靶向上调ID4基因表达药物的生物信息学预测、分析和验证

1、靶向上调ID4基因表达药物的生物信息学预测、分析和验证卢学春 杨波 朱宏丽等 1生物信息学在全球迅猛发展基因基因组学蛋白质蛋白质组学表观遗传学表观基因组学 疾病状态的2如何利用数据库为我们服务？生物信息学！3表观遗传学的贡献抗癌基因的丢失与肿瘤的发生密切相关ID4基因的表达缺失而非突变与白血病和淋巴瘤的发生密切相关4ID4丢失对白血病治疗前景的启示重新表达！转染-基因治疗药物诱导5哪些药物能够诱导ID4基因的表达？生物信息学可以预测！实验室证实6ID4基因的启动子分析7ID4基因启动子活性分析8 ID4基因5侧翼区顺式作用元件的预测结果 调控区顺式元件位置正向调控c-Myb-903, -621

2、, -441, -374, -149,-136, -606 NRSp1-901N, -872NR, -867, -559, -369, -283, -187, -118, -91, -58, +14, +17, +45, +47, +48, +78, +81, +91, +94, +1004, +1006, +1007, +1011 +124, +130, +132, +133, +134, +173, +191, +193, +194, +231, +233, +235, +236, +259, +260abaA-794NR, -498, -424, -419, -350, -157, -4

3、C/EBPalpha-705, -369, -572, -253, -108GR-355NR, -148, -106Zeste-291, -249, -80, -32, +34, +53, +61CRE/half-301，-267ERE-244，-214，-181，-155，-129，-68，-28负向调控GCF+44, +133, +160, +177WT1 -KTS+46, +102, +105, +131, +124HiNF-C+105, +131, +46EGR2+107, +127, +133, +194CACC-binding factor-873, -871 NR, -2839I

4、D4基因表达谱的生物信息学预测10雌激素对ID4基因表达的影响 a. C57BL/6小鼠卵巢切除后的胸腺用17-雌二醇（E2）或E2的类似物三羟基异黄酮处理. b. 卵巢切除14天后，小鼠皮下注射黄体酮，在不同时间点切除子宫检测11对ID4基因表达具有抑制作用的因素a.肺组织取自100氧损伤的野生型Nrf2敲除小鼠. b.用100uM ZVAD处理REtsAF-Bcl-2细胞，并在39.5条件下培养使caspases失活. REtsAF-Bcl-2细胞带有温度敏感的LT抗原突变体，能够在33而非39.5条件下抑制p53基因的活性. c.脊髓组织， 200ng的二羟维生素D3对多发脊髓硬化B10

5、PL小鼠基因表达的影响. d. 比较对Sindbis病毒具有抗性和敏感性293细胞的基因表达12对ID4基因表达具有促进作用的因素 a.3日龄小鼠用ATRA处理.在第4天给一半小鼠以地塞米松（DEX）. b. 额叶皮质的基因表达，取自过表达人类乙酰胆碱酯酶（AchE）的雌性小鼠和雌性FVB/N小鼠. C. 巨噬细胞和脐静脉内皮细胞用100nM白三烯处理1小时后的基因表达. d. 来自骨髓的巨噬细胞PIAS1用500U/ml的IFN-或10ng/ml IFN-处理2h或4h. 13有关ID4基因表达调控的文献No.paperAuthorExperiment materialsID4 expres

6、sion1Nat-GenetYu L, 2005miceMethylation(-)2Oncogene Umetani N, 2005breast cancer tissuesMethylation(-)3OncogeneChan AS，2003breast cancer cell linesMethylation(-)4Anal-BiochemSemov A，2002WI-38 fibroblastE-box binding factor and c-Myc-binding protein(-)5EndocrinologyChaudhary J，2001Sertoli cell lineFS

7、H and cAMP(+)*6Exp-Cell-ResAndres BPJ, 1999mouse forebrain astrocytescAMP(-)*7J-Biol-ChemPagliuca A, 1998DNA sequenceE-box (+)GA (-)*不同研究结果间存在矛盾. (-)抑制表达; (+)促进表达 14二丁酰环磷腺苷钙对MOLT4白血病细胞系表达ID4基因的影响 DL2000为DNA分子量标准；M4为不做任何处理的MOLT4细胞系，M4-DC浓度为0.1mmol/L的二丁酰环磷腺苷钙处理48h。ID4基因的PCR产物长度为364bp。内参hHPRT的产物长度为231bp。 15结 论生物信息学可用于筛选靶向调控功