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文档简介
1、真核细胞RNA提取及RT-PCR2015.06.10一、人骨髓细胞总RNA的提取(Trizol法提取)目的:1.掌握人骨髓细胞中总RNA提取的基本原理2.熟悉Trizol法提取总RNA的原理和操作原理:Trizol是一种新型总RNA抽提试剂,内含异硫氰酸胍等物质,能迅速破碎细胞,再加入氯仿后形成两相,DNA与蛋白质存在于有机相,RNA保留于上层水相,将上层水样收集后,通过异丙醇沉淀即可得到RNA。Trizol适用于从多种组织和细胞中快速分离总RNA器材与试剂:EP管、加样枪、离心机、振荡器、Trizol Reagent 、氯仿、异丙醇、75%乙醇、DEPC(二乙基焦炭酸盐)水标本:人骨髓液操作
2、步骤:1取骨髓液标本0.4ml,加0.8ml的Trizol,充分吹打混匀2.各层相分离:室温静置5分钟,12000转/分,4离心10分钟,将上清液转移到另外一个EP管中3加入200ul氯仿,剧烈振荡混匀30s,静置3分钟,12000转/分,4,离心10分钟,离心后分三层:底层为黄色有机相,上层为无色水相(RNA主要在水相中)和一个中间层。 4将上清液小心转移到1.5ml离心管里,加入600ul异丙醇吹打混匀,室温下放置10min,12,000转,4 离心10 min。【注意:不要吸取任何中间层物质,否则会出现Genomic DNA污染】5.小心移去上清液,防止沉淀丢失 6.用75%酒精(用DE
3、PC水配置)洗涤,每次1ml,12000转/分,4,离心5分钟 7.尽可能彻底地吸走上清,同时防止丢失RNA沉淀8.室温下干燥3-5分钟使酒精充分挥发,加20ul DEPC-H2O溶解,置冰上备用。 思考题:1.哪些原因可导致RNA被降解?2.如RNA得率比较低,最可能出现的原因是什么?二、 RNA的琼脂糖电泳【试剂准备】 所提取人骨髓细胞总RNA 10Loading Buffer Goldview琼脂糖TBE缓冲液操作步骤:1、用电子分析天平称取1.5g的琼脂糖放入三角烧瓶2、将5TBE用去离子水稀释到0.5TBE工作液3、用100ml量筒量取100ml 0.5TBE到三角烧瓶中4、将三角烧
4、瓶的口用厚纸包严以防止挥发5、将三角烧瓶放在微波炉中加热34分钟到完全融化6、将三角烧瓶放置于室温冷却到不烫手7、加入Goldview(EB替代品) 5L摇匀,倒入制胶模具中8、等琼脂糖完全凝固后拔去梳子,连塑料托底一起放入电泳槽中9、取10L所提取的人骨髓细胞总RNA,用2L10Loading Buffer混合后加入胶孔中10、120V,电泳30min,用凝胶成像仪器成像二、RT-PCR(逆转录聚合酶链反应)目的:1.掌握RT-PCR的基本原理;2.熟悉RT-PCR的反应体系、操作及电泳分析原理:提取组织或细胞中的RNA,采用oligo(DT)或随机引物,利用反转录酶反转录成CDNA,然后以
5、CDNA为模板进行PCR扩增,从而获得目的基因的表达。试剂:PrimeScript One Step RT-PCR Kit Ver.2(一步法试剂盒)器材:凝胶电泳仪、PCR仪、凝胶成像仪、离心机、移液管、0.5TBE、Goldview、DL2000 Marker、灭菌双蒸水标本:人骨髓液1.RT-PCR反应体系试剂用量终浓度PrimeScript 1 step Enzyme Mix2ul2x1 step Buffer25ul上游primer(20uM)1ul0.4uM下游primer(20uM)1ul0.4uMTemplate RNA5ulRNase Free dH2O16ul2.RT-PCR反应条件第一步:50C 30min第二步:94C 2min第三步:94C 30s 第四步:60C 30s第五步:7
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