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文档简介
1、DNA琼脂糖凝胶电泳 姓名:徐秀倩 学号:3160481 导师: 吴小芹.第1页,共26页。 实验原理琼脂糖为链状多糖 绳状琼脂糖束大网孔型 凝胶 分离、鉴定、纯化DNA影响DNA迁移率的因素:DNA分子的大小、构 象,凝胶浓度,电压,电泳缓冲液的组成缓冲液pHDNA Pi,DNA带负电荷,迁移率与 分子量对数成反比DNA分子构象影响迁移率:共价闭环DNA线 状DNA开环DNA.第2页,共26页。不同浓度琼脂糖分离DNA分子的范围琼脂糖浓度(%) 分离范围(kb) 0.3 5-60 0.6 1-20 0.7 0.8-10 0.9 0.5-7 1.2 0.4-6 1.5 0.2-4 2.0 0.
2、1-3.第3页,共26页。琼脂糖凝胶中DNA的观察溴化乙锭(EB)DNA:紫外光下 红色荧光.第4页,共26页。主要实验器材电泳仪电泳槽缓冲液琼脂糖凝胶槽梳子取液器溴酚蓝.第5页,共26页。电泳槽结构.第6页,共26页。操作步骤琼脂糖凝胶的制备:溶化,冷却,EB凝胶板的制备:加梳子,倒胶样品的制备:样品+1/5体积溴酚蓝加样:加样端为负极(黑)电泳:5V/cm观察:紫外灯下观察,照相.第7页,共26页。 溶 胶.第8页,共26页。准备胶槽.第9页,共26页。凝胶冷却至50C,加EB至终浓度0.5g/ml.第10页,共26页。铺 胶.第11页,共26页。凝胶凝固后取出梳子.第12页,共26页。加
3、缓冲液.第13页,共26页。 准备样品.第14页,共26页。点 样.第15页,共26页。电 泳.第16页,共26页。注意观察溴酚蓝染液的迁移.第17页,共26页。紫外灯下观察电泳结果.第18页,共26页。 照 相.第19页,共26页。相关实验 对琼脂糖凝胶电泳分离DNA 片段的有效性的再认识.第20页,共26页。琼脂糖凝胶电泳分离DNA 片段的基本原理 DNA 为多元酸,在中性或弱碱性缓冲液中带负电荷而向阳极泳动 由于不同DNA 分子在同一凝胶中迁移速率不一样, 电泳一段时间后可将其分开。.第21页,共26页。材料 铜绿假单胞菌噬菌体PaP1 基因组DNA ,按常规提取,置-20 保存备用。A
4、garose 、限制性内切酶EcoR为上海生工生物工程有限公司产品。从凝胶中小量回收DNA 片段的试剂盒为上海华舜生物工程有限公司产品,1 kb DNA Ladder为MBI 产品。.第22页,共26页。方法琼脂糖凝胶电泳 用1TAE 配制0.8 %琼脂糖凝胶, 电泳缓冲液为1 TAE,电压为5 V/ cm ,电泳1 h ,用溴化乙锭或LIGHTBLUE Dye 显色。.第23页,共26页。结果 电泳后在日光下(LIGHTBLUE Dye 染色)或在紫外灯下(溴化乙锭染色)切取含“ 单一” 目的DNA 分子的胶条并称重,用小量胶回收试剂盒回DNA。 .第24页,共26页。 在3 个大的目的DNA 片段1、2 和3(分别约为10 、7、4.5 kb)之后有很多的较小片段(从大约3.5 kb 到100 bp不等)。在日光下(用LIGHTBLUE Dye 显色)分别切取含有单一目的片段1、2、3 的
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