遗传与肿瘤-精准大数据的探索 孙成铭 烟台2018.4

1、2018-5-14遗传与肿瘤-精准大数据的探索主要内容检验中心-孙成铭u1.医院和实验室情况介绍2018.05.05（生物芯片北京国家工程研究中心烟台分中心）u2.霍普金斯学习体会u3.精准医学在临床医学中的应用u4.精准大数据的研究前景历史与变迁烟台简介 INTRODUCE of YANTAIp 烟台地处胶东半岛东北部p 南邻青岛，西接潍坊,东连威海,毗邻日本、韩国p 面积13745.95 km2，人口702万2016189019141890年美籍牧师郭显德及其夫人创办诊所，1914年医院建成，床位100张，并附设一所护士学校1994年6月被评为三甲医院2013年6月三甲复审通过2014年8

2、月成功创建省级区域医疗中心19942013Yantai Yuhuangding Hospital wasfounded by American Presbyterianchurch in 1890p 年GDP 6446.1亿元 RMB，全国城市排名第20位p 全国文明城市19481978Largest comprehensive hospital inthe east of Shandong province ，one of the three province-levelregional medical centers inShandong provincep 中国最佳魅力城市p 获联合国人

3、居奖1938年医院被日军占领1948年烟台二次解放，医院回归1978年医院步入快速发展时期建筑特色建筑外观呈古典西式风格，内部高大宽敞l 国内单体建筑面积（ 29万余平米）最大的医院之一l 现代化、人性化、 一体化医疗大楼12018-5-14布局、设施、流程、环境和诸多细节充分彰显以人为本的服务理念规模与业务量 医院本部建筑面积34万平方米，包括主体医疗大楼，办公 /科研/教学综合大楼，编制床位3000张。 莱山分院编制床位200张，芝罘分院编制床位 400张，牟平分院编制床位530张，福山分院编制床位 400张，威海分院编制床位 500张 2015年门诊量200余万人次，出院量11.9万人次

4、，年手术量6.8万余例国家级重点学科建设单位1个省临床重点专科24个中西医结合科, 消化内科、泌尿外科、耳鼻喉科、生殖医学科、心血管内科、妇科、产科、普外科（胃肠、肝胆胰、血管等）、神经内科、神经外科等品牌技术科研与学术肾脏移植 : 245例（2016.1-11）中心实验室-山东省干细胞工程技术研究中心生物芯片北京国家工程技术研究中心烟台分中心建立了标准化的组织标本库打造高端科研平台腔镜手术: 8000余例/年内镜诊疗技术:36,400例/年加大科技资金投入科研启动基金 科研发展基金 科研奖励基金科研绩效管理，定期考核，纳入奖惩介入诊疗技术: 14,800/年实施综合绩效管理体外胚胎生殖技术:

5、 2,000 周期/年对外交流与合作服务品质持续改进：以手机、自助机和互联网为载模式的广泛应用Established cooperation with Harvard University, M.D. Anderson Cancer Center, Cardiff University, UK,Adelaide, Australia Royal Hospital, exchangingvisitors, carrying out academic research projects.与美国哈佛大学医学院、美国安德森肿瘤中心、荷兰乌特勒支大学医学院、英国卡迪夫大学、澳大利亚阿德莱德皇家医院、德国

6、帕特博恩兄弟医院等医疗机构建立了长期的交流与合作平台，实现了互访交流及联合研究等机制22018-5-14（三）树木选型、移栽信息化建设种植（大）：18棵树龄：50年以上牡丹国色天香 花中之ep王国内首批经HIMSS认证达到美国EMR采纳模式6级水准全国首家J2EE的B/S架构的CIS/NIS结构化EMRs2011医疗质量管理2009移动查房护理质量管理院内感染管理全面“无纸化”移动护理监制首台国产查房车HIMMS certification for EMR（一）树木生态习性生物芯片北京国家研究中心烟台分中心介绍生物芯片实验室The Biochip Laboratory亦为北京博奥国家生物芯片研

7、究中心在全国设立的5个分中心之一。承担着基因芯片研究与临床转化应用的任务。已开展了一系列疾病诊断、风险评估基因检测，肿瘤基因检测，药物基因检测等项目，为精准医疗和个体化医疗的开展提供了技术支撑。(1)紫薇:花紫红色。(2)翠薇:花蓝紫色。组织标本库 Tissue Bank(4)银薇:花白色或微(3)赤薇:花火红色。带淡茧色。仪器设备测序及芯片平台u分中心现有仪器设备171台，价值3000余万元，拥有博奥、Agilent、Affymetrix、Roche等生物芯片平台和一代、二代测序平台，面向烟台地区开放。Illumina Genome AnalyzerIIx系统晶芯 LuxScan 芯片扫描系

8、统Agilent 生物芯片分析系统四大芯片平台及测序平台EasyMag全自动核酸提取工作站高通量荧光定量PCR系统Light Cycler480高灵敏度自由流电泳系统芯片点样仪ABI实时荧光PCR芯片检测ABI Prism 3130Roche480Roche NimbleGen生物芯片平台GeneAtlas芯片系统NucliSENS EasyQ Analyzer核酸扩增实时检测系统晶芯 PersonalArrayer 16个人点样仪晶芯 SmartArrayer 136微阵列芯片生系统晶芯电子病历和样品库管理系统（软件）Ion Proton测序系统OpenArray实时荧光PCR芯片系统Lum

9、inex 200 液态悬浮芯片系统Agilent 芯片扫描仪Ion ProtonAffymetrix芯片扫描仪ABI 芯片点样仪ABI Prism 3130测序系统32018-5-14生物芯片北京国家工程研究中心烟台分中心揭牌仪式（左上）杨军院长陪同程京院士在我院参观（左下）邢婉丽副总裁与刘运祥院长（前任）（右上）2012年6月16日蓬莱阁生命科学与健康高峰论坛（右下）程京院士与杨军院长参加生物芯片北京国家工程研究中心烟台分中心正式挂牌仪式2015年5月22日，生物芯片北京国家工程研究中心烟台分中心举行揭牌仪式。杨军院长、程京院士致辞，烟台市人民政府宋卫宁副市长致辞，对分中心的正式成立表示热烈

10、欢迎 。分中心宣传活动院士和院长揭牌仪式合影基因检测护健康 影视宣传片开机杨院长陪同程京院士和尚红教授参观实验室在各种报刊、媒体进行宣传2016年 我院成为国家发改委首批“山东省基因检测技术应用示范中 心” 建设单位之一今晨六点、烟台日报、烟台晚报、齐鲁晚报等42018-5-14二.霍普金斯学习体会 2017年赴美国约翰霍普金斯大学检验项目行前会 约翰霍普金斯大学 成立于1876年 世界顶级的著名私立大学 美国第一所研究型大学，科研经费连续 37年居全美大学榜首 北美顶尖大学学术联盟美国大学协会（ AAU）的14所创始学校之一 36位诺贝尔奖获奖者 医学院、公共卫生学院、国际关系学院等重要学院

11、参观实验室 学习交流学习体会学科经验交流会 一该院具有非常先进的管理理念 病理实验室包括（临床病理和解剖病理）在一个大平台下运行。在拥有1500人的大环境下，大家井然有序，有条不紊进行工作，节省资源，节约人力。患者是医生的老师，医生为所有人提供服务。病理科医生和技师承担不同领域工作和职责。 2.教学模式根深蒂固： 将临床和科研有机结合，不断传承历史文化，具有非常深的荣誉感和自豪感。科研学术水平高，贴近临床进行科研，团队力量强。大家主攻不同的方向，各自分工明确。52018-5-143.采用全面精细化管理模式借用先进的LIS系统进行数字化管理，医院 HIS和LIS系统有机结合，方便医护人员。标本运

12、输无缝连接，报告发放简单方便。每天15000份报告准确无误。和 20多家社区医院建立了一体化的信息平台，无需信息中转平台，收费由保险统一承担。4.技术项目开展全面目前开展3000项检验检查项目。不受 FDA等试剂的影响，全力为临床患者服务。我们与他们相比有明显的差距。 5.学科交流广泛深入： MDT 的多学科会诊模式广泛进行，病理科医生参与临床交流。共同提高专业水平，为临床患者提供个体化的治疗方案。 6.把握前沿的发展方向：深入了解精准医学的理念，大家在这一平台上积极努力奉献自己的一份力量。今后的一点想法培训感言 1.医院是医教研一体化的医疗机构，缺一不可，我们要在细节和水平上下功夫，积极引进

13、先进的管理理念和高端的人才，注重细节，提高水平和完善自己。 先进的管理理念培养了高素质的学科团队；以院为荣，为院争光的思想影响着每个人； 传承是美德，医术是道德的升华； 2.检验科不仅仅是辅助科室，更是医院学科发展的中心环节，我们应该不断加强学科队伍建设，加强亚专业学科梯队，培养检验医师队伍，建立自己的发展目标，通过学术提高科研能力和水平，通过优质化、人性化的理念服务每一位患者。 榜样的力量是无穷的，从自身做起，带领团队要脚踏实地，以“拿来主义”的精神不断完善自己。三、精准医学在临床中的应用精准医学一）精准医学是指以个人基因组信息为基础，结合蛋白质组学，代谢组学等相关信息，为病人量身设计出最佳

14、治疗方案，以期达到治疗效果最大化和副作用最小化的一门定制医疗模式。1）产前诊断及新生儿疾病筛查中的应用2）精准医学在其它临床检测中的应用二）从现在的“对症医疗”到未来“对个体医疗”，针对每个人不同的生物医学特征设定不同的医疗方案。62018-5-14走向临床诊断的基因芯片基因组时代伴随的高通量基因测序技术通过FDA或CE审核的诊断型芯片u Microarray,data factory/generatorl高密度、灵活定制、微量样品l 从一个实验室技术发展成一个基因组学研究所依赖的，快速产生海量 数据的常规手段，正在逐步走向临床诊断。2014年12月：罗氏公司2007年2月：荷兰Agendia

15、公司乳腺癌预后诊断芯片MammaPrint通过FDA审核。2010年：美国Pathwork公司的TOO芯片（Tissue ofOrigin Test）通过FDA审核。uHigh Throughput sequencing/next generationAmpliChip CYP450 Test 芯片诊断产品通过FDA审核。sequencing/deep sequencingl测序通量越来越高，测序 成本越来越低l2010年已经进入数千美元测定一个人全基因组的时代l2014年进入1000美元测定一个人的基因组2004年，Affymetrix专门用于体外诊断芯片的仪器系统GeneChip Syst

16、em 3000Dx（GCS3000Dx）先后通过CE和FDA的审核。国内的芯片诊断产品： CYP2C19芯片-波立维等药物指烟台毓璜顶医院分子检测临床平台系统导 MTHFR芯片-叶酸用药指导 ALDH2芯片-硝酸甘油类药物 耳聋基因芯片临床分类项目名称种类43遗传性疾病遗传性耳聋基因筛查、PGD胚胎移植前、NIPT、遗传代谢病等 分支杆菌菌种鉴定芯片 胚胎植入前诊断芯片 染色体异常筛查芯片等测序诊断产品：肿瘤及血液系统疾病感染性疾病肺癌靶向EGFR8126、乳腺癌BRCA1、血液病初筛及预后结核病、呼吸系统病原体、流感病毒、HPV筛查、HIV等基因检测药物基因心血管、神经系统、麻醉药品等基因检

17、测2742 无创产前检测（NIPT） 单基因病检测 肿瘤突变基因检测等慢性病基因爱身谱基因检测、microRNA早筛、结直肠癌基因早筛遗传性耳聋-世界性医学难题产前诊断及出生缺陷相关诊断l遗传性耳聋基因检测 听力正常的夫妻为什么生出聋儿？ 聋人夫妻能否生出听力正常的孩子？l无创产前基因检测 为什么有些人使用了某些抗生素后会致聋？ 为什么有些人的头部经过撞击后听力会快速下降，甚至l胚胎移植前PDG检测：PCR结合芯片技术l509种染色体疾病筛查：测序或芯片致聋？ 为什么有些人少儿时期听力正常，伴随年龄增长听力会不断下降？72018-5-14表1 10818例遗传性耳聋基因芯片检测结果基因突变类型

18、例数 携带率（%）GJB2基因35delGGJB2基因176del161120.010.112.560.850.432.110.610.240.056.96uu耳聋绝大多数情况下是由我们的遗传基因决定的。以前不能够解释的问题，现在非常明确。GJB2基因235delC277*92GJB2基因299delATGJB3基因C538T46*228*66SLC26A4基因IVS7-2AGSLC26A4基因A2168G线粒体12S rRNA基因A1555G线粒体12S rRNA基因C1494T合计u令人振奋的是：通过现在最尖端的芯片技术就可以检测出来。（我院自2012年五月份开展）265753可对4个基因

19、9个位点的基因型进行准确检测，报告野生、杂合突变或纯合突变等三种结果*5例GJB2（235delC）、SLC26A4(IVS7-2AG) 双杂合突变*7例GJB3(C538T)、SLC26A4(IVS7-2AG) 双杂合突变遗传性疾病典型病例分析：患者尹XX、吴XX家系九项遗传性耳聋基因检测无创产前DNA检测爱身谱个体遗传基因检测植入前胚胎检测microRNA肿瘤超早期检测尹XX结果： IVS7-2和1975双杂合吴XX结果:IVS7-2和1174双杂合目前已开展例数临床项目2012年 2013年 2014年 2015年2016年合计方法阳性率（7.31日止）遗传性耳聋基因检测29419562

20、716242018039189芯片测序6.4%3%无创产前DNA检测-101-232799659152343323221425爱身谱个体遗传基因检测芯片 风险评估尹XX父亲1975尹XX母亲IVS7-2吴XX父亲1174吴XX母亲IVS7-2植入前胚胎检测（PGD）-32646432192芯片90%microRNA肿瘤超早期检-已开展PCR测针对耳聋基因开展的工作 21、18、13-三体综合征是人类最见的三种染色体疾病，患儿面容特殊，绝大多数为严重智力障碍及器官畸形，对家庭和社会造成巨大负担。 现代医学对胎儿染色体疾病尚无有效治疗方法，最好的方法是在孕期通过产前筛查及诊断，发现异常并及时采取相

21、应措施。瑞士联邦民政部门（EDI）将为有高危染色体异常风险的孕妇提供强制性医疗保险（OKP），免费提供NIPT检测（无创产前诊断）。走进聋哑中心学校参与义诊，广做宣传82018-5-14常见的染色体病染色体数目异常无创产前基因检测（NIPT）综合征染色体异常主要临床症状NIPT科学基础： 母血浆DNA+高通量测序21三体综合征（唐氏综合征）多一条21号染色体 智力低下，特殊面容，眼裂上斜，鼻梁扁平，舌大、外伸和流涎18三体综合征（Edward综合征） 多一条18号染色体 头面、手足有严重畸形，冬瓜头，眼距宽，眼球小，手紧握拳，足突出，向背部翘起13三体综合征（Patau综合征）多一条13号染色

22、体 智力发育障碍、小头、眼球小、前脑发育缺陷，常伴有腭裂Klinefelter综合征（克氏综合症） 多一条X染色体先天性睪丸发育不全先天性卵巢发育不全Turner综合征（特纳综合征）少一条X染色体Down综合症Edward综合症Patau综合症NIPT相较临床常见产前检测技术的优势质量保证：全国第一批无创产筛室间质评调查活动共 30家医疗机构参加，我科获满分，成绩合格。92018-5-14无创项目开展例数（2014.122017.3）无创结果与（超声+核型分析）结果比较（超声+核型分析）结果（例）无创高风险（例）染色体异常无创结果相符（例） 不相符（例）准确度（%)96.7样本数（例）性染色体

23、异常（例）T21（例）30T18 （例）12T13 （例）*21-三体3012429123118-三体13-三体01004145416175阳性率0.72%0.29%0.1%0.39%*一例无创结果为21-三体临界阳性（Z值=3.05,正常范围为-3Z 3），三维超声和羊水穿刺核型分析结果均为正常。无创结果提示性染色体异常者的结局胎儿染色体非整倍体高风险病例分析无创高风险（例数）（超声+核型分析）结果（例）性染色体异常类型无创高风险（例）未能明确妊娠结局（例）血清学与B超检查21-三体（例）13-三体（例）性染色体异常（例）相符（例）不相符（例）18-三体（例）血清学高风险血清学临界风险血清学

24、低风险7100020XXXXXY或XYYX03834180202023*1*1*4*01*4*未接受血清学检查且B超无异常548*101*总计166*未接受血清学检查但B超有异常（NT3.0mm）1121*6例未能明确结局者其原因为：拒接接受介入性产前诊断检查，三维超声未能见明显异常，已生育者因婴儿太小未能见明显异常。*解决漏诊PGD部分结果图释胚胎移植前PGD检测4,16号染色体缺失XXu检测内容：全部染色体非整倍体大于4Mb的染色体微缺失/微重复精确到单个细胞uu意义：1、筛选优质囊胚进行移植2、排除染色体异常等疾病的发生。3、 提高优生优育。报告1例正常102018-5-14ION PG

25、M 应用什么是宏基因组？-复杂的样本，混合的微生物，包括食品、呕吐物、粪便等应用快速、准确、低成本、完整的解决方案未知微生物鉴定细菌分型抗药性基因测序未知病毒鉴定病毒分型PGM SystemConfidential and ProprietaryDO NOT DUPLICATE6216S 高通量测序理论基础新生儿遗传代谢病筛查的方法二代新筛-国际最先进、最权威新筛方法检测方法：串联质谱法；检测模式：一种检测、多种项目、多种疾病；优点：病种多，近百种检测参数对应30- 50种遗传代谢病，弥补国家两项或四项筛查不足。16s rRNA基因是进化遗传研究的重要对象， 相对于细菌的表型鉴定，16s rR

26、NA基因检测技术已成为细菌检测和鉴定的使用广泛和快速的工具16S rRNA基因是存在于原核生物基因组上编码rRNA相对应的DNA序列。16S rRNA基因长度是1.5kb， 具有高度保守性区域和高度特异性区域，特异性区域成为物种特异的标志序列。烟台毓璜顶医院检测数据精准医学在其他临床检测中的应用2016年1月-2016年3月1、疾病的预测预防2、肿瘤的靶向治疗3、药物个体化治疗4、病原菌检测及鉴定科室儿科产科检测样本数据 阳性数据阳性率5.55%0.16%3621596合计63230.47%112018-5-14疾病的种类1、疾病的预测预防一个成功男士的不幸l先天获得的疾病：遗传病等：单基因、

27、多基因。（地中海贫血、蚕豆病、血友病等）l后天获得的疾病：1、心脑血管疾病等2、肿瘤：一种慢性的疾病。3、各类感染性疾病（乙肝、结核、HIV等）疾病的特点l人类的绝大多数疾病都与遗传有关。（美国和日本的科学院院士的观点）l病毒与肿瘤的发生密切相关性：HPV与宫颈癌；EB病毒与鼻咽癌；肝炎病毒与肝癌等苹果总裁乔布斯 :56岁死于胰腺癌2、肿瘤靶向治疗靶向药物和信号通路药靶一个美丽女人的不幸安吉丽娜.朱莉:38岁的女人自言活不过 45岁肿瘤规范诊疗部分肿瘤个性化用药指导病史影像病理检验分子诊断检验医师其他检测项目检测数据检测结果解读整合医学与易瑞沙/特罗凯耐药EGFR突变18,19,20,21号外

28、显子 无突变12,13,61,146密码子 无突变相关西妥昔单抗/帕尼单抗疗效较好临床医师 影像科医师 病理科医师 检验技师+临床医师+信息分析师KRAS突变ERCC1多态性DPYD多态性C118T野生型铂类药物疗效较好5-FU毒副作用较低5-FU疗效较好IVS14+1GA野生型MTHFR多态性 C677T突变纯合子突变纯合子野生型MDR1多态性CDA多态性C3435TA79C紫杉醇疗效好多学科会诊（医务处）吉西他滨疗效差信息汇总,云计算精准医疗（靶向，个体化）122018-5-14白血病43种融合基因筛选针对：基因BRCANUP98-HoxD13AML1-ETOFIP1L1-RARa MLL

29、-ENLTEL-JAK2AML1-MDS1/EVI1AML1-MTG16MLL-AF10MLL-SEPT6NUP98-PMX1 TEL-PDGFRBBRCA1MLL-AF17MLL-AF1pNPM-ALKPLZF-RARaPML-RARaTLS-ERGBCR-ABLNPM-MLF1PRKAR1A-RARaCBFB-MYH11DEK-CANE2A-HLFMLL-AF1qMLL-AF4MLL-AF6NPM-RARaBRCA 2NUMA1-RARa SET-CANNUP98-HoxA11 SIL-TAL1BRCA1定位于17q21，约100 kb，含有24个外显子，其中第1、4号外显子不编码氨基酸，

30、另外22个转录出7.6 kb mRNA，最终可编码含1863个氨基酸的蛋白质。而第11号外显子较大，长3.4 kb。E2A-PBX1MLL-AF9MLL-AFXNUP98-HoxA13 STAT5b-RARaNUP98-HoxA9 TEL-ABLNUP98-HoxC11 TEL-AML1BRCA2定位在13q12-13，有27个外显子,仅编码区就有11.4K。其中11号外显子几乎含编码序列的一半，完整的BRCA2编码3418个氨基酸的蛋白质 。ETV6-PDGFRAFIP1L1-PDGFRA MLL-ELL3、个体化用药基因检测肿瘤相关基因检测 肿瘤药物靶向基因检测 血液病相关基因检测 细胞周

31、期分析（TK1） 异常糖链蛋白检测MTHFR基因检测 CYP2C19基因检测 ALDH2基因检测 载脂蛋白E基因型检测目前已开展例数目前已开展例数临床项目2012年 2013年 2014年 2015年2016年合计方法用途（7.31日止）临床项目2013年 2014年2015年2016年（7.31止）2176合计方法阳性率肿瘤药物靶向基因检测血液病相关基因检测细胞周期分析（TK1）21885128332745619614804240PCRPCR指导用药指导用药MTHFR基因检测-605131719355333芯片芯片芯片测序基因分型基因分型888161317651203CYP2C19基因检测9

32、-406200018976829429676酶免 疗效评价法ALDH2基因检测-192154418基因分型风险评估异常糖链蛋白检测-1593459310103377620065酶免 疗效评价法载脂蛋白E基因型检测771304、感染性疾病的分子检测下呼吸道感染的13种病原微生物呼吸道病原菌检测芯片u细菌 分枝杆菌菌种鉴定u病毒 结核分枝杆菌耐药检测 乙型肝炎病毒耐药检测试剂盒 结核感染T细胞检测u支原体、衣原体等序号细菌名称肺炎链球菌简称生物形态及特点 呼吸道病原体检测1234567Spn 革兰氏染色阳性球菌，需氧或兼性厌氧Sau 革兰氏染色阳性球菌，需氧或兼性厌氧Eco 革兰氏染色阴性短杆菌，

33、兼性厌氧菌Kpn 革兰氏染色阴性杆菌Pae 抗药性强、能运动的革兰氏染色阴性杆菌，形态不一Aba 非发酵型革兰氏染色阴性杆菌非发酵型革兰氏染色阴性杆菌，专性需氧没有运动力的革兰氏阴性杆菌。嗜血杆菌一般都是好Hin氧生物，但可以成长为兼性厌氧生物金黄色葡萄球菌大肠埃希氏菌肺炎克雷伯菌铜绿假单胞菌鲍曼不动杆菌嗜麦芽窄食单胞菌目前已开展例数临床项目2012年 2013年 2014年 2015年2016年合计方法芯片阳性率（7.31日止）分枝杆菌菌种鉴定3613492031059411124.5%Sma结核耐药检测3053936242457956414128809229芯片芯片1.3%089流感嗜血杆

34、菌嗜肺军团菌乙型肝炎病毒耐药检Lpn 需氧的多性革兰氏阴性杆菌10 肺炎支原体11 肺炎衣原体12 耐甲氧西林葡萄球菌 Mrs 革兰氏染色阳性球菌Mpn 原体是革兰氏阴性病原体，最小的最简单的原核生物Cpn 原体是革兰氏阴性病原体，细胞内寄生结核感染T细胞检测-1037-1594-28281552322486834170免疫斑点30%呼吸道病原体检测2618芯片13 结核分枝杆菌复合群 Mtb 细长略带弯曲的杆菌，专性需氧132018-5-14结核病人诊断流程展望：个体化检测相应指南圆梦谱超早期肿瘤检测临床试验疑似病人胸片及 结抗 核体 抗原痰液、尿液等血液痰涂片显微镜检查临床症状T-SPOT

35、检测PCR方法（TB/NTB）阳性率低辅助诊断结核阳性准确率95%以上耐药检测非结核分枝杆菌分枝杆菌菌种鉴定菌种鉴定、指导用药标本库建设组织标本统计 收集各种临床标本49083份 组织标本12980份序号1采样部位胃总人数29938236总标本数（条）405739433855811033182肠3肺 体液标本36103份4肝脏甲状腺食管肾脏宫颈子宫内膜卵巢鼻445472567117441355110288916101112131415915喉耳扁桃体咽生物芯片实验室开展基因检测 参与博奥公司的临床实验，促进新技术、新项目的临床转化和应用时间2017年（1月-8月）755例抗栓治疗个体化用药基因

36、检测试剂盒（已完成）结直肠癌血清microRNA筛选（进行中）爱身谱+单病种基因检测MTHFR基因检测3352例631例24例CYP2C19基因检测microRNA肝癌超早期检测（新开展）142018-5-14临床表型和生物组学数据整合的价值基于医疗大数据的真实世界研究利用全院级电子病历，构建回顾性队列以及支持前瞻性临床试验“The ability to derive fine-grained patient phenotypesfrom health record data电子病历（诊断、检查、手术操作、医学影像、病理报告、实验室检验、处基因碱基突变和结构变异体细胞（癌）变异基因表达量时空变

37、化非编码区基因变异已知的各种变异和表型的关系临床大数据基因大数据complements the increasinglydetailed characterizationadvance and partly automatethe process of recruiting方）监测仪流数据环境暴露、病史和家族史随访随机对照试验病例对照研究前瞻性队列回顾性队列病例报告patients for clinical trials andretrospective cohort studies .我们的整体规划：面向真实世界研究的精准医学大数据平台利用临床剩余用血建立与队列挂钩的生物样本和基因信息库样本

38、暴露结果层参计分“patients with characteristics多病种、泛研究的大型数回顾性队列析matching those of interest areselected via EHRs using a2016烟台毓璜顶医院精准医学大数据平台年5月正式开始启动combination of structured, codifiedand narrative text. The populations ofpatients thereby characterized arethen recruited to provide samples orhave their discarded clinical