中东呼吸综合征疫情处理及实验室检测课件(PPT 54页)

1、中东呼吸综合征（）疫情处理与实验室检验北京市疾病预防控制中心林长缨年月日第1页，共54页。主要内容中东呼吸综合征（）的流行病学诊断与报告实验室检测总结第2页，共54页。中东呼吸综合征 （）中东呼吸综合征： ，简称病 原 体：新型冠状病毒，传播途径：近距离长时间接触，经呼吸道传播易感人群：儿童、老年人和基础病患者首例病例：年月，沙特人，吉大港临床特点：致死率较高，儿童病例症状较轻，重症病例主要是下呼吸道感染、呼吸衰竭、休克和急性肾衰竭疫情特点：散发为主第3页，共54页。中东呼吸综合征冠状病毒第4页，共54页。人类冠状病毒第5页，共54页。冠状病毒属采用依赖聚合酶()上片段进行分析第6页，共54页

2、。分类地位冠状病毒科，冠状病毒属，亚属，种系其它冠状病毒与(扁颅蝠冠状病毒）和 (伏翼蝙蝠冠状病毒) 亲缘较近与、和分属不同种系与、分属不同亚属第7页，共54页。病毒基因组单股正链，基因组，分个开放读取框合成种独特的辅助蛋白(, , , , )及种复制酶和种结构蛋白第8页，共54页。病毒结构包膜病毒病毒外壳：棘突蛋白、包膜蛋白、膜蛋白病毒核心：单股正链、核衣壳蛋白棘突蛋白 包膜蛋白 核衣壳蛋白 膜蛋白 第9页，共54页。病毒侵入细胞的机理人类（支气管上皮细胞）是的细胞受体刺突蛋白与结合，介导了病毒附着宿主细胞，病毒与细胞融合由此触发感染。第10页，共54页。的流行病学特点第11页，共54页。传

3、染源 自然宿主？核酸片段血清抗体单峰驼分布第12页，共54页。骆驼人传播证据 （ , , ， ） , , 第13页，共54页。传染源患者有限的人传人二代病例少，没有三代病例 少量家族聚集性病例传播能力较弱第14页，共54页。传播途径第15页，共54页。疫情发现患者：岁，沙特阿拉伯籍发病时间：月日入院时间：月日，吉大港某医院主要症状：重症肺炎、肾功能衰竭死亡时间：月日实验室检测：尸检肺组织的冠状病毒通用引物 检测阳性；经荷兰医学 中心（）进行序列比对，怀 疑为一种新型冠状病毒感染。 第16页，共54页。疫情发现患者：男性，岁，卡塔尔籍发病时间：月日入院时间：月日，多哈某医院；月日转 英国治疗主要

4、症状：呼吸道症状、肾功能衰竭流行病学史：发病前曾到沙特阿拉伯实验室检测：呼吸道样本中冠状病毒通用引物 检测阳性；经序列比对，怀疑为 一种新型冠状病毒感染。 第17页，共54页。疫情发现两例病例体内的新型冠状病毒聚合酶基因序列比对（）结果显示其同源性高达病毒与蝙蝠冠状病毒的同源性较高 (和 ) 与冠状病毒在基因序列上相似程度不高此病毒感染导致一种新发传染病 第18页，共54页。病例来自于中东国家欧盟发布的疫情动态（年月底）第19页，共54页。全球疫情状态：截至年月日，全球共计例实验室确诊病例，死亡人，病死率约为。欧盟：截至年月日，全球累计报告确诊病例例，死亡例，病死率第20页，共54页。第21页

5、，共54页。病例时间分布第22页，共54页。病例地区分布截至年月日中东地区：沙特阿拉伯、阿联酋、卡塔尔、苏丹、安曼、科威特 、也门、黎巴嫩、伊朗另外：亚洲：韩国第23页，共54页。病例特征据报道，的潜伏期为天。男性病例较多：男女性别比为：年龄中位数为岁（范围为岁）男性：岁，女性：岁。病死率较高（左右）无症状感染者比例大约为。的病例为医务人员：医院是“重灾区”第24页，共54页。临床表现主要表现：发热畏寒寒战干咳、气短头痛和肌痛。其他症状：咽痛、鼻塞、咯痰恶心、呕吐、头晕腹泻和腹痛。第25页，共54页。临床表现重症患者：开始表现为发热伴上呼吸道症状一周内快速进展为重症肺炎，伴有呼吸衰竭、休克、急

6、性肾功能衰竭、凝血功能障碍和血小板减少。患者中有的病例无临床症状仅表现为轻微的呼吸道症状无发热、腹泻和肺炎。第26页，共54页。临床表现影像学表现：如发生肺炎可出现：单侧至双侧的肺部影像学改变主要特点为胸膜下和基底部分布，磨玻璃影为主，可出现实变影第27页，共54页。临床检测血常规：白细胞总数一般不高，可伴有淋巴细胞减少。血生化检查：部分患者肌酸激酶、天门冬氨酸氨基转移酶、丙氨酸氨基转移酶、乳酸脱氢酶、肌酐等升高。第28页，共54页。防控措施第29页，共54页。诊断与报告第30页，共54页。病例发现严重急性呼吸道感染（）监测区县医院科室东城天坛医院呼吸内科病房感染性疾病科病房重症医学科病房儿科

7、病房重症监护室（）石景山石景山医院朝阳北京华信医院西城北京大学人民医院海淀航天中心医院大兴大兴区人民医院密云密云县医院昌平昌平区医院门头沟京煤集团总医院怀柔怀柔区第一医院不明原因肺炎病例监测呼吸道暴发疫情监测口岸监测第31页，共54页。疑似病例定义患者同时符合临床表现和流行病学史，但尚无实验室确认依据。临床表现 难以用其他病原感染解释的急性呼吸道感染：体温 、咳嗽，有胸部影像学改变等。流行病学史发病前天内在中东呼吸综合征病例报告或流行地区旅游或居住；或与疑似临床诊断确诊病例有密切接触史。阿拉伯半岛中或附近的国家和地区：巴林、伊拉克、伊朗、以色列、约旦河西岸和加沙地带、约旦、科威特、黎巴嫩、阿曼

8、、卡塔尔、沙特阿拉伯、叙利亚、阿联酋、也门第32页，共54页。临床诊断病例定义满足疑似病例标准，仅有实验室阳性筛查结果（如仅呈单靶标或单份血清抗体阳性）的患者。满足疑似病例标准，因仅有单份采集或处理不当的标本而导致实验室检测结果阴性或无法判断结果的患者。第33页，共54页。确诊病例定义具备下述项之一者可确诊为中东呼吸综合征实验室确诊病例： 至少双靶标检测阳性。单个靶标阳性产物，经基因测序确认。 从呼吸道标本中分离出中东呼吸综合征冠状病毒。恢复期血清中东呼吸综合征冠状病毒抗体较急性期血清抗体水平呈倍及以上升高。第34页，共54页。密切接触者定义诊疗、护理中东呼吸综合征确诊、临床诊断或疑似病例时未

9、采取有效防护措施的医护人员、家属或其他与病例有类似近距离接触的人员。.在确诊、临床诊断或疑似病例出现症状期间，有共同居住、学习、工作或其它密切接触的人员。.现场调查人员调查后判断认为符合条件的人员。第35页，共54页。病例报告与调查发现中东呼吸综合征疑似病例、临床诊断病例及确诊病例时，具备网络直报条件的医疗机构应当于小时内进行网络直报，并同时报告本辖区疾控中心各区县疾控中心接到辖区内医疗机构或医务人员报告中东呼吸综合征疑似病例、临床诊断病例及确诊病例后，应在小时内报告区县卫生局、市疾控中心。按照中东呼吸综合征病例流行病学个案调查表赶赴现场对病例进行流行病学调查和采样于小时内将流行病学调查报告上

10、报区县卫生局和市疾控中心，同时将调查情况通报病例现住址辖区疾控中心。第36页，共54页。标本采集与检测采集疑似病例的上呼吸道标本和下呼吸道标本；采集急性期血清和恢复期血清。按照高致病性病原微生物运输相关要求送本辖区疾控中心进行标本检测。辖区疾控中心检测出核酸阳性样本后，应立即将阳性标本送市疾控中心进行复核。具备实验室检测条件的网络实验室所在医疗机构对于本单位发现的疑似病例，可在确保生物安全的情况下进行初筛。第37页，共54页。病例救治医疗机构发现疑似病例后应按照北京市卫生局关于做好可能发生的中东呼吸综合征疫情医疗救治准备工作的通知（京卫医字号）有关规定进行救治做好医疗救治所需的人员、药品、设施

11、、设备、防护用品等保障工作。第38页，共54页。病例管理在知情同意的情况下，对临床诊断和确诊病例实行隔离治疗参与救治的医护人员实施有效防护措施（标准预防飞沫传播预防接触传播预防）。病例管理和感染防护具体要求参见国家卫生计生委制定的中东呼吸综合征病例诊疗方案（年版）和中东呼吸综合征医院感染预防与控制技术指南（年版）。 第39页，共54页。病例管理对于疑似病例：在尚未明确排除中东呼吸综合征冠状病毒感染前，原则上也应当实施隔离医学观察和治疗做好感染防护，直至病人发热、咳嗽等临床症状体征消失或排除感染中东呼吸综合征冠状病毒。第40页，共54页。密切接触者的追踪和管理由密切接触者现住址所在区县卫生局组织

12、、协调密切接触者的追踪和管理。密切接触者均实行居家医学观察，每日至少进行次体温测定，并询问是否出现急性呼吸道症状或其他相关症状及病情进展。第41页，共54页。密切接触者的追踪和管理密切接触者医学观察期为与病例末次接触后天。医学观察期内，一旦出现发热、咳嗽，或腹泻等非呼吸道感染症状 ，或有肺炎症状和体征等表现的病例，区县卫生局负责将其转送至定点医疗机构进行诊断、报告、隔离及治疗。现住址所在区县疾控中心应当采集密切接触者的咽拭子标本和双份血清标本。第一份血清标本应当尽可能在末次暴露后天内采集第二份血清标本间隔周后采集咽拭子标本由采集标本的区县疾控中心开展检测；血清标本送市疾控中心。第42页，共54

13、页。实验室检测第43页，共54页。实验室检测血常规：白细胞总数一般不高，可伴有淋巴细胞减少。血生化检查：部分患者肌酸激酶、天门冬氨酸氨基转移酶、丙氨酸氨基转移酶、乳酸脱氢酶、肌酐等升高。病原学检测病毒分离培养：金标准血清学抗体检测：需要双份血清核酸检测：可用于早期检测第44页，共54页。病原学检测病毒分离：需在实验室内进行标本上、下呼吸道采样物，粪便，尿液，组织器官等培养用细胞系非洲绿猴肾（）细胞恒河猴肾（）细胞第45页，共54页。病原学检测血清学检测：可在实验室内进行标本：急性期、恢复期双份血清，各急性期血清应在发病后天内采集，恢复期血清应在发病后第周采集。方法法恢复期血清抗体滴度较急性期倍

14、及以上升高第46页，共54页。病原学检测血清学检测：可在实验室内进行标本：急性期、恢复期双份血清，各急性期血清应在发病后天内采集恢复期血清应在发病后第周采集方法法恢复期血清抗体滴度较急性期倍及以上升高注意血清学检测中交叉凝集问题第47页，共54页。病原学检测核酸检测：可在实验室内进行标本：上呼吸道标本：包括咽拭子、鼻拭子、鼻咽抽取物、咽漱液、深咳痰液下呼吸道标本：包括呼吸道（支气管）抽取物、支气管灌洗液、肺组织活检标本其它标本，如尸检标本，粪便，尿液（日）等标本储存及运输采集后小时内，可冷藏或运输长期保存温度为或更低每个病例应尽可能在病程进展的不同阶段连续同时采集上、下呼吸道标本第48页，共5

15、4页。病原学检测核酸检测：可在实验室内进行靶基因：蛋白上游基因（）： ，初筛和确认基因： ，初筛和确认基因： ，初筛和确认 依赖的聚合酶（）基因：，用于测序核衣壳蛋白（）基因：，用于测序第49页，共54页。病原学检测核酸检测阳性结果：至少两种 检测结果阳性；或一种 阳性产物序列测序结果与已知对应序列相符。两种靶序列检测结果不一致时测序第50页，共54页。病原学检测考虑假阴性的因素：样本质量差技术本身存在的原因检测结果为阴性，但临床表现和流行病学特点提示是感染时：可采用血清学方法进行检测：双份血清标本能够满足血清学检测的要求。第51页，共54页。病原学检测巢式：巢式通过两次扩增，可对样本中微量病毒目的片段进行特异扩增，扩增产物序列较长，可用于序列测定对基因和基因序列进行扩增，可产生较长片段的基因序列，通过序列测定，确定感染病毒型别可用于初筛和确认第52页，共54页。加强实验室生物安全及检测各有关医疗卫生机构应按照高致病性病原微生物实验室生物安全相关规定开展病例救治、流行病学调查、标本采集、运输和检测等工作。应当尽可能采集病例的下呼吸道标本，以提高检出率。在疑似病例标本检测过程中，只要出现任何一个靶序列检测结果阳性或可疑阳性，请及时与市疾控