任何两个相都可以形成表面，其中一个相的

5、物质或溶解在其中的溶质在此表面密集现象称为吸附，利用吸附剂对不同物质具有不同吸附力使混合物得到分的现象就叫吸附层析。凡能将其他物质聚集到自己表面的物质称吸附剂，包括硅皮、氧化铝、活性炭、淀粉、纤维素及陶土，而聚集于聚集于吸附剂表面的物质称被吸附剂。吸附剂与被吸附剂之间的作用除了物理作用外，还有化学作用，如DNS-氨基酸双向聚酰胺薄膜层析时中被分离的物质之所以能吸附在聚酰胺薄膜上就是由于二者之间形成氢键。分配层析技术 （液-液层析法）原理：利用混合物在两种不相混溶的液相（固定相和流动相）之间的分配系数的不同而达到分离各组分的目的。纸层析是最广泛的一种分配层析。特点：液-液层析法适合于分离同系物或

6、同分异构体分配层析技术相关的概念（二）：迁移率：在一定条件下，在相同的时间内某一组分在固定相移动的距离与流动相本身移动的距离之比值。常用Rf来表示。物质在一定溶剂中的分配系数是一定的， Rf值也是恒定的，因此可以根据Rf值来鉴定被分离的物质。Rf =色斑中心至原点中心的距离溶剂前缘至原点中心的距离亲和层析法亲和层析（Affinity Chromatography）是利用生物分子间专一性亲和力而进行分离的一种层析技术。如我们熟悉的：抗原和抗体；酶和底物或辅酶或抑制剂；激素和受体；RNA和其互补的DNA等。亲和层析的分离原理简单的说就是通过将具有亲和力的两个分子中一个固定在不溶性基质上，利用分子间

7、亲和力的特异性和可逆性，对另一个分子进行分离纯化。 亲和层析可用于纯化生物大分子、稀释液的浓缩、不稳定蛋白质的贮藏、从纯化的分子中出去残余的污染物、用免疫吸附剂吸附纯化对此尚无互补配体的生物大分子，分离核酸是亲和层析应用的重要方面。亲和层析纯化过程简单、迅速，且分离效率高。对分离含量极少又不稳定的活性物质尤为有效。缺点是针对某一分离对象，制备专一的配基和寻求层析的稳定条件限制了其使用。离子交换层析离子交换层析是依据各种离子或离子化合物与离子交换剂的结合力不同而进行分离纯化。离子交换层析的固定相是离子交换剂，它是由一类不溶于水的惰性高分子聚合物基质通过一定的化学反应共价结合上某种电荷基团形成的。

8、离子交换剂包括交换树脂和交换纤维素两种。离子交换剂可以分为三部分：高分子聚合物基质、电荷基团和平衡离子。电荷基团与高分子聚合物共价结合，形成一个带电的可进行离子交换的基团。平衡离子是结合于电荷基团上的相反离子，它能与溶液中其它的离子基团发生可逆的交换反应。平衡离子带正电的离子交换剂能与带正电的离子基团发生交换作用，称为阳离子交换剂；平衡离子带负电的离子交换剂与带负电的离子基团发生交换作用，称为阴离子交换剂。凝胶层析技术概念：凝胶层析又称分子筛层析、排阻层析，当生物大分子随流动相通过装有作为固定相的凝胶颗粒的层析柱时，根据它们分子大小不同而进行分离的技术。原理：凝胶颗粒内部具有多孔性网状结构，被

9、分离的混合物流过层析柱时，比凝胶孔径大的分子不能进入凝胶孔内，在凝胶颗粒之间的空隙向下移动，并最先被洗脱出来；比网孔小的分子能不同程度的自由出入凝胶孔内外，在柱内经过的路程较长移动速度较慢，最后被洗脱出来。凝胶颗粒是一类具有三维空间多孔性网络结构的物质，不带电荷，可起滤过或“筛”的作用。凝胶层析的基本概念外水体积是指凝胶柱中凝胶颗粒周围空间的体积，也就是凝胶颗粒间液体流动相的体积。内水体积是指凝胶颗粒中孔穴的体积，凝胶层析中固定相体积就是指内水体积。基质体积是指凝胶颗粒实际骨架体积。柱床体积就是指凝胶柱所能容纳的总体积。洗脱体积是指将样品中某一组分洗脱下来所需洗脱液的体积。我们设柱床体积为Vt

10、，外水体积为Vo，内水体积为Vi，基质体积为Vg，则有：VtVoViVg 由于Vg相对很小，可以忽略不计，则有：VtVoVi 凝胶层析柱各种体积示意图（阴影部分）外水体积（V0）内水体积（Vi）基质体积（Vg）基质体积（Vt）原理聚酰胺薄膜层析是一类特殊的分配层析。混合物随流动相通过聚酰胺薄膜时，由于被分离物质与薄膜形成氢键，而各物质形成氢键的能力不同，决定吸附力的差异，吸附力强,展层速度慢，吸附力弱，展层速度快。展层溶剂与被分离物质在聚酰胺离子表面竞争形成氢键，选择适当的展层溶剂，使被分离物质在溶剂与聚酰胺薄膜表面之间的分配系数有最大差异。易溶于展层剂的所受的动力作用大，展层速度快，反之，速

11、度慢。 DNS-氨基酸的双向聚酰胺薄膜层析本实验中，聚酰胺上的氨基与氨基酸（AA）的羰基形成氢键，酰胺基团上羰基与AA中羟基或酚基形成氢键。由于有些AA结构相似，如只采用一种溶剂系统进行单向层析，难达到完全分离的目的。因此可选择另一溶剂系统进行第二向层析。这种层析方法称为双向层析。 第一向：苯冰醋酸溶剂 第二向：甲酸水显色：二甲氨基萘磺酰氯（DNS-Cl）可与氨基酸的游离氨基结合成DNS-氨基酸。形成的DNS-氨基酸在紫外光下呈黄色荧光。DNS-Cl + AADNS-AA + HCl实验操作DNS-氨基酸的制备（已完成）混合DNS氨基酸的双向层析点样：在薄膜右下角距两边各0.6cm，直径控制在

12、23mm之间，点在无光泽面，可重复点样2-3次；苯冰醋酸层析：将点好样品的薄膜用回形针固定放入展层剂中，展层剂前缘在距薄膜顶端2mm处即可停止,冷风吹干，紫外灯下观察；甲酸水层析：调转90度与第一相垂直，放入展层剂中，热风吹干，紫外灯下观察，用铅笔轻轻标记（以免损坏薄膜表面）；分析实验结果；将层析后标记好的薄膜以点样点为左下角贴于实验报告中。3、操作注意事项：严格控制点样位置以及点样直径。展层时勿将点样点浸入展层剂中。展层后必须经电吹风将膜吹干。紫外光对眼睛有害不要把头伸到灯下观察。颉亮苯丙赖甘丝天脯谷DNS-氨基酸的双向层析预期实验结果实验原理由于Hb（红色，分子量64500）与二硝苯-鱼精

13、蛋白（黄色，分子量2000-12000）的分子量不同，通过交联葡聚糖凝胶G-50（sephadex）层析柱用蒸馏水洗脱分离。从颜色不同可直接观察到血红蛋白洗脱较快，鱼精蛋白洗脱较慢。凝胶层析分离血红蛋白与鱼精蛋白G类葡聚糖凝胶（Sephadex-G）的最基本骨架是葡聚糖，它是一种以右旋葡萄糖为残基的多糖，分子间主要是-1,6-糖苷键（约占95%），分枝为l,3-糖苷键（约占5%），以1-氯-2,3-环氧丙烷为交联剂将链状结构连接为三维空间的网状结构的高分子化合物。葡聚糖凝胶网孔大小可通过调节交联剂和葡聚糖的配比及反应条件来控制。交联度越大，网孔越小，吸水膨胀就越小。交联度越小，网孔越大，吸水膨

14、胀就越大。G类葡聚糖凝胶常用G-X代表，X数字既代表交联度，也代表特水量。X数字越小，交联度越大，网孔越小，适用于分离低分子质量生化产品。X数字越大，交联度越小，网孔越大，适用于分离高分子生化产品。X数字也代表凝胶的持水量，如G-25表示1g干胶持水2.5ml，G-100表示 1g干胶持水10ml，依次类推。装柱前准备: 先用自来水洗净,再用蒸馏水洗净,之后往层析柱加入2-3ml蒸馏水,以确保凝胶底部没有气泡；装柱：垂直装柱，待凝胶装至柱高的10-15cm即可（装柱的时候注意要不断混匀凝胶）。注意防止气泡与分层, 否则重新装柱。可用玻棒搅拌使表面平整；平衡：反复加蒸馏水,平衡10分钟.使蒸馏水维持在3-4cm高度；加样：待蒸馏水流至柱平面时（不可使柱平面干掉），马上靠近柱平面小心滴加4滴样品（注意尽量不要使床面搅动），待样品浸入到凝胶中后马上加入34滴蒸馏水(动作轻